Usmernenia vydané v roku 2008 Usmernenie č. 18/2008-U ku koncoročným uzávierkovým pracovným postupom a k eurokonverzii pre užívateľov ISUF Usmernenie č. 16/2008 - U k nezrovnalostiam v rámci finančného riadenia štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho fondu pre rybné hospodárstvo Usmernenie č. 15/2008-U k postupu financovania projektov štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho fondu pre rybné hospodárstvo v súvislosti s ukončením rozpočtového roka 2008 a zavedením Usmernenie č. 13/2008-U k príjmovým účtom platobnej jednotky pre programové obdobie 2004 - 2006 a programové obdobie 2007 - 2013 Usmernenie č. 11/2008-U k postupu účtovania vrátenia príspevku vo výške príjmu z projektu od konečného prijímateľa / príjemcu pomoci / prijímateľa na úrovni platobnej jednotky v systéme ISUF Usmernenie č. 10/2008-U k postupu účtovania vrátení vyplývajúcich z povahy projektu od konečného prijímateľa / príjemcu pomoci / prijímateľa na úrovni platobnej jednotky v systéme ISUF Usmernenie č. 9/2008-U k postupu účtovania vrátení finančných prostriedkov nezúčtovanej zálohovej platby a nezúčtovaného predfinancovania od konečného prijímateľa / príjemcu pomoci / prijímateľa na Usmernenie č. 8/2008-U k postupu účtovania nezrovnalostí štrukturálnych fondov a Kohézneho fondu od konečného prijímateľa / príjemcu pomoci / prijímateľa na úrovni platobnej jednotky v systéme ISUF Usmernenie č. 7/2008-U k postupu účtovania opakovanej realizácie vrátenej platby od konečného prijímateľa / príjemcu pomoci / prijímateľa na rozpočtový výdavkový účet platobnej jednotky Usmernenie č. 5/2008-U k postupu účtovania prijatej mylnej platby a jej vrátenia v ISUF pre platobnú jednotku