Systém financovania a finančného riadenia FM EHP a NFM pre programové obdobie 
2009 – 2014 („Systém“), verzia 1.5

1.	V celom dokumente boli vykonané formálne a štylistické úpravy.
2.	Kapitola 2 „Základné definície a pojmy“
-	upravená definícia výkazu výdavkov.
3.	Kapitola 3.1.2 „Správca programu“
-	bod 16 upravený nasledovne: „zabezpečiť vrátenie neoprávnene poskytnutých alebo použitých finančných prostriedkov od prijímateľa podľa projektovej zmluvy zohľadnením pri výpočte záverečnej bilancie v záverečnej programovej správe“;
-	doplnený nový bod 19 v znení: „zohľadniť výnosy vzniknuté z prostriedkov FM EHP a NFM na financovanie projektov 
v roku, v ktorom sa predkladá záverečná programová správa, v záverečnej programovej správe a pri výpočte záverečnej bilancie“;
-	doplnený nový bod 20 v znení: „na základe vyžiadania Úradom pre finančný mechanizmus oznámiť výšku výnosov vzniknutých na účte správcu programu z prostriedkov FM EHP a NFM na financovanie projektov, ktoré vznikli 
od dátumu predloženia záverečnej programovej správy certifikačnému orgánu do dátumu vyplatenia záverečnej platby 
v nadväznosti na čl. 8.4.5 nariadení, v kópii certifikačnému orgánu, ktorú následne Úrad pre finančný mechanizmus započíta v rámci záverečnej bilancie“; 
-	ostatné body relevantne prečíslované;
-	doplnený nový odsek v znení: „Z dôvodu zmeny postupov ohľadom vysporiadania finančných vzťahov 
pred predložením záverečnej programovej správy (FPR) certifikačnému orgánu budú všetky finančné prostriedky prijaté v čase platnosti verzie 1.0 usmernenia certifikačného orgánu č. 1/2016-U k ukončeniu pomoci z Finančného mechanizmu EHP a Nórskeho finančného mechanizmu pre programové obdobie 2009 – 2014 vrátené na účty správcov programov ako mylné platby. Vysporiadanie finančných vzťahov prebehne až po schválení FPR Úradom pre finančný  mechanizmus“.
4.	Kapitola 3.1.4 „Orgán auditu“
-	bod 10 upravený nasledovne: „predložiť Úradu pre finančný mechanizmus najneskôr do 31. decembra 2017 záverečné vyhlásenie orgánu auditu, ktoré hodnotí platnosť žiadosti o záverečnú platbu, zahrnutej v záverečnej programovej správe, v súlade s čl. 4.6.1 písm. f) nariadení. V prípade, že donorské štáty schvália predĺženie obdobia oprávnenosti výdavkov programu, termín na predloženie záverečnej audítorskej správy a záverečného vyhlásenia orgánu auditu je 31. 12. 2018, ak donorské štáty neustanovia inak. Orgán auditu sa môže rozhodnúť predložiť jednu spoločnú Záverečnú audítorskú správu ("final audit report") a jedno spoločné Záverečné vyhlásenie orgánu auditu ("closure declaration") za všetky programy spoločne, a to najneskôr do 31.12.2018.“
5.	Kapitola 4.2.4 „Záverečná programová správa (FPR) a záverečná platba z Úradu pre finančný mechanizmus“
-	text v predposlednom odseku upravený nasledovne: „všetky finančné prostriedky vrátené, resp. ktoré majú byť vrátené prijímateľom správcovi programu, ktoré následne správca programu nevyplatil na iné projekty, alebo nevrátil Úradu 
pre finančný mechanizmus“.
6.	Kapitola 4.8.1 „Pravidlá pre financovanie finančných korekcií z titulu zistených nezrovnalostí a vylúčenie projektu z financovania pomoci FM EHP a NFM“
-	text prvého odseku upravený nasledovne: „V tomto prípade dotknuté výdavky certifikačný orgán odpočíta 
od nasledujúcej IFR / FPR a správca programu je prvotne zodpovedný podľa projektovej zmluvy za zabezpečenie vrátenia neoprávnene vyplatených finančných prostriedkov od prijímateľa na príslušné účty certifikačného orgánu 
za zdroj FM EHP a NFM a za zdroj prostriedkov štátneho rozpočtu na spolufinancovanie, a to najneskôr ich zohľadnením pri výpočte záverečnej bilancie v záverečnej programovej správe.“ 
7.	Kapitola 5 „Audit“
-	text kapitoly upravený nasledovne:
„V zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov sa audit prostriedkov FM EHP a NFM 2009 – 2014 vykonáva ako vládny audit.
Vládny audit prostriedkov FM EHP a NFM je vykonávaný ako: 
•	audit súladu;
•	systémový audit;
•	audit projektov.
Auditom súladu orgán auditu overuje, či systém implementácie FM EHP a NFM certifikačného orgánu, národného kontaktného bodu a správcu programu je v súlade s nariadeniami, Memorandom o porozumení FM EHP 2009 – 2014, Memorandom o porozumení pre implementáciu NFM 2009 – 2014 a všeobecne uznávanými účtovnými princípmi. Ďalej sa auditom súladu posudzuje primeranosť požiadaviek na riadiace a kontrolné systémy vo vzťahu k efektívnosti dosahovania cieľov programov.
V rámci systémového auditu je kľúčovou úlohou orgánu auditu overenie efektívneho fungovania riadiaceho a kontrolného systému podľa predloženej riadiacej dokumentácie a testovanie funkčnosti a účinnosti riadiaceho a kontrolného systému na vybranej vzorke.
Pri auditoch projektov sa overuje najmä:
•	výberový a hodnotiaci proces;
•	či boli transfery platieb uskutočnené v súlade s projektovou dokumentáciou;
•	či bolo dodržané, že nasledovná zálohová platba bola poskytnutá až po zúčtovaní minimálne 50% zo zálohových platieb, ktoré boli poskytnuté predtým.
Základné pravidlá vládneho auditu vrátane práv a povinností auditujúcich orgánov, oprávnených osôb a povinných osôb sú uvedené v zákone č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov. Podrobnosti výkonu vládneho auditu upravujú Postupy pre vládny audit štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho fondu pre rybné hospodárstvo a k nim vydané metodické usmernenia, ktoré sa pri výkone vládneho auditu FM EHP a NFM  uplatňujú primerane.“