Usmernenia vydané v roku 2008 Usmernenie č. 18/2008-U ku koncoročným uzávierkovým pracovným postupom a k eurokonverzii pre užívateľov ISUF Usmernenie č. 16/2008-U k nezrovnalostiam v rámci finančného riadenia štrukturálnych fondov a Kohézneho fondu pre programové obdobie 2004 - 2006 a programové obdobie 2007 - 2013 Usmernenie č. 15/2008-U k postupu financovania projektov štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho fondu pre rybné hospodárstvo v súvislosti s ukončením rozpočtového roka 2008 a zavedením Usmernenie č. 3/2008-U k postupu účtovania programu ISPA/Kohézny fond v ISUF pre platobnú jednotku ISPA/ Kohézny fond Usmernenie č. 2/2008-U k postupu pri účtovaní príjmu výnosov z prostriedkov štátneho rozpočtu v systéme ISUF Usmernenie č. 1/2008-U k ukončeniu pomoci z Kohézneho fondu a ISPA/Kohézneho fondu na programové obdobie 2004 – 2006
