Systém finančného riadenia štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu na programové obdobie 2014 – 2020

Obsah                                                                                                                                                                                      strana

1	Legislatíva Európskej únie a Slovenskej republiky
2	Základné definície a pojmy
3	Subjekty zapojené do finančného riadenia a ich zodpovednosť
3.1	Centrálny koordinačný orgán a Koordinačný orgán pre finančné nástroje
3.1.1	Centrálny koordinačný orgán
3.1.2	Koordinačný orgán pre finančné nástroje
3.2	Riadiace orgány
3.3	Certifikačný orgán
3.4	Platobné jednotky
3.5	Monitorovacie výbory
3.6	Orgán auditu
3.7	Orgány vydávajúce rozhodnutia v správnom konaní
3.7.1	Úrad vládneho auditu
3.7.2	Samostatné oddelenie správneho konania Ministerstva financií SR
3.8	Orgán zabezpečujúci ochranu finančných záujmov
4.	Financovanie zo štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu
4.1.	Pomoc zo štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu
4.2.	Obmedzenia pre využívanie prostriedkov EÚ
4.3.	Rozhodnutie Európskej komisie o poskytnutí pomoci a presuny finančných prostriedkov
4.4.	Záväzky a platby z EÚ
4.4.1	Záväzky
4.4.1.1	Záväzky vo vzťahu k programom
4.4.1.2	Záväzky vo vzťahu k projektom
4.4.2	Platby z Európskej komisie
4.4.2.1	Počiatočná zálohová platba z Európskej komisie
4.4.2.2	Ročné zálohy z Európskej komisie
4.4.2.3	Priebežné platby z Európskej komisie
4.4.3	Účty
4.5	Platby na národnej úrovni
4.5.1	Zaradenie prostriedkov EÚ do štátneho rozpočtu
4.5.1.1	Programové rozpočtovanie
4.5.1.2	Realizácia výdavkov prostredníctvom Štátnej pokladnice
4.5.2	Platby vo vzťahu certifikačný orgán – platobná jednotka
4.5.3	Platby vo vzťahu platobná jednotka – prijímateľ / partner
4.5.4	Platby vo vzťahu platobná jednotka – sprostredkovateľský orgán pre globálny grant
4.5.5	Platby vo vzťahu sprostredkovateľský orgán pre globálny grant – prijímateľ
4.5.6	Platby vo vzťahu prijímateľ – dodávateľ / zhotoviteľ
4.5.7	Spracovanie účtov na národnej úrovni
4.5.8	Vysporiadanie finančných vzťahov
4.5.8.1	Vysporiadanie čistého príjmu
4.5.8.2	Vzájomné započítanie pohľadávok a záväzkov
4.5.8.3	Odvod za porušenie finančnej disciplíny, správa a účtovanie pohľadávok
4.5.9	Odhad očakávaných výdavkov
5	Systém bankových účtov
5.1	Účty certifikačného orgánu
5.2	Účty platobnej jednotky
5.3	Účty sprostredkovateľského orgánu pre globálny grant
5.4	Účty prijímateľa – štátna rozpočtová organizácia
5.4.1	Účty prijímateľa – štátna rozpočtová organizácia – Ústredie práce, sociálnych vecí a rodiny
5.5	Účty prijímateľa – štátna príspevková organizácia a iné subjekty verejnej správy
5.6	Účty prijímateľa – vyšší územný celok
5.7	Účty prijímateľa – obec
5.8	Účty prijímateľa – rozpočtová a príspevková organizácia v zriaďovacej pôsobnosti VÚC a obce
5.8.1	Účty prijímateľa – rozpočtová organizácia v zriaďovacej pôsobnosti VÚC a obce
5.8.2	Účty prijímateľa – príspevková organizácia v zriaďovacej pôsobnosti VÚC a obce
5.9	Účty prijímateľa – súkromný sektor
5.10	Účty prijímateľa – v rámci implementácie finančných nástrojov
6	Systém informačných a finančných tokov na národnej úrovni
6.1	Systém predfinancovania
6.2	Systém predfinancovania pre prijímateľov – štátne rozpočtové organizácie
6.3	Systém zálohových platieb
6.4	Systém zálohových platieb pre prijímateľov – štátne rozpočtové organizácie
6.5	Systém refundácie
6.6	Systém refundácie Programov Interreg V-A SK – CZ, Interreg V-A SK – AT a Interreg V-A SK – HU
6.7	Systém finančných tokov pri implementácii finančných nástrojov
6.8	Systém finančných tokov pri implementácii globálnych grantov
6.8.1	Poskytnutie platby riadiacim orgánom sprostredkovateľskému orgánu pre globálny grant
6.8.2	Poskytnutie platby sprostredkovateľským orgánom pre globálny grant prijímateľovi
6.8.2.1	Systém refundácie pri implementácii globálnych grantov
6.9	Prechod a prevod práv a povinností prijímateľa na iný subjekt
7	Systém certifikácie
8	Nezrovnalosti a finančné opravy
8.1	Nezrovnalosti
8.2	Finančné opravy
8.2.1	Finančné opravy vykonané Slovenskou republikou
8.2.2	Finančné opravy vykonané Európskou komisiou
8.3	Vysporiadanie finančných vzťahov na národnej úrovni
8.3.1	Uznanie neoprávnených výdavkov za opätovne oprávnené
8.4	Vylúčenie projektu z financovania pomoci a podpory EÚ
9	Účtovníctvo
9.1	Účtovníctvo certifikačného orgánu a platobnej jednotky
9.2	Účtovníctvo prijímateľa a partnera
10	Finančné výkazníctvo a archivácia
11	Používanie mien a kurzové rozdiely
12	Monitorovanie a elektronická výmena informácií
13	Zoznam príloh
14	Zoznam odkazov

1	Legislatíva Európskej únie a Slovenskej republiky
Systém finančného riadenia štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu na programové obdobie 2014 – 2020 je vypracovaný v súlade s právnymi predpismi Európskych únie (ďalej aj "ES" alebo "EÚ") a Slovenskej republiky (ďalej aj "SR") a inými dokumentmi, najmä:
a)	Medzinárodné dohody
•	Zmluva o Európskej únii a Zmluva o fungovaní Európskej únie
b)	Základné právne predpisy EÚ
Nariadenia upravujúce rozpočet EÚ
•	nariadenie Európskeho parlamentu a Rady (EÚ, Euratom) č. 966/2012 o rozpočtových pravidlách, ktoré sa vzťahujú na všeobecný rozpočet Únie a zrušení nariadenia Rady (ES, Euratom) č. 1605/2002 v platnom znení
•	delegované nariadenie Komisie (EÚ) č. 1268/2012 o pravidlách uplatňovania nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ, Euratom) č. 966/2012 o rozpočtových pravidlách, ktoré sa vzťahujú na všeobecný rozpočet Únie
Nariadenia upravujúce systémy riadenia a kontroly
•	nariadenie Rady (ES) č. 2185/1996 o kontrolách a inšpekciách na mieste vykonávaných Európskou komisiou s cieľom ochrany finančných záujmov Európskych spoločenstiev pred spreneverou a inými podvodmi 
Nariadenia upravujúce fondy 
•	nariadenie Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1299/2013 o osobitných ustanoveniach na podporu cieľa Európska územná spolupráca z Európskeho fondu regionálneho rozvoja v platnom znení
•	nariadenie Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1300/2013 o Kohéznom fonde, ktorým sa zrušuje nariadenie Rady (ES) č. 1084/2006 v platnom znení
•	nariadenie Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1301/2013 o Európskom fonde regionálneho rozvoja a o osobitných ustanoveniach týkajúcich sa cieľa Investovanie do rastu a zamestnanosti, a ktorým sa zrušuje nariadenie (ES) č. 1080/2006 v platnom znení
•	nariadenie Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1302/2013, ktorým sa mení nariadenie (ES) č. 1082/2006 o Európskom zoskupení územnej spolupráce (EZÚS), pokiaľ ide o vyjasnenie, zjednodušenie a zlepšenie zakladania a fungovania takýchto zoskupení v platnom znení
•	nariadenie Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013, ktorým sa stanovujú spoločné ustanovenia o Európskom fonde regionálneho rozvoja, Európskom sociálnom fonde, Kohéznom fonde, Európskom poľnohospodárskom fonde pre rozvoj vidieka a Európskom námornom a rybárskom fonde a ktorým sa stanovujú všeobecné ustanovenia o Európskom fonde regionálneho rozvoja, Európskom sociálnom fonde, Kohéznom fonde a Európskom námornom a rybárskom fonde, a ktorým sa zrušuje nariadenie Rady (ES) č. 1083/2006 v platnom znení
•	nariadenie Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1304/2013 o Európskom sociálnom fonde a o zrušení nariadenia Rady (ES) č. 1081/2006 v platnom znení
•	nariadenie Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 508/2014 zo dňa 15. mája 2014 o Európskom námornom a rybárskom fonde a zrušení nariadení Rady (ES) č. 2328/2003, (ES) č. 861/2006, (ES) č. 1198/2006 a (ES) č. 791/2007 a nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1255/2011 v platnom znení
•	príslušné vykonávacie a delegované nariadenia Komisie v platnom znení
c)	Základné záväzné právne predpisy SR
•	zákon č. 292/2014 o príspevku poskytovanom z európskych štrukturálnych a investičných fondov a o zmene a doplnení niektorých zákonov
•	zákon č. 575/2001 Z. z. o organizácii činnosti vlády a organizácii ústrednej štátnej správy v znení neskorších predpisov
•	zákon č. 40/1964 Zb. Občiansky zákonník v znení neskorších predpisov
•	zákon č. 513/1991 Zb. Obchodný zákonník v znení neskorších predpisov
•	zákon č. 323/2015 Z. z. o finančných nástrojoch financovaných z európskych štrukturálnych a investičných fondov a o zmene a doplnení niektorých zákonov
Rozpočtové pravidlá
•	zákon č. 523/2004 Z. z. o rozpočtových pravidlách verejnej správy a o zmene a doplnení niektorých zákonov v znení neskorších predpisov
•	zákon č. 583/2004 Z. z. o rozpočtových pravidlách územnej samosprávy a o zmene a doplnení niektorých zákonov v znení neskorších predpisov
Finančná kontrola a audit
•	Zákon č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov
•	zákon č. 39/1993 Z. z. o Najvyššom kontrolnom úrade Slovenskej republiky v znení neskorších predpisov
•	zákon č. 10/1996 Z. z. o kontrole v štátnej správe v znení neskorších predpisov
Verejné obstarávanie
•	zákon č. 25/2006 Z. z. o verejnom obstarávaní a o zmene a doplnení niektorých zákonov v znení neskorších predpisov
•	zákon č. 343/2015 Z. z. o verejnom obstarávaní a o zmene a doplnení niektorých zákonov
Účtovníctvo
•	zákon č. 431/2002 Z. z. o účtovníctve v znení neskorších predpisov
Štátna pokladnica
•	zákon č. 291/2002 Z. z. o Štátnej pokladnici a o zmene a doplnení niektorých zákonov v znení neskorších predpisov
Ďalšie súvisiace predpisy
•	zákon č. 122/2013 Z. z. o ochrane osobných údajov a o zmene a doplnení niektorých zákonov
•	zákon č. 231/1999 Z. z. o štátnej pomoci v znení neskorších predpisov
•	zákon č. 539/2008 o podpore regionálneho rozvoja a ktorým sa ruší zákon č. 503/2001 Z. z. o podpore regionálneho rozvoja v znení zákona č. 351/2004 Z. z.
•	zákon č. 416/2004 Z. z. o Úradnom vestníku Európskej únie v znení zákona č. 606/2004 Z. z.
•	zákon č. 275/2006 Z. z. o informačných systémoch verejnej správy a o zmene a doplnení niektorých zákonov v znení neskorších predpisov
•	zákon č. 150/2013 Z. z. o Štátnom fonde rozvoja bývania
•	zákon č. 211/2000 Z. z. o slobodnom prístupe k informáciám v znení neskorších predpisov
•	zákon č. 305/2013 Z. z. o elektronickej podobe výkonu pôsobnosti orgánov verejnej moci a o zmene a doplnení niektorých zákonov (zákon o e–Governmente)
•	zákon č. 395/2002 Z. z. o archívoch a registratúrach a o doplnení niektorých zákonov v znení neskorších predpisov
2	Základné definície a pojmy
Pre účely systému finančného riadenia štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu sa rozumie:
1.	Administratívne overenie – pre účely tohto materiálu sa administratívnym overením rozumie overenie súhrnnej žiadosti o platbu / mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu, ktorého súčasťou je kontrola v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. Administratívne overenie zahrňuje:
•	overenie formálnej správnosti, ktoré zahrňuje overenie pravdivosti, kompletnosti a správnosti údajov v súhrnnej žiadosti o platbu / mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu,
•	overenie vecnej správnosti, ktoré zahrňuje overenie správnosti údajov v relevantných informačných systémoch a overenie iných skutočností potrebných pre schválenie súhrnnej žiadosti o platbu / mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu.
2.	Audit trail – podrobný popis riadenia a realizácie poskytovania príspevku zo štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu na všetkých úrovniach zahrňujúci tok informácií, dokumentov, finančných prostriedkov a kontrolu.
3.	Centrálny elektronický databázový informačný systém (ďalej len "CEDIS") – informačný systém orgánu auditu, ktorý slúži na evidenciu plánov, monitorovanie a reporting výsledkov z vládnych auditov prostriedkov EÚ a prostriedkov ostatných nástrojov finančnej pomoci zo zahraničia poskytovaných Slovenskej republike na základe medzinárodných zmlúv a dohôd.
4.	Centrálny koordinačný orgán – ústredný orgán štátnej správy určený v Partnerskej dohode SR na roky 2014 – 2020 (ďalej aj "Partnerská dohoda") zodpovedný za efektívnu a účinnú koordináciu riadenia poskytovania príspevku z európskych štrukturálnych a investičných fondov v rámci Partnerskej dohody. V podmienkach Slovenskej republiky plní úlohy centrálneho koordinačného orgánu Úrad vlády SR.
5.	Certifikácia – potvrdenie správnosti, zákonnosti, oprávnenosti a overiteľnosti výdavkov vo vzťahu k systému riadenia a kontroly pri realizácii príspevku zo štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu.
6.	Certifikačný orgán – národný, regionálny alebo miestny verejný orgán alebo subjekt verejnej správy určený členským štátom za účelom certifikácie. Certifikačný orgán plní úlohu orgánu zodpovedného za koordináciu a usmerňovanie subjektov zapojených do systému finančného riadenia, vypracovanie účtov, vypracovanie žiadostí o platbu a ich predkladanie Európskej komisii, príjem platieb z Európskej komisie, vysporiadanie finančných vzťahov (najmä z titulu nezrovnalostí a finančných opráv) s Európskou komisiou a na národnej úrovni ako aj realizáciu platieb pre jednotlivé programy. V podmienkach Slovenskej republiky určuje certifikačný orgán vláda SR. 
7.	Certifikačné overovanie – je proces ktorý vykonáva certifikačný orgán v rámci svojich kompetencií s cieľom presvedčiť sa o správnosti, zákonnosti, oprávnenosti a overiteľnosti výdavkov, ako aj správnosti a zákonnosti postupu riadiaceho orgánu a platobnej jednotky pri realizácii príspevku.
8.	Cieľ Investovanie do rastu a zamestnanosti – cieľ EÚ umožňujúci podporu z európskych štrukturálnych a investičných fondov pre všetky regióny na úrovni NUTS 2 v intenzite stanovenej podľa kategórie regiónu (menej rozvinuté, prechodné, viac rozvinuté).
9.	Cieľ Európska územná spolupráca – cieľ EÚ umožňujúci podporu z Európskeho fondu regionálneho rozvoja zameranú na cezhraničnú, nadnárodnú a medziregionálnu spoluprácu. V podmienkach Slovenskej republiky a pre potreby tohto materiálu sa pod programami cieľa Európska územná spolupráca rozumejú Program Interreg V-A SK – CZ, Program Interreg V-A SK – AT a Program Interreg V-A SK – HU. Ide o programy, pri ktorých plní Ministerstvo financií SR funkciu certifikačného orgánu, okrem Programu spolupráce INTERACT III na programové obdobie 2014 – 2020.
10.	Čiastkový výkaz výdavkov – dokument obsahujúci súhrn výdavkov uskutočnených v priebehu stanoveného obdobia (okrem výdavkov zahrnutých v predchádzajúcich čiastkových výkazoch výdavkov) za príslušný program podľa jednotlivých zdrojov, na ktorého základe sa preplácajú zdroje Európskej únie. Čiastkový výkaz výdavkov je vypracovaný platobnou jednotkou a tvorí prílohu k súhrnnej žiadosti o platbu / mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu.
11.	Európsky fond regionálneho rozvoja – jeden z hlavných nástrojov štrukturálnej a regionálnej politiky EÚ, ktorý prispieva k financovaniu podpory, ktorej cieľom je posilniť hospodársku, sociálnu a územnú súdržnosť vyrovnávaním hlavných regionálnych rozdielov v Únii prostredníctvom udržateľného rozvoja a štrukturálneho prispôsobenia regionálnych hospodárstiev vrátane konverzie upadajúcich priemyselných regiónov a zaostávajúcich regiónov.
12.	Európska investičná banka – medzinárodná finančná a úverová inštitúcia poskytujúca úvery určené na spolufinancovanie projektov, resp. programových dokumentov.
13.	Európsky námorný a rybársky fond – finančný nástroj námornej a rybárskej politiky EÚ v programovom období 2014 – 2020 zameraný na podporu environmentálne udržateľného, inovačného a konkurencieschopného rybárstva a akvakultúry, podporu rozvoja a vykonávania integrovanej námornej politiky Únie spôsobom, ktorý dopĺňa politiku súdržnosti a spoločnú rybársku politiku, podporu vyváženého a inkluzívneho územného rozvoja rybolovných oblastí (vrátane akvakultúry a vnútrozemského rybolovu) a vykonávanie spoločnej rybárskej politiky.
14.	Európsky sociálny fond (ďalej aj "ESF") – jeden z hlavných nástrojov štrukturálnej a regionálnej politiky EÚ, ktorý podporuje vyššiu úroveň zamestnanosti a kvality práce, zlepšuje prístup na trh práce, podporuje geografickú a pracovnú mobilitu pracovníkov a uľahčuje ich prispôsobenie sa priemyselnej zmene a zmenám výrobného systému nevyhnutným na trvalo udržateľný rozvoj, podporuje vysoký stupeň vzdelania a odbornej prípravy pre všetkých a podporuje prechod medzi vzdelávaním a zamestnaním v prípade mladých ľudí, boj proti chudobe, zlepšuje sociálne začlenenie a podporuje rodovú rovnosť, nediskrimináciu a rovnaké príležitosti, čím prispieva k prioritám Únie, pokiaľ ide o posilňovanie hospodárskej, sociálnej a územnej súdržnosti.
15.	Európske štrukturálne a investičné fondy – spoločné označenie pre Európsky fond regionálneho rozvoja, Európsky sociálny fond, Kohézny fond, Európsky poľnohospodársky fond pre rozvoj vidieka a Európsky námorný a rybársky fond.
16.	Európsky úrad pre boj proti podvodom (ďalej aj "OLAF EK") – inštitúcia Európskej komisie, ktorej hlavným poslaním je ochrana finančných záujmov Európskej únie, boj proti podvodom, korupcii a akýmkoľvek iným nezákonným aktivitám.
17.	Finančné nástroje – aktivity definované v čl. 37 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013, ktorými sa môže prispievať predovšetkým na podporu malých a stredných podnikateľov, ako sú napr. fondy rizikového kapitálu, záručné fondy a pôžičkové fondy, a na fondy mestského rozvoja, ako sú napr. investície do verejno-súkromných partnerstiev a iných projektov vrátane integrovaného plánu pre udržateľný mestský rozvoj. V podmienkach Slovenskej republiky sa aktivity finančných nástrojov realizujú najmä prostredníctvom Slovenského investičného holdingu.
18.	Finančný rok – obdobie od 1. januára do 31. decembra daného kalendárneho roku.
19.	Finančný sprostredkovateľ – právnická osoba definovaná v § 3 písm. h) zákona č. 323/2015 Z. z. o finančných nástrojoch financovaných z európskych štrukturálnych a investičných fondov a o zmene a doplnení niektorých zákonov, ktorú prijímateľ poveril vykonávaním finančných nástrojov na základe zmluvy.
20.	Finančný záväzok – právny záväzok Európskej komisie voči SR na poskytnutie finančných prostriedkov za predpokladu, že sú splnené stanovené podmienky. Je určený na čerpanie počas viacerých finančných rokov. 
21.	Fond fondov – fond založený s cieľom poskytovať podporu z programov niekoľkým finančným nástrojom. Ak sú finančné nástroje implementované prostredníctvom fondu fondov, subjekt, ktorý vykonáva fond fondov, sa považuje za prijímateľa.
22.	Globálny grant – časť programu, ktorého riadením je poverený sprostredkovateľský orgán pre globálny grant riadiacim orgánom na základe písomnej zmluvy. 
23.	Hlavný cezhraničný partner – subjekt v pozícii partnera v rámci Programu Interreg V-A SK – CZ, Programu Interreg V-A SK – AT a Programu Interreg V-A SK – HU, ktorému sa na základe zmluvy o spolufinancovaní zo štátneho rozpočtu poskytujú prostriedky štátneho rozpočtu Slovenskej republiky na spolufinancovanie v prípade, kedy má hlavný prijímateľ projektu sídlo mimo územia Slovenskej republiky a zároveň je v rámci projektu viacero partnerov so sídlom v Slovenskej republike.
24.	Informačný systém účtovníctva fondov (ďalej len "ISUF") – samostatný účtovný systém, vyvíjaný a spravovaný certifikačným orgánom, subjektov zapojených do finančného riadenia a implementácie projektov štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu (certifikačný orgán a platobná jednotka) pre účtovanie transakcií týkajúcich sa projektov pri dodržaní jednotného postupu účtovania, poskytovania výstupov z účtovníctva a spracovania údajov vyhovujúcich požiadavkám Európskej komisie a požiadavkám národnej legislatívy pre vedenie účtovníctva. Prostredníctvom ISUF je zabezpečovaný aj výkon platieb certifikačného orgánu a platobných jednotiek.
25.	Iniciatíva na podporu zamestnanosti mladých ľudí – iniciatíva financovaná z osobitných rozpočtových prostriedkov a z cielených investícií z Európskeho sociálneho fondu na doplnenie a posilnenie podpory poskytovanej z európskych štrukturálnych a investičných fondov. Zameriava sa na podporu zamestnanosti mladých ako súčasť cieľa Investovanie do rastu zamestnanosti.
26.	IT monitorovací systém 2014+ (ďalej len "ITMS") – informačný systém, ktorý zahŕňa štandardizované procesy programového a projektového riadenia. Obsahuje údaje, ktoré sú potrebné na transparentné a efektívne riadenie, finančné riadenie a kontrolu poskytovania príspevku. Prostredníctvom ITMS sa elektronicky vymieňajú údaje s údajmi v informačných systémoch Európskej komisie určených pre správu európskych štrukturálnych a investičných fondov a s inými vnútroštátnymi informačnými systémami vrátane ISUF, pre ktorý je zdrojovým systémom v rámci integračného rozhrania. 
27.	Kategória regiónov – rozdelenie regiónov na úrovni NUTS 2 na "menej rozvinuté", "prechodné" a "viac rozvinuté" v súlade s čl. 90 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013.
28.	Kohézny fond – finančný nástroj EÚ určený na financovanie projektov dopravnej infraštruktúry a infraštruktúry životného prostredia pre členské krajiny, ktorých hodnota hrubého národného dôchodku na obyvateľa je menšia ako 90 % priemeru EÚ 27.
29.	Konečný prijímateľ – právnická alebo fyzická osoba, ktorej sú poskytované finančné prostriedky z finančných nástrojov.
30.	Koordinačný orgán pre finančné nástroje – samostatný útvar Ministerstva financií SR, ktorý plní úlohy v súlade s § 6 zákona č. 323/2015 Z. z. finančných nástrojoch financovaných z európskych štrukturálnych a investičných fondov a o zmene a doplnení niektorých zákonov a je zodpovedný za efektívnu a účinnú koordináciu implementácie finančných nástrojov. 
31.	Lehota – ak nie je v tomto dokumente uvedené inak, za dni sa považujú pracovné dni. Najneskôr do 31. decembra 2015 sa za moment, od ktorého začína plynúť lehota, považuje deň doručenia písomnej dokumentácie príslušnému subjektu a od spustenia elektronického predkladania dokumentácie sa za moment, od ktorého začína plynúť lehota, považuje deň prijatia dokumentácie príslušným subjektom v ITMS, ak nie je stanovené inak. Do plynutia lehoty sa nezapočítava deň, keď došlo k skutočnosti určujúcej začiatok lehoty. Lehoty určené podľa týždňov, mesiacov alebo rokov sa končia uplynutím toho dňa, ktorý sa svojím označením zhoduje s dňom, keď došlo k skutočnosti určujúcej začiatok lehoty. Ak taký deň v mesiaci nie je, lehota sa končí posledným dňom mesiaca. Lehota je zachovaná, ak sa posledný deň lehoty podanie podá na príslušný orgán, alebo ak sa podanie odovzdá na poštovú prepravu, ak nie je v tomto dokumente uvedené inak. V prípade, ak je koniec lehoty stanovený na konkrétny deň a ten pripadne na deň pracovného voľna alebo štátneho sviatku, za koniec lehoty sa považuje najbližší pracovný deň, ktorý nasleduje po dni pracovného voľna alebo štátneho sviatku.
32.	Memorandum o porozumení pre programy cieľa Európska územná spolupráca – medzinárodná zmluva podpísaná medzi Slovenskou republikou a partnerským štátom pre jednotlivé programy cieľa Európska územná spolupráca zamerané na cezhraničnú spoluprácu, ktorá podrobne stanovuje úlohy, právomoci a zodpovednosti jednotlivých orgánov zapojených do riadenia a implementácie spoločného programu. 
33.	Miera finančnej medzery – podiel diskontovaných nákladov počiatočnej investície, ktorý nie je pokrytý diskontovaným čistým výnosom projektu. V prípade projektov generujúcich príjmy finančná medzera predstavuje hodnotu celkových oprávnených výdavkov, na ktorú sa uplatňuje miera financovania stanovená Stratégiou financovania Európskych štrukturálnych a investičných fondov pre programové obdobie 2014 – 2020 v súlade s finančným plánom programu.
34.	Mimoriadna súhrnná žiadosť o platbu – doklad zostavený zo žiadostí o platbu, ktoré boli vrátené platobnej jednotke certifikačným orgánom a na základe ktorého certifikačný orgán schvaľuje oprávnené výdavky v príslušnom pomere a zodpovedajúcu úhradu platobnej jednotke (príloha 2a).
35.	Monitorovací výbor – orgán zriadený riadiacim orgánom pre program, ktorý skúma všetky otázky ovplyvňujúce výkonnosť programu vrátane záverov z preskúmania výkonnosti, poskytuje konzultácie. Monitorovací výbor skúma a schvaľuje všetky návrhy riadiaceho orgánu na zmenu programu. Monitorovací výbor pre program v rámci cieľa Európska územná spolupráca zriaďujú členské štáty zúčastnené na programe a po dohode s riadiacim orgánom aj tretie krajiny, ktoré prijali pozvanie zúčastniť sa na programe.
36.	Národný monitorovací výbor – orgán zriadený Úradom vlády SR, ktorého hlavnou úlohou je pravidelné sledovanie a vyhodnocovanie realizácie cieľa Investovanie do rastu a zamestnanosti a cieľa Európska územná spolupráca a vyhodnocovanie účinnosti vykonávania činností spojených s poskytovaním príspevku z fondov EÚ. Národný monitorovací výbor berie na vedomie návrhy riadiacich orgánov na presuny finančných prostriedkov medzi programami.
37.	Národný príspevok na spolufinancovanie – príspevok členského štátu na spolufinancovanie prostriedkov EÚ vyplateným mimo územia Slovenskej republiky orgánom zabezpečujúcim úhradu národného spolufinancovania hlavnému prijímateľovi / partnerovi v rámci programu Interreg V-A SK – CZ, Programu Interreg V-A SK – AT a Programu Interreg V-A SK – HU.
38.	Národný projekt – projekt realizovaný na návrh poskytovateľa prijímateľom, ktorý je určený v programe, jeho kompetencie vyplývajú z osobitných predpisov (napr. zákona č. 453/2003 Z. z., zákona č. 575/2001 Z. z., zákona č. 125/2006 Z. z.). Zoznam národných projektov schvaľuje monitorovací výbor alebo komisia zriadená riadiacim orgánom pri monitorovacom výbore. 
39.	Nezrovnalosť – akékoľvek porušenie práva Únie alebo vnútroštátneho práva týkajúceho sa jeho uplatňovania, vyplývajúce z konania alebo opomenutia hospodárskeho subjektu, ktorý sa zúčastňuje na vykonávaní európskych štrukturálnych a investičných fondov, dôsledkom čoho je alebo by bol negatívny dopad na rozpočet Únie zaťažením všeobecného rozpočtu neoprávneným výdavkom.
40.	Operácia – projekt alebo súbor projektov vybraných riadiacim orgánom príslušného programu, alebo na jeho zodpovednosť, ktorého vykonávanie prispieva k dosiahnutiu cieľov príslušného špecifického cieľa alebo cieľov prioritnej osi alebo prioritných osí. V prípade finančných nástrojov operáciu tvoria finančné príspevky z programu na finančné nástroje a následná finančná podpora, ktorú poskytujú finančné nástroje.
41.	Oprávnené výdavky – výdavky, ktoré boli skutočne vynaložené počas obdobia stanoveného v zmluve o poskytnutí nenávratného finančného príspevku alebo v zmluve o financovaní alebo v rozhodnutí o schválení žiadosti o nenávratný finančný príspevok vo forme nákladov alebo výdavkov prijímateľa, v relevantných prípadoch partnera, a ktoré boli vynaložené na operácie vybrané na podporu v rámci programov v súlade s kritériami výberu a obmedzeniami stanovenými nariadením Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013, nariadením Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1300/2013, nariadením Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1301/2013, nariadením Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1304/2013 a nariadením Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1299/2013 pri zohľadnení zjednodušeného vykazovania výdavkov v zmysle čl. 67 ods. 1 prvý pododsek písm. b), c) a d), čl. 68, čl. 69 ods. 1 a čl. 109 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a čl. 14 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1304/2013. V podmienkach Slovenskej republiky za stanovenie minimálnych štandardov k oprávnenosti výdavkov zodpovedá centrálny koordinačný orgán.
42.	Orgán auditu – národný, regionálny alebo miestny orgán verejnej moci alebo subjekt verejnej správy, ktorý je funkčne nezávislý od riadiaceho orgánu a certifikačného orgánu. V podmienkach Slovenskej republiky plní úlohy orgánu auditu Ministerstvo financií SR, ak vláda SR nerozhodne inak.
43.	Partner – osoba, ktorá sa spolupodieľa na príprave projektu so žiadateľom a ktorá sa spolupodieľa na realizácii projektu s prijímateľom podľa zmluvy o poskytnutí nenávratného finančného príspevku alebo podľa písomnej zmluvy uzavretej medzi prijímateľom a partnerom alebo ktorá sa spolupodieľa na realizácii projektu s prijímateľom podľa zmluvy alebo podľa písomnej zmluvy uzavretej medzi prijímateľom a partnerom (v texte aj "podľa zmluvy"). Partner, ktorý je účastníkom zmluvného vzťahu podľa § 25 ods. 3 zákona č. 292/2014 Z. z. o príspevku poskytovanom z európskych štrukturálnych a investičných fondov a o zmene a doplnení niektorých zákonov, má z hľadiska práv a povinností vyplývajúcich zo zmluvy o poskytnutí nenávratného finančného príspevku rovnocenné povinnosti a práva ako prijímateľ. V rámci Programu Interreg V-A SK – CZ, Programu Interreg V-A SK – AT a Programu Interreg V-A SK – HU je partnerom prijímateľ a vzťahy medzi hlavným prijímateľom a prijímateľom upravuje vždy osobitná zmluva. 
44.	Partnerská dohoda SR na roky 2014 – 2020 – dokument vypracovaný členským štátom v spolupráci s partnermi, ktorý nastavuje stratégiu, priority a implementačný mechanizmus európskych štrukturálnych a investičných fondov s cieľom efektívne a účinne dosahovať ciele stratégie Európa 2020. Partnerskú dohodu schvaľuje Európska komisia.
45.	Platba – finančný prevod príspevku alebo jeho časti.
46.	Platobná jednotka – ústredný orgán štátnej správy určený vládou SR alebo agentúra (pre program financovaný z Európskeho námorného a rybárskeho fondu v súlade s § 6 až 11 zákona č. 543/2007 Z. z. v znení neskorších predpisov) zodpovedné za prevod prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie prijímateľovi na základe vykonania kontroly žiadosti o platbu v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov. Platobnú jednotku určuje vláda SR v súlade s osobitným predpisom. Vo vzťahu k Štátnej pokladnici vystupuje platobná jednotka v mene príslušného ministerstva ako vnútorná organizačná jednotka klienta Štátnej pokladnice.
47.	Pomoc "de minimis" – pomoc poskytnutá jedinému podniku (v zmysle čl. 2, ods. 2 nariadenia Komisie (EÚ) č. 1407/2013), ktorá neprekročí súhrnne 200 000 EUR v priebehu troch fiškálnych rokov a jej poskytnutie je v súlade s právnym predpisom EÚ o poskytnutí pomoci "de minimis". Celková pomoc "de minimis" poskytnutá jedinému podniku (v zmysle čl. 2, ods. 2 nariadenia Komisie (EÚ) č. 1407/2013) pôsobiacemu v sektore cestnej nákladnej dopravy v prenájme alebo za úhradu nesmie prekročiť 100 000 EUR v priebehu troch fiškálnych rokov. Výška pomoci "de minimis" pre jeden podnik, ktorý poskytuje služby všeobecného hospodárskeho záujmu, nesmie prekročiť 500 000 EUR v priebehu troch fiškálnych rokov.
48.	Poskytnutie zálohovej platby prijímateľovi – poskytnutie nárokovaných finančných prostriedkov z výdavkov štátneho rozpočtu za zdroj EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie formou zálohovej platby pre projekty financované z Európskeho sociálneho fondu, resp. prijímateľovi – štátnej rozpočtovej organizácii pre projekty financované z Európskeho sociálneho fondu, Európskeho fondu regionálneho rozvoja, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu do výšky 40 % z relevantnej časti rozpočtu projektu zodpovedajúcej 12 mesiacom realizácie aktivít projektu po nadobudnutí účinnosti zmluvy o poskytnutí nenávratného finančného príspevku a začatí realizácie projektu. Za poskytnutú zálohovú platbu sa považuje každá jedna suma finančných prostriedkov poskytnutá prijímateľovi na základe jeho žiadosti o platbu (poskytnutie zálohovej platby) v zmysle časti 6.3 a časti 6.4. 
49.	Poskytnutie zálohovej platby sprostredkovateľskému orgánu pre globálny grant – poskytnutie nárokovaných finančných prostriedkov z výdavkov štátneho rozpočtu za zdroj EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie formou zálohovej platby pre projekty financované z Európskeho sociálneho fondu, Európskeho fondu regionálneho rozvoja, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu sprostredkovateľskému orgánu pre globálny grant, a to maximálne do výšky 40 % z programového príspevku zodpovedajúceho 12 mesiacom realizácie globálneho grantu po nadobudnutí účinnosti písomnej zmluvy uzatvorenej medzi riadiacim orgánom a sprostredkovateľským orgánom pre globálny grant.
50.	Poskytnutie predfinancovania prijímateľovi – poskytnutie nárokovaných finančných prostriedkov prijímateľovi pri projektoch financovaných z Európskeho fondu regionálneho rozvoja, Kohézneho fondu alebo Európskeho námorného a rybárskeho fondu, z výdavkov štátneho rozpočtu za zdroje Európskeho fondu regionálneho rozvoja, Kohézneho fondu, Európskeho námorného a rybárskeho fondu a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie na uhrádzanie záväzkov voči dodávateľovi / zhotoviteľovi na základe predloženia neuhradených účtovných dokladov vystavených dodávateľom / zhotoviteľom, ktoré prijímateľ predloží v lehote splatnosti.
51.	Prevod tranže prijímateľovi / holdingovému fondu – poskytnutie finančných prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie prijímateľovi / holdingovému fondu v rámci implementácie projektov finančných nástrojov na základe žiadosti o platbu.
52.	Prijímateľ – súkromná alebo verejná právnická osoba, v prípade Európskeho námorného a rybárskeho fondu aj fyzická osoba, zodpovedná za začatie alebo za začatie a implementáciu operácií. V kontexte schém štátnej pomoci a schém pomoci "de minimis" je prijímateľom podnik podľa čl. 107 ods. 1 Zmluvy o fungovaní EÚ, ktorý vykonáva hospodársku činnosť bez ohľadu na jeho právne postavenie a spôsob jeho financovania. Hospodárskou činnosťou je každá činnosť, ktorá spočíva v ponuke tovaru a / alebo služieb na trhu. V prípade finančných nástrojov je prijímateľom subjekt, ktorý implementuje finančný nástroj alebo fond fondov. V prípade implementácie globálneho grantu je prijímateľom orgán, organizácia, právnická osoba alebo administratívna jednotka, ktorej sprostredkovateľský orgán pre globálny grant poskytuje prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie na základe zmluvných podmienok. V prípade Programu Interreg V-A SK – CZ, Programu Interreg V-A SK – AT a Programu Interreg V-A SK – HU sa za prijímateľa považuje hlavný prijímateľ, ktorým je orgán, organizácia, právnická osoba alebo administratívna jednotka vystupujúca v mene projektového partnerstva pri projekte Programu Interreg V-A SK – CZ, Programu Interreg V-A SK – AT a Programu Interreg V-A SK – HU, a ktorej sú za účelom realizácie projektu alebo operácie poskytované prostriedky EÚ (Európskeho fondu regionálneho rozvoja) a prostriedky štátneho rozpočtu na spolufinancovanie (v prípade, ak je hlavný prijímateľ zo Slovenskej republiky) ako aj prijímateľ – európske zoskupenie územnej spolupráce a prijímateľ v prípade projektov technickej pomoci. Prijímateľom je osoba od nadobudnutia účinnosti zmluvy podľa § 25 zákona č. 292/2014 Z. z. o príspevku poskytovanom z európskych štrukturálnych a investičných fondov a o zmene a doplnení niektorých zákonov alebo právoplatnosti rozhodnutia o schválení žiadosti podľa § 16 ods. 2 zákona č. 292/2014 Z. z. o príspevku poskytovanom z európskych štrukturálnych a investičných fondov a o zmene a doplnení niektorých zákonov, ktorej bola schválená žiadosť v konaní podľa tohto zákona. Z hľadiska pravidiel štátnej pomoci, dátumom poskytnutia pomoci podľa schém štátnej pomoci a schém pomoci "de minimis" je dátum, kedy je prijímateľovi priznané zákonné právo prijať pomoc v súlade s uplatniteľným vnútroštátnym právnym poriadkom.
53.	Princíp "pro-rata" – pomerné financovanie výdavkov projektu s prospechom aj pre územie spadajúce do inej kategórie regiónov pre realizáciu aktivít projektu v prospech programu. Pre stanovenie percentuálnej výšky pomerného financovania sa použije ekvivalent viac rozvinutého regiónu (napr. podiel počtu obyvateľov Bratislavského kraja na celkovom počte obyvateľov Slovenska na základe údajov Štatistického úradu zo Sčítania obyvateľov, domov a bytov v roku 2011).
54.	Prioritná os – jedna z priorít stratégie v programe, ktorá sa skladá zo skupiny navzájom súvisiacich operácií (aktivít) s konkrétnymi, merateľnými cieľmi. V prípade Európskeho námorného a rybárskeho fondu sa pod prioritnou osou rozumie Priorita Únie.
55.	Príspevok – finančné prostriedky poskytované z Európskeho fondu regionálneho rozvoja, Európskeho sociálneho fondu, Kohézneho fondu, Európskeho námorného a rybárskeho fondu a finančné prostriedky štátneho rozpočtu na spolufinancovanie. Príspevok je poskytovaný vo forme nenávratného finančného príspevku na realizáciu projektu na základe zmluvy o poskytnutí nenávratného finančného príspevku podľa § 25 zákona č. 292/2014 Z. z. o príspevku poskytovanom z európskych štrukturálnych a investičných fondov a o zmene a doplnení niektorých zákonov alebo rozhodnutia o schválení žiadosti § 16 ods. 2 zákona č. 292/2014 Z. z. o príspevku poskytovanom z európskych štrukturálnych a investičných fondov a o zmene a doplnení niektorých zákonov alebo ako príspevok na finančný nástroj na základe zmluvy o financovaní podľa § 15 zákona č. 323/2015 Z. z. o finančných nástrojoch a o zmene a doplnení niektorých zákonov.
56.	Program – programový dokument vypracovaný členským štátom a schválený Európskou komisiou, ktorý určuje stratégiu s prínosom programu pre stratégiu Únie na zabezpečenie inteligentného, udržateľného a inkluzívneho rastu, a to aj v súlade s Partnerskou dohodou, stanovením priorít financovania, ktoré sa majú realizovať s pomocou európskych štrukturálnych a investičných fondov.
57.	Refundácia – poskytnutie finančných prostriedkov prijímateľovi na základe zmluvy o poskytnutí nenávratného finančného príspevku / rozhodnutia o schválení žiadosti o nenávratný finančný príspevok za zdroje EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie a na základe žiadosti o platbu prijímateľa formou vyhlásenia prijímateľa k deklarovaným výdavkom prijímateľa, ku ktorým sú doložené účtovné doklady1, ktoré prijímateľ uhradil najskôr z vlastných zdrojov. Prijímateľovi v rámci globálneho grantu sú poskytnuté finančné prostriedky sprostredkovateľským orgánom pre globálny grant v zmysle zmluvy podľa § 25 ods. 3 zákona č. 292/2014 Z. z. o príspevku poskytovanom z európskych štrukturálnych a investičných fondov a o zmene a doplnení niektorých zákonov.
58.	Riadiaci orgán – národný, regionálny alebo miestny orgán verejnej moci určený členským štátom, ktorý je určený na realizáciu programu a zodpovedá za riadenie programu v súlade so zásadou riadneho finančného hospodárenia. V podmienkach Slovenskej republiky určuje riadiaci orgán vláda SR. Pre účely tohto materiálu sa úlohy riadiaceho orgánu vzťahujú aj na sprostredkovateľské orgány, ak je to relevantné.
59.	Rozhodnutie o schválení žiadosti – rozhodnutie, ktoré vydáva štatutárny orgán riadiaceho orgánu, ktorým schvaľuje žiadosť o poskytnutie nenávratného finančného príspevku. Pre účely tohto materiálu sa pod rozhodnutím o schválení žiadosti rozumie rozhodnutie podľa § 16 ods. 2 zákona č. 292/2014 Z. z. o príspevku poskytovanom z európskych štrukturálnych a investičných fondov a o zmene a doplnení niektorých zákonov, a teda rozhodnutie o schválení žiadosti, ak je prijímateľ a riadiaci orgán tá istá osoba a rozhodnutie obsahuje aj práva a povinnosti riadiaceho orgánu aj prijímateľa.
60.	Schémy štátnej pomoci a schémy pomoci "de minimis" – dokumenty, ktoré presne stanovujú pravidlá a podmienky, na ktorých základe môžu poskytovatelia pomoci poskytnúť štátnu pomoc a pomoc "de minimis" jednotlivým prijímateľom. Schémy štátnej pomoci a schémy pomoci "de minimis" nie sú všeobecne záväzným právnym predpisom. Poskytovanie pomoci môžu schémy pomoci upravovať len v súlade s ich príslušným právnym základom a nemôžu byť nad rámec právneho základu. 
61.	Slovenský investičný holding – kapitálová spoločnosť zriadená a založená v zmysle príslušných ustanovení Obchodného zákonníka, ktorej zakladateľom je Slovenská záručná a rozvojová banka, a.s. ako finančná inštitúcia vlastnená SR zastúpenou Ministerstvom financií SR. Účelom zriadenia Slovenského investičného holdingu je implementácia finančných nástrojov z finančných príspevkov relevantných programov. Slovenský investičný holding je navrhovaný ako fond fondov, ktorý bude investovať prostriedky do jednotlivých fondov (vrátane osobitných fondov) alebo podfondov zriadených napr. správcom, Slovak Business Agency, finančným sprostredkovateľom a pod. Nevylučuje sa, že jednotlivé fondy a podfondy budú zriadené mimo územia Slovenskej republiky. Z hľadiska implementácie finančných nástrojov vystupuje Slovenský investičný holding v rámci finančného riadenia ako prijímateľ. 
62.	Spolupracujúci orgán – Úrad vládneho auditu alebo iná právnická osoba podľa osobitného predpisu (§ 4 a § 19 zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov), ktorí vykonávajú úlohy podľa osobitného predpisu (čl. 127 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013, čl. 25 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1299/2013) v spolupráci s orgánom auditu.
63.	Správa o zistenej nezrovnalosti – dokument vyplnený riadiacim orgánom, sprostredkovateľským orgánom, platobnou jednotkou, certifikačným orgánom, orgánom auditu a jeho spolupracujúcom orgánom alebo Úradu vládneho auditu, na ktorého základe je oficiálne zdokumentované podozrenie z nezrovnalosti alebo zistenie nezrovnalosti.
64.	Správa z kontroly – výstupný dokument z kontroly projektu (napr. žiadosti o platbu), ktorý vypracováva riadiaci orgán v zmysle postupov definovaných v Systéme riadenia európskych štrukturálnych a investičných fondov na programové obdobie 2014 – 2020. 
65.	Sprostredkovateľský orgán – ministerstvo, ostatný ústredný orgán štátnej správy, samosprávny kraj, obec alebo iná právnická osoba, ktorá má odborné, personálne a materiálne predpoklady určená na plnenie určitých úloh riadiaceho orgánu podľa čl. 123 ods. 6 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a to na základe písomného poverenia riadiaceho orgánu sprostredkovateľskému orgánu na výkon časti úloh riadiaceho orgánu.
66.	Sprostredkovateľský orgán pre globálny grant – ministerstvo, ostatný ústredný orgán štátnej správy, samosprávny kraj, obec poverená riadením časti programu podľa čl. 123 ods. 7 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 formou písomnej zmluvy uzavretej medzi sprostredkovateľským orgánom pre globálny grant a riadiacim orgánom po overení solventnosti, spôsobilosti v príslušnej oblasti, kapacity administratívneho a finančného riadenia sprostredkovateľského orgánu pre globálny grant. Pri implementácii časti programu formou globálneho grantu plní sprostredkovateľský orgán pre globálny grant aj platobnú funkciu pri realizácii platieb prijímateľovi alebo partnerovi.
67.	Súhrnná žiadosť o platbu – doklad zostavený zo žiadostí o platbu, na základe ktorého certifikačný orgán schvaľuje oprávnené výdavky v príslušnom pomere a zodpovedajúcu úhradu platobnej jednotke (príloha 2a).
68.	Systém finančného riadenia štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu – súhrn pravidiel, postupov a činností financovania príspevku. Systém finančného riadenia zahŕňa finančné plánovanie a rozpočtovanie, riadenie a realizáciu toku finančných prostriedkov, účtovanie, výkazníctvo a monitorovanie finančných tokov, certifikáciu a vysporiadanie finančných vzťahov voči Slovenskej republike a voči Európskej komisii. 
69.	Systémová nezrovnalosť – každá nezrovnalosť, ktorá sa môže vyskytnúť opakovane s vysokou pravdepodobnosťou výskytu pri podobnom type operácií a ktorá je dôsledkom závažného nedostatku účinného fungovania systémov riadenia a kontroly, a to vrátane nestanovenia vhodných postupov implementácie podľa nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a pravidiel pre jednotlivé fondy.
70.	Štátna pokladnica – orgán štátnej správy zriadený v zmysle zákona č. 291/2002 Z. z. o Štátnej pokladnici a o zmene a doplnení niektorých zákonov v znení neskorších predpisov zabezpečujúci sústavu činností v rámci systému Štátnej pokladnice, najmä centralizáciu riadenia verejných financií, realizáciu rozpočtu subjektov verejnej správy, vedenie a správu účtov klientov a realizáciu platobného styku klientov.
71.	Štátna pomoc – akákoľvek pomoc poskytovaná z prostriedkov štátneho rozpočtu alebo akoukoľvek formou z verejných zdrojov podniku podľa čl. 107 ods. 1 Zmluvy o fungovaní EÚ, ktorá narúša súťaž alebo hrozí narušením súťaže tým, že zvýhodňuje určité podniky alebo výrobu určitých druhov tovarov a môže nepriaznivo ovplyvniť obchod medzi členskými štátmi Európskej únie.
72.	Štrukturálne fondy – nástroje štrukturálnej politiky EÚ využívané na dosiahnutie jej cieľov. K štrukturálnym fondom patria Európsky fond regionálneho rozvoja a Európsky sociálny fond.
73.	Ukončená operácia – operácia, ktorej realizácia bola fyzicky ukončená alebo bola plne implementovaná a všetky platby vzťahujúce sa na túto operáciu boli uhradené prijímateľom a zároveň príslušný verejný príspevok bol vyplatený prijímateľovi. 
74.	Užívateľ – osoba, ktorej prijímateľ alebo partner poskytuje príspevok alebo jeho časť za podmienok určených vo výzve alebo vo vyzvaní pre národný projekt na základe predchádzajúceho písomného súhlasu poskytovateľa a v súlade so zmluvou uzavretou medzi prijímateľom a užívateľom alebo partnerom a užívateľom. 
75.	Účtovný doklad – doklad definovaný v § 10 ods. 1 zákona č. 431/2002 Z. z. o účtovníctve v znení zákona č. 198/2007 Z. z. Na účely predkladania žiadostí o platbu (predfinancovanie, refundácia – priebežná platba, zúčtovanie zálohovej platby) sa vyžaduje splnenie náležitostí definovaných v § 10 ods. 1 písm. a) až f) predmetného zákona, pričom za dostatočné splnenie náležitosti podľa písm. f) sa považuje vyhlásenie prijímateľa v žiadosti o platbu v časti Čestné vyhlásenie v znení: "1. nárokovaná suma zodpovedá údajom uvedeným v účtovných dokladoch, je matematicky správna a vychádza z účtovníctva týkajúceho sa projektu; 2. deklarované výdavky sú oprávnené a boli skutočne realizované v súlade s ustanoveniami zmluvy o poskytnutí nenávratného finančného príspevku, zmluvy o financovaní, písomnej zmluvy uzatvorenej medzi riadiacim orgánom a sprostredkovateľským orgánom pre globálny grant alebo s rozhodnutím o schválení žiadosti o nenávratný finančný príspevok; 3. k deklarovaným výdavkom existuje overiteľná podporná dokumentácia, pričom originály dokumentácie k platbe definované v zozname príloh sú v mojej držbe, podpísané a prístupné pre účely auditu a kontroly; 4. deklarované výdavky sú v súlade s právnymi predpismi EÚ a SR; 5. požiadavky na informovanie verejnosti boli dodržané v súlade s ustanoveniami zmluvy o poskytnutí nenávratného finančného príspevku, zmluvy o financovaní, písomnej zmluvy uzatvorenej medzi riadiacim orgánom a sprostredkovateľským orgánom pre globálny grant alebo s rozhodnutím o schválení žiadosti o nenávratný finančný príspevok. Som si vedomý skutočnosti, že v prípade nesplnenia podmienok zmluvy alebo v prípade nesprávne nárokovaných finančných prostriedkov v tejto žiadosti je možné, že príspevok nebude vyplatený, bude upravený alebo bude vyžiadané vrátenie neoprávnene vyplatených finančných prostriedkov."
V súvislosti s postúpením pohľadávky sa z pohľadu splnenia požiadaviek nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 za účtovný doklad, ktorého dôkazná hodnota je rovnocenná faktúram, považuje aj doklad preukazujúci vykonanie započítania.
76.	Účtovný rok – obdobie od 1. júla do 30. júna nasledujúceho finančného roka s výnimkou prvého účtovného roka v rámci programového obdobia 2014 – 2020, ktorý trvá od 1. januára 2014 do 30. júna 2015. Posledný účtovný rok programového obdobia 2014 – 2020 trvá od 1. júla 2023 do 30. júna 2024. Pre účely systému finančného riadenia štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu v podmienkach SR sa za účtovný rok považuje obdobie od 1. apríla do 31. marca nasledujúceho finančného roka s výnimkou prvého účtovného roka v rámci programového obdobia 2014 – 2020, ktorý trvá od 1. januára 2014 do 31. marca 2015. Posledný účtovný rok programového obdobia 2014 – 2020 trvá od 1. apríla 2023 do 31. marca 2024. Za každý účtovný rok sa zostavujú účty, ktoré zodpovedajú výdavkom zaúčtovaným v účtovníctve certifikačného orgánu a výdavkom zahrnutých v žiadostiach o platbu predložených Európskej komisii do 30. apríla.
77.	Účty – dokument vypracovaný certifikačným orgánom v súlade s čl. 137 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a predkladaný Európskej komisii v súlade s čl. 59 ods. 5 písm. a) nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 966/2012 certifikačným orgánom za každý program.
78.	Úhrada účtovného dokladu – predstavuje úhradu záväzku alebo pohľadávky prijímateľa / riadiaceho orgánu / platobnej jednotky / certifikačného orgánu. V súvislosti so vzájomným započítaním pohľadávky a záväzku, záväzok prijímateľa (napr. z titulu nezrovnalosti) vysporiadaný formou vzájomného započítania pohľadávky a záväzku sa považuje za uhradený momentom schválenia zníženej pohľadávky prijímateľa z poskytnutého nenávratného finančného príspevku v súhrnnej žiadosti o platbu, resp. mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu.
79.	Veľký projekt – projekt financovaný z Európskeho fondu regionálneho rozvoja alebo Kohézneho fondu podľa čl. 100 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013, ktorého celkové oprávnené náklady presahujú 50 mil. EUR, resp. 75 mil. EUR v prípade projektov, ktoré prispievajú k tematickému cieľu – podpora udržateľnej dopravy a odstraňovanie prekážok v kľúčových sieťových infraštruktúrach. Finančné nástroje sa nepovažujú za veľké projekty.
80.	Verejné výdavky – všetky verejné príspevky na financovanie operácií, ktoré pochádzajú z rozpočtu národných, regionálnych a miestnych orgánov verejnej správy, rozpočtu Európskej únie, rozpočtu verejnoprávnych subjektov alebo rozpočtu združení orgánov verejnej správy alebo verejnoprávnych subjektov a na účely stanovenia podielu spolufinancovania pre program alebo prioritné osi Európskeho sociálneho fondu môže zahŕňať prípadné finančné zdroje, ktorými kolektívne prispeli zamestnávatelia a zamestnanci. 
81.	Verejnoprávny subjekt – každý subjekt, ktorý sa riadi verejným právom v zmysle čl. 1 ods. 9 smernice Európskeho parlamentu a Rady (ES) č. 18/2004 z 31. marca 2004 o koordinácii postupov zadávania verejných zákaziek na práce, verejných zákaziek na dodávku tovaru a verejných zákaziek na služby, a každé európske zoskupenie územnej spolupráce zriadené v súlade s nariadením Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1302/2013 alebo vzniknuté podľa zákona č. 90/2008 Z. z., bez ohľadu na to, či sa európske zoskupenie územnej spolupráce považuje podľa právnych predpisov Slovenskej republiky za verejnoprávny subjekt alebo subjekt súkromného práva. 
82.	Viazaný účet ("Escrow account") – je bankový účet zabezpečený písomnou dohodou medzi riadiacim orgánom alebo sprostredkovateľským orgánom a orgánom vykonávajúcim finančný nástroj alebo v prípade operácie verejno-súkromného partnerstva písomnou dohodou medzi verejným subjektom ako prijímateľom a súkromným partnerom, ktorý bol schválený riadiacim orgánom alebo sprostredkovateľským orgánom, osobitne zriadený na účely držby finančných prostriedkov vyplácaných po uplynutí obdobia oprávnenosti, a to výlučne na účely uvedené v čl. 42 ods. 1 písm. c), v čl. 42 ods. 2, čl. 42 ods. 3 a čl. 64 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2014, alebo bankový účet zriadený za podmienok zabezpečujúcich rovnocenné záruky za platby vyplácané z fondov.
83.	Vládny audit – vládnym auditom sa rozumie nezávislá, objektívna, overovacia, hodnotiaca a uisťovacia činnosť vykonávaná podľa zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov so zohľadnením medzinárodne uznávaných audítorských štandardov.
84.	Vlastné zdroje prijímateľa – finančné prostriedky, ktorými sa podieľa prijímateľ na financovaní operácie v stanovenej výške a určenom podiele. Za tieto zdroje sa považujú aj tie prostriedky, ktoré prijímateľ získal z iného zdroja (okrem zdroja nenávratného finančného príspevku – štátneho rozpočtu na spolufinancovanie a zdroja EÚ), ako napr. úver z banky alebo príspevok tretej osoby.
85.	Výkaz výdavkov – dokument obsahujúci oprávnené výdavky uskutočnené v priebehu stanoveného obdobia oprávnenosti za príslušný program. Výkaz výdavkov je vypracovaný certifikačným orgánom a tvorí prílohu k žiadosti o platbu na Európsku komisiu.
86.	Výkonnostná rezerva – finančná čiastka predstavujúca časť zdrojov Európskeho fondu regionálneho rozvoja, Európskeho sociálneho fondu, Kohézneho fondu v rámci cieľa Investovanie do rastu a zamestnanosti, ako aj Európskeho námorného a rybárskeho fondu. Výkonnostná rezerva tvorí 5 % až 7 % pridelených prostriedkov na každú prioritnú os v rámci programov financovaných z Európskeho fondu regionálneho rozvoja, Európskeho sociálneho fondu a Kohézneho fondu a prioritu Únie v rámci Európskeho námorného a rybárskeho fondu, s výnimkou prioritných osí / priorít Únie venovaných technickej pomoci. Celková výška výkonnostnej rezervy pridelenej na európske štrukturálne a investičné fondy a kategóriu regiónov je 6 %. 
87.	Zdroj "pro-rata" – zdroje štátneho rozpočtu určené na krytie výdavkov ekvivalentu viac rozvinutého regiónu v prípade:
•	ak je prioritná os financovaná len z kategórie menej rozvinutého regiónu alebo
•	ak je prioritná os financovaná z oboch kategórií regiónov, boli splnené podmienky a limity v zmysle čl. 70 ods. 2 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a čl. 13 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1304/2013 a došlo k vyčerpaniu alokácie viac rozvinutého regiónu.
88.	Zmluva o financovaní – znamená zmluvu podľa § 15 zákona č. 323/2015 Z. z. o finančných nástrojoch financovaných z európskych štrukturálnych a investičných fondov a o zmene a doplnení niektorých zákonov uzavretú medzi riadiacim orgánom a prijímateľom, ktorá upravuje práva a povinnosti riadiaceho orgánu a prijímateľa pri vykonávaní finančných nástrojov. Ak sa finančné nástroje vykonávajú prostredníctvom fondu fondov, zmluva o financovaní je trojstrannou zmluvou, pričom fond fondov a správca fondu fondov sú zmluvnými stranami zmluvy o financovaní. Príslušný riadiaci orgán prevedie za podmienok uvedených v tejto zmluve prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie za účelom ich vloženia do fondu fondov a vykonávania jeho činnosti.
89.	Zmluva o poskytnutí nenávratného finančného príspevku – podrobná zmluva o podpore projektu financovaného zo štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu alebo Európskeho námorného a rybárskeho fondu a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie uzatvorená medzi riadiacim orgánom a prijímateľom určujúca podmienky poskytnutia príspevku, ako aj práva a povinnosti zúčastnených strán. Pre potreby tohto materiálu sa pod zmluvou o poskytnutí nenávratného finančného príspevku rozumie aj v relevantných prípadoch "Rozhodnutie o schválení žiadosti", kedy je poskytovateľ a prijímateľ tá istá osoba. V rámci implementácie Programu Interreg V-A SK – CZ, Programu Interreg V-A SK – AT a Programu Interreg V-A SK – HU je zmluva o poskytnutí nenávratného finančného príspevku uzatvorená medzi riadiacim orgánom a hlavným prijímateľom, pričom sa v taktom prípade zmluvou o poskytnutí nenávratného finančného príspevku poskytuje iba zdroj EÚ. Prostriedky štátneho rozpočtu na spolufinancovanie sa poskytujú na základe zmluvy o poskytnutí spolufinancovania.
90.	Zmluva o spolufinancovaní – zmluva, na základe ktorej sa poskytuje spolufinancovanie zo štátneho rozpočtu Slovenskej republiky pre hlavných prijímateľov / partnerov so sídlom v Slovenskej republike v rámci programov Interreg V-A SK – CZ, Interreg V-A SK – AT a Interreg V-A SK – HU. Zmluva sa uzatvára medzi riadiacim orgánom a hlavným prijímateľom (ak má sídlo v Slovenskej republike) alebo hlavným cezhraničným partnerom (ak hlavný prijímateľ nemá sídlo v Slovenskej republike). 
91.	Zúčtovanie zálohovej platby – predloženie žiadosti o platbu (zúčtovanie zálohovej platby) prijímateľom, resp. sprostredkovateľským orgánom pre globálny grant riadiacemu orgánu v zmysle podmienok uvedených v časti 6.3, 6.4, resp. 6.8. Pre splnenie povinnosti zúčtovania 100 % z poskytnutej zálohovej platby do 9 mesiacov, resp. do 12 mesiacov pri implementácii časti programu formou globálneho grantu odo dňa pripísania finančných prostriedkov na účte prijímateľa / na účte sprostredkovateľského orgánu pre globálny grant / aktivácie rozpočtového opatrenia sa považuje:
a)	odoslanie žiadosti o platbu (zúčtovanie zálohovej platby) prijímateľom / sprostredkovateľským orgánom pre globálny grant cez verejnú časť ITMS riadiacemu orgánu najneskôr v posledný deň uvedeného obdobia 9 mesiacov, resp. 12 mesiacov v prípade implementácie časti programu formou globálneho grantu a súčasne
b)	do 31. decembra 2015 aj odoslanie písomnej verzie žiadosti o platbu (zúčtovanie zálohovej platby) riadiacemu orgánu, resp. osobné doručenie písomnej žiadosti o platbu (zúčtovanie zálohovej platby) riadiacemu orgánu najneskôr do 3 pracovných dní odo dňa odoslania žiadosti o platbu (zúčtovanie zálohovej platby) cez verejnú časť ITMS. V prípade neodoslania, resp. osobného nedoručenia písomnej verzie žiadosti o platbu (zúčtovanie zálohovej platby) riadiacemu orgánu najneskôr do 3 pracovných dní odo dňa odoslania žiadosti o platbu (zúčtovanie zálohovej platby) cez verejnú časť ITMS, je riadiaci orgán oprávnený predmetnú žiadosť o platbu (zúčtovanie zálohovej platby) vo verejnej časti ITMS zamietnuť
c)	vrátenie celej sumy poskytnutej zálohovej platby, resp. nezúčtovaného rozdielu do 100 % z poskytnutej zálohovej platby platobnej jednotke.
92.	Žiadosť o platbu – doklad, na ktorého základe je prijímateľovi alebo partnerovi podľa zmluvy o poskytnutí nenávratného finančného príspevku poskytovaný príspevok, t. j. prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie v príslušnom pomere. Žiadosť o platbu prijímateľ eviduje v ITMS (príloha 1a).
93.	Žiadosť o platbu (finančné nástroje) – doklad, na ktorého základe je prijímateľovi podľa zmluvy o financovaní poskytovaný príspevok, t. j. prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie v príslušnom pomere. Žiadosť o platbu (finančné nástroje) prijímateľ eviduje v ITMS (príloha 1c). Do času spustenia verejnej časti ITMS prijímateľ predkladá žiadosť o platbu (finančné nástroje) v papierovej forme a evidencia v ITMS sa jednotlivými subjektmi vykoná dodatočne.
94.	Žiadosť o platbu (globálny grant) – doklad, na ktorého základe je sprostredkovateľskému orgánu pre globálny grant podľa písomnej zmluvy uzatvorenej medzi riadiacim orgánom a sprostredkovateľským orgánom pre globálny grant poskytovaný príspevok, t. j. prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie v príslušnom pomere. Žiadosť o platbu (globálny grant) sprostredkovateľský orgán pre globálny grant eviduje v ITMS (príloha 1e).
95.	Žiadosť o vrátenie finančných prostriedkov – doklad, ktorý pozostáva z formuláru žiadosti o vrátenie finančných prostriedkov a príloh, na ktorých základe má prijímateľ povinnosť vrátiť finančné prostriedky v príslušnom pomere na stanovené bankové účty.
3	Subjekty zapojené do finančného riadenia a ich zodpovednosť
Do systému finančného riadenia štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu sú zapojené nasledovné subjekty:
a)	centrálny koordinačný orgán a koordinačný orgán pre finančné nástroje,
b)	riadiace orgány,
c)	sprostredkovateľské orgány,
d)	certifikačný orgán,
e)	platobné jednotky,
f)	monitorovacie výbory.
Pri zabezpečovaní svojich úloh a zodpovedností vyššie uvedené subjekty komunikujú a spolupracujú s nasledovnými subjektmi:
a)	orgán auditu,
b)	príslušné orgány vydávajúce rozhodnutie v správnom konaní,
c)	orgán zabezpečujúci ochranu finančných záujmov.
Hlavnou zásadou pri určení subjektov zapojených do riadenia štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu je náležité oddelenie funkcií riadiaceho orgánu, certifikačného orgánu a orgánu auditu.
3.1	Centrálny koordinačný orgán a Koordinačný orgán pre finančné nástroje
3.1.1	Centrálny koordinačný orgán
Funkciu a úlohy centrálneho koordinačného orgánu pre programy Partnerskej dohody plní v súlade s čl. 123 ods. 8 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2014 Úrad vlády SR.
Centrálny koordinačný orgán vykonáva úlohy v súlade s ustanovením § 6 zákona č. 292/2014 Z. z. o príspevku poskytovanom z európskych štrukturálnych a investičných fondov a o zmene a doplnení niektorých zákonov, pričom vo vzťahu k finančnému riadeniu štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu zabezpečuje najmä:
1.	stanovenie minimálnych štandardov k oprávnenosti výdavkov na národnej úrovni;
2.	vydávanie a aktualizáciu Systému riadenia európskych štrukturálnych a investičných fondov pre programové obdobie 2014 – 2020, metodických pokynov a príručiek centrálneho koordinačného orgánu a výkladov centrálneho koordinačného orgánu k systému riadenia a kontroly pre programové obdobie 2014 – 2020 a v spolupráci s certifikačným orgánom vypracovanie vzoru zmluvy o poskytnutí nenávratného finančného príspevku;
3.	vybudovanie a správu ITMS. Procesy a funkcionality ITMS vzťahujúce sa k systému finančného riadenia sú vybudované a spravované v spolupráci s certifikačným orgánom;
4.	v spolupráci s riadiacimi orgánmi navrhovanie realokácií prostriedkov medzi programami, ich predkladanie na posúdenie Ministerstvu financií SR a koordináciu komunikácie s Európskou komisiou na základe žiadosti riadiaceho orgánu.
Bližšia úprava postavenia a úloh centrálneho koordinačného orgánu je upravená v Systéme riadenia európskych štrukturálnych a investičných fondov pre programové obdobie 2014 – 2020.
3.1.2	Koordinačný orgán pre finančné nástroje
Funkciu a úlohy koordinačného orgánu pre finančné nástroje plní Ministerstvo financií SR v súlade s § 6 zákona č. 323/2015 Z. z. o finančných nástrojoch financovaných z európskych štrukturálnych a investičných fondov a o z mene a doplnení niektorých zákonov. Koordinačný orgán pre finančné nástroje vo vzťahu k finančnému riadeniu finančných nástrojov financovaných zo štrukturálnych fondov a Kohézneho fondu zabezpečuje najmä:
1.	vydávanie a aktualizáciu Systému riadenia finančných nástrojov financovaných z Kohézneho fondu, Európskeho fondu regionálneho rozvoja a Európskeho sociálneho fondu na programové obdobie 2014 – 2020, metodických pokynov, výkladov, vzorov, výnimiek a stanovísk k implementácii finančných nástrojov;
2.	vydáva vzor zmluvy o financovaní ako prílohu Systému riadenia finančných nástrojov financovaných z Kohézneho fondu, Európskeho fondu regionálneho rozvoja a Európskeho sociálneho fondu na programové obdobie 2014 – 2020;
3.	spolupracuje s centrálnym koordinačným orgánom pri plnení svojich úloh, najmä pri tvorbe ITMS pre oblasť finančných nástrojov.
Bližšia úprava postavenia a úloh koordinačného orgánu pre finančné nástroje je upravená v Systéme riadenia finančných nástrojov financovaných z Kohézneho fondu, Európskeho fondu regionálneho rozvoja a Európskeho sociálneho fondu na programové obdobie 2014 – 2020.
3.2	Riadiace orgány
Orgány zodpovedné za riadenie a kontrolu programov určuje vláda SR v súlade s čl. 124 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a s kompetenčným zákonom. Každý riadiaci orgán môže písomne poveriť sprostredkovateľský orgán vykonávaním časti svojich úloh alebo poveriť sprostredkovateľský orgán pre globálny grant riadením časti programu na základe písomnej zmluvy po overení splnenia podmienok stanovených v čl. 123 ods. 7 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2014. Celková zodpovednosť za program však ostáva riadiacemu orgánu. 
Jednotlivé riadiace orgány vo vzťahu k finančnému riadeniu štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu zabezpečujú najmä:
Vo vzťahu k nastaveniu systému implementácie programu:
1.	vypracovanie podrobnejšieho finančného plánu v zmysle usmernenia certifikačného orgánu;
2.	vypracovanie manuálu procedúr riadiaceho orgánu a jeho zavedenie ako organizačnej smernice organizácie a predkladanie manuálu procedúr riadiaceho orgánu vrátane jeho akýchkoľvek zmien s označením čísla verzie a dátumu platnosti elektronicky s naskenovanou stranou obsahujúcou podpis zodpovednej osoby certifikačnému orgánu na e-mailovú adresu CO_manual@mfsr.sk a orgánu auditu na e-mailovú adresu manualy@mfsr.sk, a to najneskôr do 10 pracovných dní od schválenia zodpovedným vedúcim. Maximálna veľkosť odosielaných dokumentov je 5 MB. Ak odosielaný manuál procedúr je rozsiahlejší, je potrebné ho rozdeliť a zaslať na vyššie uvedené e-mailové adresy po častiach;
3.	predkladanie interných pokynov (postupov, príručiek atď.), ktoré všeobecne dopĺňajú postupy riadiaceho orgánu, elektronicky s naskenovanou stranou obsahujúcou podpis zodpovednej osoby certifikačnému orgánu na e-mailovú adresu CO_manual@mfsr.sk a orgánu auditu na e-mailovú adresu manualy@mfsr.sk, a to najneskôr do 10 pracovných dní od schválenia zodpovedným vedúcim. Maximálna veľkosť odosielaných dokumentov je 5 MB. Ak sú odosielané interné pokyny rozsiahlejšie, je potrebné ich rozdeliť a zaslať po častiach;
Vo vzťahu k implementácii a finančnému riadeniu projektov:
4.	dodržiavanie usmernení certifikačného orgánu k systému finančného riadenia štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu a podrobnejšiu úpravu pravidiel finančného riadenia vo vzťahu k prijímateľom v súlade s týmto materiálom vrátane vydania verejne dostupných metodických usmernení (príručiek) k finančnému riadeniu príslušného programu pre prijímateľov v súlade s týmto materiálom;
5.	evidovanie a aktualizovanie údajov súvisiacich s využívaním poskytnutého príspevku v ITMS;
6.	predkladanie Informácie o realizovaní operačného programu, ktorú riadiaci orgán vypracováva v zmysle Systému riadenia európskych štrukturálnych a investičných fondov na programové obdobie 2014 – 2020 (v rozsahu stanovenom metodickým pokynom centrálneho koordinačného orgánu č. 10 k obsahu informácie o realizovaní operačného programu), elektronicky na vedomie certifikačnému orgánu na e-mailovú adresu co@mfsr.sk, a to v lehote stanovenej Systémom riadenia európskych štrukturálnych a investičných fondov na programové obdobie 2014 – 2020. Maximálna veľkosť odosielaných dokumentov je 5 MB. Ak sú odosielané interné pokyny rozsiahlejšie, je potrebné ich rozdeliť a zaslať po častiach;
7.	informovanie certifikačného orgánu o pripravovaných zasadnutiach komisií na výber žiadostí o nenávratný finančný príspevok elektronicky na e-mailovú adresu co@mfsr.sk, pred zasadnutím komisie pre výber žiadostí o nenávratný finančný príspevok, ak je relevantné;
8.	predkladanie kópií záverečných správ z výberu žiadostí o nenávratný finančný príspevok certifikačnému orgánu najneskôr do 5 pracovných dní od schválenia, ak je relevantné. Riadiaci orgán môže využiť na predloženie naskenovanej verzie záverečnej správy z výberu žiadostí o nenávratný finančný príspevok e-mailovú adresu co@mfsr.sk;
9.	dodržiavanie pravidiel a podmienok poskytnutia pomoci podľa schém štátnej pomoci a schém pomoci "de minimis", ak je relevantné;
10.	uzatváranie zmluvy o poskytnutí nenávratného finančného príspevku a jej dodatkov, vrátane stanovenia možných sankcií v prípade nesplnenia zmluvných podmienok a v relevantných prípadoch uzatváranie zmlúv o financovaní s prijímateľom – v rámci implementácie finančných nástrojov;
11.	dodržiavanie postupov vzťahujúcich sa k využitiu zdrojov financovania pri projektoch financovaných na základe princípu "pro-rata" v zmysle časti 4.5.4;
12.	spolufinancovanie programu zo štátneho rozpočtu a overenie spolufinancovania jednotlivých projektov z vlastných zdrojov prijímateľa;
13.	predloženie žiadosti o potvrdenie pomoci pre veľký projekt podľa čl. 101 ods. 1 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 na posúdenie certifikačnému orgánu elektronicky na e-mailovú adresu co@mfsr.sk pred jej predložením Európskej komisii;
14.	zaslanie rozhodnutia Európskej komisie o schválení, resp. neschválení veľkého projektu certifikačnému orgánu elektronicky na e-mailovú adresu co@mfsr.sk do 10 pracovných dní od jeho doručenia;
15.	predloženie návrhu zmluvy o poskytnutí nenávratného finančného príspevku týkajúcej sa veľkého projektu na posúdenie certifikačnému orgánu elektronicky na e-mailovú adresu co@mfsr.sk pred jeho uzatvorením s prijímateľom a informovanie certifikačného orgánu elektronicky na e-mailovú adresu co@mfsr.sk o uzatvorení zmluvy o poskytnutí nenávratného finančného príspevku týkajúcej sa veľkého projektu do 10 pracovných dní od jej uzavretia;
16.	kontrolu zoznamu deklarovaných výdavkov v prípade hlavného prijímateľa / partnera zo Slovenskej republiky v rámci Programu Interreg V-A SK – CZ, Programu Interreg V-A SK – AT a Programu Interreg V-A SK – HU podľa čl. 23 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1299/2013 a v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov, ktorá je začatá chronologicky podľa dátumu ich prijatia. Táto kontrola sa vykonáva v zmysle zásad a postupov definovaných v platnom Systéme riadenia európskych štrukturálnych a investičných fondov na programové obdobie 2014 – 2020, resp. v súlade s usmernením riadiaceho orgánu;
17.	kontrolu žiadostí o platbu podľa čl. 125 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013, v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov, ktorá je začatá chronologicky podľa dátumu ich prijatia riadiacim orgánom. Táto kontrola sa vykonáva v zmysle zásad a postupov definovaných v platnom Systéme riadenia európskych štrukturálnych a investičných fondov na programové obdobie 2014 – 2020 a na základe podmienok a postupov definovaných v Systéme riadenia finančných nástrojov financovaných z Kohézneho fondu, Európskeho fondu regionálneho rozvoja a Európskeho sociálneho fondu na programové obdobie 2014 – 2020;
18.	schvaľovanie žiadosti o platbu predloženej prijímateľom, resp. hlavným prijímateľom v rámci Programu Interreg V-A SK – CZ, Programu Interreg V-A SK – AT a Programu Interreg V-A SK – HU;
19.	schvaľovanie žiadosti o platbu (globálny grant) predloženej sprostredkovateľským orgánom pre globálny grant;
20.	riadiaci orgán je oprávnený pozastaviť platby pre projekt alebo jeho časti, ak má podozrenie, že vznikli nedostatky v postupe prijímateľa / hlavného prijímateľa, partnera, užívateľa alebo osoby, ktorá má k prijímateľovi / hlavnému prijímateľovi, partnerovi alebo užívateľovi vzťah dodávateľa tovarov, prác alebo služieb pri realizácii projektu. Riadiaci orgán je oprávnený schváliť deklarované výdavky vo výške zníženej o sumu neoprávnených výdavkov, schváliť deklarované výdavky alebo skupinu deklarovaných výdavkov bez deklarovaných výdavkov, u ktorých počas výkonu kontroly rozhodol, že budú predmetom samostatnej kontroly vyčlenenej časti deklarovaných výdavkov z dôvodu dopĺňania / zmeny / overenia skutočností na mieste a pod. (nevzťahuje sa na Program Interreg V-A SK – CZ, Program Interreg V-A SK – AT a Program Interreg V-A SK – HU) alebo zamietnuť všetky deklarované výdavky, ak zistí nedostatky v postupe prijímateľa / hlavného prijímateľa alebo partnera, užívateľa alebo osoby, ktorá má k prijímateľovi / hlavnému prijímateľovi, partnerovi alebo užívateľovi vzťah dodávateľa tovarov, prác alebo služieb pri realizácii projektu;
21.	vypracovanie návrhu správy / správy z kontroly žiadosti o platbu;
22.	predkladanie príslušnej časti žiadosti o platbu platobnej jednotke; 
23.	plnenie úlohy národného kontrolóra podľa čl. 23 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1299/2013 v rámci Programu Interreg V-A SK – CZ, Programu Interreg V-A SK – AT a Programu Interreg V-A SK – HU;
24.	schvaľovanie žiadosti o platbu v rámci Programu Interreg V-A SK – CZ, Programu Interreg V-A SK – AT a Programu Interreg V-A SK – HU;
25.	overovanie národného príspevku na spolufinancovanie a predkladanie čestného vyhlásenia k úhrade národného príspevku na spolufinancovanie zo štátneho rozpočtu Českej republiky / príslušného rozpočtu Rakúskej spolkovej republiky / príslušného rozpočtu Maďarska za zrealizované úhrady schválených žiadostí o platbu hlavných prijímateľov za predchádzajúci štvrťrok do 10. kalendárneho dňa mesiaca nasledujúceho po skončení príslušného štvrťroka elektronicky na e-mailovú adresu platby@mfsr.sk. Certifikačný orgán je oprávnený požiadať riadiaci orgán o predloženie čestného vyhlásenia aj v iných termínoch v priebehu kalendárneho roka, a to z dôvodu prípravy žiadosti o platbu na Európsku komisiu. Čestné vyhlásenie za sledované obdobie štvrťroka obsahuje nasledovné náležitosti: čísla žiadosti o platbu, dátum úhrady podľa výpisu z účtu, výšku uhradenej sumy za zdroj spolufinancovania z príslušného rozpočtu a v prípade neuhradenia spolufinancovania dôvod neuhradenia; 
26.	sledovanie dodržiavania povinnosti prijímateľa týkajúcej sa zúčtovania 100 % poskytnutej zálohovej platby (osobitne za každú poskytnutú zálohovú platbu) najneskôr do 9 mesiacov odo dňa pripísania finančných prostriedkov na účte prijímateľa, resp. dňa aktivácie rozpočtového opatrenia a evidovanie sledovania poskytnutej a zúčtovanej zálohovej platby v rámci projektu samostatne v štruktúre stanovenej riadiacim orgánom. Riadiaci orgán priebežne aktualizuje a ukladá prehľad v ním stanovenej štruktúre ako elektronickú prílohu do ITMS do časti prílohy v rámci žiadosti o platbu; 
27.	vypracovanie a predkladanie odhadu očakávaných výdavkov certifikačnému orgánu elektronicky na e-mailovú adresu odhady@mfsr.sk mesačne k 6. kalendárnemu dňu nasledujúceho mesiaca po skončení príslušného mesiaca, ku ktorému sa odhad vypracováva v spolupráci s platobnou jednotkou. Odhady očakávaných výdavkov vypracovávané k 31. decembru roku "n" predkladá riadiaci orgán do 15. januára roku "n+1", odhady očakávaných výdavkov vypracovávané k 30. júnu predkladá riadiaci orgán do 30. júna. Ak deň predloženia pripadá na deň pracovného pokoja, tak najbližší pracovný deň pred týmto termínom, prípadne v iný deň predchádzajúci tomu dňu na základe požiadavky certifikačného orgánu;
28.	navrhovanie realokácie prostriedkov v rámci programu a medzi programami (v spolupráci s centrálnym koordinačným orgánom), ich predkladanie certifikačnému orgánu na posúdenie a následne ich predkladanie monitorovaciemu výboru na schválenie, ak je relevantné;
29.	predkladanie revidovaného finančného plánu v prípade uplatnenia automatického zrušenia finančného záväzku programu pred jeho zaslaním Európskej komisii certifikačnému orgánu na posúdenie;
30.	predkladanie návrhu na zmenu finančného plánu v prípade prerozdeľovania výkonnostnej rezervy pred jeho zaslaním Európskej komisii certifikačnému orgánu na posúdenie;
Vo vzťahu k overovaniu certifikačným orgánom, kontrolám a auditom:
31.	písomné predkladanie stanovísk riadiaceho orgánu / sprostredkovateľského orgánu a platobnej jednotky k zisteniam a odporúčaniam z overovania certifikačnému orgánu a v kópii platobnej jednotke v lehote stanovenej certifikačným orgánom;
32.	vypracovanie stanoviska riadiaceho orgánu k zisteniam a odporúčaniam z overovania certifikačného orgánu a jeho predloženie certifikačnému orgánu v rámci Programu Interreg V-A SK – CZ, Programu Interreg V-A SK – AT a Programu Interreg V-A SK – HU v lehote stanovenej certifikačným orgánom;
33.	poskytovanie všetkých relevantných informácií certifikačnému orgánu potrebných pre schválenie súhrnnej žiadosti o platbu / mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu;
34.	predkladanie opatrení na nápravu nedostatkov a na odstránenie príčin ich vzniku k všetkým kontrolám a auditom, ktoré boli vykonané inými auditujúcimi / kontrolnými orgánmi na organizačnom útvare plniacom úlohy riadiaceho orgánu a odpočtov ich plnenia certifikačnému orgánu a aj orgánu auditu v prípade, ak kontrola alebo audit neboli vykonané orgánom auditu alebo spolupracujúcim orgánom, a to do 10 pracovných dní od ich zaslania auditujúcemu / kontrolnému orgánu;
35.	v relevantných prípadoch vypracovanie a plnenie akčného plánu k nedostatkom identifikovaným auditom Európskej komisie a Európskeho dvora audítorov a pravidelné predkladanie plnenia opatrení z akčného plánu certifikačnému orgánu a orgánu auditu. V prípade, ak je to relevantné riadiaci orgán spolupracuje pri vypracovaní a plnení akčného plánu s platobnou jednotkou;
36.	predkladanie správ o výsledku externého auditu (audit Európskej komisie, Európskeho dvora audítorov a iný audit), protokolov z kontrol vykonávaných podľa zákona č. 39/1993 Z. z. o Najvyššom kontrolnom úrade Slovenskej republiky v znení neskorších predpisov a všetkých protokolov z kontrol (vrátane tých, kde kontrola u prijímateľa nebola začatá na podnet riadiaceho orgánu) a rozhodnutí v správnom konaní Úradu pre verejné obstarávanie elektronicky s naskenovanou stranou obsahujúcou podpis zodpovednej osoby certifikačnému orgánu na e-mailovú adresu co@mfsr.sk, orgánu auditu na e-mailovú adresu organauditu@mfsr.sk a centrálnemu koordinačnému orgánu na e-mailovú adresu metodika.cko@vlada.gov.sk do 5 pracovných dní od ich prerokovania, resp. právoplatnosti rozhodnutia; 
37.	predkladanie správy o výsledku externého auditu (audit Európskej komisie, Európskeho dvora audítorov a iný audit) orgánu zabezpečujúcemu ochranu finančných záujmov elektronicky na e-mailovú adresu nezrovnalosti@vlada.gov.sk do 7 pracovných dní od ich doručenia riadiacemu orgánu;
38.	predkladanie správ o výsledku vnútorného auditu a finančnej kontroly vykonaných na riadiacom orgáne v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov elektronicky s naskenovanou stranou obsahujúcou podpis zodpovednej osoby certifikačnému orgánu na e-mailovú adresu co@mfsr.sk, orgánu auditu na e-mailovú adresu organauditu@mfsr.sk a centrálnemu koordinačnému orgánu na e-mailovú adresu metodika.cko@vlada.gov.sk do 5 pracovných dní od odovzdania audítorskej správy vnútorným audítorom vedúcemu auditovaného subjektu, resp. od prerokovania správy o výsledku finančnej kontroly;
39.	predkladanie správ z vyšetrovania Európskeho úradu pre boj proti podvodom elektronicky certifikačnému orgánu na e-mailovú adresu co@mfsr.sk, orgánu auditu na e-mailovú adresu organauditu@mfsr.sk a centrálnemu koordinačnému orgánu na e-mailovú adresu metodika.cko@vlada.gov.sk;
Vo vzťahu k nezrovnalostiam, finančným opravám a vysporiadaniu finančných vzťahov:
40.	riešenie nezrovnalostí v rámci programu podľa podmienok v časti 8 a bezodkladné prijímanie účinných nápravných opatrení s cieľom odstránenia nezrovnalostí a predchádzania ich vzniku (najmä vo väzbe na vysporiadanie finančných vzťahov s prijímateľom alebo nedostatkov v systéme riadenia a kontroly);
41.	vypracovanie a predkladanie správ o zistenej nezrovnalosti v súlade s postupom a v lehote uvedenými v časti 8 vrátane aktualizácie údajov o zistenej nezrovnalosti v ITMS; 
42.	výzvou na úhradu oznamovanie dlžníkovi, že eviduje voči nemu pohľadávku z príspevku;
43.	evidenciu a správu všetkých pohľadávok z príspevku;
44.	zabezpečenie vysporiadania finančných vzťahov v rámci projektu alebo programu v súlade s právnymi predpismi SR alebo EÚ;
45.	stanovovanie a vykonávanie finančných opráv v súlade s postupom v časti 8;
46.	zaevidovanie schválenej dohody o splátkach alebo schválenej dohody o odklade plnenia v ITMS;
47.	vykonanie sumárnej kontroly presnosti, správnosti a úplnosti evidovania údajov o nezrovnalostiach a vysporiadaných finančných vzťahoch a prípadnej opravy nekorektných / neaktuálnych údajov v ITMS štvrťročne;
48.	vypracovanie a predkladanie výkazu súm, ktoré nie je možné vymôcť, alebo v prípade ktorých sa neočakáva, že budú vrátené v rámci príslušného účtovného roka v súlade s požiadavkou čl. 137 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 certifikačnému orgánu do 30. septembra nasledujúceho po skončení účtovného roku. Riadiaci orgán predkladá predmetný zoznam s nulovými hodnotami, ak neeviduje žiadne takéto prípady;
Vo vzťahu k zostavovaniu účtov:
49.	vypracovanie a predloženie schválených správ o zistených nezrovnalostiach, zoznamu nevymožiteľných súm v zmysle prílohy 9 a návrhu Ročného súhrnu konečných audítorských správ a výsledkov uskutočnených kontrol podľa čl. 125 ods. 4 písm. e) nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 v súlade s čl. 59 ods. 5 písm. a) nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ, Euratom) č. 966/2012 najneskôr do 30. septembra nasledujúceho po skončení účtovného roku orgánu auditu a certifikačnému orgánu;
50.	vypracovanie a predloženie Vyhlásenia riadiaceho orgánu o vierohodnosti a Ročného súhrnu konečných audítorských správ a výsledkov uskutočnených kontrol, vrátane analýzy o povahe a rozsahu chýb a slabých stránkach nájdených v systémoch riadenia a kontroly a o akýchkoľvek prijatých opravných opatreniach SR podľa čl. 125 ods. 4 písm. e) nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 v súlade s čl. 59 ods. 5 písm. a) nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ, Euratom) č. 966/2012 najneskôr do 15. decembra nasledujúceho po skončení účtovného roku orgánu auditu a certifikačnému orgánu;
51.	spoluprácu a poskytovanie súčinnosti certifikačnému orgánu a orgánu auditu pri príprave účtov a stanoviska k nim predkladaných Európskej komisii;
Vo vzťahu k uchovávaniu a archivácii dokumentácie: 
52.	poskytnutie informácií o účtovných záznamoch operácií Európskej komisii podľa čl. 125 ods. 9 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013;
53.	uchovávanie a dodržiavanie manuálu procedúr, vrátane audit trailu, na každej úrovni riadenia;
54.	v relevantných prípadoch uchovávanie schém štátnej pomoci, schém pomoci "de minimis", výziev na predkladanie projektov, príslušných interných riadiacich aktov daného subjektu;
55.	zabezpečenie uchovávania všetkých podporných dokumentov vzťahujúcich sa na výdavky projektov v súlade s čl. 140 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013. Registrácia a uchovávanie dokumentov musí byť zabezpečená aj v súlade so zákonom č. 395/2002 Z. z. o archívoch a registratúrach a o doplnení niektorých zákonov v znení neskorších predpisov. 
3.3	Certifikačný orgán
Funkcie certifikačného orgánu v zmysle uznesenia vlády č. 519 zo dňa 15. októbra 2014 vykonáva pre všetky programy financované zo štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu programového obdobia 2014 – 2020 Ministerstvo financií SR. V prípade programov cezhraničnej (okrem Programu Interreg V-A SK – CZ, Programu Interreg V-A SK – AT a Programu Interreg V-A SK – HU), nadnárodnej a medziregionálnej spolupráce (okrem Operačného programu INTERACT III) vystupuje ako certifikačný orgán partnerský štát.
Certifikačný orgán vo vzťahu k finančnému riadeniu štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu zabezpečuje:
Vo vzťahu k nastaveniu a koordinácii systému finančného riadenia:
1.	koordináciu systému finančného riadenia štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu a metodické usmerňovanie platobných jednotiek a riadiacich orgánov v oblasti finančného riadenia štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu. V oblasti metodického usmerňovania sa pre subjekty zapojené do finančného riadenia využíva mailová adresa co@mfsr.sk;
2.	vypracovanie manuálu procedúr certifikačného orgánu a jeho zavedenie ako organizačnej smernice ministerstva a predloženie manuálu procedúr certifikačného orgánu vrátane jeho akýchkoľvek zmien s označením čísla verzie a dátumu platnosti elektronicky s naskenovanou stranou obsahujúcou podpis zodpovednej osoby orgánu auditu na e-mailovú adresu manualy@mfsr.sk, a to najneskôr do 10 pracovných dní od schválenia zodpovedným vedúcim. Maximálna veľkosť odosielaných dokumentov je 5 MB. Ak odosielaný manuál procedúr je rozsiahlejší, je potrebné ho rozdeliť a zaslať na vyššie uvedenú e-mailovú adresu po častiach;
3.	vypracovanie a aktualizáciu Systému finančného riadenia štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu na programové obdobie 2014 – 2020, vrátane predloženia zmien na pripomienkové konanie všetkým relevantným subjektom (okrem dodatkov k materiálu, ktoré sa vypracovávajú v prípade zmeny legislatívy, administratívnych úprav a iných technických zmien materiálu) a ich predkladanie ministrovi financií na schválenie. V prípade zásadných zmien bude Systém finančného riadenia štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu na programové obdobie 2014 – 2020 predložený na schválenie vláde SR; 
4.	udeľovanie výnimiek zo Systému finančného riadenia štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu na programové obdobie 2014 – 2020 na základe oprávnených a riadne odôvodnených žiadostí orgánov zapojených do finančného riadenia adresovaných ministrovi financií. Pri posudzovaní každej z výnimiek certifikačný orgán dôsledne zváži ich dopad. Minister financií neudeľuje výnimky zo Systému finančného riadenia štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu na programové obdobie 2014 – 2020 týkajúce sa nedodržiavania podmienok pre zúčtovanie zálohovej platby / zúčtovania predfinancovania. Subjekt, ktorému bola udelená výnimka je povinný zabezpečiť dodržiavanie všetkých stanovených podmienok, pričom v prípade ich porušenia udelená výnimka stráca platnosť;
5.	vydávanie usmernení a manuálov k finančnému riadeniu, vydávanie vykonávacích usmernení vo forme metodických pokynov alebo metodických výkladov, ktoré sú v závislosti na ich charaktere záväzné alebo odporúčajúce (popisujúce správnu prax), pričom záväznosť týchto metodických usmernení / metodických výkladov je definovaná osobitne v jednotlivých metodických usmerneniach / metodických výkladoch;
6.	riadenie vývoja, aktualizácie ISUF, zabezpečenie integračných väzieb komplexu ISUF, ITMS, Informačného systému Štátnej pokladnice a Rozpočtového informačného systému;
7.	definovanie požiadaviek a testovanie aplikačného programového vybavenia ITMS za oblasť finančného riadenia, vrátenia finančných prostriedkov a nezrovnalostí a spoluprácu pri definovaní požiadaviek a testovaní aplikačného vybavenia ITMS pre ostatné oblasti v súlade s platnou legislatívou EÚ a Slovenskej republiky a v zmysle usmernení a špecifických požiadaviek centrálneho koordinačného orgánu;
8.	organizovanie školení súvisiacich s finančným riadením štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu na národnej úrovni;
9.	účasť svojho zástupcu na zasadnutiach Koordinačného výboru Európskej komisie pre európske štrukturálne a investičné fondy (COESIF), Expertnej skupiny pre európske štrukturálne a investičné fondy (EGESIF) a Výboru podľa čl. 163 Zmluvy (napr. Pracovná skupiny Výboru Európskeho sociálneho fondu – Technickej pracovnej skupiny – Výbor ESF – TWG) v rámci kompetencií certifikačného orgánu;
10.	účasť svojho zástupcu na zasadnutiach monitorovacích výborov a národného monitorovacieho výboru v rámci kompetencií certifikačného orgánu;
11.	posudzovanie návrhu:
a)	riadiacich orgánov na realokáciu finančných prostriedkov v rámci programov, medzi programami pred ich predložením na schválenie monitorovaciemu výboru, ak je relevantné,
b)	riadiacich orgánov na revíziu finančného plánu v prípade uplatnenia automatického zrušenia finančného záväzku programu pred jeho zaslaním Európskej komisii,
c)	riadiacich orgánov na zmenu finančného plánu v prípade prerozdeľovania výkonnostnej rezervy pred jeho zaslaním Európskej komisii,
d)	žiadostí o potvrdenie pomoci pre veľký projekt podľa čl. 101 ods. 1 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013;
Vo vzťahu k účtom, prevodom finančných prostriedkov a rozpočtovým záležitostiam:
12.	zriadenie mimorozpočtových účtov Ministerstva financií SR pre prostriedky EÚ v Štátnej pokladnici za každý program / fond v prípade viacfondových programov;
13.	zriadenie mimorozpočtového účtu v Štátnej pokladnici pre príjem prostriedkov EÚ od prijímateľov, partnerov alebo užívateľov z titulu finančného vysporiadania nezrovnalostí a ostatných druhov finančného vysporiadania;
14.	zriadenie mimorozpočtového účtu v Štátnej pokladnici pre odvod prostriedkov EÚ od prijímateľov, partnerov alebo užívateľov na základe právoplatných rozhodnutí za porušenie finančnej disciplíny;
15.	zriadenie mimorozpočtových účtov v Štátnej pokladnici slúžiacich na úhradu bankových poplatkov a daní z úrokov;
16.	príjem prostriedkov EÚ na mimorozpočtové účty Ministerstva financií SR;
17.	prevod finančných prostriedkov EÚ z mimorozpočtového účtu Ministerstva financií SR na účet príslušnej platobnej jednotky na základe schválenej súhrnnej žiadosti o platbu / mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu;
18.	zostavenie a predloženie odhadu očakávaných výdavkov pre príslušný a nasledujúci rok Európskej komisii na základe podkladov riadiacich orgánov každý rok do 31. januára a do 31. júla;
19.	spoluprácu pri návrhu ročných finančných limitov prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie pre platobné jednotky pri tvorbe návrhu štátneho rozpočtu;
20.	koordinovanie procesu spracovania a schvaľovania návrhu zabezpečenia a použitia prostriedkov rezervy na štrukturálne operácie v kapitole Všeobecná pokladničná správa;
Vo vzťahu k systému certifikácie a žiadostiam o platbu na Európsku komisiu:
21.	administratívne overenie, t. j. overenie súhrnnej žiadosti o platbu / mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu, ktorého súčasťou je aj kontrola vykonávaná v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov. Toto overenie zahrňuje:
a)	overenie formálnej správnosti, ktoré zahrňuje overenie pravdivosti, kompletnosti a správnosti údajov v súhrnnej žiadosti o platbu / mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu,
b)	overenie vecnej správnosti, ktoré zahrňuje overenie správnosti údajov v relevantných informačných systémoch a overenie iných skutočností potrebných pre schválenie súhrnnej žiadosti o platbu / mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu;
22.	certifikačné overovanie s cieľom uistenia sa o postupoch riadiaceho orgánu a platobnej jednotky;
23.	vypracovanie a predkladanie informácie o zisteniach, ktoré nasvedčujú systémovým nedostatkom centrálnemu koordinačnému orgánu elektronicky na e-mailovú adresu monitorovanie.cko@vlada.gov.sk a orgánu auditu na základe vykonaných certifikačných overovaní v termínoch stanovených centrálnym koordinačným orgánom alebo orgánom auditu s cieľom zahrnúť tieto informácie do formalizovaného riadenia rizík na úrovni centrálneho koordinačného orgánu a na ďalšie využitie;
24.	zaregistrovanie podozrenia z nezrovnalosti alebo zistenej nezrovnalosti v ITMS, vypracovanie a schválenie správy o zistenej nezrovnalosti a zaevidovanie schválenej správy o zistenej nezrovnalosti v ITMS v súlade s postupom a v lehote uvedenými v časti 8.1 vrátane aktualizácie údajov o nezrovnalosti v ITMS;
25.	zostavenie, certifikáciu a zaslanie výkazu výdavkov Európskej komisii ako súčasť žiadosti o platbu na základe čiastkových výkazov výdavkov a schválených súhrnných žiadostí o platbu / mimoriadnych súhrnných žiadostí o platbu predložených platobnými jednotkami; 
26.	v oprávnených a odôvodnených prípadoch pozastavenie platieb pre príslušný program, resp. relevantnú časť programu a informovanie orgánu auditu, riadiaceho orgánu a platobnej jednotky príslušného programu;
27.	v oprávnených a odôvodnených prípadoch zamietnutie platby alebo upravenie výšky platby pre príslušný program, resp. relevantnú časť programu, finančný nástroj alebo ich časti, ak zistí nedostatky v postupe riadiaceho orgánu alebo platobnej jednotky pri realizácii operácii a informovanie orgánu auditu, riadiaceho orgánu a platobnej jednotky príslušného programu;
28.	v prípade, ak Európska komisia zašle upozorňujúci list (tzv. "warning letter"), resp. rozhodne o prerušení lehoty pre platby podľa čl. 83 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013, prípadne rozhodne o pozastavení platieb podľa čl. 142 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013, oprávnenie pozastaviť platby pre príslušný program, resp. relevantnú časť programu a informovanie orgánu auditu, riadiaceho orgánu a platobnej jednotky príslušného programu;
Vo vzťahu k zostavovaniu účtov: 
29.	vypracovanie a predloženie návrhu účtov za účtovný rok orgánu auditu do 5. pracovných dní po 30. apríli;
30.	vypracovanie a predloženie upraveného návrhu účtov zohľadňujúceho návrh Ročného súhrnu konečných audítorských správ a výsledkov uskutočnených kontrol (ktorý predkladá riadiaci orgán orgánu auditu a certifikačnému orgánu do 30. septembra) orgánu auditu do 15. októbra nasledujúceho po skončení účtovného roka; 
31.	vypracovanie a predloženie účtov za účtovný rok orgánu auditu najneskôr do 7. januára nasledujúceho po skončení účtovného roka; 
32.	spoluprácu a poskytovanie súčinnosti pri príprave účtov predkladaných Európskej komisii riadiacemu orgánu a orgánu auditu; 
33.	zostavenie a predkladanie účtov Európskej komisii do 15. februára nasledujúceho po skončení účtovného roku v súlade s čl. 137 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013;
Vo vzťahu k nezrovnalostiam, finančným opravám a účtovníctvu:
34.	vedenie a predkladanie knihy dlžníkov, resp. mesačného výkazu nezrovnalostí a vratiek k 15. kalendárnemu dňu v mesiaci elektronicky riadiacemu orgánu a orgánu auditu na e-mailovú adresu reporting@mfsr.sk a v písomnej forme platobnej jednotke;
35.	vypracovanie a predkladanie súhrnného prehľadu správ o zistenej nezrovnalosti štvrťročne orgánu zabezpečujúcemu ochranu finančných záujmov;
36.	spoluprácu s orgánom zabezpečujúcim ochranu finančných záujmov EÚ v záležitostiach týkajúcich sa nezrovnalostí a ochrany finančných záujmov EÚ;
37.	vrátenie prostriedkov EÚ v súlade s § 20 ods. 7 zákona č. 523/2004 Z. z. o rozpočtových pravidlách verejnej správy a o zmene a doplnení niektorých zákonov v znení neskorších predpisov, a to vrátane úrokov z omeškania v súlade s § 20 ods. 8 zákona č. 523/2004 Z. z. o rozpočtových pravidlách verejnej správy a o zmene a doplnení niektorých zákonov v znení neskorších predpisov formou vykonania finančných opráv prostriedkov EÚ;
38.	spracovanie relevantných častí výročných správ o vykonávaní a záverečnej správy o vykonávaní programu / poslednej výročnej správy o vykonávaní programu financovaného Európskeho námorného a rybárskeho fondu týkajúcich sa čerpania prostriedkov EÚ a ich predloženie riadiacemu orgánu;
39.	metodické riadenie a koordinácia postupov účtovania certifikačného orgánu a platobných jednotiek v rámci ISUF a koordinácia postupu poskytovania údajov účtovnej závierky a finančných výkazov;
40.	vedenie účtovníctva certifikačného orgánu vrátane vyhotovovania a predkladania údajov účtovnej závierky a vyhotovovania podkladov pre konsolidovanú účtovnú závierku ústrednej správy, vyhotovovanie a predkladanie údajov finančných výkazov podľa osobitných predpisov za certifikačný orgán a uchovávanie účtovných dokladov a ostatnej účtovnej dokumentácie;
Vo vzťahu k uchovávaniu a archivácii dokumentácie:
41.	poskytnutie informácií o účtovných záznamoch operácií Európskej komisii podľa čl. 125 ods. 9 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013;
42.	uschovávanie všetkých podkladov vzťahujúcich sa na výdavky v súlade s čl. 140 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013. Registrácia a uchovávanie dokumentov musí byť zabezpečená aj v súlade so zákonom č. 395/2002 Z. z. o archívoch a registratúrach a o doplnení niektorých zákonov v znení neskorších predpisov.
3.4	Platobné jednotky
Základnou úlohou platobných jednotiek je zabezpečiť prevod finančných prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie prijímateľovi v súlade so zákonom č. 523/2004 Z. z. o rozpočtových pravidlách verejnej správy a o zmene a doplnení niektorých zákonov v znení neskorších predpisov (ďalej len "zákon č. 523/2004 Z. z. o rozpočtových pravidlách verejnej správy").
Platobné jednotky vo vzťahu k finančnému riadeniu štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu zabezpečujú:
Vo vzťahu k nastaveniu systému implementácie:
1.	vypracovanie manuálu procedúr platobnej jednotky a jeho zavedenie ako organizačnej smernice organizácie;
2.	predloženie manuálu procedúr platobnej jednotky vrátane jeho akýchkoľvek zmien s označením čísla verzie a dátumu platnosti elektronicky s naskenovanou stranou obsahujúcou podpis zodpovednej osoby certifikačnému orgánu na e-mailovú adresu CO_manual@mfsr.sk a orgánu auditu na e-mailovú adresu manualy@mfsr.sk, a to najneskôr do 10 pracovných dní od schválenia zodpovedným vedúcim. Maximálna veľkosť odosielaných dokumentov je 5 MB. Ak odosielaný manuál procedúr je rozsiahlejší, je potrebné ho rozdeliť a zaslať na vyššie uvedené e-mailové adresy po častiach;
3.	zriadenie a spravovanie príjmových účtov a výdavkového účtu platobnej jednotky v Štátnej pokladnici;
4.	evidovanie a aktualizovanie relevantných údajov súvisiacich s využívaním poskytnutého príspevku v ITMS a ISUF;
Vo vzťahu k implementácii a finančnému riadeniu projektov:
5.	kontrolu v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov žiadosti o platbu, ktorá zahŕňa kontrolu formálnej správnosti predložených dokumentov (príslušnej časti formulára žiadosti o platbu), overenie súladu žiadosti o platbu s rozpočtovým limitom pre danú prioritnú os. V závislosti od dohody medzi riadiacim orgánom a platobnou jednotkou je platobná jednotka oprávnená pre potreby finančnej kontroly vyžiadať si od riadiaceho orgánu iba dokumenty, ktoré zásadne ovplyvňujú výkon finančnej kontroly žiadosti o platbu; 
6.	zostavenie súhrnnej žiadosti o platbu / mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu a čiastkového výkazu výdavkov a jej predloženie certifikačnému orgánu podľa termínov a postupov stanovených certifikačným orgánom, pričom najneskôr do 31. decembra 2015 predkladá súhrnnú žiadosť o platbu / mimoriadnu súhrnnú žiadosti o platbu a čiastkový výkaz výdavkov elektronicky na e-mailovú adresu platby@mfsr.sk za každý fond a projekty Iniciatívy na podporu zamestnanosti mladých ľudí osobitne;
Vo vzťahu k prevodom finančných prostriedkov a rozpočtovým záležitostiam:
7.	zostavenie súhrnnej žiadosti o platbu / mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu a čiastkového výkazu výdavkov v rámci Programu Interreg V-A SK – CZ, Programu Interreg V-A SK – AT a Programu Interreg V-A SK – HU a jej predloženie certifikačnému orgánu podľa termínov a postupov stanovených certifikačným orgánom pričom najneskôr do 31. decembra 2015 predkladá súhrnnú žiadosť o platbu / mimoriadnu súhrnnú žiadosti o platbu a čiastkový výkaz výdavkov elektronicky na e-mailovú adresu platby@mfsr.sk;
8.	prevod prostriedkov EÚ v súlade s čl. 96 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie prijímateľom v súlade s § 20 ods. 2 zákona č. 523/2004 Z. z. o rozpočtových pravidlách verejnej správy;
9.	v rámci Programu Interreg V-A SK – CZ, Programu Interreg V-A SK – AT a Programu Interreg V-A SK – HU prevod prostriedkov EÚ v súlade s čl. 96 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 hlavnému prijímateľovi a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie hlavnému prijímateľovi zo Slovenskej republiky, resp. hlavnému cezhraničnému partnerovi zo Slovenskej republiky v súlade s § 20 ods. 2 zákona č. 523/2004 Z. z. o rozpočtových pravidlách verejnej správy;
10.	informovanie prijímateľa o prevode prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie, pričom formu a spôsob informovania prijímateľa určí platobná jednotka. V prípade Programu Interreg V-A SK – CZ, Programu Interreg V-A SK – AT a Programu Interreg V-A SK – HU informovanie hlavného prijímateľa zo Slovenskej republiky / Českej republiky / Rakúskej spolkovej republiky / Maďarska o prevode prostriedkov EÚ, informovanie hlavného prijímateľa z Českej republiky / Rakúskej spolkovej republiky / Maďarska, hlavného cezhraničného partnera zo Slovenskej republiky a národného orgánu zabezpečujúceho úhradu národného príspevku na spolufinancovanie v Českej republike / Rakúskej spolkovej republike / Maďarsku o prevode prostriedkov štátneho rozpočtu na spolufinancovanie, pričom spôsob informovania hlavného prijímateľa / partnera určí platobná jednotka;
11.	usmerňovanie prijímateľov v oblasti odvodu výnosov z prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie poskytnutých systémom zálohovej platby / predfinancovania tak, aby prijímateľ v zmysle § 7 ods. 1 písm. m) zákona č. 523/2004 Z. z. o rozpočtových pravidlách verejnej správy odviedol k 31. januáru nasledujúceho roka do príjmov štátneho rozpočtu skutočný výnos, ktorý vznikol z prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie, t. j. po odpočítaní alikvotnej časti poplatkov za vedenie účtov, prípadne celý poplatok, ak ich vedie na osobitnom účte;
12.	vypracovanie a predloženie odhadu očakávaných výdavkov za programy cieľa Európska územná spolupráca okrem Programu Interreg V-A SK – CZ, Programu Interreg V-A SK – AT a Programu Interreg V-A SK – HU certifikačnému orgánu elektronicky na e-mailovú adresu odhady@mfsr.sk pre potreby prípravy a aktualizácie odhadu plnenia štátneho rozpočtu mesačne do 6. kalendárneho dňa v mesiaci. Odhady očakávaných výdavkov vypracovávané k 31. decembru roku "n" predkladá platobná jednotka do 15. januára roku "n+1". Ak deň predloženia pripadá na deň pracovného pokoja, tak najbližší pracovný deň pred týmto termínom, prípadne v iný deň predchádzajúci tomu dňu na základe požiadavky certifikačného orgánu;
13.	v spolupráci s útvarom spravujúcim rozpočet príslušnej kapitoly preverenie odhadu očakávaných výdavkov predložených riadiacim orgánom;
14.	rozpočtovanie prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie v štátnom rozpočte pre príslušný rok;
Vo vzťahu k nezrovnalostiam, účtovníctvu, kontrolám a auditom:
15.	vedenie účtovníctva o stave a pohybe pohľadávok z príspevku a pohľadávok z rozhodnutí riadiaceho orgánu alebo Úradu vládneho auditu vydaných v správnom konaní, záväzkov a peňažných prostriedkov spojených s poskytovaním prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie, vrátane vyhotovovania a predkladania údajov účtovnej závierky a vyhotovovania podkladov pre konsolidovanú účtovnú závierku ústrednej správy za platobnú jednotku;
16.	vedenie čiastkovej knihy dlžníkov, resp. čiastkového výkazu nezrovnalostí a vratiek a jej predkladanie elektronicky k 20. kalendárnemu dňu v mesiaci riadiacemu orgánu, ak nastala zmena v danom mesiaci;
17.	zaregistrovanie podozrenia z nezrovnalosti alebo zistenej nezrovnalosti v ITMS, vypracovanie a schválenie správy o zistenej nezrovnalosti a zaevidovanie schválenej správy o zistenej nezrovnalosti v ITMS v súlade s postupom a v lehote uvedenými v časti 8.1 vrátane aktualizácie údajov o nezrovnalosti v ITMS;
18.	vypracovanie stanoviska platobnej jednotky k zisteniam a odporúčaniam z overovania certifikačného orgánu a jeho predloženie riadiacemu orgánu (v termíne stanovenom riadiacim orgánom) za účelom zaslania stanoviska certifikačnému orgánu v lehote stanovenej certifikačným orgánom;
19.	predkladanie správ o výsledku externého auditu (audit Európskej komisie, Európskeho dvora audítorov a iný audit), protokolov z kontrol vykonávaných podľa zákona č. 39/1993 Z. z. o Najvyššom kontrolnom úrade Slovenskej republiky v znení neskorších predpisov týkajúcich sa platobnej jednotky elektronicky v naskenovanej verzii certifikačnému orgánu na e-mailovú adresu co@mfsr.sk a orgánu auditu na e-mailovú adresu spravy@mfsr.sk do 5 pracovných dní od ich doručenia;
20.	predkladanie opatrení na nápravu nedostatkov a na odstránenie príčin ich vzniku k všetkým vykonaným kontrolám a auditom na organizačnom útvare plniacom úlohy platobnej jednotky a odpočty ich plnenia elektronicky v naskenovanej verzii certifikačnému orgánu na e-mailovú adresu co@mfsr.sk a aj orgánu auditu na e-mailovú adresu spravy@mfsr.sk v prípade, ak kontrola alebo audit neboli vykonané orgánom auditu alebo spolupracujúcim orgánom, a to do 10 pracovných dní od ich prijatia; 
21.	v relevantných prípadoch vypracovanie a plnenie akčného plánu k nedostatkom identifikovaným auditom Európskej komisie a Európskeho dvora audítorov a pravidelné predkladanie plnenia opatrení z akčného plánu certifikačnému orgánu a orgánu auditu; 
Vo vzťahu k uchovávaniu a archivácii dokumentácie:
22.	vyhotovovanie a predkladanie údajov finančných výkazov podľa osobitných predpisov za platobnú jednotku a uchovávanie účtovných dokladov a ostatnej účtovnej dokumentácie;
23.	uschovávanie všetkých podkladov vzťahujúcich sa na výdavky v súlade s čl. 140 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013. Registrácia a uchovávanie dokumentov musí byť zabezpečená aj v súlade so zákonom č. 395/2002 Z. z. o archívoch a registratúrach a o doplnení niektorých zákonov v znení neskorších predpisov.
3.5	Monitorovacie výbory
Riadiace orgány zriaďujú v súlade s čl. 47 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 monitorovacie výbory pre každý program najneskôr do troch mesiacov od dátumu oznámenia rozhodnutia Európskej komisie o schválení programu.
Monitorovacie výbory pre programy sú vo vzťahu k finančnému riadeniu štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu zodpovedné najmä za nasledovné úlohy:
1.	prerokovanie a schvaľovanie výročných správ o vykonávaní programu a záverečnej správy o vykonávaní programu (v prípade Európskeho fondu regionálneho rozvoja, Európskeho sociálneho fondu a Kohézneho fondu), ktoré sú predkladané Európskej komisii;
2.	preskúmanie výkonnosti programu vzhľadom na výkonnostný rámec stanovený v príslušnom programe;
3.	schvaľovanie prideľovania výkonnostnej rezervy programom na základe preskúmania ich výkonnosti v roku 2019;
4.	prerokovanie a schvaľovanie každého návrhu na zmenu programu.
V podmienkach Slovenskej republiky je zároveň zriadený Národný monitorovací výbor pre Partnerskú dohodu, ktorý berie na vedomie presuny finančných prostriedkov medzi programami.
3.6	Orgán auditu
V súlade s čl. 123 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a čl. 31 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 223/2014 je členský štát povinný pre každý program zriadiť orgán auditu. Tento orgán ako aj spolupracujúce orgány musia byť funkčne nezávislé od riadiaceho orgánu, certifikačného orgánu a platobnej jednotky. Orgán auditu musí rovnako zabezpečiť, aby sa v rámci výkonu vládnych auditov zohľadňovali medzinárodne uznávané audítorské štandardy. Funkcie orgánu auditu v zmysle uznesenia vlády č. 519 zo dňa 15. októbra 2014 vykonáva pre všetky programy financované zo štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu cieľa Investovanie do rastu a zamestnanosti, Program Interreg V-A SK – CZ, Program Interreg V-A SK – AT, Program Interreg V-A SK – HU a program financovaný z Európskeho námorného a rybárskeho fondu programového obdobia 2014 – 2020 Ministerstvo financií SR.
Orgán auditu zodpovedá najmä za:
1.	zabezpečenie, aby sa vykonali vládne audity riadneho fungovania systému riadenia a kontroly programu v súlade s čl. 127 ods. 1 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013;
2.	zabezpečenie, aby sa vládne audity vykonali na primeranej vzorke operácií na základe vykázaných výdavkov v súlade s čl. 127 ods. 1 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013;
3.	zabezpečenie, aby sa vykonávali vládne audity s cieľom získať primerané uistenie o úplnosti, presnosti a pravdivosti súm deklarovaných v účtoch uvedených v čl. 137 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013, pričom orgán auditu zohľadní predovšetkým výsledky systémových auditov vykonávaných na certifikačnom orgáne a auditov operácií;
4.	zabezpečenie potrebnej funkčnej nezávislosti subjektu vykonávajúceho vládny audit, ak vládny audit vykonáva iný subjekt ako orgán auditu v súlade s čl. 127 ods. 2 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013;
5.	do 15. februára5 nasledujúceho po skončení účtovného roka za:
a)	vypracovanie audítorského stanoviska k účtom a k súhrnu konečných audítorských správ a kontrol podľa čl. 127 ods. 5 písm. a) nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a čl. 59 ods. 5 druhého pododseku nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ, Euratom) č. 966/2012,
b)	vypracovanie kontrolnej správy, ktorá obsahuje hlavné zistenia z vykonaných auditov vrátane zistení tykajúcich sa nedostatkov zistených v rámci systémov riadenia a kontroly, navrhované a zrealizované nápravné opatrenia v súlade s čl. 127 ods. 5 písm. b) nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013;
6.	vypracovanie stratégie auditu pre vykonávanie auditov do 8 mesiacov od prijatia programu v súlade s čl. 127 ods. 4 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013;
7.	koordinovanie, plánovanie, usmerňovanie a monitorovanie vykonávania vládnych auditov a zabezpečenie kvality práce a dohľadu nad spolupracujúcimi orgánmi;
8.	spoluprácu pri výkone auditu externými subjektmi, napr. Európskou komisiu, Európskym dvorom audítorov;
9.	zabezpečenie odborného vzdelávania zamestnancov vykonávajúcich vládny audit;
10.	spoluprácu s certifikačným orgánom a orgánom zabezpečujúcim ochranu finančných záujmov EÚ v záležitostiach týkajúcich sa nezrovnalostí a ochrany finančných záujmov EÚ;
11.	vypracovanie a schválenie správy o zistenej nezrovnalosti a zaevidovanie schválenej správy o zistenej nezrovnalosti v ITMS v súlade s postupom a v lehote uvedenými v časti 8.1 vrátane aktualizácie údajov o nezrovnalosti v ITMS;
12.	evidovanie a aktualizovanie údajov súvisiacich s vládnymi auditmi a zistenými nezrovnalosťami v CEDIS;
13.	vypracovanie správy a stanoviska nezávislého auditného subjektu, ktorý posúdi, či auditované orgány spĺňajú kritériá súvisiace s prostredím vnútornej kontroly, riadením rizika, riadiacimi a kontrolnými činnosťami a monitorovaním, v súlade s čl. 124 a podľa prílohy XIII nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a v súlade s čl. 21 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1299/2013 pre všetky programy, kde je orgánom auditu Ministerstvo financií SR a ich predkladanie certifikačnému orgánu a centrálnemu koordinačnému orgánu;
14.	predkladanie správy z vládneho auditu prostredníctvom vedúceho audítorskej skupiny elektronicky riadiacemu orgánu, centrálnemu koordinačnému orgánu na e-mailovú adresu monitorovanie.cko@vlada.gov.sk, sprostredkovateľskému orgánu a platobnej jednotke najneskôr do 15. kalendárneho dňa nasledujúceho mesiaca po mesiaci, v ktorom bola správa z vládneho auditu doručená auditovanej osobe;
15.	zabezpečenie prístupu do CEDIS pre certifikačný orgán;
16.	zabezpečenie včasného uloženia relevantnej dokumentácie v CEDIS, prípadne ďalších informačných systémoch v súlade s termínmi a postupmi stanovenými orgánom auditu.
Pri príprave účtov predkladaných Európskej komisii orgán auditu komunikuje s riadiacim orgánmi a certifikačným orgánom.
Orgán auditu a spolupracujúce orgány majú právo vyžiadať zabezpečenie priameho pripojenia a prístupu do informačných systémov subjektov zapojených do finančného riadenia v ním určenej lehote. 
3.7	Orgány vydávajúce rozhodnutia v správnom konaní
3.7.1	Úrad vládneho auditu
Úrad vládneho auditu vo vzťahu k vydaným rozhodnutiam v správnom konaní podľa zákona č. 71/1967 Zb. o správnom konaní v znení neskorších predpisov plnia najmä nasledovné úlohy:
1.	v prípade prijímateľa, partnera alebo užívateľa, okrem užívateľa v rámci realizovaného národného projektu prijímateľom, ktorým je Ústredie práce, sociálnych vecí a rodiny predkladanie vydaných rozhodnutí v správnom konaní s prílohou aktualizovanej správy o zistenej nezrovnalosti bezodkladne, najneskôr do 10 pracovných dní odo dňa právoplatnosti I. stupňového rozhodnutia / odo dňa doručenia II. stupňového rozhodnutia vydaného v správnom konaní certifikačnému orgánu a platobnej jednotke, v kópii príslušnému riadiacemu orgánu a orgánu auditu. V prípade užívateľa v rámci realizovaného národného projektu prijímateľom, ktorým je Ústredie práce, sociálnych vecí a rodiny predkladanie vydaných rozhodnutí v správnom konaní najneskôr do 10 pracovných dní odo dňa právoplatnosti I. stupňového rozhodnutia / odo dňa doručenia II. stupňového rozhodnutia vydaného v správnom konaní prijímateľovi, ktorým je Ústredie práce, sociálnych vecí a rodiny;
2.	aktualizovanie údajov v súvislosti so zistenými nezrovnalosťami a splatnými pohľadávkami prijímateľov v ITMS na základe právoplatného rozhodnutia vydaného v správnom konaní;
3.	predloženie aktualizovanej správy o zistenej nezrovnalosti najneskôr do 10 pracovných dní odo dňa splatnosti pohľadávky certifikačnému orgánu, v kópii príslušnému riadiacemu orgánu.
3.7.2	Samostatné oddelenie správneho konania Ministerstva financií SR
Samostatné oddelenie správneho konania Ministerstva financií SR, ktoré nepatrí pod orgán auditu, ale je v priamej riadiacej pôsobnosti vedúceho služobného úradu Ministerstva financií SR, je odvolacím a preskúmavacím orgánom v správnom konaní voči prvostupňovým rozhodnutiam Úradu vládneho audiu vydaným v nadväznosti na porušenie finančnej disciplíny, ktoré bolo zistené na základe vykonaných vládnych auditov zameraných na hospodárenie s prostriedkami štátneho rozpočtu a s prostriedkami EÚ.
Samostatné oddelenie správneho konania Ministerstva financií SR zasiela vydané rozhodnutie v správnom konaní II. stupňa Úradu vládneho auditu, ktorý bezodkladne, najneskôr do 10 pracovných dní odo dňa doručenia právoplatného II. stupňového rozhodnutia Úradu vládneho auditu aktualizuje správu o zistenej nezrovnalosti a spolu s kópiou právoplatného II. stupňového rozhodnutia ju predloží certifikačnému orgánu a v kópii riadiacemu orgánu a orgánu auditu. 
3.8	Orgán zabezpečujúci ochranu finančných záujmov
Funkciu koordinačného útvaru boja proti podvodom v Slovenskej republike, tzv. AFCOS-u (Antifraud Coordination Service) vykonáva orgán zabezpečujúci ochranu finančných záujmov, ktorým je v zmysle § 5 zákona č. 292/2014 Z. z. o príspevku poskytovanom z európskych štrukturálnych a investičných fondov a o zmene a doplnení niektorých zákonov organizačný útvar sekcie kontroly a prevencie korupcie Úradu vlády SR.
Tento orgán je zodpovedný najmä za:
1.	koordináciu opatrení zameraných na ochranu finančných záujmov Európskej únie v Slovenskej republike v súlade s Národnou stratégiou ochrany finančných záujmov Európskych spoločenstiev v Slovenskej republike;
2.	zber a pravidelné oznamovanie nezrovnalostí Európskemu úradu pre boj proti podvodom prostredníctvom informačného systému AFIS;
3.	poskytnutie písomnej informácie o nezrovnalostiach štvrťročne, ktoré boli predmetom pravidelného hlásenia Európskemu úradu pre boj proti podvodom certifikačnému orgánu a relevantným inštitúciám vrátane orgánu auditu a evidovanie týchto údajov v ITMS;
4.	v prípade zistenia nezrovnalosti na základe kontroly vykonanej podľa zákona č. 10/1996 Z. z. informuje riadiaci orgán o zistenej nezrovnalosti a riadiaci orgán vypracuje správu o zistenej nezrovnalosti v súlade s časťou 8.

4.	Financovanie zo štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu
4.1.	Pomoc zo štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu
Pomoc z Európskej únie sa v programovom období 2014 – 2020 v rámci Slovenskej republiky poskytuje najmä prostredníctvom:
a)	Európskeho fondu regionálneho rozvoja,
b)	Európskeho sociálneho fondu,
c)	Kohézneho fondu,
d)	Európskeho námorného a rybárskeho fondu,
e)	Európskeho poľnohospodárskeho fondu pre rozvoj vidieka,
Štrukturálne fondy (Európsky fond regionálneho rozvoja, Európsky sociálny fond) a Kohézny fond prispievajú k rozvoju a uskutočňovaniu činností Únie vedúcich k posilneniu jej hospodárskej, sociálnej a územnej súdržnosti a taktiež prispievajú k plneniu stratégie Únie na zabezpečenie inteligentného, udržateľného a inkluzívneho rastu, pričom sa sledujú tieto ciele:
a)	Investovanie do rastu a zamestnanosti členských štátov a regiónov (financovaný zo štrukturálnych fondov a Kohézneho fondu),
b)	Európska územná spolupráca (financovaný z Európskeho fondu regionálneho rozvoja).
Finančné rozdelenie pre cieľ Investovanie do rastu a zamestnanosti a cieľ Európska územná spolupráca vychádza z kritérií stanovených v čl. 92, 93 a 94 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013.
V rámci cieľa Investovanie do rastu a zamestnanosti sa v podmienkach Slovenskej republiky rozlišujú dve kategórie regiónov na úrovni NUTS 2:
a)	menej rozvinuté regióny,
b)	viac rozvinuté regióny.
V zmysle uznesenia vlády SR č. 157/2002 k alternatívam návrhov na úpravu kategorizácie územno-štatistických jednotiek na úrovni NUTS 2 sú v rámci Slovenskej republiky ustanovené nasledovné regióny NUTS 2: Bratislavský kraj (viac rozvinutý región), Západné Slovensko, Stredné Slovensko a Východné Slovensko (menej rozvinuté regióny). 
V prípade finančnej podpory z Európskeho námorného a rybárskeho fondu sa v rámci Slovenskej republiky nerozlišujú ciele a kategórie regiónov. Možnosť získať prostriedky z Európskeho námorného a rybárskeho fondu majú všetky regióny NUTS 2. 
Na rozdiel od rozdelenia finančných prostriedkov štrukturálnych fondov a Kohézneho fondu podľa jednotlivých cieľov a kategórií regiónov, a určenia minimálneho podielu Európskeho sociálneho fondu v rámci alokácie štrukturálnych fondov, ktoré určuje legislatíva EÚ, rozdelenie alokácií medzi programami je v kompetencii Slovenskej republiky, pri rešpektovaní právomoci Európskej komisie schvaľovať programy v zmysle nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013.
4.2.	Obmedzenia pre využívanie prostriedkov EÚ
Pri financovaní zo štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu v programovom období 2014 – 2020 musia byť splnené nasledovné podmienky:
1.	obdobie oprávnenosti výdavkov na projekty prijímateľov vrátane veľkých projektov, financovaných zo štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu plynie od 1. januára 2014 do 31. decembra 2023 s výnimkou výdavkov v rámci Iniciatívy na podporu zamestnanosti mladých ľudí, v rámci ktorej obdobie oprávnenosti plynie od 1. septembra 2013;
2.	akékoľvek výdavky realizované prijímateľmi pred alebo po uvedenom období nemožno považovať za oprávnené. Projekty financované zo štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu nesmú byť ukončené pred začatím obdobia oprávnenosti. Nariadenia ani žiadna iná legislatíva EÚ nestanovuje, či oprávnené obdobie pre výdavky na príslušný projekt plynie pred alebo po podaní žiadosti o nenávratný finančný príspevok, pričom platí, že výdavky na príslušný projekt nie sú oprávnené, ak sa projekt fyzicky ukončil alebo plne realizoval ešte pred predložením žiadosti o poskytnutie nenávratného finančného príspevku prijímateľom riadiacemu orgánu;
3.	v prípade poskytovania štátnej pomoci na národnej úrovni je oprávnené obdobie pre výdavky stanovené v príslušných schémach štátnej pomoci a schémach pomoci "de minimis" v ich platnom znení. Skrátenie stanoveného oprávneného obdobia v rámci programu je v právomoci riadiaceho orgánu;
4.	programy môžu byť financované spoločne z Európskeho fondu regionálneho rozvoja, Európskeho sociálneho fondu a Kohézneho fondu a môžu zahŕňať viaceré kategórie regiónov (nevzťahuje sa na Kohézny fond);
5.	podpora z Európskeho námorného a rybárskeho fondu je realizovaná len prostredníctvom samostatného programu;
6.	programy sa skladajú z prioritných osí;
7.	prioritná os sa spravidla týka jedného fondu a jednej kategórie regiónov s výnimkou Kohézneho fondu a programu, prostredníctvom ktorého sa financuje technická pomoc v súlade s čl. 59 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013;
8.	prioritná os zodpovedá tematickému cieľu a spravidla zahŕňa jednu alebo viacero investičných priorít tohto tematického cieľa;
9.	v prípade potreby prioritná os môže:
•	zahŕňať viacero kategórií regiónov,
•	kombinovať jednu alebo viacero doplnkových investičných priorít z Európskeho fondu regionálneho rozvoja, Kohézneho fondu a Európskeho sociálneho fondu v rámci jedného tematického cieľa,
•	v riadne odôvodnených prípadoch kombinovať jednu alebo viaceré doplnkové investičné priority rozličných tematických cieľov,
•	v prípade Európskeho sociálneho fondu kombinovať investičné priority tematických cieľov, aby sa uľahčil ich príspevok k iným prioritným osiam. V praxi to znamená, že ak je potrebná dodatočná pomoc z Európskeho sociálneho fondu pre doplnenie špecifických cieľov podporovaných z programov, ktoré sú financované prevažne z Európskeho fondu regionálneho rozvoja alebo z Kohézneho fondu, je možné vytvoriť jednu prioritnú os, ktorá bude kombináciou investičných priorít Európskeho sociálneho fondu, aby sa zabezpečil vyvážený prístup;
10.	v súlade s čl. 98 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 sa financovanie z Európskeho fondu regionálneho rozvoja a Európskeho sociálneho fondu môže dopĺňať do výšky 10 % príspevku EÚ každej prioritnej osi programu pri činnostiach patriacich do rozsahu pôsobnosti pomoci z iného fondu za predpokladu, že tieto činnosti sú potrebné na uspokojivú realizáciu operácie / projektu a sú s ňou priamo spojené.
4.3.	Rozhodnutie Európskej komisie o poskytnutí pomoci a presuny finančných prostriedkov
Rozhodnutie o schválení prijíma Európska komisia k Partnerskej dohode a programom prostredníctvom vykonávacích nariadení. Rozhodnutie k Partnerskej dohode, ktoré prijíma Európska komisia pred schválením programov, obsahuje finančný plán s budúcimi rozpočtovými záväzkami na jednotlivé roky a fondy v členení na programy. Rozhodnutie o schválení programu, ktoré Európska komisia prijíma najneskôr do 6 mesiacov od predloženia akceptovateľného programu členským štátom, nie však pred 1. januárom 2014, obsahuje finančný plán s rozpočtovými záväzkami na roky 2014 – 2020, fondy a kategórie regiónov v členení na prioritné osi.
Presun finančných prostriedkov medzi prioritnými osami programu má dopad na finančný plán a vyžaduje si nové rozhodnutie Európskej komisie po schválení príslušným monitorovacím výborom. Nové rozhodnutie prijme Európska komisia najneskôr do troch mesiacov od predloženia žiadosti o zmenu programu riadiacim orgánom Európskej komisii.
Presuny v rámci programov, ktoré by mali dopad na výšku finančných záväzkov za jednotlivé roky (napr. presun prostriedkov z finančného záväzku roku 2014 do roku 2015) nie sú možné.
Presuny finančných prostriedkov medzi programami majú dopad na finančné plány programov a vyžadujú si nové rozhodnutia Európskej komisie po schválení na národnej úrovni a príslušnými monitorovacími výbormi. Presuny finančných prostriedkov medzi programami berie na vedomie národný monitorovací výbor.
Presuny medzi programami, ktoré by mali dopad na výšku finančných záväzkov príslušných programov za jednotlivé roky a / alebo kategóriu regiónu, sú možné len za predpokladu, že akékoľvek zvýšenie (resp. zníženie) finančného záväzku v rámci programu za určitý rok a / alebo kategóriu regiónu musí byť kompenzované adekvátnym znížením (resp. zvýšením) finančného záväzku v inom programe za ten istý rok a / alebo kategóriu regiónu, keďže celkový finančný záväzok daného roka za príslušnú kategóriu regiónu sa nemôže meniť.
Presuny medzi programami možno realizovať za aktuálne a budúce ročné finančné záväzky na žiadosť členskej krajiny o zmenu programu predloženú Európskej komisii, pričom sa odporúča predkladať žiadosti o zmenu programu najneskôr do 30. septembra roku aktuálneho záväzku. V prípade zmeny programu, ktorej cieľom je prerozdelenie výkonnostnej rezervy na základe preskúmania programu žiadosť o zmenu programu predkladá riadiaci orgán Európskej komisii najneskôr do 31. októbra 2019.
Presuny alokácie medzi viac rozvinutým regiónom a menej rozvinutými regiónmi (medzi regiónom NUTS 2 Bratislavský kraj a ostatnými regiónmi NUTS 2), pri ktorej by sa menila celková alokácia vyčlenená pre viac rozvinutý región a menej rozvinuté regióny, s výnimkou využitia ustanovenia čl. 93 ods. 2 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013, nie sú možné. 
Presuny medzi štrukturálnymi fondmi, Kohéznym fondom a Európskym námorným a rybárskym fondom nie sú možné. 
Presuny v rámci štrukturálnych fondov (medzi Európskym fondom regionálneho rozvoja a Európskym sociálnym fondom) sú možné len po odsúhlasení daného presunu Európskou komisiou.
Presuny finančných prostriedkov medzi cieľom Investovanie do rastu a zamestnanosti a cieľom Európska územná spolupráca nie sú možné.
Presuny medzi prioritnými osami týkajúcimi sa jednej kategórie regiónov sú možné za predpokladu, že sa nezmení celková výška národných zdrojov pre danú prioritnú os, prípadne program. Na prípadnú zmenu (zvýšenie) celkovej výšky národných zdrojov pre program z dôvodu technickej úpravy finančného plánu je potrebný súhlas Ministerstva financií SR.
Príslušné riadiace orgány sú povinné predkladať všetky návrhy na presuny finančných prostriedkov v rámci finančného plánu programu certifikačnému orgánu na posúdenie.
4.4.	Záväzky a platby z EÚ
4.4.1	Záväzky
4.4.1.1	Záväzky vo vzťahu k programom
Príspevok EÚ poskytovaný v rámci štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu sa stanovuje ako viacročný finančný záväzok pre konkrétne programové obdobie pre daný členský štát.
Finančné záväzky týkajúce sa pomoci, ktorá má byť realizovaná viac ako jeden rok, sú prijímané v období od 1. januára 2014 do 31. decembra 2020 každoročne pre program. Finančné záväzky týkajúce sa výkonnostnej rezervy v každom programe sa realizujú oddelene od ostatných prostriedkov, ktoré boli pridelené na program. Pre programy financované z viacerých fondov sa prijíma finančný záväzok za každý fond jednotlivo. Prvý finančný záväzok sa prijme potom, ako Európska komisia vydá rozhodnutie o schválení programu a výkonnostnej rezerve. Následné finančné záväzky sa prijímajú každý rok do 1. mája na základe rozhodnutia podľa časti 4.3 s výnimkou prípadov automatického zrušenia záväzku podľa pravidla "n+3". 
Čerpanie finančných prostriedkov finančných záväzkov na roky 2014 – 2020 pre všetky programy Slovenskej republiky je možné podľa pravidla "n+3" do troch rokov od ich prijatia. Európska komisia automaticky zruší každú časť finančného záväzku, ktorá nebola využitá z počiatočnej zálohovej platby a ročných záloh, alebo na ktorý neprijala prijateľnú žiadosť o platbu od certifikačného orgánu (platby z Európskej komisie sú uvedené v časti 4.4.2) do 31. decembra tretieho roka, ktorý nasleduje po roku prijatia finančného záväzku. 
V praxi to znamená, že za účelom vyhnutia sa automatickému zrušeniu časti finančného záväzku pre rok "n" na daný program:
a)	je potrebné, aby certifikačný orgán predložil Európskej komisii žiadosť o platbu spolu s výkazom výdavkov najneskôr do 31. decembra roku "n+3";
b)	výkaz výdavkov predkladaný Európskej komisii musí zodpovedať výdavkom skutočne realizovaným prijímateľmi, tzn. že tieto výdavky musia byť najneskôr do tohto dátumu schválené na všetkých úrovniach v rámci systému informačných a finančných tokov v súlade s časťou 6.
Výnimkou vo vzťahu k čerpaniu finančného záväzku je prvý finančný záväzok roku 2014, ktorý je znížený o celkovú sumu poskytnutej počiatočnej zálohovej platby Európskou komisiou a finančný záväzok pre rok 2020 (zvýšený o celkovú sumu poskytnutej počiatočnej zálohovej platby Európskou komisiou podľa čl. 134 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013), na ktorý je potrebné požiadať Európsku komisiu o platbu najneskôr do 31. júla 2024 formou záverečnej priebežnej žiadosti o platbu za posledný účtovný rok a zároveň do 15. februára 2025 zaslať záverečnú dokumentáciu podľa čl. 141 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013. Obdobná výnimka pre finančný záväzok pre rok 2020 platí aj pre finančné záväzky týkajúce sa výkonnostnej rezervy, ktorých výška sa pripočítava k finančnému záväzku pre rok 2020. Zároveň vo vzťahu k čerpaniu ročných finančných záväzkov sa zohľadňujú aj ročné zálohy poskytnuté Európskou komisiou v rámci rokov 2016 až 2023.
Automatické zrušenie finančného záväzku sa nevzťahuje na:
•	časť finančného záväzku zodpovedajúcu pozastaveným projektom z dôvodu súdnych konaní alebo odvolaní v správnom konaní, ktoré majú odkladný účinok. Takéto prípady najčastejšie zahrňujú projekty, pri ktorých sa mešká s ich realizáciou, projekty, pri ktorých vznikol spor medzi prijímateľom a dodávateľom, alebo projekty, pri ktorých existuje spor medzi príslušnými orgánmi členského štátu a prijímateľom ohľadne uznania oprávnenosti výdavkov. Tieto prípady sa však musia vzťahovať na práce alebo výdavky, ktoré boli realizované pred 31. decembrom roku "n+3"; 
•	časť finančného záväzku, pre ktorý nebolo možné predložiť prijateľnú žiadosť o platbu z dôvodov vyššej moci, ktorá závažným spôsobom ovplyvňuje realizáciu programu alebo jeho časti. Národné orgány, ktoré vyhlásili pôsobenie vyššej moci, musia dokázať jej priame následky na realizáciu programu alebo jeho časti;
O zníženie sumy, ktorej sa týka automatické zrušenie záväzku možno požiadať raz, ak odkladný účinok alebo pôsobenie vyššej moci netrvalo dlhšie ako jeden rok, alebo niekoľkokrát podľa dĺžky pôsobenia vyššej moci alebo počtu rokov medzi dátumom súdneho alebo správneho rozhodnutia, ktoré majú odkladný účinok na plnenie projektu, a dátumom konečného súdneho alebo správneho rozhodnutia. 
Certifikačný orgán je povinný zaslať Európskej komisii do 31. januára informácie o týchto výnimkách, vrátane vyčíslenia predmetných čiastok, ktoré by za normálnych okolností boli deklarované v žiadostiach o platbu do konca predchádzajúceho roka "n+3".
•	časť finančného záväzku, pre ktorý predložil certifikačný orgán žiadosť o platbu, ale ktorej úhradu Európska komisia prerušila alebo pozastavila do 31. decembra roku "n+3" v súlade s čl. 83 a 142 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013. 
Certifikačný orgán monitoruje stav čerpania finančných prostriedkov aj s ohľadom na potenciálne riziko automatického zrušenia finančného záväzku. 
V prípade existencie rizika automatického zrušenia finančného záväzku Európska komisia najneskôr do 31. januára informuje členský štát a riadiaci orgán o výške sumy automatického zrušenia finančného záväzku. Odo dňa prijatia tejto informácie má členský štát dvojmesačnú lehotu na odsúhlasenie stanovenej sumy, resp. na predloženie pripomienok. Riadiaci orgán do 30. júna zostaví a zašle Európskej komisii revidovaný finančný plán na príslušný rozpočtový rok, v ktorom odzrkadlí zníženú sumu na relevantné prioritné osi programu. Predmetný revidovaný finančný plán pred jeho zaslaním Európskej komisii predloží certifikačnému orgánu na posúdenie a centrálnemu koordinačnému orgánu na vedomie. Ak riadiaci orgán nepredloží Európskej komisii revidovaný finančný plán do 30. júna, Európska komisia pomerne zníži príspevok EÚ pre každú prioritnú os programu. O čiastku automatického zrušenia finančného záväzku Európska komisia zníži príspevok EÚ (finančný záväzok) na príslušný rok zmenou rozhodnutia o schválení programu prostredníctvom vykonávacieho nariadenia Európskej komisie najneskôr do 30. septembra.
4.4.1.2	Záväzky vo vzťahu k projektom
Nariadenia ani žiadna iná legislatíva EÚ pre programové obdobie 2014 – 2020 nestanovujú konečný termín na uzavretie zmluvných záväzkov s prijímateľmi, tzn. že rozhodnutia o schválení žiadosti / zmluvy o poskytnutí nenávratného finančného príspevku / zmluvy o financovaní môžu byť uzatvárané aj v rokoch 2021 – 2023. Pri poskytovaní pomoci podľa schém štátnej pomoci a schém pomoci "de minimis" stanovujú konečný termín na uzavretie zmluvných záväzkov s prijímateľmi príslušné ustanovenia týchto schém v ich platnom znení. Uzatváranie zmluvných záväzkov s prijímateľmi v rokoch 2021 – 2023 je možné len za predpokladu platnosti a účinnosti jednotlivých schém štátnej pomoci a schém pomoci "de minimis", resp. vypracovania nových schém štátnej pomoci a schém pomoci "de minimis". Prijímateľ je však povinný realizovať svoje výdavky najneskôr do 31. decembra 2023, v opačnom prípade ich nie je možné považovať za oprávnené.
Nariadenia ani žiadna iná legislatíva EÚ pre programové obdobie 2014 – 2020 rovnako nestanovujú pravidlo "n+3" na dobu implementácie jednotlivých projektov, tzn. že projekty je možné realizovať aj po dobu dlhšiu, ako sú štyri roky.
Nariadenia ani žiadna iná legislatíva EÚ pre programové obdobie 2014 – 2020 rovnako nestanovujú maximálne objemy finančných prostriedkov na projekty, tzn. že rozhodnutia o schválení žiadosti / zmluvy o poskytnutí nenávratného finančného príspevku / zmluvy o financovaní môžu byť v príslušnom roku uzatvárané nad rámec výšky daného finančného záväzku. Riadiaci orgán môže určiť tieto objemy za predpokladu dodržania celkovej sumy finančných záväzkov na daný program. Z pohľadu čerpania jednotlivých ročných finančných záväzkov na príslušný program platí, že tieto finančné záväzky je možné čerpať najskôr v roku prijatia daného finančného záväzku (napr. v roku 2016 je možné čerpať z finančných záväzkov z rokov 2014 až 2016, nie však z roku 2017).
Výdavky na jednotlivé projekty možno čerpať z viacerých finančných záväzkov pre program, za predpokladu rešpektovania pravidla "n+3", tzn. že finančné prostriedky zo záväzku roku "n" je možné dočerpať do roku "n+3". V praxi to znamená, že na: 
a)	projekt schválený v roku 2014 možno čerpať z finančného záväzku roku 2014, aj z finančných záväzkov rokov 2015 až 2020;
b)	projekt schválený v roku 2015 možno čerpať z finančného záväzku roku 2014 (v prípade, ak nie je dočerpaný), aj z finančných záväzkov rokov 2015 až 2020;
c)	projekt schválený v roku 2016 možno čerpať z finančných záväzkov rokov 2014, 2015 (v prípade, ak nie je dočerpaný), aj z finančných záväzkov rokov 2016 až 2020;
d)	projekt schválený v roku 2017 možno čerpať z finančných záväzkov rokov 2014, 2015 a 2016 (v prípade, ak nie je finančný záväzok za príslušný rok dočerpaný), aj z finančných záväzkov rokov 2017 až 2020.
4.4.2	Platby z Európskej komisie
Prostriedky EÚ prevádza Európska komisia na mimorozpočtový účet Ministerstva financií SR v Štátnej pokladnici zriadený v súlade s § 10 zákona č. 291/2002 Z. z. o Štátnej pokladnici a o zmene a doplnení niektorých zákonov v znení neskorších predpisov. 
Úroky získané z prostriedkov EÚ poskytnutých Európskou komisiou formou zálohových platieb na mimorozpočtovom účte Ministerstva financií SR sú považované za zdroje Slovenskej republiky.
Platby z Európskej komisie realizované pre každý program jednotlivo majú formu počiatočnej zálohovej platby, ročných záloh, priebežných platieb a záverečnej platby a používajú sa výlučne na financovanie výdavkov súvisiacich s príslušným programom. Počiatočná zálohová platba je priradená k prvému ročnému finančnému záväzku. Každá nasledovná platba sa priraďuje k najstaršiemu dostupnému finančnému záväzku. Platby z finančných záväzkov výkonnostnej rezervy môžu byť vykonané až po konečnom pridelení tejto rezervy v zmysle čl. 22 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013.
Priebežné platby a záverečnú platbu realizuje Európska komisia podľa pomeru stanoveného v príslušnom rozhodnutí o poskytnutí pomoci pre daný program na úrovni prioritných osí k celkovým oprávneným výdavkom uvedeným v predloženom výkaze výdavkov v zmysle čl. 120 ods. 2 písm. a) nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013.
Akákoľvek komunikácia medzi certifikačným orgánom a Európskou komisiou týkajúca sa platieb sa uskutočňuje elektronickými prostriedkami. V prípade vyššej moci, a najmä ak nastane porucha spoločného počítačového systému, alebo ak nie je trvalé spojenie, certifikačný orgán môže zaslať výkaz výdavkov a žiadosť o platbu v písomnej forme.
4.4.2.1	Počiatočná zálohová platba z Európskej komisie
Pri prijatí rozhodnutia o schválení programu prevedie Európska komisia počiatočnú zálohovú platbu na mimorozpočtový účet Ministerstva financií SR v Štátnej pokladnici. Celá výška počiatočnej zálohovej platby je priradená k prvému ročnému finančnému záväzku. Zálohová platba nemusí byť členským štátom podložená skutočne vynaloženými výdavkami prijímateľov až do podania žiadosti o záverečnú priebežnú platbu Európskej komisii v roku 2024, resp. záverečnej dokumentácie predloženej Európskej komisii do 15. februára 2025, dokedy musí byť najneskôr v celej sume zúčtovaná. 
Podľa čl. 134 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 predstavuje počiatočná zálohová platba 3 % z celkových finančných záväzkov EÚ vyčlenených na daný program pre každý fond. Pri výpočte počiatočnej zálohovej platby sa do celkových finančných záväzkov nezarátava suma výkonnostnej rezervy, ktorá bola pridelená programu.
Počiatočná zálohová platba na program je rozdelená na tri rozpočtové roky:
a)	1 % z celkového záväzku v roku 2014, 
b)	1 % z celkového záväzku v roku 2015, 
c)	1 % z celkového záväzku v roku 2016.
Počiatočná zálohová platba predstavuje počiatočný finančný kapitál pokrývajúci výdavky na rozbehnutie programov.
4.4.2.2	Ročné zálohy z Európskej komisie
V zmysle čl. 134 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 každý rok od roku 2016 do roku 2023 vždy pred 1. júlom prevedie Európska komisia ročnú zálohu na mimorozpočtový účet Ministerstva financií SR nasledovne:
a)	2 % z celkového záväzku v roku 2016,
b)	2,625 % z celkového záväzku v roku 2017,
c)	2,75 % z celkového záväzku v roku 2018,
d)	2,875 % z celkového záväzku v roku 2019,
e)	3 % z celkového záväzku v rokoch 2020 až 2023.
Pri výpočte ročných záloh do roku 2020 vrátane sa do celkových finančných záväzkov nezarátava suma výkonnostnej rezervy, ktorá bola pridelená programu. Ročné zálohy predstavujú doplnok k počiatočnej zálohovej platbe za účelom poskytnutia pravidelného peňažného toku podporujúceho realizáciu pomoci. Na rozdiel od počiatočnej zálohovej platby sa automaticky nepriraďujú k prvému ročnému finančnému záväzku, a preto sa ani o ich sumu neznižuje prvý rozpočtový záväzok roku 2014 ani ďalšie rozpočtové záväzky. Pravidlá zúčtovania ročných záloh sú uvedené v časti 4.4.3. 
4.4.2.3	Priebežné platby z Európskej komisie
Certifikačný orgán na základe ním schválených súhrnných žiadostí o platbu / mimoriadnych súhrnných žiadostí o platbu zaúčtovaných v príslušnom účtovnom roku v ISUF predkladá Európskej komisii žiadosti o platbu podľa potreby za účelom doplnenia finančných prostriedkov EÚ na mimorozpočtovom účte Ministerstva financií SR. Ak certifikačný orgán uzná za potrebné, môže časť výdavkov schválených v súhrnných žiadostiach o platbu / mimoriadnych súhrnných žiadostiach o platbu a zaúčtovaných v ISUF v príslušnom účtovnom roku zahrnúť do žiadostí o platbu Európskej komisii v nasledovných účtovných rokoch. 
Záverečnú priebežnú žiadosť o platbu pre príslušný účtovný rok predkladá certifikačný orgán v podmienkach SR najneskôr do 30. apríla. Prvú žiadosť o platbu nasledovného účtovného roka predkladá certifikačný orgán Európskej komisii až po predložení záverečnej priebežnej žiadosti o platbu predchádzajúceho účtovného roka. 
Prvú priebežnú platbu prevedie Európska komisia za predpokladu splnenia podmienok stanovených čl. 135 ods. 3 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013, tzn. že pred predložením prvej priebežnej žiadosti o platbu musí byť Európska komisia informovaná o dátume a forme určenia riadiaceho a certifikačného orgánu pre príslušný program. Určenie týchto orgánov vychádza zo správy nezávislého auditného subjektu hodnotiacej súlad určených orgánov s kritériami stanovenými v prílohe XIII nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013. 
Každú priebežnú platbu prevedie Európska komisia na mimorozpočtový účet Ministerstva financií SR v zmysle čl. 130 ods. 1 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 vo výške 90 % deklarovaných výdavkov uplatňujúc mieru financovania pre príslušnú prioritnú os v zmysle aktuálne platného finančného plánu programu, a to na základe skutočne vynaložených a uhradených výdavkov prijímateľov zaúčtovaných certifikačným orgánom, ktoré boli alebo majú byť preplatené z nenávratného finančného príspevku. 
Tieto výdavky musia byť podložené faktúrami alebo dokladmi rovnocennej dôkaznej hodnoty s výnimkou prípadov uplatnenia zjednodušeného vykazovania výdavkov v zmysle čl. 67 ods. 1 písm. b), c) a d), čl. 68, čl. 69 ods. 1 a spoločných akčných plánov v zmysle čl. 109 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 ako aj čl. 14 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1304/2013 o Európskom sociálnom fonde a o zrušení nariadenia Rady (ES) č. 1081/2006. V daných prípadoch sú deklarované výdavky v žiadosti o platbu vypočítané na základe stanovených pravidiel. Čo sa týka projektov realizovaných v rámci schém štátnej pomoci alebo schém pomoci "de minimis", deklarované výdavky zodpovedajúce nenávratnému finančnému príspevku musia byť v čase predloženia žiadosti o platbu Európskej komisii aj preplatené prijímateľom.
Z vyššie uvedeného vyplýva, že každá žiadosť o platbu predložená Európskej komisii môže obsahovať iba výdavky, ktoré zodpovedajú schváleným súhrnným žiadostiam o platbu / mimoriadnym súhrnným žiadostiam o platbu certifikačným orgánom.
Najskorším momentom zahrnutia výdavkov do žiadosti o platbu Európskej komisii je schválenie súhrnnej žiadosti o platbu, resp. mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu certifikačným orgánom.
Výdavky veľkých projektov definovaných v čl. 100 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 môžu byť zahrnuté do žiadosti o platbu Európskej komisii až potom, ako riadiaci orgán zaslal Európskej komisii notifikáciu o jeho schválení alebo žiadosť o jeho schválenie podľa čl. 102 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013.
Pokiaľ ide o finančné nástroje, do každej priebežnej žiadosti o platbu na Európsku komisiu sa zahrnú príspevky programu vyplatené na finančné nástroje ako aj informácia o výdavkoch, ktoré boli efektívne vyplatené ako oprávnené výdavky konečným prijímateľom podľa čl. 42 ods. 1 písm. a), b) a d) v súlade s podmienkami definovanými v čl. 41 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a ktoré boli schválené v rámci súhrnnej žiadosti o platbu / mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu certifikačným orgánom.
Európska komisia prevedie priebežnú platbu za splnenia nasledovných podmienok:
a)	certifikačný orgán predložil Európskej komisii žiadosť o platbu;
b)	riadiaci orgán zaslal Európskej komisii najnovšiu výročnú správu o vykonávaní programu schválenú monitorovacím výborom;
c)	Európska komisia nerozhodla o žiadnom pozastavení ani prerušení platieb.
V závislosti od dostupných finančných prostriedkov Európska komisia prevedie priebežné platby na mimorozpočtové účty Ministerstva financií SR najneskôr do 60 dní odo dňa zaregistrovania žiadosti o platbu.
4.4.3	Účty
Výdavky sú v žiadostiach o platbu (priebežné platby, ktoré sú Európskou komisiou uhrádzané vo výške 90 %) pre program deklarované kumulatívne priebežne v príslušnom účtovnom roku, a to najneskôr do 31. júla, t. j. do jedného mesiaca po skončení príslušného účtovného roka, pričom v podmienkach SR je to najneskôr do 30. apríla, resp. výdavkov deklarovaných v záverečnej priebežnej žiadosti o platbu na Európsku komisiu, ktorá sa predkladá najskôr 1. júla po skončení príslušného účtovného roka (pričom platí, že táto záverečná priebežná žiadosť o platbu na Európsku komisiu nebude obsahovať nové deklarované výdavky nad rámec ostatnej priebežnej žiadosti o platu predloženej do 30. apríla. 
V súlade s nariadením Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 každý účtovný rok je členský štát povinný zúčtovať a za týmto účelom predkladať Európskej komisii v termíne do 15. februára roku "n+1"5 od roku 2016 do roku 2025 vrátane nasledovné dokumenty: 
a)	Účty predložené certifikačným orgánom v zmysle čl. 59 ods. 5 písm. a) nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 966/2012, ktoré obsahujú na úrovni každej prioritnej osi, fondu a kategórie regiónov:
•	výkaz oprávnených výdavkov zaúčtovaných certifikačným orgánom v ISUF, ktoré boli zahrnuté v žiadostiach o platbu predložených Európskej komisii do 31. júla nasledujúceho po skončení príslušného účtovného roka a zodpovedajú sume verejných výdavkov,
•	výkaz prostriedkov, ktoré boli počas účtovného roka stiahnuté alebo odpočítané zo žiadostí o platbu na Európsku komisiu; výkaz prostriedkov, ktoré majú byť vrátené do konca účtovného roka; výkaz prostriedkov, ktoré boli odpočítané v zmysle čl. 71 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013; výkaz nevymožiteľných súm,
•	kumulatívny výkaz prostriedkov vyplatených na finančné nástroje podľa čl. 41 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 v členení podľa príspevkov vyplatených z programu a deklarovaných v žiadostiach o platbu a prostriedkov efektívne vyplatených ako oprávnené výdavky konečným prijímateľom podľa čl. 42 ods. 1 písm. a), b) a d),
•	kumulatívny výkaz o poskytnutých zálohách v rámci schém pomoci podľa čl. 107 Zmluvy o fungovaní EÚ v zmysle čl. 131 ods. 5 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013,
•	výkaz porovnania výdavkov deklarovaných v žiadostiach o platbu Európskej komisii a oprávnených výdavkov deklarovaných vo výkaze oprávnených výdavkov podľa prvej odrážky písm. a) tejto časti materiálu, vyčíslenie tohto rozdielu a v prípade rozdielu jeho zdôvodnenie;
b)	Vyhlásenie riadiaceho orgánu o vierohodnosti a Ročný súhrn konečných audítorských správ a výsledkov uskutočnených kontrol, vrátane analýzy o povahe a rozsahu chýb a slabých stránkach nájdených v systémoch riadenia a kontroly a o akýchkoľvek prijatých opravných opatreniach, ktoré predkladá riadiaci orgán v zmysle čl. 125 ods. 4 písm. e) nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 v súlade s čl. 59 ods. 5 písm. a) nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ, Euratom) č. 966/2012;
c)	Stanovisko k účtom a k súhrnu konečných audítorských správ a kontrol podľa čl. 127 ods. 5 písm. a) nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013. V stanovisku sa uvedie, či účtovné informácie poskytujú pravdivý a reálny obraz, či sú výdavky v súvislosti s ktorými sa od Európskej komisie požaduje preplatenie zákonne a správne a či zavedené kontrolné systémy fungujú riadne. V stanovisku sa tiež uvedie, či zistenia auditu spochybňujú tvrdenia uvedené vo vyhlásení riadiaceho orgánu vypracovaného podľa čl. 59 ods. 5 písm. a) prvý pododsek nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ, Euratom) č. 966/2012;
d)	Kontrolnú správu, ktorá obsahuje hlavné zistenia vykonaných auditov vrátane zistení týkajúcich sa nedostatkov zistených v rámci systémov riadenia a kontroly a navrhované a zrealizované nápravné opatrenia podľa čl. 127 ods. 5 písm. b) nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013.
Certifikačný orgán je oprávnený na základe podnetu riadiaceho orgánu a orgánu auditu, resp. na základe vlastného podnetu dočasne vyčleniť z účtov výdavky zahrnuté v žiadostiach o platbu príslušného účtovného roka z dôvodu prebiehajúceho posudzovania ich zákonnosti a správnosti. V prípade preukázania zákonnosti a správnosti týchto výdavkov alebo ich časti, je certifikačný orgán oprávnený zahrnúť ich do žiadostí o platbu vzťahujúcich sa na nasledovné účtovné roky. 
Európska komisia posúdi predložené dokumenty, pričom je oprávnená dožiadať doplňujúce informácie s cieľom stanovenia, že účty sú úplné, presné a pravdivé. V takom prípade schváli účty a informuje členský štát v termíne do 31. mája, a to za podmienky, že orgán auditu poskytol stanovisko podľa písm. c) tejto časti bez výhrad k úplnosti, presnosti a pravdivosti účtov, a že existuje dôkaz o spoľahlivosti stanoviska orgánu auditu. 
V prípade, ak Európska komisia neschváli účty do 31. mája, prijme rozhodnutie prostredníctvom vykonávacieho nariadenia s uvedením dôvodov a harmonogramu krokov, ktoré sa majú prijať na to, aby boli účty schválené. Schválenie účtov Európskou komisiou sa týka výhradne úplnosti, presnosti a pravdivosti účtov a nie zákonnosti a správnosti zahrnutých výdavkov. Procedúra schvaľovania účtov nemôže byť dôvodom prerušenia ani pozastavenia platieb podľa čl. 83 a 142 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013.
Na základe schválených účtov Európska komisia vypočíta sumu, ktorú je potrebné preplatiť alebo vrátiť zohľadňujúc rozdiel medzi: 
•	sumou deklarovaných oprávnených výdavkov v účtoch a
•	sumou ročnej zálohy a priebežných platieb.
Európska komisia následne zúčtuje príslušnú ročnú zálohu a v prípade, ak suma deklarovaných oprávnených výdavkov v účtoch prevyšuje sumu ročnej zálohy a priebežných platieb, prevedie sumu ročného zostatku na mimorozpočtový účet Ministerstva financií SR pre program do 30. dní od schválenia účtov. V opačnom prípade je suma rozdielu vrátená Európskej komisii transferom v prospech účtu Európskej komisie alebo odpočítaním z nasledovnej žiadosti o platbu. Takéto vrátenie neznamená finančnú opravu. 
V prípade nesúhlasu s účtami Európska komisia vypočíta sumu, ktorú je potrebné preplatiť alebo vrátiť na základe dostupných informácií zohľadňujúc skutočnosti uvedené v predchádzajúcom odseku. Pokiaľ členský štát súhlasí s vypočítanou sumou do dvoch mesiacov, uplatní sa obdobný postup uvedený v predchádzajúcom odseku. V prípade nesúhlasu členského štátu Európska komisia prijme rozhodnutie prostredníctvom vykonávacieho nariadenia o sume ročného zostatku, ktorú je potrebné preplatiť certifikačnému orgánu alebo vrátiť Európskej komisii. Toto rozhodnutie rovnako neznamená finančnú opravu. 
Schválením účtov Európskou komisiou nie je dotknutá jej právomoc následne vykonať finančné opravy v zmysle čl. 144 a 145 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013.
V prípade zistenia nezrovnalosti členským štátom po predložení účtov Európskej komisii, je možné tieto výdavky nahradiť inými výdavkami za predpokladu, že účty, v ktorých sa nezrovnalosti zistili, boli následne upravené o sumu nezrovnalosti. Týmto však rovnako nie je dotknutá právomoc Európskej komisie vykonať finančné opravy v zmysle čl. 144 a 145 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013.
V rámci zúčtovania posledného účtovného roka riadiaci orgán okrem štandardne predkladaných dokumentov uvedených vyššie predkladá pre účely uzatvárania pomoci do 15. februára 2025 záverečnú správu o vykonávaní programu, resp. poslednú výročnú správu o vykonávaní programu v prípade programu financovaného z Európskeho námorného a rybárskeho fondu. 
V prípade preplatku, záverečnú platbu vo forme posledného ročného zostatku prevedie Európska komisia na mimorozpočtový účet Ministerstva financií SR v termíne do 3 mesiacov od schválenia účtov za posledný účtovný rok alebo do jedného mesiaca od schválenia záverečnej správy o vykonávaní / poslednej výročnej správy o vykonávaní programu financovaného z Európskeho námorného a rybárskeho fondu (podľa toho, ktorý z termínov nastane neskôr). V prípade nedoplatku vráti finančné prostriedky certifikačný orgán Európskej komisii na základe príkazu na vrátenie.
Postupy spracovania účtov na národnej úrovni sú bližšie rozpracované v časti 4.5.8. 
4.5	Platby na národnej úrovni
4.5.1	Zaradenie prostriedkov EÚ do štátneho rozpočtu
Prostriedky EÚ sa v súlade so zákonom č. 523/2004 Z. z. o rozpočtových pravidlách verejnej správy zaraďujú do príjmov štátneho rozpočtu po ich prevode z mimorozpočtového účtu Ministerstva financií SR na príjmový účet platobnej jednotky (okrem prostriedkov poskytnutých v rámci cieľa Európska územná spolupráca, pri ktorých Ministerstvo financií SR neplní úlohy certifikačného orgánu).
Na použitie účelovo určených prostriedkov EÚ poskytnutých Slovenskej republike, zaradených do príjmov štátneho rozpočtu, sa v štátnom rozpočte v dotknutých ministerstvách rozpočtujú príslušné výdavky v zmysle § 8 ods. 3 zákona č. 523/2004 Z. z. o rozpočtových pravidlách verejnej správy. Tieto výdavky sa poskytujú prijímateľovi prostredníctvom platobných jednotiek na základe podmienok určených v zmluve o poskytnutí nenávratného finančného príspevku v zmysle § 20 ods. 2 zákona č. 523/2004 Z. z. o rozpočtových pravidlách verejnej správy.
V súlade § 8 ods. 4 zákona č. 523/2004 Z. z. o rozpočtových pravidlách verejnej správy možno prostriedky EÚ a prostriedky štátneho rozpočtu na spolufinancovanie použiť aj v nasledujúcich rozpočtových rokoch až do ich vyčerpania na určený účel.
Vláda môže zmeniť účel použitia výdavkov, ktoré možno použiť v nasledujúcich rozpočtových rokoch. Pri zmene účelu použitia na bežné výdavky je tieto možné použiť len do konca rozpočtového roka, v ktorom bol zmenený účel použitia výdavkov. Správca kapitoly je povinný oznámiť Ministerstvu financií SR výšku všetkých výdavkov (t. j. výdavkov platobnej jednotky), ktoré použije až v nasledujúcom rozpočtovom roku do 15. decembra bežného rozpočtového roka. Termín nahlásenia všetkých výdavkov z prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie, ktoré kapitola použije v nasledujúcom rozpočtovom roku, je 20. november a do 15. decembra doručuje potvrdenia oznámenia z 20. novembra. Po doručení tohto oznámenia Ministerstvo financií SR viaže tieto prostriedky a o sumu viazaných prostriedkov môže povoliť prekročenie limitu výdavkov v nasledujúcom rozpočtovom roku. V nasledujúcom rozpočtovom roku sa plnenie rozpočtu verejnej správy sleduje v zmysle platnej rozpočtovej klasifikácie.
4.5.1.1	Programové rozpočtovanie
Prostriedky EÚ a prostriedky štátneho rozpočtu na spolufinancovanie sú zaradené do programovej štruktúry relevantných rozpočtových kapitol.
Spôsob zaradenia prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie do programov príslušných kapitol je stanovený v metodickom pokyne Ministerstva financií SR na usmernenie programového rozpočtovania. Príslušnej úrovni programovej štruktúry programu je okrem kódu programového rozpočtovania priradený špeciálny kód (eurokód), ktorý umožní z Rozpočtového informačného systému vyselektovať výstupy výdavkov, resp. prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie na spoločné programy Slovenskej republiky a EÚ a zároveň zabezpečí kompatibilitu s ITMS a ISUF. Číselník kódov pre prostriedky EÚ a pre prostriedky štátneho rozpočtu na spolufinancovanie je vydaný samostatným usmernením Ministerstva financií SR.
Presuny rozpočtových prostriedkov v rámci rozpočtu daného programu možno vykonať v súlade so zákonom č. 523/2004 Z. z. o rozpočtových pravidlách verejnej správy a platným metodickým pokynom Ministerstva financií SR na usmernenie programového rozpočtovania. Presuny týchto prostriedkov schválených v programoch, častiach programov nie je možné realizovať do ostatných programov, resp. častí programov, ktoré v štruktúre programového rozpočtovania nemajú väzbu na tieto prostriedky.
4.5.1.2	Realizácia výdavkov prostredníctvom Štátnej pokladnice
Certifikačný orgán postupuje pri realizácii výdavkov zo zdrojov EÚ podľa § 10 zákona č. 291/2002 Z. z. o Štátnej pokladnici a o zmene a doplnení niektorých zákonov v znení neskorších predpisov.
Platobné jednotky postupujú pri realizácii výdavkov zo zdrojov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie podľa § 8 zákona č. 291/2002 Z. z. o Štátnej pokladnici a o zmene a doplnení niektorých zákonov v znení neskorších predpisov.
4.5.2	Platby vo vzťahu certifikačný orgán – platobná jednotka
Certifikačný orgán prevádza prostriedky EÚ platobnej jednotke po schválení súhrnnej žiadosti o platbu / mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu na základe čiastkového výkazu výdavkov predloženého platobnou jednotkou (časť 6).
Prostriedky EÚ sú z mimorozpočtového účtu Ministerstva financií SR prevedené na príslušný príjmový účet platobnej jednotky.
4.5.3	Platby vo vzťahu platobná jednotka – prijímateľ / partner
Prijímatelia alebo partneri podľa zmluvy o poskytnutí nenávratného finančného príspevku môžu byť zo sektora verejnej správy alebo zo súkromného sektora. Medzi prijímateľov / partnerov z verejnej správy v súlade s § 3 zákona č. 523/2004 Z. z. o rozpočtových pravidlách verejnej správy patria:
•	subjekty ústrednej správy:
a)	štátne rozpočtové organizácie;
b)	štátne príspevkové organizácie;
c)	verejné vysoké školy;
d)	iné subjekty, ktoré sú zapísané v registri organizácií vedených Štatistickým úradom SR podľa § 19 až 21 zákona č. 540/2001 Z. z. o štátnej štatistike v znení neskorších predpisov;
•	subjekty územnej samosprávy:
a)	obce alebo nimi zriadené rozpočtové a príspevkové organizácie;
b)	vyššie územné celky alebo nimi zriadené rozpočtové a príspevkové organizácie;
•	združenia právnických osôb zo sektora verejnej správy (všetci členovia združenia sú zo sektora verejnej správy).
Medzi prijímateľov / partnerov zo súkromného sektora patria subjekty, ktoré nespadajú pod definíciu § 3 zákona č. 523/2004 Z. z. o rozpočtových pravidlách verejnej správy:
a)	iné právnické osoby;
b)	fyzické osoby;
c)	združenia právnických osôb v prípade, ak minimálne jeden člen združenia je zo súkromného sektora.
Prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie sú prijímateľom / partnerom poskytované systémom:
•	predfinancovania
•	zálohových platieb
•	refundácie.
Systém predfinancovania sú oprávnení využívať prijímatelia – štátne rozpočtové organizácie pre projekty financované z Európskeho sociálneho fondu (časť 6.2) a prijímatelia pre projekty financované z Európskeho fondu regionálneho rozvoja, Európskeho námorného a rybárskeho fondu a Kohézneho fondu (časť 6.1 a 6.2).
Systém zálohových platieb sú oprávnení využiť prijímatelia pre projekty financované z Európskeho sociálneho fondu (časť 6.3) a prijímatelia – štátne rozpočtové organizácie pre projekty financované z Európskeho sociálneho fondu, Európskeho fondu regionálneho rozvoja, Európskeho námorného a rybárskeho fondu a Kohézneho fondu (časť 6.4).
Systém refundácie sa uplatňuje v prípade určenia riadiaceho orgánu po dohode s prijímateľom a v prípade záverečných platieb pri uplatnených systémoch predfinancovania, resp. zálohových platieb (s výnimkou systému predfinancovania a systému zálohových platieb pre prijímateľov – štátne rozpočtové organizácie).
Prijímateľom (okrem štátnych rozpočtových organizácií), ktorí sú oprávnení využívať systém predfinancovania s kombináciou refundácie (časť 6.1.), resp. systém zálohovej platby s kombináciou refundácie (časť 6.3.), sú na základe predložených žiadostí o platbu (primerane použitých k využitému systému financovania) preplácané finančné prostriedky do momentu dosiahnutia maximálne 95 % nenávratného finančného príspevku. Suma každej uhradenej žiadosti o platbu prijímateľa sa napočítava do jednej spoločnej sumy, ktorá vyjadruje sumárny stav percentuálneho čerpania celkových oprávnených výdavkov na projekt k aktuálnemu obdobiu. Po vyčerpaní maximálne 95 % nenávratného finančného príspevku je prijímateľ povinný zostávajúcich minimálne 5 % nenávratného finančného príspevku, aj za podiel prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie, uhradiť najskôr z vlastných zdrojov.
Prijímatelia v rámci Programu Interreg V-A SK – CZ, Programu Interreg V-A SK – AT a Programu Interreg V-A SK – HU sú oprávnení využívať prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie výlučne systémom refundácie.
Pre prijímateľa – v rámci implementácie finančných nástrojov sa prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie platobnou jednotkou prevádzajú v jednej alebo viacerých tranžiach (časť 4.8.6) v súlade s čl. 41 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č.1303/2013 na základe žiadosti o platbu.
Systém financovania partnera prijímateľa sa uplatňuje podľa využívaného systému financovania prijímateľom, v závislosti od dohody medzi prijímateľom a partnerom a za podmienok stanovených v zmluve. V prípade, ak je partner účastníkom zmluvného vzťahu podľa § 25 ods. 3 zákona č. 292/2014 Z. z. o príspevku poskytovanom z európskych štrukturálnych a investičných fondov a o zmene a doplnení niektorých zákonov, môže platobná jednotka realizovať poskytnutie príspevku alebo jeho časti priamo partnerovi alebo prostredníctvom prijímateľa. Každú žiadosť o platbu prijímateľ predkladá samostatne za seba a samostatne za partnera.
V prípade, ak je projekt financovaný z viacerých prioritných osí, prijímateľ predkladá žiadosť o platbu za každú prioritnú os samostatne. V prípade, ak je projekt financovaný na princípe "pro-rata" z oboch kategórií regiónov, prijímateľ predkladá len jednu žiadosť o platbu za obe kategórie regiónov. 
Prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie sa prijímateľovi poskytujú na základe žiadosti o platbu. Každú žiadosť o platbu najneskôr do 31. decembra 2015 vyhotovuje prijímateľ v dvoch rovnopisoch, pričom jeden rovnopis zostáva u prijímateľa a druhý predkladá riadiacemu orgánu. Prijímateľ predkladá žiadosť o platbu prostredníctvom verejnej časti ITMS, pričom za predloženie žiadosti o platbu riadiacemu orgánu sa považuje jej zaslanie cez verejnú časť ITMS a zároveň najneskôr do 31. decembra 2015 aj písomné doručenie vytlačenej žiadosti o platbu z ITMS označenej podpisom štatutárneho orgánu prijímateľa, pričom riadiaci orgán je povinný zaevidovať doručenie žiadosti o platbu v ITMS až po prijatí písomnej verzie žiadosti o platbu.
Riadiaci orgán je oprávnený zvýšiť alebo znížiť výšku žiadosti o platbu z technických dôvodov na strane riadiaceho orgánu maximálne do výšky 1 EUR v rámci jednej žiadosti o platbu, pričom celková suma poskytnutého príspevku môže byť prekročená maximálne o 1 EUR. 
Minimálna výška žiadosti o platbu, ktorú predkladá prijímateľ, je 40,00 EUR, s výnimkou žiadosti o platbu – poskytnutie predfinancovania a zúčtovanie zálohovej platby v prípadoch nevyhnutných pre splnenie podmienok na zúčtovanie. Riadiaci orgán môže na základe vzájomnej dohody s prijímateľom stanoviť prísnejšie pravidlá na minimálnu výšku výdavkov deklarovaných v žiadosti o platbu.
Poskytnutie prostriedkov systémom refundácie podlieha predchádzajúcemu schváleniu certifikačného orgánu. Poskytnutie prostriedkov systémom predfinancovania a zálohových platieb nepodlieha predchádzajúcemu schváleniu certifikačného orgánu.
Každá platba prijímateľovi z prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie je realizovaná v EUR len do výšky súčtu pomeru zdrojov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie z oprávnených výdavkov projektu, okrem prípadov, ak sa prijímateľ podieľa na financovaní projektu materiálnymi príspevkami (in-kind). V prípade, ak má prijímateľ povinnosť použiť vlastné zdroje, každá platba musí byť doplnená zdrojmi prijímateľa v pomere schválenom na projekt vrátane zdrojov za neoprávnené výdavky nad rámec finančnej medzery pre projekty, pri ktorých sa na ich začiatku alebo pri ich schvaľovaní vypočítava čistý príjem z projektu.
V prípade, ak je projekt financovaný na základe princípu "pro-rata" je riadiaci orgán vo vzťahu k použitiu jednotlivých zdrojov financovania povinný aplikovať nasledovný postup:
•	ak je prioritná os programu financovaná len z jednej kategórie regiónov, riadiaci orgán využíva na krytie ekvivalentu viac rozvinutého regiónu zdroj "pro-rata";
•	ak je prioritná os programu financovaná z oboch kategórií regiónov, je riadiaci orgán v prvom rade povinný využiť na financovanie podielu viac rozvinutého regiónu prostriedky EÚ určené pre viac rozvinutý región vrátane príslušného spolufinancovania a až po ich vyčerpaní kryť ekvivalent viac rozvinutého regiónu zdrojom "pro-rata".
Prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie z príslušného výdavkového účtu platobnej jednotky sú prevedené na účet prijímateľa / partnera podľa zmluvy v súlade s § 8 zákona č. 291/2002 Z. z. o Štátnej pokladnici a o zmene a doplnení niektorých zákonov v znení neskorších predpisov. 
V rámci Programu Interreg V-A SK – CZ, Programu Interreg V-A SK – AT a Programu Interreg V-A SK – HU je realizovaný prevod finančných prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie / národných príspevkov na spolufinancovanie za nasledovných podmienok:
•	prostriedky EÚ sú prevedené najskôr z príslušného výdavkového účtu platobnej jednotky na účet hlavného prijímateľa zo Slovenskej republiky / Českej republiky / Rakúskej spolkovej republiky / Maďarska, podľa zmluvy o poskytnutí nenávratného finančného príspevku v súlade s § 8 zákona č. 291/2002 Z. z. o Štátnej pokladnici a o zmene a doplnení niektorých zákonov v znení neskorších predpisov;
•	prostriedky štátneho rozpočtu na spolufinancovanie sú prevádzané z príslušného výdavkového účtu platobnej jednotky priamo, avšak výlučne na účet hlavného prijímateľa zo Slovenskej republiky / hlavného cezhraničného partnera zo Slovenskej republiky, podľa zmluvy v súlade s § 8 zákona č. 291/2002 Z. z. o Štátnej pokladnici a o zmene a doplnení niektorých zákonov v znení neskorších predpisov; 
•	prevod národných príspevkov na spolufinancovanie hlavnému prijímateľovi z Českej republiky / Rakúskej spolkovej republiky / Maďarska zabezpečuje orgán zabezpečujúci úhradu národného spolufinancovania v Českej republike / Rakúskej spolkovej republike / Maďarsku;
•	k prevodu prostriedkov EÚ z mimorozpočtových účtov certifikačného orgánu na príjmový účet platobnej jednotky dochádza až následne na základe schválenej súhrnnej žiadosti o platbu / mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu.
Pre prijímateľov / partnerov – štátne rozpočtové organizácie platobná jednotka zabezpečuje prevod prostriedkov na realizáciu projektu rozpočtovým opatrením prostredníctvom úpravy limitov výdavkov za prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie: viazaním výdavkov v rozpočte platobnej jednotky a navýšením limitov výdavkov prijímateľa / partnera. 
V rámci Programu Interreg V-A SK – CZ, Programu Interreg V-A SK – AT a Programu Interreg V-A SK – HU pre hlavných prijímateľov zo Slovenskej republiky / hlavných cezhraničných partnerov zo Slovenskej republiky – štátne rozpočtové organizácie platobná jednotka zabezpečuje prevod prostriedkov na realizáciu projektu rozpočtovým opatrením prostredníctvom úpravy limitov výdavkov za prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie: viazaním výdavkov v rozpočte platobnej jednotky a navýšením limitov výdavkov hlavného prijímateľa zo Slovenskej republiky / hlavného cezhraničného partnera zo Slovenskej republiky. 
Pre prijímateľov / partnerov – ostatné subjekty verejnej správy (štátna príspevková organizácia, VÚC, obec, rozpočtová alebo príspevková organizácia VÚC alebo obce, iná organizácia verejnej správy), pre subjekty súkromného sektora (nezisková organizácia, podnikateľ a pod.) zabezpečuje platobná jednotka prevod prostriedkov na realizáciu projektu z výdavkového účtu formou transferu.
V rámci Programu Interreg V-A SK – CZ, Programu Interreg V-A SK – AT a Programu Interreg V-A SK – HU pre hlavných prijímateľov zo Slovenskej republiky / hlavných cezhraničných partnerov zo Slovenskej republiky – ostatné subjekty verejnej správy (štátna príspevková organizácia, VÚC, obec, rozpočtová alebo príspevková organizácia VÚC alebo obce, iná organizácia verejnej správy), pre subjekty súkromného sektora (nezisková organizácia, podnikateľ a pod.) a pre subjekty mimo územia Slovenskej republiky zabezpečuje platobná jednotka prevod prostriedkov na realizáciu projektu z výdavkového účtu formou transferu.
4.5.4	Platby vo vzťahu platobná jednotka – sprostredkovateľský orgán pre globálny grant
V súlade s § 8 ods. 4 zákona č. 292/2014 Z. z. o príspevku poskytovanom z európskych štrukturálnych a investičných fondov a o zmene a doplnení niektorých zákonov realizuje sprostredkovateľskému orgánu pre globálny grant platbu platobná jednotka. Za účelom implementácie časti programu formou globálneho grantu predkladá sprostredkovateľský orgán pre globálny grant riadiacemu orgánu žiadosť o platbu (poskytnutie zálohovej platby, zúčtovanie zálohovej platby). Zálohové platby sa sprostredkovateľskému orgánu pre globálny grant poskytujú do úrovne 100 % alokácie globálneho grantu.
4.5.5	Platby vo vzťahu sprostredkovateľský orgán pre globálny grant – prijímateľ
V prípade implementácie časti programu prostredníctvom globálneho grantu, podľa čl. 123 ods. 7 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013, môže sprostredkovateľský orgán pre globálny grant realizovať platby prijímateľovi alebo partnerovi, ak je partner účastníkom zmluvného vzťahu podľa § 25 ods. 3 zákona č. 292/2014 Z. z. o príspevku poskytovanom z európskych štrukturálnych a investičných fondov a o zmene a doplnení niektorých zákonov. 
Sprostredkovateľský orgán pre globálny grant teda plní aj platobnú funkciu, t. j. zodpovedá za prevod finančných prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie prijímateľovi na základe jeho žiadosti o platbu, ktorú predkladá sprostredkovateľskému orgánu pre globálny grant v zmysle časti 6.8.2.
4.5.6	Platby vo vzťahu prijímateľ – dodávateľ / zhotoviteľ
Prijímateľ uhrádza účtovné doklady súvisiace s realizáciou projektu dodávateľovi / zhotoviteľovi v zmysle časti 6. V prípade, ak dodávateľ / zhotoviteľ postúpil pohľadávky voči prijímateľovi na postupníka v súlade s § 524 – 530 Občianskeho zákonníka (napr. faktoringová spoločnosť, resp. iný subjekt), prijímateľ uhrádza účtovné doklady postupníkovi, a to v súlade so zmluvou o poskytnutí nenávratného finančného príspevku. 
V prípade projektov, ktoré obsahujú aj výdavky neoprávnené nad rámec finančnej medzery, je tieto prijímateľ povinný uhrádzať dodávateľovi / zhotoviteľovi pomerne z každého účtovného dokladu podľa pomeru stanoveného zmluvou o poskytnutí nenávratného finančného príspevku, pričom vecne neoprávnené výdavky si prijímateľ hradí z vlastných zdrojov.
4.5.7	Spracovanie účtov na národnej úrovni
V súlade s čl. 137 a 138 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 certifikačný orgán vypracuje a predkladá za každý program Európskej komisii účty za účtovný rok najneskôr do 15. februára finančného roka, ktorý nasleduje po danom účtovnom roku. 
Certifikačný orgán pri zostavovaní účtov spracováva a berie do úvahy:
•	súhrnné žiadosti o platby / mimoriadne súhrnné žiadosti o platbu schválené certifikačným orgánom v období od 1. apríla do 31. marca príslušného účtovného roku a aj súhrnné žiadosti o platbu / mimoriadne súhrnné žiadosti o platbu, ktoré neboli zahrnuté do predchádzajúcich účtov (v prípade prvého účtovného roka je to obdobie od 1. januára 2014 do 31. marca 2015). V prípade Iniciatívy na podporu zamestnanosti mladých ľudí, vo vzťahu k druhému účtovnému roku a v nadväznosti na konečný termín pre zúčtovanie minimálne 50 % sumy z poskytnutej dodatočnej počiatočnej zálohovej platby certifikačný orgán pri zostavovaní účtov za druhý účtovný rok berie do úvahy súhrnné žiadosti o platbu / mimoriadne súhrnné žiadosti o platbu schválené certifikačným orgánom v období od 1. apríla 2015 do 30. apríla 2016;
•	žiadosti o priebežné platby predložené na Európsku komisiu certifikačným orgánom v období od 1. mája do 30. apríla príslušného účtovného roku. V prípade prvého účtovného roka je to obdobie od 1. januára 2014 do 30. apríla 2015). V prípade Iniciatívy na podporu zamestnanosti mladých ľudí, vo vzťahu k druhému účtovnému roku a v nadväznosti na konečný termín pre zúčtovanie minimálne 50 % sumy z poskytnutej dodatočnej počiatočnej zálohovej platby certifikačný orgán pri zostavovaní účtov za druhý účtovný rok berie do úvahy žiadosti o priebežné platby predložené na Európsku komisiu certifikačným orgánom v období od 1. mája 2015 do 21. mája 2016.
Účty obsahujú aj informácie za nezrovnalosti:
•	sumy stiahnuté z výkazov výdavkov v žiadostiach o platbu na Európsku komisiu predložených v období od 1. mája do 30. apríla (v prípade Iniciatívy na podporu zamestnanosti mladých ľudí vo vzťahu k druhému účtovnému roku v období do 21. mája 2016) a v žiadostiach o platbu vylúčených z predchádzajúcich účtov. V prípade prvého účtovného roku je to v období od 1. januára 2014 do 30. apríla 2015;
•	sumy odpočítané z výkazov výdavkov v žiadostiach o platbu na Európsku komisiu predložených v období od 1. mája do 30. apríla (v prípade Iniciatívy na podporu zamestnanosti mladých ľudí vo vzťahu k druhému účtovnému roku v období do 21. mája 2016) a v žiadostiach o platbu vylúčených z predchádzajúcich účtov. V prípade prvého účtovného roku je to v období od 1. januára 2014 do 30. apríla 2015;
•	výkaz vrátených súm podľa čl. 71 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 podľa stavu k 30. aprílu príslušného účtovného roka; 
•	výkaz nevymožiteľných súm príslušného účtovného roka.
•	Certifikačný orgán pri vypracovaní účtov zostavuje Výkaz porovnania výdavkov deklarovaných v žiadostiach o platbu Európskej komisii a výdavkov deklarovaných vo výkaze výdavkov zaúčtovaných certifikačným orgánom v ISUF, ktoré boli zahrnuté v žiadostiach o platbu predložených Európskej komisii za obdobie od 1. mája do 30. apríla, pričom do úvahy berie aj výdavky, ktoré neboli zahrnuté do predchádzajúcich účtov. Vo vzťahu k záverečnej priebežnej žiadosti o platbu na Európsku komisiu platí, že certifikačný orgán predkladá túto žiadosť o platbu Európskej komisii v období od 1. júla do 31. júla po skončení príslušného účtovného roka, pričom táto záverečná priebežná žiadosť o platbu na Európsku komisiu nebude obsahovať nové deklarované výdavky nad rámec ostatnej priebežnej žiadosti o platbu na Európsku komisiu, ktorá bola predložená príslušnom účtovnom roku. 
V súlade s čl. 138 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a čl. 59 ods. 5 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ, Euratom) č. 966/2012 platí na národnej úrovni pri zostavovaní účtov a dokumentácie predkladanej Európskej komisii do 15. februára nasledujúceho po skončení príslušného účtovného roku pre príslušný program nasledovný postup:
1.	certifikačný orgán poskytne orgánu auditu a riadiacemu orgánu návrh účtov najneskôr do 5. pracovných dní po 30. apríli;
2.	riadiaci orgán v termíne do 15. septembra nasledujúceho po skončení účtového roku dokončí všetky potrebné kontroly výdavkov zahrnutých do žiadostí o platbu predložených Európskej komisii v období od 1. mája do 30. apríla, posúdi, či závery z týchto kontrol majú vplyv na výdavky deklarované v príslušnom účtovnom roku vo vzťahu k prípadnému stiahnutiu alebo dočasnému vyčleneniu a predloží schválené správy o zistených nezrovnalostiach, zoznam nevymožiteľných súm v zmysle prílohy 9 a návrh Ročného súhrnu audítorských správ a výsledkov uskutočnených kontrol certifikačnému orgánu a orgánu auditu do 30. septembra nasledujúceho po skončení účtovného roka;
3.	certifikačný orgán zohľadní výsledky z uskutočnených kontrol uvedených v návrhu Ročného súhrnu konečných audítorských správ a výsledkov uskutočnených kontrol vypracovanom riadiacim orgánom a vypracuje a predloží upravený návrh účtov orgánu auditu do 15. októbra nasledujúceho po skončení účtovného roka;
4.	orgán auditu v termíne do 15. novembra nasledujúceho po skončení účtového roku sfinalizuje správy z vládnych auditov a predloží schválené správy o zistených nezrovnalostiach certifikačnému orgánu a riadiacemu orgánu do 30. novembra nasledujúceho po skončení účtovného roku na účely úprav účtov sumárny prehľad výdavkov, ktoré je potrebné z účtov stiahnuť alebo dočasne vyčleniť, resp. prípravy Vyhlásenia riadiaceho orgánu o vierohodnosti a Ročného súhrnu konečných audítorských správ a výsledkov uskutočnených kontrol;
5.	certifikačný orgán pri úprave účtov zohľadňuje výsledky všetkých vládnych auditov vykonaných orgánom auditu a spolupracujúcimi orgánmi, výsledky z certifikačných overovaní, resp. iné podnety alebo zistenia ovplyvňujúce deklarované
výdavky v príslušnom účtovnom roku;
6.	riadiaci orgán predloží Vyhlásenie riadiaceho orgánu o vierohodnosti a Ročný súhrn konečných audítorských správ a výsledkov uskutočnených kontrol, vrátane analýzy o povahe a rozsahu chýb a slabých stránkach nájdených v systémoch riadenia a kontroly a o akýchkoľvek prijatých nápravných opatreniach SR orgánu auditu a certifikačnému orgánu najneskôr do 15. decembra nasledujúceho po skončení účtovného roku; 
7.	certifikačný orgán predloží orgánu auditu a riadiacemu orgánu účty najneskôr do 7. januára nasledujúceho po skončení účtovného roku, ktorý zohľadňuje požiadavky orgánu auditu a riadiaceho orgánu na stiahnutie alebo dočasné vyčlenenie výdavkov zahrnutých v žiadostiach o platbu na Európsku komisiu počas účtovného roka ako aj vlastné rozhodnutia vo vzťahu k stiahnutiu alebo dočasnému vyčleneniu výdavkov zahrnutých v žiadostiach o platbu na Európsku komisiu počas účtovného roka;
8.	orgán auditu vypracuje kontrolnú správu obsahujúcu výsledky z auditov vykonaných za výdavky zahrnuté do príslušných účtov a stanovisko o efektívnosti fungovania systému riadenia a kontroly a zákonnosti a správnosti výdavkov deklarovaných v účtoch a v termíne do 10. februára ich zasiela riadiacemu orgánu a certifikačnému orgánu.
Jednotlivé dokumenty sú Európskej komisii predkladané výlučne elektronicky. Informácie je povinný do informačného systému Európskej komisie SFC v stanovenom termíne 15. februára5 nasledujúceho po skončení príslušného účtovného roka zadať subjekt zodpovedný za príslušnú etapu zostavenia účtov. Po ich odoslaní bude z informačného systému Európskej komisie SFC vygenerované potvrdenie o ich odoslaní / prijatí. Informácie zadané v informačnom systéme Európskej komisie SFC musia byť jednotné a vo vzájomnom súlade na všetkých úrovniach subjektov zodpovedných za príslušnú etapu zostavenia účtov. 
4.5.8	Vysporiadanie finančných vzťahov
Vysporiadanie finančných vzťahov sa vykonáva:
a)	vzájomným započítaním pohľadávky z príspevku voči pohľadávke prijímateľa / partnera podľa zmluvy o poskytnutí nenávratného finančného príspevku alebo jeho časti;
b)	vzájomným započítaním pohľadávky z rozhodnutia voči pohľadávke prijímateľa / partnera podľa zmluvy o poskytnutí nenávratného finančného príspevku alebo jeho časti alebo
c)	vrátením príspevku alebo jeho časti, ak sa nevykoná vzájomné započítanie pohľadávok. Na základe zmluvy o poskytnutí nenávratného finančného príspevku / zmluvy o financovaní / rozhodnutia o schválení žiadosti / zmluvy o spolufinancovaní sa vrátenie finančných prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie, ktoré boli poskytnuté prijímateľovi / partnerovi uskutočňuje v nasledovných prípadoch:
•	prijímateľ nevyčerpal poskytnuté prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie,
•	prijímateľ / partner / hlavný cezhraničný partner vyčerpal poskytnuté prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie v rozpore so všeobecne záväznými predpismi SR alebo právne záväznými predpismi EÚ (najmä porušenie finančnej disciplíny alebo vznik nezrovnalosti),
•	prijímateľ / partner / hlavný cezhraničný partner vyčerpal poskytnuté prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie v rozpore s podmienkami zmluvy o poskytnutí nenávratného finančného príspevku / zmluvy o financovaní alebo rozhodnutia o schválení žiadosti / zmluvy o spolufinancovaní, resp. prijímateľ porušil alebo nesplnil povinnosti stanovené v zmluve o poskytnutí nenávratného finančného príspevku / zmluvy o financovaní / zmluvy o spolufinancovaní (najmä porušenie finančnej disciplíny alebo vznik nezrovnalosti) a porušenie týchto povinností, resp. nesplnenie týchto povinností je spojené s povinnosťou vrátenia finančných prostriedkov,
•	prijímateľ – holdingový fond nezabezpečil použitie prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie na účel pomoci definovaný v zmluve o financovaní do 31. decembra 2023 v nadväznosti na požiadavky nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2014, (ešte potrebné analyzovať bližšie podmienky vykazovania údajov za finančné nástroje v nadväznosti na požiadavky Európskej komisie) resp. boli naplnené podmienky pre vrátenie príspevku upravené ustanoveniami § 19 až 21 zákona č. 323/2015 Z. z. o finančných nástrojoch financovaných z európskych štrukturálnych a investičných fondov a o zmene a doplnení niektorých zákonov, 
•	prijímateľovi / partnerovi / hlavnému cezhraničnému partnerovi boli poskytnuté finančné prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie z titulu mylnej platby,
•	a iných (napr. bol vytvorený príjem z projektu).
V súlade s § 33 ods. 2 zákona č. 292/2014 Z. z. o príspevku poskytovanom z európskych štrukturálnych a investičných fondov a o zmene a doplnení niektorých zákonov je prijímateľ / partner podľa zmluvy povinný vrátiť nenávratný finančný príspevok alebo jeho časť za podmienok a spôsobom uvedeným v zmluve o poskytnutí nenávratného finančného príspevku / zmluve o financovaní alebo v rozhodnutí o schválení žiadosti. Ak suma nenávratného finančného príspevku alebo jeho časti, ktorá sa má vrátiť, nepresiahne 40,00 EUR, tento nenávratný finančný príspevok alebo jeho časť riadiaci orgán nevymáha. 
Riadiaci orgán sa môže rozhodnúť podľa charakteru projektu alebo typu prijímateľa, či priebežne kumuluje nezúčtovaný nenávratný finančný príspevok vrátane súm do 40,00 EUR a súčasne ho aj priebežne vymáha v momente prekročenia sumy 40,00 EUR alebo uplatní a vymáha úhrnnú sumu takto nezúčtovaného nenávratného finančného príspevku po prekročení sumy 40,00 EUR pri poslednom zúčtovaní zálohovej platby. Riadiaci orgán voči finančnému limitu 40,00 EUR posudzuje iba sumu príspevku, ktorý podľa definície príspevku v § 3 ods. 1 písm. a) zákona č. 292/2014 Z. z. o príspevku poskytovanom z európskych štrukturálnych a investičných fondov a o zmene a doplnení niektorých zákonov tvoria len prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie poskytnuté riadiacim orgánom podľa zmluvy o poskytnutí nenávratného finančného príspevku / rozhodnutia o schválení žiadosti bez možnosti zahrnutia sankcie alebo úroku z omeškania.
V prípade vzniku dôvodu na vrátenie príspevku alebo jeho časti (napr. z dôvodov porušení všeobecne záväzných právnych predpisov SR alebo legislatívy EÚ prijímateľom), prijímateľ podľa zmluvy o poskytnutí nenávratného finančného príspevku / zmluvy o spolufinancovaní je povinný pri vrátení finančných prostriedkov postupovať v súlade so zmluvou o poskytnutí nenávratného finančného príspevku / zmluvou o spolufinancovaní a zákonom č. 292/2014 Z. z. o príspevku poskytovanom z európskych štrukturálnych a investičných fondov a o zmene a doplnení niektorých zákonov. 
V jednotlivých prípadoch vrátenia finančných prostriedkov riadiaci orgán zašle prijímateľovi / partnerovi žiadosť o vrátenie finančných prostriedkov podľa zmluvy o poskytnutí nenávratného finančného príspevku / zmluvy o financovaní / zmluvy o spolufinancovaní, v kópii certifikačnému orgánu a platobnej jednotke elektronicky v ITMS – nevyhnutnosť predkladania listinnej podoby schválenej žiadosti o vrátenie finančných prostriedkov certifikačnému orgánu, platobnej jednotke a prijímateľovi bude závislá od podmienok evidencie dokladov vysporiadania finančných vzťahov vo verejnej časti ITMS a neverejnej časti ITMS, pričom prijímateľ / partner bude informovaný o zozname svojich záväzkov na verejnej časti ITMS na základe jedinečného, ITMS automaticky generovaného variabilného symbolu. Riadiaci orgán je povinný výzvu na úhradu oznámiť dlžníkovi, že eviduje voči nemu pohľadávku, upozorniť ho na následky neuhradenia pohľadávky. Osobitná evidencia pohľadávok plynúcich zo zmluvy bude vedená v informačnom monitorovacom systéme, pričom do termínu sprístupnenia súvisiacich funkcionalít ITMS a jeho prepojenia na ISUF, budú takéto pohľadávky evidované manuálne v ISUF a výzva, resp. žiadosť o vrátenie finančných prostriedkov predkladaná poskytovateľom dlžníkovi, platobnej jednotke a certifikačnému orgánu len v listinnej podobe. 
Formulár žiadosti o vrátenie finančných prostriedkov spolu s pokynom k jeho vyplneniu je uvedený v prílohe 6a a 6b.
Pre splnenie právnych záväzkov prijímateľa / partnera vo vzťahu k vysporiadaniu finančných vzťahov sa vyžaduje uvedenie správnych bankových účtov a správneho, ITMS automaticky generovaného variabilného symbolu pri uskutočnení úhrady prostriedkov príkazom na SEPA inkaso v rámci ITMS2014+ na základe schváleného mandátu na inkaso v SEPA (príloha 7) platiteľom inkasa – prijímateľom / partnerom alebo platobným príkazom v banke podľa podmienok uvedených v zmluve uzatvorenej medzi poskytovateľom a prijímateľom / partnerom.
Ak prijímateľ / partner nevráti NFP alebo jeho časť na správne účty alebo pri uskutočnení úhrady neuvedie správny automaticky ITMS2014+ generovaný variabilný symbol , príslušný záväzok prijímateľa / partnera zostáva nesplnený a finančné vzťahy voči poskytovateľovi sa považujú za nevysporiadané. Mylná platba bude vrátená odosielateľovi do konca mesiaca nasledujúceho po mesiaci, v ktorom bola úhrada prijatá na účet certifikačného orgánu alebo platobnej jednotky.
Na účely zabezpečenia správnych a jednoznačných administratívnych, finančných a účtovných postupov pre spracovanie spätných tokov (vysporiadania finančných vzťahov) pri implementácii a realizácii prostriedkov EÚ a prostriedkov štátneho rozpočtu na spolufinancovanie, zabezpečenia triedenia príjmov a výdavkov podľa ekonomickej klasifikácie rozpočtovej klasifikácie pre správne sledovanie a vykazovanie aktuálneho dopadu finančných opráv a vrátených finančných prostriedkov v rámci realizácie spoločných programov Slovenskej republiky a Európskej únie financovaných z fondov Európskej únie a prostriedkov štátneho rozpočtu na schodok verejnej správy sú schémy a popis schém k vráteniu finančných prostriedkov upravené v metodickom usmernení Ministerstva financií SR č. 3/2015-U k schéme procesov vrátenia finančných prostriedkov v rámci finančného riadenia štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu, Európskeho fondu pre rybné hospodárstvo a Európskeho námorného a rybárskeho fondu. 
V rámci implementácie finančných nástrojov sú pravidlá vrátenia príspevku na finančný nástroj a vysporiadanie finančných vzťahov upravené ustanoveniami § 19 až 21 zákona č. 323/2015 Z. z. o finančných nástrojoch financovaných z európskych štrukturálnych a investičných fondov a o zmene a doplnení niektorých zákonov. Prijímateľ je povinný vrátiť príspevok na finančný nástroj v súlade s podmienkami zmluvy o financovaní, a to najmä v prípadoch, ak došlo k porušeniu povinností podľa § 20 ods. 2 zákona č. 323/2015 Z. z. o finančných nástrojoch financovaných z európskych štrukturálnych a investičných fondov a o zmene a doplnení niektorých zákonov. Finančný sprostredkovateľ a konečný prijímateľ sú povinní vrátiť príspevok na finančný nástroj v súlade s podmienkami zmluvy, a to najmä ak došlo k porušeniu ich povinností v zmluve. V súlade s § 20 ods. 1 zákona č. 323/2015 Z. z. o finančných nástrojoch financovaných z európskych štrukturálnych a investičných fondov a o zmene a doplnení niektorých zákonov ak suma príspevku na finančný nástroj alebo jeho časti, ktorá sa má vrátiť, nepresiahne 100,00 EUR, tento príspevok na finančný nástroj alebo jeho časť poskytovateľ neuplatňuje a nevymáha.
4.5.8.1	Vysporiadanie čistého príjmu
Ak bol počas realizácie a v troch rokoch od ukončenia projektu (alebo do 30. septembra 2023, ktorý dátum je skorší) vytvorený čistý príjem z projektu, ktorý sa nezohľadnil v znížení príspevku prijímateľovi / partnerovi podľa zmluvy už pri poskytnutí (na základe paušálnej sadzby, výpočtu zníženého čistého príjmu alebo objektívnych skutočností), prijímateľ / partner podľa zmluvy je povinný vrátiť pomernú časť príspevku z prostriedkov EÚ na mimorozpočtový účet Ministerstva financií SR a tieto prostriedky certifikačný orgán odpočíta z výkazu výdavkov v žiadosti o platbu na Európsku komisiu. Ak je predpokladaný čistý príjem z projektu zohľadnený znížením príspevku prijímateľovi / partnerovi podľa zmluvy už pri poskytnutí, prijímateľ / partner podľa zmluvy je povinný vrátiť príspevok, len ak je vytvorený čistý príjem vyšší, ako bol predpokladaný čistý príjem podľa čl. 61 ods. 3 písm. b) alebo ods. 6 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013. Pomernú časť príspevku z prostriedkov štátneho rozpočtu na spolufinancovanie je prijímateľ / partner podľa zmluvy povinný vrátiť na príjmový účet platobnej jednotky. Prostriedky uvoľnené vrátením čistého príjmu z projektu je možné opätovne použiť na nové výdavky v rámci programu.
Ak nastane podstatná zmena podmienok pre projekty generujúce čistý príjem počas monitorovania čistých príjmov v súlade s čl. 61 ods. 3 písm. b) alebo ods. 6 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013, prijímateľ / partner podľa zmluvy postupuje v súlade so zmluvou o poskytnutí nenávratného finančného príspevku / zmluvy o financovaní alebo rozhodnutím o schválení žiadosti.
V prípade vytvorenia čistého príjmu z projektu v troch rokoch po ukončení projektu (alebo do 30. septembra 2023, ktorý dátum je skorší), vrátené finančné prostriedky budú takto odpočítané certifikačným orgánom v záverečnom výkaze výdavkov a záverečnej žiadosti o platbu / účtoch predloženej Európskej komisii, najneskôr však do 15. februára 2024 (čl. 59 ods. 5 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ, Euratom) č. 966/2012).
V prípade vzniku povinnosti vrátenia čistého príjmu podľa čl. 61 ods. 3 písm. b) alebo ods. 6 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 je prijímateľ / partner podľa zmluvy povinný vrátiť čistý príjem do 31. januára roku nasledujúceho po roku, v ktorom bol zostavená účtovná závierka za príslušné účtovné obdobie (resp. posledná účtovná závierka za viacročné sledované obdobie na základe dohodnutých podmienok v zmluve o poskytnutí nenávratného finančného príspevku medzi poskytovateľom a prijímateľom / partnerom podľa zmluvy) alebo, ak sa na prijímateľa / partnera podľa zmluvy vzťahuje povinnosť overenia účtovnej závierky audítorom v súlade s ustanoveniami zákona o účtovníctve o overovaní účtovnej závierky audítorom, po roku, v ktorom bola účtovná závierka overená. 
V prípade vzniku povinnosti vrátenia čistého príjmu počas realizácie projektu podľa čl. 61 ods. 3 písm. b) nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 je prijímateľ / partner podľa zmluvy povinný vrátiť čistý príjem najneskôr ku dňu schválenia žiadosti o platbu (s príznakom záverečná) na projekt riadiacim orgánom, resp. požiadať o započítanie vykázaného čistého príjmu najneskôr v žiadosti o platbu (s príznakom záverečná) na projekt.
V prípade vzniku povinnosti vrátenia čistého príjmu podľa čl. 61 ods. 6 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 za účtovné obdobie roka 2023 je prijímateľ / partner podľa zmluvy povinný vrátiť čistý príjem do 31. januára 2024 vychádzajúc z údajov v účtovníctve do 30. septembra 2023. 
V prípade vzniku povinnosti odvodu výnosu je prijímateľ / partner podľa zmluvy povinný odviesť výnos do 31. januára roku nasledujúceho po roku, v ktorom vznikol výnos.
Prijímateľ / partner podľa zmluvy je povinný bezodkladne (od kedy sa o tejto skutočnosti dozvedel) požiadať riadiaci orgán o informáciu k podrobnostiam vrátenia čistého príjmu alebo odvodu výnosu (napr. číslo účtu, variabilný symbol) podľa podmienok zmluvy. V prípade, ak prijímateľ / partner podľa zmluvy príjem alebo výnos riadne a včas nevráti, resp. neodvedie, riadiaci orgán postupuje prostredníctvom žiadosti o vrátenie finančných prostriedkov. 
4.5.8.2	Vzájomné započítanie pohľadávok a záväzkov 
Vysporiadanie finančných vzťahov vzájomným započítaním pohľadávok z príspevku alebo jeho časti prostredníctvom žiadosti o platbu je možné uplatniť v súlade s § 40 až 42 a § 45 zákona č. 292/2014 Z. z. o príspevku poskytovanom z európskych štrukturálnych a investičných fondov a o zmene a doplnení niektorých zákonov. 
Vzájomné započítanie pohľadávok sa považuje za spôsob plnenia záväzku a nejde o peňažný tok. Dokladom, na základe ktorého možno vyhotoviť účtovný doklad je dohoda o započítaní, resp. jednostranný započítací prejav. Týmto sa nevylučuje vzájomné započítanie pohľadávok na strane dodávateľa. Je v kompetencii riadiaceho orgánu overiť, či boli aktivity na základe uvedených faktúr zrealizované v súlade so zmluvou o poskytnutí nenávratného finančného príspevku, či boli dodržané ustanovenia Obchodného zákonníka, Občianskeho zákonníka a zákona č. 431/2002 Z. z. o účtovníctve v znení neskorších predpisov.
Vzájomné započítanie pohľadávok z príspevku alebo jeho časti nie je možné vykonať, ak je prijímateľom / partnerom podľa zmluvy štátna rozpočtová organizácia.
4.5.8.3	Odvod za porušenie finančnej disciplíny, správa a účtovanie pohľadávok
Správca pohľadávky z príspevku, ktorým je poskytovateľ (riadiaci orgán alebo sprostredkovateľský orgán), je povinný najmä 
a)	výzvou na úhradu oznámiť dlžníkovi, že eviduje voči nemu pohľadávku a upozorniť ho na následky neuhradenia pohľadávky;
b)	viesť osobitnú evidenciu všetkých pohľadávok. 
Osoba okrem užívateľa v rámci realizovaného národného projektu prijímateľom, ktorým je Ústredie práce, sociálnych vecí a rodiny, ktorej bol uložený odvod za porušenie finančnej disciplíny pri hospodárení s prostriedkami EÚ a prostriedkami štátneho rozpočtu na spolufinancovanie, odvádza prostriedky EÚ schválené certifikačným orgánom na účet ministerstva financií. Prostriedky EÚ neschválené certifikačným orgánom a prostriedky štátneho rozpočtu na spolufinancovanie odvádza na príjmový účet príslušnej platobnej jednotky.
Ak bol užívateľovi uložený odvod za porušenie finančnej disciplíny pri hospodárení s prostriedkami EÚ a prostriedkami štátneho rozpočtu na spolufinancovanie v rámci realizovaného národného projektu prijímateľom, ktorým je Ústredie práce, sociálnych vecí a rodiny, takýto užívateľ odvádza prostriedky EÚ a prostriedky štátneho rozpočtu na spolufinancovanie na samostatný mimorozpočtový účet prijímateľa, ktorým je Ústredie práce, sociálnych vecí a rodiny. Prijímateľ, ktorým je Ústredie práce, sociálnych vecí a rodiny, vráti prostriedky EÚ schválené certifikačným orgánom na účet ministerstva financií, prostriedky EÚ neschválené certifikačným orgánom a prostriedky štátneho rozpočtu na spolufinancovanie odvádza na príjmový účet príslušnej platobnej jednotky. 
Ak dôjde k porušeniu finančnej disciplíny podľa zákona č. 523/2004 Z. z., je správcom pohľadávky z príspevku poskytovateľ do dňa nadobudnutia právoplatnosti rozhodnutia o porušení finančnej disciplíny. Dňom nadobudnutia právoplatnosti rozhodnutia o porušení finančnej disciplíny sa správcom pohľadávky štátu stáva Úrad vládneho auditu. 
O pohľadávke z rozhodnutia týkajúcej sa prostriedkov štátneho rozpočtu na spolufinancovanie v správe Úradu vládneho auditu účtuje príslušná platobná jednotka. O pohľadávke z rozhodnutia týkajúcej sa prostriedkov EÚ schválených certifikačným orgánom v správe Úradu vládneho auditu alebo o pohľadávke z príspevku týkajúcej sa prostriedkov EÚ schválených certifikačným orgánom účtuje certifikačný orgán. O pohľadávke z rozhodnutia voči užívateľovi v rámci národného projektu prijímateľa, ktorým je Ústredie práce, sociálnych vecí a rodiny týkajúcej sa prostriedkov EÚ a prostriedkov štátneho rozpočtu na spolufinancovanie účtuje prijímateľ, ktorým je Ústredie práce, sociálnych vecí a rodiny.
V rámci implementácie finančných nástrojov v súlade s § 21 zákona č. 323/2015 Z. z. o finančných nástrojoch financovaných z európskych štrukturálnych a investičných fondov a o zmene a doplnení niektorých zákonov ak prijímateľ nevráti príspevok na finančný nástroj alebo jeho časť na základe žiadosti o vrátenie finančných prostriedkov, riadiaci orgán oznámi túto skutočnosť Úradu vládneho auditu, ktorý rozhodne o vrátení príspevku na finančný nástroj alebo jeho časti. Ak prijímateľ nevráti príspevok na finančný nástroj alebo jeho časť, Úrad vládneho auditu tento príspevok na finančný nástroj alebo jeho časť a penále vymáha v správnom konaní.
Bližšie podmienky pre podrobnosti správy pohľadávok sú upravené v metodických usmerneniach a manuáloch Ministerstva financií SR, najmä v metodickom usmernení Ministerstva financií SR č. 4/2014-U k účtom platobnej jednotky a platobného orgánu / certifikačného orgánu v Štátnej pokladnici a k pohľadávkam v rámci programového obdobia 2004 – 2006, 2007 – 2013 a 2014 – 2020.
4.5.9	Odhad očakávaných výdavkov
Odhad očakávaných výdavkov zo štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu sa predkladá s cieľom:
•	zaslania odhadov očakávaných výdavkov na roky "n" a "n+1" na sumy, ktoré členský štát očakáva, že predloží žiadosti o platbu Európskej komisii;
•	mesačného spracovania odhadov plnenia príjmov a čerpania výdavkov štátneho rozpočtu za prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie;
•	prípravy a aktualizácie odhadov plnenia štátneho rozpočtu pre roky "n", "n+1", "n+2" a "n+3".
Odhad očakávaných výdavkov zasiela Európskej komisii certifikačný orgán každý rok do 31. januára a 31. júla pre daný rozpočtový rok "n" a pre nasledujúci rozpočtový rok "n+1", pričom odhad na rok "n+1" sa aktualizuje vždy v príslušnom roku.
Certifikačný orgán usmerňuje riadiaci orgán a platobnú jednotku v oblasti prípravy a schvaľovania odhadov očakávaných výdavkov. Odhad očakávaných výdavkov musí vychádzať predovšetkým z nasledovných skutočností:
•	finančných plánov programov;
•	objemu prostriedkov schválených v štátnom rozpočte pre rok "n", prípadne viazaných prostriedkov z roku "n-1";
•	finančných plánov už schválených projektov po zohľadnení času potrebného na kolobeh žiadosti o platbu do momentu jej úhrady;
•	predpokladaného objemu finančných prostriedkov v projektoch, ktoré majú byť schválené a realizované v nasledujúcich rozpočtových rokoch;
•	objemu prostriedkov alokovaných na konkrétne výzvy / vyzvania;
•	reálnej implementácie už realizovaných projektov;
•	skúseností z predchádzajúcej realizácie projektov.
Uvedené informácie monitoruje riadiaci orgán zodpovedný za schvaľovanie projektov a implementáciu programov. Z tohto dôvodu za spracovanie podkladov k odhadom očakávaných výdavkov zodpovedá príslušný riadiaci orgán.
Pri príprave odhadu očakávaných výdavkov je potrebné vziať do úvahy nasledovné skutočnosti:
•	nemožno presiahnuť rámec príslušných záväzkov na úrovni prioritných osí uvedených v programe (napr. odhad pre rok 2015 nesmie predstavovať sumu vyššiu ako záväzok na rok 2015 + zostatok nevyčerpaného záväzku pre rok 2014);
•	je potrebné dodržiavať pomery medzi zdrojmi na úrovni jednotlivých prioritných osí v súlade s aktuálne platnou verziou Stratégie financovania Európskych štrukturálnych a investičných fondov na programové obdobie 2014 – 2020;
•	odhad pre posledný rok "n+3" čerpania rozpočtového záväzku pre príslušný rok "n" v rámci pravidla "n+3" by mal predstavovať čiastku minimálne sa rovnajúcu výške rozdielu sumy záväzku pre príslušný rok "n" a čerpania tohto záväzku počas troch predchádzajúcich rozpočtových rokov "n", "n+1" a "n+2" s cieľom dočerpania uvedeného záväzku;
•	certifikačný orgán zahŕňa do odhadov očakávaných výdavkov na Európsku komisiu pre rok "n" žiadosti o platbu, ktoré predpokladá predložiť v roku "n" v súlade s metodikou Európskej komisie. Certifikačný orgán môže upraviť odhady riadiaceho orgánu pred predložením odhadov Európskej komisii;
•	uvedený odhad nie je pre Európsku komisiu záväzný, len indikatívny. Slovenská republika môže v príslušnom roku požiadať Európsku komisiu o platby, ktorých celková výška je vyššia, ako bol predpokladaný odhad očakávaných výdavkov na daný rok a naopak, čiastka predstavujúca rozdiel predpokladaného čerpania a reálneho čerpania neznamená automatickú stratu pre Slovenskú republiku.
Odhad pre rok "n+1" je podkladom pre prípravu štátneho rozpočtu pre nasledovný rok "n+1" s výhľadom na roky "n+2" a "n+3".
Z uvedeného vyplýva, že pri príprave odhadov očakávaných výdavkov musí každý riadiaci orgán úzko spolupracovať s príslušnou platobnou jednotkou, útvarom spravujúcim rozpočet príslušnej kapitoly ako aj prijímateľmi.
Pri vypracovaní odhadu očakávaných výdavkov (príloha 8a) sa postupuje podľa pokynov k vyplneniu odhadu očakávaných výdavkov (príloha 8b) a uplatňuje sa nasledovný postup:
1.	Riadiaci orgán spracuje odhad očakávaných výdavkov na úrovni schválených projektov a operácií, ako aj na úrovni predpokladaných projektov a operácií, ktoré majú byť schválené a výdavky z nich realizované v nasledujúcom období v rozdelení na prioritné osi programu. Takto spracované podklady sú základom pre spracovanie prílohy, ktorú riadiaci orgán predkladá certifikačnému orgánu do 6. kalendárneho dňa v mesiaci, resp. v prípade odhadu očakávaných výdavkov k 31. decembru roku "n" do 15. januára roku "n+1". V prípade, ak je pre príslušný program zriadený sprostredkovateľský orgán, riadiaci orgán je oprávnený vyžiadať si čiastkový odhad sprostredkovateľského orgánu na preverenie. V prípade, že sprostredkovateľský orgán má svoju vlastnú platobnú jednotku, predkladá odhad očakávaných výdavkov priamo certifikačnému orgánu.
2.	Tabuľky vyplnené v stanovenej forme (príloha 8a) predloží riadiaci orgán príslušnej platobnej jednotke. Platobná jednotka v spolupráci s útvarom spravujúcim rozpočet príslušnej kapitoly preverí odhad očakávaných výdavkov pre rok "n" predložený riadiacim orgánom z hľadiska súladu s platným zákonom o štátnom rozpočte. Rovnako zohľadní odhad na roky "n+1", "n+2" a "n+3" pri príprave štátneho rozpočtu pre rok "n+1". Platobná jednotka pre potreby riadiaceho orgánu vyčísli odhad očakávaných výdavkov, presahujúci úroveň schváleného rozpočtu na rok "n". Po preverení postupuje odhad očakávaných výdavkov späť riadiacemu orgánu.
3.	Riadiaci orgán predloží vyplnenú tabuľku iba elektronicky na e-mailovú adresu odhady@mfsr.sk v stanovenej forme (príloha 8a) certifikačnému orgánu najneskôr do 6. kalendárneho dňa v mesiaci po skončení príslušného mesiaca, ku ktorému sa odhad vypracováva, resp. v prípade odhadu očakávaných výdavkov k 31. decembru roku "n" do 15. januára roku "n+1". Riadiaci orgán informuje certifikačný orgán, ak odhad očakávaných výdavkov prekročí sumu schváleného rozpočtu na rok "n" alebo informuje a zároveň zdôvodní, ak odhad očakávaných výdavkov prekročí sumu schváleného rozpočtu na rok "n" vrátane sumy finančných prostriedkov viazaných v roku "n-1". Podklady na spracovanie prílohy 8a si ponecháva riadiaci orgán. Odhad očakávaných výdavkov, ktorý vypracováva riadiaci orgán v spolupráci s platobnou jednotkou podľa údajov k 30. júnu bežného roka predkladá certifikačnému orgánu v termíne najneskôr do 30. júna (ak tento deň pripadá na deň pracovného pokoja, tak najbližší pracovný deň pred týmto termínom).
4.	Certifikačný orgán preverí odhad očakávaných výdavkov, predložený riadiacim orgánom, z hľadiska čerpania rozpočtových záväzkov na úrovni jednotlivých prioritných osí v nadväznosti na aktuálne finančné plány programov. Podkladom pre potreby vypracovania návrhu štátneho rozpočtu je odhad k 31. januáru, k 31. máju a k 30. júnu. Odhady sú vypracované na mesačnej báze s cieľom dôsledného monitorovania plnenia štátneho rozpočtu počas celého roka. Podkladom pre odhad očakávaných výdavkov predkladaný Európskej komisii je odhad zostavený k 31. decembru roku "n-1" a k 30. júnu roku "n".
5.	Odhad očakávaných výdavkov pre programy cieľa Európska územná spolupráca, pri ktorých Ministerstvo financií SR neplní funkciu certifikačného orgánu pre potreby prípravy a aktualizácie odhadov plnenia štátneho rozpočtu pre roky "n", "n+1", "n+2" a "n+3" spracováva platobná jednotka v spolupráci s národným orgánom a útvarom spravujúcim rozpočet príslušnej kapitoly. Vyplnenú tabuľku v stanovenej forme (príloha 8a) predkladá platobná jednotka certifikačnému orgánu elektronicky na e-mailovú adresu odhady@mfsr.sk mesačne do 6. kalendárneho dňa v mesiaci po skončení príslušného mesiaca, ku ktorému sa odhad vypracováva. Odhad slúži na zostavenie a monitorovanie vývoja štátneho rozpočtu.

5	Systém bankových účtov
Pri finančnom riadení štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu sa používa nasledovný systém bankových účtov, pričom platí, že v prípade realizácie platieb z platobnej jednotky priamo na účet partnera platia pre partnera rovnaké podmienky pre vedenie účtov ako pre prijímateľa podľa príslušného typu.
5.1	Účty certifikačného orgánu
•	mimorozpočtové účty pre prostriedky z rozpočtu EÚ sú vedené v Štátnej pokladnici a operácie na nich sa vykonávajú na základe § 10 zákona č. 291/2002 Z. z. o Štátnej pokladnici a o zmene a doplnení niektorých zákonov v znení neskorších predpisov;
•	Ministerstvo financií SR otvára pre certifikačný orgán mimorozpočtové účty samostatne pre každý program, pre programy financované spoločne z viacerých fondov otvára samostatné účty pre každý z fondov;
•	oprávnenie disponovať s finančnými prostriedkami týchto účtov majú poverení zamestnanci certifikačného orgánu;
•	tieto účty slúžia najmä na:
-	prijatie prostriedkov EÚ (počiatočná zálohová platba, ročná záloha, priebežná platba) a na ich prevod na príslušné príjmové účty platobných jednotiek (na základe certifikačným orgánom schválenej súhrnnej žiadosti o platbu / mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu);
-	prevod prostriedkov EÚ na účet Európskej komisie v prípade, ak suma deklarovaných oprávnených výdavkov v účtoch je nižšia ako suma ročnej zálohy a priebežných platieb;
•	účty sú vedené v EUR;
•	účet / účty pre prostriedky EÚ sú úročené a úrok vzniknutý na účte sa použije na financovanie príslušného programu9;
•	bankové poplatky a dane z úrokov sú uhrádzané z vyrovnávacieho účtu pre príslušný fond;
•	zostatok prostriedkov prechádza po skončení kalendárneho roka automaticky do ďalšieho roka.
Certifikačný orgán otvára:
•	mimorozpočtový účet pre nezrovnalosti a vrátenie finančných prostriedkov EÚ vedený v EUR. Tento účet slúži na pripísanie vrátených prostriedkov EÚ od prijímateľov, okrem vymožených prostriedkov prostredníctvom Úradu vládneho auditu alebo Ministerstva financií SR na základe právoplatného rozhodnutia za porušenie finančnej disciplíny;
•	mimorozpočtové účty pre odvod prostriedkov EÚ vymožených prostredníctvom Úradu vládneho auditu alebo Ministerstva financií SR na základe právoplatného rozhodnutia za porušenie finančnej disciplíny, a to vrátane sumy zodpovedajúcej úroku z omeškania za prostriedky EÚ.
•	Účet pre nezrovnalosti a vrátenie finančných prostriedkov EÚ, ako aj účty pre odvod prostriedkov EÚ slúžia na prevod vrátených, resp. vymožených finančných prostriedkov na príslušné účty programov. Tieto účty nie sú úročené a bankové poplatky a iné náklady sú uhrádzané z vyrovnávacieho účtu. Zostatok finančných prostriedkov prechádza po skončení kalendárneho roka automaticky do ďalšieho roka.
Certifikačný orgán rovnako disponuje vyrovnávacími účtami pre jednotlivé fondy vedené v EUR. Tieto účty slúžia najmä na úhradu bankových poplatkov a daní z úrokov. Zostatok finančných prostriedkov prechádza po skončení kalendárneho roka automaticky do ďalšieho roka.
Bližšie podmienky pre účty certifikačného orgánu sú upravené v usmernení č. 4/2014-U k účtom platobnej jednotky a platobného orgánu / certifikačného orgánu v Štátnej pokladnici a k pohľadávkam v rámci programového obdobia 2004 – 2006, 2007 – 2013 a 2014 – 2020.
5.2	Účty platobnej jednotky
•	rozpočtový výdavkový účet pre prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie pre programové obdobie 2014 – 2020 vedený v Štátnej pokladnici, na ktorom sa operácie vykonávajú v súlade so zákonom č. 291/2002 Z. z. o Štátnej pokladnici a o zmene a doplnení niektorých zákonov v znení neskorších predpisov. Účet je vedený v EUR a slúži na úhradu prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie prijímateľom, resp. v rámci Programu Interreg V-A SK – CZ, Programu Interreg V-A SK – AT a Programu Interreg V-A SK – HU na úhradu prostriedkov EÚ hlavnému prijímateľovi zo Slovenskej republiky / Českej republiky / Rakúskej spolkovej republiky / Maďarska, ako aj úhradu prostriedkov štátneho rozpočtu na spolufinancovanie hlavnému cezhraničnému partnerovi zo Slovenskej republiky a na úhradu prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie sprostredkovateľskému orgánu pre globálny grant;
•	rozpočtový príjmový účet pre programové obdobie 2014 – 2020 vedený v Štátnej pokladnici, ktorý sa využíva na príjem:
-	prostriedkov EÚ z účtu certifikačného orgánu na základe schválenej súhrnnej žiadosti o platbu / mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu;
-	nezrovnalostí a iných vratiek za prostriedky EÚ zaradených do štátneho rozpočtu a za prostriedky spolufinancovania mimo odvodov z rozhodnutí Úradu vládneho auditu / Ministerstva financií SR za porušenie finančnej disciplíny; 
-	odvodov za porušenie finančnej disciplíny z rozhodnutí Úradu vládneho auditu / Ministerstva financií SR s prístupom k výpisom z účtu pre Úrad vládneho auditu na tento účet;
-	výnosov štátneho rozpočtu z poskytnutých prostriedkov prijímateľom;
-	zmluvnej pokuty;
•	oprávnenie disponovať s prostriedkami EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie týchto účtov majú poverení zamestnanci platobnej jednotky;
•	rozpočtové účty platobných jednotiek nie sú úročené a úhrada nákladov (napr. bankové poplatky) je zabezpečovaná príslušnou rozpočtovou kapitolou; 
•	všetky platby pre projekty financované zo štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu musia byť označené v zmysle platnej schémy kódovania zdrojov v štátnom rozpočte a musia poskytovať prehľad (v členení prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie), koľko prostriedkov sa vyplatilo na daný projekt.
Bližšie podmienky pre účty platobnej jednotky sú upravené v usmernení č. 4/2014-U k účtom platobnej jednotky a platobného orgánu / certifikačného orgánu v Štátnej pokladnici a k pohľadávkam v rámci programového obdobia 2004 – 2006, 2007 – 2013 a 2014 – 2020.
5.3	Účty sprostredkovateľského orgánu pre globálny grant 
•	mimorozpočtový účet, ktorý používa pre prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie, vedený v Štátnej pokladnici a operácie na ňom sa vykonávajú na základe § 10 zákona č. 291/2002 Z. z. o Štátnej pokladnici a o zmene a doplnení niektorých zákonov v znení neskorších predpisov v prípade, ak sprostredkovateľský orgán pre globálny grant je štátna rozpočtová organizácia;
•	bežný účet pre prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie vedený v Štátnej pokladnici, na ktorom sa operácie vykonávajú v súlade so zákonom č. 291/2002 Z. z. o Štátnej pokladnici a o zmene a doplnení niektorých zákonov v znení neskorších predpisov v prípade, ak sprostredkovateľský orgán pre globálny grant je štátna príspevková organizácia. Tento bežný účet slúži na pripísanie prostriedkov EÚ a prostriedkov štátneho rozpočtu na spolufinancovanie formou transferu z platobnej jednotky. V prípade iných subjektov verejnej správy, ktorí nie sú povinným klientom Štátnej pokladnice, si môžu tieto sprostredkovateľské orgány pre globálny grant otvoriť účet aj v komerčnej banke; 
•	osobitný účet pre prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie vedený v komerčnej banke v prípade, ak sprostredkovateľský orgán pre globálny grant je zo súkromného / mimovládneho / neziskového sektora;
•	v prípade otvorenia účtu pre príjem prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie v komerčnej banke v zahraničí, sprostredkovateľský orgán pre globálny grant zodpovedá za úhradu všetkých nákladov spojených s realizáciou platieb na a z tohto účtu;
•	účet slúži najmä na:
-	prijatie prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie (zálohová platba) z rozpočtového výdavkového účtu platobnej jednotky,
-	prevod prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie na príslušné účty prijímateľov;
•	oprávnenie disponovať s prostriedkami EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie tohto účtu majú poverení zamestnanci sprostredkovateľského orgánu pre globálny grant;
•	účet je vedený v EUR;
•	v prípade, ak je účet úročený, úrok vzniknutý na účte sa použije na financovanie príslušného globálneho grantu.
Účty budú podrobnejšie rozpracované po definitívnom vyjasnení otvorených otázok súvisiacich s nastavením implementácie globálnych grantov.
5.4	Účty prijímateľa – štátna rozpočtová organizácia
•	výdavkový účet, ktorý sa používa pre prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie, vedený v Štátnej pokladnici, na ktorom sa operácie vykonávajú v súlade so zákonom č. 291/2002 Z. z. o Štátnej pokladnici a o zmene a doplnení niektorých zákonov v znení neskorších predpisov. Tento účet môže byť používaný aj na poskytnutie prostriedkov EÚ a prostriedkov štátneho rozpočtu na spolufinancovanie na financovanie projektu formou zálohovej platby a predfinancovania na základe rozpočtového opatrenia;
•	výdavkový účet pre prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie vedený v Štátnej pokladnici, ktorý slúži na prijatie zálohovej platby formou rozpočtového opatrenia a na refundáciu realizovaných výdavkov formou rozpočtového opatrenia pri uplatnení systému refundácie a následný prevod formou rozpočtového opatrenia na rozpočtový výdavkový účet, z ktorého boli prostriedky pôvodne vynaložené. Tento účet môže byť prijímateľom použitý aj na úhradu výdavkov spojených s realizáciou projektu v súlade so zákonom č. 291/2002 Z. z. o Štátnej pokladnici a o zmene a doplnení niektorých zákonov v znení neskorších predpisov;
•	v prípade, ak je výdavkový účet pre prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie využívaný aj na úhradu výdavkov spojených s realizáciou projektu z poskytnutej zálohovej platby, môžu byť špecifické výdavky realizované z rozpočtového výdavkového účtu prijímateľa. Prijímateľ je povinný oznámiť riadiacemu orgánu identifikáciu takéhoto účtu. Tieto výdavky nesmú byť hradené z účtu zriadeného na realizáciu iných programov zahraničnej pomoci (napr. projektov Finančného mechanizmu Európskeho hospodárskeho priestoru, Nórskeho finančného mechanizmu alebo iných projektov financovaných zo štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu). V tomto prípade prijímateľ po pripísaní zálohovej platby prevádza prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie na úhradu špecifických výdavkov jedným z nasledovných spôsobov:
-	z výdavkového účtu pre prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie prevedie alikvotný podiel špecifického výdavku na výdavkový účet a následne, najneskôr do 5 pracovných dní realizuje platbu dodávateľovi / zhotoviteľovi. Prijímateľ predloží riadiacemu orgánu výpis z výdavkového účtu potvrdzujúci úhradu výdavku dodávateľovi / zhotoviteľovi a výpis z výdavkového účtu pre prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie potvrdzujúci použitie prostriedkov z poskytnutej zálohovej platby;
-	v rámci kalendárneho mesiaca (v decembri najneskôr do 30. decembra daného rozpočtového roka) prevedie prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie z výdavkového účtu pre prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie na výdavkový účet, z ktorého priebežne v danom kalendárnom mesiaci realizuje úhrady špecifických výdavkov;
•	účet / účty nie sú úročené a sú vedené v EUR.
V prípade, ak je prijímateľom štátna rozpočtová organizácia a projekt realizuje organizácia v zriaďovateľskej pôsobnosti prijímateľa, úhrada oprávnených výdavkov môže byť realizovaná aj z účtov tohto subjektu pri dodržaní podmienky existencie účtu prijímateľa určeného na príjem prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie. Zároveň subjekt v zriaďovateľskej pôsobnosti prijímateľa je povinný realizovať oprávnené výdavky prostredníctvom rozpočtu. Prijímateľ je povinný bezodkladne oznámiť riadiacemu orgánu identifikáciu účtov, z ktorých realizuje úhradu oprávnených výdavkov za podmienky dodržania pravidiel vzťahujúcich sa na špecifické výdavky a úroky. 
5.4.1	Účty prijímateľa – štátna rozpočtová organizácia – Ústredie práce, sociálnych vecí a rodiny
•	mimorozpočtový účet Ústredia práce, sociálnych vecí a rodiny zriadený pre odvod prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie užívateľom na základe právoplatných rozhodnutí za porušenie finančnej disciplíny Úradu vládneho auditu s prístupom k výpisom z účtu. Na tento účet užívateľ odvádza prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie v prípade, ak bol užívateľovi uložený odvod za porušenie finančnej disciplíny pri hospodárení s prostriedkami EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie na základe právoplatných rozhodnutí za porušenie finančnej disciplíny v rámci realizovaného národného projektu prijímateľom, ktorým je Ústredie práce, sociálnych vecí a rodiny.
5.5	Účty prijímateľa – štátna príspevková organizácia a iné subjekty verejnej správy
•	bežný účet pre prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie vedený v Štátnej pokladnici, na ktorom sa operácie vykonávajú v súlade so zákonom č. 291/2002 Z. z. o Štátnej pokladnici a o zmene a doplnení niektorých zákonov v znení neskorších predpisov. Tento bežný účet slúži na pripísanie prostriedkov EÚ a prostriedkov štátneho rozpočtu na spolufinancovanie formou transferu z platobnej jednotky. V prípade iných subjektov verejnej správy, ktorí nie sú povinným klientom Štátnej pokladnice, si môžu títo prijímatelia otvoriť účet aj v komerčnej banke; 
•	v prípade otvorenia účtu pre príjem prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie v komerčnej banke v zahraničí, prijímateľ zodpovedá za úhradu všetkých nákladov spojených s realizáciou platieb na a z tohto účtu;
•	v prípade využitia systému refundácie môže prijímateľ realizovať úhrady oprávnených výdavkov aj z iných účtov otvorených prijímateľom pri dodržaní podmienky existencie jedného účtu na príjem prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie. Prijímateľ je povinný oznámiť riadiacemu orgánu identifikáciu takýchto účtov;
•	v prípade, ak prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie sú poskytované systémom refundácie, sú úroky vzniknuté na tomto účte príjmom prijímateľa;
•	v prípade, ak prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie poskytnuté systémom predfinancovania, resp. zálohovej platby sú úročené, prijímateľ je povinný otvoriť si osobitný účet na projekt. Vlastné zdroje prijímateľa na realizáciu projektu môžu prechádzať cez osobitný účet. V prípade, ak vlastné zdroje prijímateľa prechádzajú cez osobitný účet, prijímateľ je povinný vložiť vlastné zdroje na spolufinancovanie najneskôr pred vykonaním platby dodávateľovi / zhotoviteľovi a predložiť riadiacemu orgánu výpis z osobitného účtu ako potvrdenie o prevode vlastných zdrojov. V prípade, ak vlastné zdroje prijímateľa neprechádzajú cez osobitný účet, prijímateľ je povinný ku každému uhradenému výdavku doložiť výpis z iného bežného účtu otvoreného prijímateľom o úhrade vlastných zdrojov prijímateľa. Prijímateľ je povinný vzniknuté výnosy za prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie odviesť do príjmov štátneho rozpočtu na príjmový účet platobnej jednotky jedenkrát ročne. Odvod výnosov prijímateľ potvrdí predložením výpisu z osobitného účtu;
•	v prípade využitia systému zálohovej platby môžu byť špecifické výdavky14 realizované aj z iného účtu otvoreného prijímateľom. Prijímateľ je povinný oznámiť riadiacemu orgánu identifikáciu takéhoto účtu. Tieto výdavky nesmú byť hradené z osobitného účtu zriadeného na realizáciu iných programov zahraničnej pomoci (napr. projektov Finančného mechanizmu Európskeho hospodárskeho priestoru, Nórskeho finančného mechanizmu alebo iných projektov financovaných zo štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu). Prijímateľ po pripísaní prostriedkov zálohovej platby prevádza prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie na úhradu špecifických výdavkov jedným z nasledovných spôsobov:
-	z osobitného účtu prevedie alikvotný podiel špecifického výdavku na iný účet otvorený prijímateľom a následne realizuje platbu dodávateľovi / zhotoviteľovi. Prijímateľ predloží riadiacemu orgánu výpis z iného účtu otvoreného prijímateľom potvrdzujúci úhradu výdavku dodávateľovi / zhotoviteľovi a výpis z osobitného účtu potvrdzujúci použitie prostriedkov z poskytnutej zálohovej platby;
-	minimálne raz mesačne prevedie prostriedky z osobitného účtu na iný účet otvorený prijímateľom, z ktorého priebežne realizuje úhrady špecifických výdavkov. Prijímateľ prevedie sumu vo výške oprávnených výdavkov vzniknutých počas predchádzajúceho kalendárneho mesiaca najneskôr do 5 pracovných dní od ukončenia predmetného kalendárneho mesiaca;
•	účet je vedený v EUR.
V prípade, ak prijímateľom je štátna príspevková organizácia a iné subjekty verejnej správy15 a projekt realizuje organizácia v zriaďovateľskej pôsobnosti prijímateľa, úhrada oprávnených výdavkov môže byť realizovaná aj z účtov tohto subjektu pri dodržaní podmienky existencie účtu prijímateľa určeného na príjem prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie. Zároveň subjekt v zriaďovateľskej pôsobnosti prijímateľa je povinný realizovať oprávnené výdavky prostredníctvom rozpočtu. Prijímateľ je povinný bezodkladne oznámiť riadiacemu orgánu identifikáciu účtov, z ktorých realizuje úhradu oprávnených výdavkov za podmienky dodržania pravidiel vzťahujúcich sa na špecifické výdavky a úroky. 
5.6	Účty prijímateľa – vyšší územný celok	
•	bežný účet pre príjem prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie vedený v Štátnej pokladnici, na ktorom sa operácie vykonávajú na základe § 9a zákona č. 291/2002 Z. z. o Štátnej pokladnici a o zmene a doplnení niektorých zákonov v znení neskorších predpisov;
•	v prípade využitia systému refundácie môže prijímateľ realizovať úhrady oprávnených výdavkov aj z iných účtov otvorených prijímateľom pri dodržaní podmienky existencie jedného účtu na príjem prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie. Prijímateľ je povinný oznámiť riadiacemu orgánu identifikáciu takýchto účtov;
•	v prípade, ak prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie sú poskytované systémom refundácie, sú úroky vzniknuté na tomto účte príjmom prijímateľa;
•	v prípade, ak prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie poskytnuté systémom predfinancovania, resp. zálohovej platby sú úročené, prijímateľ je povinný otvoriť si osobitný účet16 na projekt. Vlastné zdroje prijímateľa na realizáciu projektu môžu prechádzať cez osobitný účet. V prípade, ak vlastné zdroje prijímateľa prechádzajú cez osobitný účet, prijímateľ je povinný vložiť vlastné zdroje na spolufinancovanie najneskôr pred vykonaním platby dodávateľovi / zhotoviteľovi na osobitný účet prijímateľa a predložiť riadiacemu orgánu výpis z osobitného účtu ako potvrdenie o prevode vlastných zdrojov. V prípade, ak vlastné zdroje prijímateľa neprechádzajú cez osobitný účet, prijímateľ je povinný ku každému uhradenému výdavku predložiť riadiacemu orgánu výpis z iného účtu otvoreného prijímateľom o úhrade vlastných zdrojov prijímateľa. Prijímateľ je povinný výnosy za prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie vzniknuté na osobitnom účte odviesť do príjmov štátneho rozpočtu na príjmový účet platobnej jednotky jedenkrát ročne. Odvod výnosov prijímateľ potvrdí predložením výpisu z osobitného účtu;
•	v prípade otvorenia účtu pre príjem prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie v komerčnej banke v zahraničí, prijímateľ zodpovedá za úhradu všetkých nákladov spojených s realizáciou platieb na a z tohto účtu;
•	v prípade využitia systému zálohovej platby môžu byť špecifické výdavky14 realizované aj z iného účtu otvoreného prijímateľom. Prijímateľ je povinný oznámiť riadiacemu orgánu identifikáciu takéhoto účtu. Tieto výdavky nesmú byť hradené z osobitného účtu zriadeného na realizáciu iných programov zahraničnej pomoci (napr. projektov Finančného mechanizmu Európskeho hospodárskeho priestoru, Nórskeho finančného mechanizmu alebo iných projektov financovaných zo štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu). Prijímateľ po pripísaní prostriedkov zálohovej platby prevádza prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie na úhradu špecifických výdavkov jedným z nasledovných spôsobov:
-	z osobitného účtu prevedie alikvotný podiel špecifického výdavku na iný účet otvorený prijímateľom a následne realizuje platbu dodávateľovi / zhotoviteľovi. Prijímateľ predloží riadiacemu orgánu výpis z iného účtu otvoreného prijímateľom potvrdzujúci úhradu výdavku dodávateľovi / zhotoviteľovi a výpis z osobitného účtu potvrdzujúci použitie prostriedkov z poskytnutej zálohovej platby;
-	minimálne raz mesačne prevedie prostriedky z osobitného účtu na iný účet otvorený prijímateľom, z ktorého priebežne realizuje úhrady špecifických výdavkov. Prijímateľ prevedie sumu vo výške oprávnených výdavkov vzniknutých počas predchádzajúceho kalendárneho mesiaca najneskôr do 5 pracovných dní od ukončenia predmetného kalendárneho mesiaca;
•	účet je vedený v EUR.
V prípade, ak prijímateľom je VÚC a projekt realizuje rozpočtová alebo príspevková organizácia v zriaďovateľskej pôsobnosti prijímateľa, úhrada oprávnených výdavkov môže byť realizovaná aj z účtov tohto subjektu pri dodržaní podmienky existencie účtu prijímateľa určeného na príjem prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie. Zároveň subjekt v zriaďovateľskej pôsobnosti prijímateľa je povinný realizovať oprávnené výdavky prostredníctvom rozpočtu. Prijímateľ je povinný bezodkladne oznámiť riadiacemu orgánu identifikáciu účtov, z ktorých realizuje úhradu oprávnených výdavkov za podmienky dodržania pravidiel vzťahujúcich sa na špecifické výdavky a úroky.
5.7	Účty prijímateľa – obec
•	bežný účet pre prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie vedený v komerčnej banke, z ktorého prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie realizuje prostredníctvom rozpočtu;
•	v prípade otvorenia účtu pre príjem prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie v komerčnej banke v zahraničí, prijímateľ zodpovedá za úhradu všetkých nákladov spojených s realizáciou platieb na a z tohto účtu;
•	v prípade využitia systému refundácie môže prijímateľ realizovať úhrady oprávnených výdavkov aj z iných účtov otvorených prijímateľom pri dodržaní podmienky existencie jedného účtu na príjem prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie. Prijímateľ je povinný oznámiť riadiacemu orgánu identifikáciu takýchto účtov;
•	v prípade, ak prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie sú poskytované systémom refundácie, sú úroky vzniknuté na tomto účte príjmom prijímateľa;
•	v prípade, ak prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie poskytnuté systémom predfinancovania, resp. zálohovej platby sú úročené, prijímateľ je povinný otvoriť si osobitný účet16 na projekt. Vlastné zdroje prijímateľa na realizáciu projektu môžu prechádzať cez osobitný účet. V prípade, ak vlastné zdroje prijímateľa prechádzajú cez osobitný účet, prijímateľ je povinný vložiť vlastné zdroje na spolufinancovanie najneskôr pred vykonaním platby dodávateľovi / zhotoviteľovi na osobitný účet prijímateľa a predložiť riadiacemu orgánu výpis z osobitného účtu ako potvrdenie o prevode vlastných zdrojov. V prípade, ak vlastné zdroje prijímateľa neprechádzajú cez osobitný účet, prijímateľ je povinný ku každému uhradenému výdavku predložiť riadiacemu orgánu výpis z iného účtu otvoreného prijímateľom o úhrade vlastných zdrojov prijímateľa. Prijímateľ je povinný výnosy za prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie vzniknuté na osobitnom účte odviesť do príjmov štátneho rozpočtu na príjmový účet platobnej jednotky jedenkrát ročne. Odvod výnosov prijímateľ potvrdí predložením výpisu z osobitného účtu;
•	v prípade využitia systému zálohovej platby môžu byť špecifické výdavky14 realizované aj z iného účtu otvoreného prijímateľom. Prijímateľ je povinný oznámiť riadiacemu orgánu identifikáciu takéhoto účtu. Tieto výdavky nesmú byť hradené z osobitného účtu zriadeného na realizáciu iných programov zahraničnej pomoci (napr. projektov Finančného mechanizmu Európskeho hospodárskeho priestoru, Nórskeho finančného mechanizmu alebo iných projektov financovaných zo štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu). Prijímateľ po pripísaní prostriedkov zálohovej platby prevádza prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie na úhradu špecifických výdavkov jedným z nasledovných spôsobov:
-	z osobitného účtu prevedie alikvotný podiel špecifického výdavku na iný účet otvorený prijímateľom a následne realizuje platbu dodávateľovi / zhotoviteľovi. Prijímateľ predloží riadiacemu orgánu výpis z iného účtu otvoreného prijímateľom potvrdzujúci úhradu výdavku dodávateľovi / zhotoviteľovi a výpis z osobitného účtu potvrdzujúci použitie prostriedkov z poskytnutej zálohovej platby;
-	minimálne raz mesačne prevedie prostriedky z osobitného účtu na iný účet otvorený prijímateľom, z ktorého priebežne realizuje úhrady špecifických výdavkov. Prijímateľ prevedie sumu vo výške oprávnených výdavkov vzniknutých počas predchádzajúceho kalendárneho mesiaca najneskôr do 5 pracovných dní od ukončenia predmetného kalendárneho mesiaca;
•	účet je vedený v EUR.
V prípade, ak prijímateľom je obec a projekt realizuje rozpočtová alebo príspevková organizácia v zriaďovateľskej pôsobnosti prijímateľa, úhrada oprávnených výdavkov môže byť realizovaná aj z účtov tohto subjektu pri dodržaní podmienky existencie účtu prijímateľa určeného na príjem prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie. Zároveň subjekt v zriaďovateľskej pôsobnosti prijímateľa je povinný realizovať oprávnené výdavky prostredníctvom rozpočtu. Prijímateľ je povinný bezodkladne oznámiť riadiacemu orgánu identifikáciu účtov, z ktorých realizuje úhradu oprávnených výdavkov za podmienky dodržania pravidiel vzťahujúcich sa na špecifické výdavky a úroky.
5.8	Účty prijímateľa – rozpočtová a príspevková organizácia v zriaďovacej pôsobnosti VÚC a obce
5.8.1	Účty prijímateľa – rozpočtová organizácia v zriaďovacej pôsobnosti VÚC a obce
•	základným pravidlom pri realizácii výdavkov financovaných z prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie rozpočtových organizácií v zriaďovateľskej pôsobnosti VÚC a obce je povinnosť ich realizácie prostredníctvom rozpočtu VÚC a rozpočtu obce. Ak sú prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie určené na financovanie projektov štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu poskytnuté priamo rozpočtovej organizácii v pôsobnosti VÚC alebo obce, tieto môžu byť použité len prostredníctvom rozpočtu zriaďovateľa, t. j. rozpočtu VÚC alebo obce;
•	mimorozpočtový účet pre prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie vedený v Štátnej pokladnici / komerčnej banke, z ktorého prostriedky do 5 pracovných dní od ich prijatia na mimorozpočtový účet prevedie do rozpočtu zriaďovateľa. Zriaďovateľ ich následne prevedie na rozpočtový výdavkový účet prijímateľa. V prípade, ak zriaďovateľ neprevedie prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie na rozpočtový výdavkový účet prijímateľa, a výdavky potrebné na financovanie určených účelov sú zabezpečené v rozpočte prijímateľa, zriaďovateľ dá pokyn prijímateľovi na preklasifikovanie výdavkov (realizované úhrady oprávnených výdavkov z iných účtov otvorených prijímateľom) v rámci svojho výkazníctva na výdavky na realizáciu prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie;
•	v prípade otvorenia účtu pre príjem prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie v komerčnej banke v zahraničí, prijímateľ zodpovedá za úhradu všetkých nákladov spojených s realizáciou platieb na a z tohto účtu;
•	v prípade využitia systému refundácie môže prijímateľ realizovať úhrady oprávnených výdavkov aj z iných účtov otvorených prijímateľom pri dodržaní podmienky existencie jedného účtu na príjem prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie. Prijímateľ je povinný oznámiť riadiacemu orgánu identifikáciu takýchto účtov; 
•	v prípade, ak prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie sú poskytované systémom refundácie, sú úroky vzniknuté na tomto účte príjmom prijímateľa;
•	v prípade, ak prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie poskytnuté systémom predfinancovania, resp. zálohovej platby sú úročené, prijímateľ je povinný otvoriť si osobitný rozpočtový účet na projekt. Vlastné zdroje prijímateľa na realizáciu projektu môžu prechádzať cez osobitný rozpočtový účet. V prípade, ak vlastné zdroje prijímateľa prechádzajú cez osobitný rozpočtový účet, prijímateľ je povinný vložiť vlastné zdroje na spolufinancovanie najneskôr pred vykonaním platby dodávateľovi / zhotoviteľovi na osobitný rozpočtový účet prijímateľa a predložiť riadiacemu orgánu výpis z osobitného rozpočtového účtu ako potvrdenie o prevode vlastných zdrojov. V prípade, ak vlastné zdroje prijímateľa neprechádzajú cez osobitný rozpočtový účet, prijímateľ je povinný ku každému uhradenému výdavku predložiť riadiacemu orgánu výpis z iného rozpočtového účtu otvoreného prijímateľom o úhrade vlastných zdrojov prijímateľa. Prijímateľ je povinný výnosy za prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie vzniknuté na osobitnom rozpočtovom účte odviesť do príjmov štátneho rozpočtu na príjmový účet platobnej jednotky jedenkrát ročne. Odvod výnosov prijímateľ potvrdí predložením výpisu z osobitného rozpočtového účtu;
•	v prípade využitia systému zálohovej platby môžu byť špecifické výdavky14 realizované aj z iného účtu otvoreného prijímateľom. Prijímateľ je povinný oznámiť riadiacemu orgánu identifikáciu takéhoto účtu. Tieto výdavky nesmú byť hradené z osobitného účtu zriadeného na realizáciu iných programov zahraničnej pomoci (napr. projektov Finančného mechanizmu Európskeho hospodárskeho priestoru, Nórskeho finančného mechanizmu alebo iných projektov financovaných zo štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu). Prijímateľ po pripísaní prostriedkov zálohovej platby prevádza prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie na úhradu špecifických výdavkov jedným z nasledovných spôsobov:
-	z osobitného účtu prevedie alikvotný podiel špecifického výdavku na iný účet otvorený prijímateľom a následne realizuje platbu dodávateľovi / zhotoviteľovi. Prijímateľ predloží riadiacemu orgánu výpis z iného účtu otvoreného prijímateľom potvrdzujúci úhradu výdavku dodávateľovi / zhotoviteľovi a výpis z osobitného rozpočtového účtu potvrdzujúci použitie prostriedkov z poskytnutej zálohovej platby;
-	minimálne raz mesačne prevedie prostriedky z osobitného rozpočtového účtu na iný účet otvorený prijímateľom, z ktorého priebežne realizuje úhrady špecifických výdavkov. Prijímateľ prevedie sumu vo výške oprávnených výdavkov vzniknutých počas predchádzajúceho kalendárneho mesiaca najneskôr do 5 pracovných dní od ukončenia predmetného kalendárneho mesiaca;
•	účet / účty sú vedené v EUR.
5.8.2	Účty prijímateľa – príspevková organizácia v zriaďovacej pôsobnosti VÚC a obce
•	v prípade, ak príspevková organizácia nepožaduje príspevok za podiel zodpovedajúci vlastným zdrojom od zriaďovateľa, bežný účet pre prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie vedený v komerčnej banke, z ktorého prostriedky realizuje prostredníctvom rozpočtu;
•	v prípade, ak príspevková organizácia požaduje príspevok za podiel zodpovedajúci vlastným zdrojom od zriaďovateľa, bežný účet pre prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie vedený v Štátnej pokladnici / komerčnej banke, z ktorého prostriedky pred ich použitím prevedie do 5 pracovných dní do rozpočtu zriaďovateľa. Zriaďovateľ ich následne prevedie na bežný účet prijímateľa;
•	v prípade otvorenia účtu pre príjem prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie v komerčnej banke v zahraničí, prijímateľ zodpovedá za úhradu všetkých nákladov spojených s realizáciou platieb na a z tohto účtu;
•	v prípade využitia systému refundácie môže prijímateľ realizovať úhrady oprávnených výdavkov aj z iných účtov otvorených prijímateľom pri dodržaní podmienky existencie jedného účtu na príjem prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie. Prijímateľ je povinný oznámiť riadiacemu orgánu identifikáciu takýchto účtov;
•	v prípade, ak prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie sú poskytované systémom refundácie, sú úroky vzniknuté na tomto účte príjmom prijímateľa;
•	v prípade, ak prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie poskytnuté systémom predfinancovania, resp. zálohovej platby sú úročené, prijímateľ je povinný otvoriť si osobitný účet na projekt. Vlastné zdroje prijímateľa na realizáciu projektu môžu prechádzať cez osobitný účet. V prípade, ak vlastné zdroje prijímateľa prechádzajú cez osobitný účet, prijímateľ je povinný vložiť vlastné zdroje na spolufinancovanie najneskôr pred vykonaním platby dodávateľov / zhotoviteľovi na osobitný účet prijímateľa a predložiť riadiacemu orgánu výpis z osobitného účtu ako potvrdenie o prevode vlastných zdrojov. V prípade, ak vlastné zdroje prijímateľa neprechádzajú cez osobitný účet, prijímateľ je povinný ku každému uhradenému výdavku predložiť riadiacemu orgánu výpis z iného účtu otvoreného prijímateľom o úhrade vlastných zdrojov prijímateľa. Prijímateľ je povinný vzniknuté výnosy za prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie odviesť do príjmov štátneho rozpočtu na príjmový účet platobnej jednotky jedenkrát ročne. Odvod výnosov prijímateľ potvrdí predložením výpisu z osobitného účtu;
•	v prípade využitia systému zálohovej platby môžu byť špecifické výdavky14 realizované aj z iného účtu otvoreného prijímateľom. Prijímateľ je povinný oznámiť riadiacemu orgánu identifikáciu takéhoto účtu. Tieto výdavky nesmú byť hradené z osobitného účtu zriadeného na realizáciu iných programov zahraničnej pomoci (napr. projektov Finančného mechanizmu Európskeho hospodárskeho priestoru, Nórskeho finančného mechanizmu alebo iných projektov financovaných zo štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu). Prijímateľ po pripísaní prostriedkov zálohovej platby prevádza prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie na úhradu špecifických výdavkov jedným z nasledovných spôsobov:
-	z osobitného účtu prevedie alikvotný podiel špecifického výdavku na iný účet otvorený prijímateľom a následne realizuje platbu dodávateľovi / zhotoviteľovi. Prijímateľ predloží riadiacemu orgánu výpis z iného účtu otvoreného prijímateľom potvrdzujúci úhradu výdavku dodávateľovi / zhotoviteľovi a výpis z osobitného účtu potvrdzujúci použitie prostriedkov z poskytnutej zálohovej platby;
-	minimálne raz mesačne prevedie prostriedky z osobitného účtu na iný účet otvorený prijímateľom, z ktorého priebežne realizuje úhrady špecifických výdavkov. Prijímateľ prevedie sumu vo výške oprávnených výdavkov vzniknutých počas predchádzajúceho kalendárneho mesiaca najneskôr do 5 pracovných dní od ukončenia predmetného kalendárneho mesiaca;
•	účet / účty sú vedené v EUR. 
5.9	Účty prijímateľa – súkromný sektor 
•	v prípade, ak prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie určené na financovanie projektu sú poskytované iba systémom refundácie, prijímateľ je povinný prijímať ich na jeden účet vedený v komerčnej banke;
•	v prípade otvorenia účtu pre príjem prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie v komerčnej banke v zahraničí, prijímateľ zodpovedá za úhradu všetkých nákladov spojených s realizáciou platieb na a z tohto účtu;
•	v prípade, ak prijímateľ využíva systém refundácie, môže realizovať úhrady oprávnených výdavkov aj z iných účtov otvorených prijímateľom pri dodržaní podmienky existencie jedného účtu na príjem prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie. Prijímateľ je povinný oznámiť riadiacemu orgánu identifikáciu takýchto účtov;
•	prijímateľ si môže otvoriť v komerčnej banke osobitný účet pre projekt;
•	v prípade, ak prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie sú poskytované systémom refundácie, sú úroky vzniknuté na tomto účte príjmom prijímateľa;
•	v prípade, ak prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie poskytnuté systémom zálohovej platby / predfinancovania sú úročené, prijímateľ je povinný otvoriť si osobitný účet16 na projekt. Vlastné zdroje prijímateľa na realizáciu projektu môžu prechádzať cez osobitný účet. V prípade, ak vlastné zdroje prijímateľa prechádzajú cez osobitný účet, prijímateľ je povinný vložiť vlastné zdroje na spolufinancovanie najneskôr pred vykonaním platby dodávateľovi / zhotoviteľovi na osobitný účet prijímateľa a predložiť riadiacemu orgánu výpis z osobitného účtu ako potvrdenie o prevode vlastných zdrojov. V prípade, ak vlastné zdroje prijímateľa neprechádzajú cez osobitný účet, prijímateľ je povinný ku každému uhradenému výdavku predložiť riadiacemu orgánu výpis z iného účtu otvoreného prijímateľom o úhrade vlastných zdrojov prijímateľa. Prijímateľ je povinný výnosy za prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie vzniknuté na osobitnom účte odviesť do príjmov štátneho rozpočtu na príjmový účet platobnej jednotky jedenkrát ročne. Odvod výnosov prijímateľ potvrdí predložením výpisu z osobitného účtu;
•	v prípade, ak prijímateľ využije systém zálohovej platby, môžu byť špecifické výdavky14 realizované aj z iného účtu otvoreného prijímateľom. Prijímateľ je povinný oznámiť riadiacemu orgánu identifikáciu takéhoto účtu. Tieto výdavky nesmú byť hradené z osobitného účtu zriadeného na realizáciu iných programov zahraničnej pomoci (napr. projektov Finančného mechanizmu Európskeho hospodárskeho priestoru, Nórskeho finančného mechanizmu alebo iných projektov financovaných zo štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu). Prijímateľ po pripísaní prostriedkov zálohovej platby prevádza prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie na úhradu špecifických výdavkov jedným z nasledovných spôsobov:
-	z osobitného účtu prevedie alikvotný podiel špecifického výdavku na iný účet otvorený prijímateľom a následne realizuje platbu dodávateľovi / zhotoviteľovi. Prijímateľ predloží riadiacemu orgánu výpis z iného účtu otvoreného prijímateľom potvrdzujúci úhradu výdavku dodávateľovi / zhotoviteľovi a výpis z osobitného účtu potvrdzujúci použitie prostriedkov z poskytnutej zálohovej platby;
-	minimálne raz mesačne prevedie prostriedky z osobitného účtu na iný účet otvorený prijímateľom, z ktorého priebežne realizuje úhrady špecifických výdavkov. Prijímateľ prevedie sumu vo výške oprávnených výdavkov vzniknutých počas predchádzajúceho kalendárneho mesiaca najneskôr do 5 pracovných dní od ukončenia predmetného kalendárneho mesiaca;
•	účet je vedený v EUR.
5.10	Účty prijímateľa – v rámci implementácie finančných nástrojov
•	ak prijímateľ získa príspevky z viac ako jedného programu a / alebo z viac ako jednej prioritnej osi, je povinný zabezpečiť vedenie samostatného účtu pre príjem príspevku na finančný nástroj v Štátnej pokladnici / komerčnej banke alebo pobočke zahraničnej banky so sídlom v členskom štáte EÚ pre každý program / prioritnú os alebo zabezpečiť vhodné kódové označenie v členení na jednotlivé zdroje financovania;
•	účet pre príjem príspevku na finančný nástroj slúži na prijatie finančných prostriedkov určených na financovanie finančných nástrojov a ich správu a pre účely vykonávania činnosti prijímateľa v súvislosti s výkonom finančných nástrojov;
•	prijímateľ je povinný finančné prostriedky programu na účte pre príjem príspevku na finančný nástroj v súlade s čl. 38 ods. 6 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 účtovne odlíšiť od iných prostriedkov prijímateľa;
•	v prípade, ak prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie poskytnuté prijímateľovi prostredníctvom jednotlivých tranží sú úročené, je prijímateľ povinný použiť vzniknuté úroky v súlade s čl. 43 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 ods. 2, Systémom riadenia finančných nástrojov financovaných z Kohézneho fondu, Európskeho fondu regionálneho rozvoja a Európskeho sociálneho fondu na programové obdobie 2014 – 2020 a príslušnou zmluvou o financovaní;
•	prijímateľ si môže otvoriť viazaný účet na účely držby finančných prostriedkov vyplácaných po uplynutí obdobia oprávnenosti v súlade s čl. 42 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a v súlade so zmluvou o financovaní;
•	účty sú vedené v EUR.

6	Systém informačných a finančných tokov na národnej úrovni
6.1	Systém predfinancovania
Pri projektoch financovaných z Európskeho fondu regionálneho rozvoja, Európskeho námorného a rybárskeho fondu a Kohézneho fondu sa vyplácanie prijímateľa môže realizovať systémom predfinancovania alebo systémom refundácie (časť 6.5) v súlade s určením riadiaceho orgánu v spolupráci s prijímateľom. 
Prijímateľ môže kombinovať uvedené systémy v závislosti od určenia riadiaceho orgánu stanoveného v zmluve o poskytnutí nenávratného finančného príspevku. 
Jednotlivé žiadosti o platbu môže prijímateľ predkladať len na jeden z uvedených systémov, tzn. že výdavky realizované z poskytnutého predfinancovania nemôže prijímateľ kombinovať s výdavkami uplatňovanými systémom refundácie v rámci jednej žiadosti o platbu. V takom prípade prijímateľ predkladá samostatne žiadosť o platbu (zúčtovanie predfinancovania) a samostatne žiadosť o platbu (priebežná platba). V prípade zmeny právnej formy prijímateľa na typ, ktorý v zmysle časti 4.5.4 nie je oprávnený ďalej využívať systém predfinancovania, prijímateľovi nie sú poskytované žiadne platby až do zúčtovania poskytnutých predfinancovaní.
Predfinancovanie je prijímateľovi poskytované pomerne za prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie na základe ním predložených nezaplatených účtovných dokladov.
Riadiaci orgán prispôsobí po súčinnosti s platobnou jednotkou a prijímateľom lehoty predkladacieho a schvaľovacieho procesu v rámci systému predfinancovania tak, aby bola dodržaná maximálna možná lehota na splnenie peňažného záväzku dlžníka (t. j. uhradenie faktúry), vyplývajúca zo zákona č. 513/1991 Zb. Obchodný zákonník v znení neskorších predpisov. 
Riadiaci orgán je zároveň oprávnený prijať prísnejšie postupy, ako sú stanovené v Systéme finančného riadenia štrukturálnych fondov a Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu na programové obdobie 2014 – 2020. 
V prípade, ak sa riadiaci orgán v súčinnosti s platobnou jednotkou rozhodne pre skrátenie lehôt schvaľovacieho procesu, ktoré by mali dopad na podmienky definované v zmluve o poskytnutí nenávratného finančného príspevku, na úpravu zmluvných podmienok vzťahujúcich sa k skráteniu týchto lehôt, nie je potrebný súhlas certifikačného orgánu.
Dôvody predĺženia schvaľovacieho procesu žiadosti o platbu uvedie riadiaci orgán v správe z kontroly žiadosti o platbu.
Pri využití systému predfinancovania sa vyplácanie prijímateľa uskutočňuje v troch etapách – etape poskytnutia predfinancovania, etape zúčtovania predfinancovania a etape refundácie uskutočnených výdavkov.
Etapa poskytnutia predfinancovania:
1.	Prijímateľ predkladá riadiacemu orgánu žiadosť o platbu (poskytnutie predfinancovania) elektronicky prostredníctvom ITMS a najneskôr do 31. decembra 2015 aj písomne. V rámci formulára žiadosti o platbu prijímateľ uvedie nárokované finančné prostriedky projektu podľa skupiny výdavkov v zmysle zmluvy o poskytnutí nenávratného finančného príspevku. Žiadosť o platbu predkladá prijímateľ v lehote splatnosti záväzku dodávateľovi / zhotoviteľovi. 
2.	Prijímateľ spolu so žiadosťou o platbu predkladá účtovné doklady1 (minimálne jeden rovnopis faktúry, prípadne rovnopis dokladu rovnocennej dôkaznej hodnoty) prijaté od dodávateľa / zhotoviteľa a relevantnú podpornú dokumentáciu, ktorej minimálny rozsah stanovuje Systém riadenia európskych štrukturálnych a investičných fondov na programové obdobie 2014 – 2020. Ďalší rovnopis účtovného dokladu si ponecháva prijímateľ. 
V prípade, ak súčasťou nárokovaných finančných prostriedkov prijímateľa sú aj hotovostné úhrady, zahrnie prijímateľ tieto nárokované finančné prostriedky do žiadosti o platbu a spolu so žiadosťou o platbu predloží aj rovnopisy, resp. kópie príslušných účtovných dokladov označené podpisom štatutárneho orgánu prijímateľa, ktoré potvrdzujú hotovostnú úhradu (napr. pokladničný blok).
3.	Riadiaci orgán vykoná kontrolu žiadosti o platbu podľa čl. 125 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a kontrolu v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov a na základe podmienok a postupu výkonu kontroly projektu definovaných v Systéme riadenia európskych štrukturálnych a investičných fondov na programové obdobie 2014 – 2020. 
V prípade zistenia nedostatkov riadiaci orgán vyzve prijímateľa, aby v stanovenej lehote doplnil / zmenil žiadosť o platbu. Lehota na výkon kontroly žiadosti o platbu môže byť riadiacim orgánom pozastavená.
4.	Riadiaci orgán počas výkonu kontroly žiadosti o platbu vykonáva v prípade potreby aj samostatnú kontrolu vyčlenenej časti nárokovaných finančných prostriedkov z predloženej žiadosti o platbu. Samostatná kontrola vyčlenenej časti nárokovaných finančných prostriedkov z predloženej žiadosti o platbu sa nevykonáva v prípade žiadosti o platbu vrátenej z platobnej jednotky v zmysle bodu 14a) a 14b). Riadiaci orgán môže počas výkonu samostatnej kontroly vyčlenenej časti nárokovaných finančných prostriedkov vyčleniť z už vyčlenenej časti nárokovaných finančných prostriedkov ďalšiu časť nárokovaných finančných prostriedkov na samostatnú kontrolu. Podrobnosti výkonu samostatnej kontroly vyčlenenej časti nárokovaných finančných prostriedkov z predloženej žiadosti o platbu stanovuje Systém riadenia európskych štrukturálnych a investičných fondov na programové obdobie 2014 – 2020.
5.	Po vykonaní kontroly žiadosti o platbu riadiaci orgán žiadosť o platbu schváli (schváli nárokované finančné prostriedky prijímateľa v plnej výške), žiadosť o platbu schváli v zníženej sume (schváli nárokované finančné prostriedky vo výške zníženej o sumu neoprávnených nárokovaných finančných prostriedkov), žiadosť o platbu schváli v zníženej sume (schváli nárokované finančné prostriedky bez nárokovaných finančných prostriedkov, ktoré sú predmetom samostatnej kontroly, resp. schváli nárokované finančné prostriedky, ktoré sú predmetom samostatnej kontroly v zmysle postupu podľa bodu 6b) alebo žiadosť o platbu zamietne bezodkladne najneskôr však v lehote 25 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od prijímateľa riadiacim orgánom. 
Ukončením výkonu kontroly nárokovaných finančných prostriedkov z predloženej žiadosti o platbu (okrem prípadu podľa bodu 6a) sa ku kódu žiadosti o platbu (v rámci časti žiadosti o platbu vypĺňanej riadiacim orgánom) automaticky priraďuje dodatočný číselný identifikátor. V prípade schválenia nárokovaných finančných prostriedkov vo vyššie uvedených prípadoch, v stanovenej lehote 25 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od platobnej jednotky v ITMS, riadiaci orgán predkladá platobnej jednotke len príslušnú časť formulára žiadosti o platbu, v rámci ktorej je kód žiadosti o platbu rozšírený o príslušný číselný identifikátor. 
6.	V prípade výkonu samostatnej kontroly riadiaci orgán schváli nárokované finančné prostriedky, ktoré boli predmetom samostatnej kontroly v plnej výške, schváli nárokované finančné prostriedky, ktoré boli predmetom samostatnej kontroly vo výške zníženej o sumu neoprávnených nárokovaných finančných prostriedkov, schváli nárokované finančné prostriedky, ktoré boli predmetom samostatnej kontroly vo výške zníženej o sumu nárokovaných finančných prostriedkov, ktoré sú predmetom ďalšej samostatnej kontroly, schvaľovanie pozastaví20 alebo zamietne bezodkladne21, najneskôr však v lehote 25 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od prijímateľa riadiacim orgánom, pričom v prípade, ak samostatná kontrola vyčlenenej časti nárokovaných finančných prostriedkov:
a)	je ukončená pred alebo súčasne s ukončením kontroly nárokovaných finančných prostriedkov, ktoré neboli vyčlenené na samostatnú kontrolu, riadiaci orgán nárokované finančné prostriedky, ktoré neboli vyčlenené na samostatnú kontrolu a nárokované finančné prostriedky, ktoré boli vyčlenené na samostatnú kontrolu schváli v plnej výške, prípadne schváli v zníženej výške v lehote stanovenej na výkon kontroly (25 pracovných dní). V tomto prípade riadiaci orgán predkladá platobnej jednotke len príslušnú časť formulára žiadosti o platbu, v ktorom identifikuje všetky oprávnené nárokované finančné prostriedky. Ku kódu žiadosti o platbu (v rámci časti žiadosti o platbu vypĺňanej riadiacim orgánom) je v tomto prípade automaticky priraďovaný len jeden číselný identifikátor;
b)	je ukončená po ukončení kontroly nárokovaných finančných prostriedkov, ktoré neboli vyčlenené na samostatnú kontrolu, riadiaci orgán, v lehote stanovenej na výkon kontroly (25 pracovných dní), predkladá platobnej jednotke príslušnú časť formulára žiadosti o platbu, v ktorom identifikuje oprávnené nárokované finančné prostriedky, ktoré boli vyčlenené na samostatnú kontrolu.
V každom z uvedených prípadov predkladá riadiaci orgán platobnej jednotke príslušnú časť formulára žiadosti o platbu, v ktorej sa uvádza výška schválených nárokovaných finančných prostriedkov na preplatenie platobnou jednotkou.
7.	Platobná jednotka vykoná kontrolu žiadosti o platbu (poskytnutie predfinancovania) v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov do 5 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu v ITMS. Platobná jednotka overí súlad sumy nárokovaných finančných prostriedkov so schváleným rozpočtom platobnej jednotky. Následne v stanovenej lehote schváli alebo neschváli žiadosť o platbu. V prípade jej schválenia platobná jednotka najneskôr do 3 pracovných dní od schválenia žiadosti o platbu zadá platobné príkazy na úhradu prijímateľovi z rozpočtovaných výdavkov (z výdavkového účtu) pomerne za zdroje EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie. V prípade neschválenia žiadosti o platbu, vracia predmetnú žiadosť o platbu riadiacemu orgánu v stanovenej lehote 5 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu v ITMS .
8.	V prípade vrátenia žiadosti o platbu z platobnej jednotky v zmysle bodu 7 riadiaci orgán vykoná kontrolu žiadosti o platbu podľa čl. 125 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a kontrolu v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov a na základe podmienok a postupov pre výkon kontroly žiadosti o platbu definovaných v Systéme riadenia európskych štrukturálnych a investičných fondov na programové obdobie 2014 – 2020. 
Riadiaci orgán počas výkonu kontroly žiadosti o platbu môže schvaľovanie žiadosti o platbu pozastaviť20.
Po vykonaní kontroly žiadosti o platbu riadiaci orgán žiadosť o platbu schváli (schváli nárokované finančné prostriedky v plnej výške), žiadosť o platbu schváli v zníženej sume (schváli nárokované finančné prostriedky vo výške zníženej o sumu neoprávnených výdavkov), alebo žiadosť o platbu zamietne bezodkladne21 najneskôr však v lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od platobnej jednotky v ITMS. Po schválení žiadosti o platbu vo vyššie uvedených prípadoch, v stanovenej lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od platobnej jednotky v ITMS, riadiaci orgán predloží príslušnú časť formulára žiadosti o platbu platobnej jednotke, ktorá postupuje podľa bodu 7. 
9.	Prijímateľ je povinný bezodkladne21 previesť prostriedky EÚ, štátneho rozpočtu na spolufinancovanie a vlastných zdrojov dodávateľovi / zhotoviteľovi na úhradu nezaplatených účtovných dokladov. Úrok z omeškania platby voči dodávateľovi / zhotoviteľovi znáša samotný prijímateľ.
Etapa zúčtovania poskytnutého predfinancovania:
10.	Po poskytnutí predfinancovania je prijímateľ povinný celú výšku poskytnutého predfinancovania zúčtovať najneskôr do 10 pracovných dní odo dňa pripísania týchto prostriedkov na jeho účet. Ku každej schválenej žiadosti o platbu (poskytnutie predfinancovania) prijímateľ predkladá riadiacemu orgánu samostatnú žiadosť o platbu (zúčtovanie predfinancovania).
Prijímateľ v rámci zúčtovania predfinancovania predkladá spolu so žiadosťou o platbu výpis z bankového účtu1 (originál alebo kópiu18 označenú podpisom štatutárneho orgánu prijímateľa) potvrdzujúci príjem prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie, ako aj doklady preukazujúce skutočnú úhradu výdavkov deklarovaných v žiadosti o platbu (výpis z bankového účtu1, resp. prehlásenie banky o úhrade výdavkov originál alebo kópiu18 označenú podpisom štatutárneho orgánu prijímateľa). 
Prijímateľ v rámci zúčtovania predfinancovania uvedie v žiadosti o platbu aj výdavky viažuce sa na hotovostné úhrady uvedené v bode 2, ktoré boli zahrnuté v žiadosti o platbu (poskytnutie predfinancovania), pričom prijímateľ nie je povinný opätovne predkladať tie isté overené kópie príslušných účtovných dokladov potvrdzujúce hotovostnú úhradu. 
Nezúčtovaný rozdiel predfinancovania je prijímateľ povinný na základe vzájomnej komunikácie s riadiacim orgánom vrátiť platobnej jednotke bezodkladne21, najneskôr do 5 pracovných dní od ukončenia lehoty na zúčtovanie22. Prijímateľ predloží riadiacemu orgánu oznámenie o vysporiadaní finančných vzťahov v zmysle časti 4.5.9. 
11.	Riadiaci orgán vo vzťahu k žiadosti o platbu (zúčtovanie predfinancovania) postupuje podobne ako v bode 3 a 5, pričom skontroluje žiadosť o platbu a výpis z bankového účtu.
12.	Po vykonaní kontroly žiadosti o platbu riadiaci orgán žiadosť o platbu schváli (schváli deklarované výdavky prijímateľa v plnej výške), žiadosť o platbu schváli v zníženej sume (schváli deklarované výdavky vo výške zníženej o sumu neoprávnených výdavkov), alebo žiadosť o platbu zamietne bezodkladne21, najneskôr však v lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od prijímateľa riadiacim orgánom a po schválení žiadosti o platbu vo vyššie uvedených prípadoch, v stanovenej lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od prijímateľa riadiacim orgánom, riadiaci orgán predloží príslušnú časť formulára žiadosti o platbu platobnej jednotke, ktorá postupuje v zmysle bodu 14a).
13.	Riadiaci orgán v prípade vrátenia žiadosti o platbu z platobnej jednotky v zmysle:
a)	bodu 14a) vykoná kontrolu žiadosti o platbu podľa čl. 125 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov a na základe podmienok a postupov pre výkon kontroly žiadosti o platbu definovaných v Systéme riadenia európskych štrukturálnych a investičných fondov na programové obdobie 2014 – 2020. 
Riadiaci orgán počas výkonu kontroly žiadosti o platbu môže schvaľovanie žiadosti o platbu pozastaviť20. 
Po vykonaní kontroly žiadosti o platbu riadiaci orgán žiadosť o platbu schváli (schváli deklarované výdavky v plnej výške), žiadosť o platbu schváli v zníženej sume (schváli deklarované výdavky vo výške zníženej o sumu neoprávnených výdavkov), alebo žiadosť o platbu zamietne bezodkladne21, najneskôr však v lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od platobnej jednotky v ITMS a po schválení žiadosti o platbu vo vyššie uvedených prípadoch v stanovenej lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od platobnej jednotky v ITMS, riadiaci orgán predloží príslušnú časť formulára žiadosti o platbu platobnej jednotke, ktorá postupuje v zmysle bodu 14a).
b)	bodu 14b) a 14c) ii v prípade zistených nedostatkov, ktoré majú vplyv na výšku a / alebo oprávnenosť výdavkov vykoná kontrolu žiadosti o platbu podľa čl. 125 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov a na základe podmienok a postupov pre výkon kontroly žiadosti o platbu definovaných v Systéme riadenia európskych štrukturálnych a investičných fondov na programové obdobie 2014 – 2020. V rámci nedostatkov bez vplyvu na výšku a / alebo oprávnenosť výdavkov sa uplatňuje bod 30 časti 3.2.
Riadiaci orgán počas výkonu kontroly žiadosti o platbu môže schvaľovanie žiadosti o platbu pozastaviť20.
Po vykonaní kontroly žiadosti o platbu riadiaci orgán žiadosť o platbu schváli (schváli deklarované výdavky v plnej výške), žiadosť o platbu schváli v zníženej sume (schváli deklarované výdavky vo výške zníženej o sumu neoprávnených výdavkov), alebo žiadosť o platbu zamietne bezodkladne21, najneskôr však v lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od platobnej jednotky v ITMS a po schválení žiadosti o platbu vo vyššie uvedených prípadoch v stanovenej lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od platobnej jednotky v ITMS, riadiaci orgán predloží príslušnú časť formulára žiadosti o platbu platobnej jednotke, ktorá postupuje v zmysle bodu 14b).
14.	Platobná jednotka zostavuje súhrnnú žiadosť o platbu / mimoriadnu súhrnnú žiadosť o platbu zo žiadostí o platbu, pričom pri:
a)	žiadosti o platbu (zúčtovanie predfinancovania) predloženej riadiacim orgánom v zmysle bodu 12 a 13a) vykoná kontrolu žiadosti o platbu v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov do 5 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu v ITMS. Platobná jednotka overí súlad deklarovanej sumy so schváleným rozpočtom platobnej jednotky. Následne v stanovenej lehote schváli alebo neschváli žiadosť o platbu. V prípade jej schválenia platobná jednotka zahrnie sumu do nasledovnej súhrnnej žiadosti o platbu a v intervale dvakrát do mesiaca podľa stanovených termínov predkladá spolu s čiastkovým výkazom výdavkov certifikačnému orgánu prostredníctvom ITMS. V prípade neschválenia žiadosti o platbu, vracia predmetnú žiadosť o platbu v stanovenej lehote 5 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu v ITMS riadiacemu orgánu, ktorý postupuje podľa bodu 13a);
b)	žiadosti o platbu (zúčtovanie predfinancovania) predloženej riadiacim orgánom v zmysle bodu 13b) vykoná kontrolu žiadosti o platbu v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov do 3 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu v ITMS a v tejto lehote žiadosť o platbu schváli alebo neschváli. Po schválení žiadosti o platbu platobná jednotka najneskôr nasledujúci pracovný deň, resp. podľa postupov a termínov stanovených certifikačným orgánom, zahrnie predmetnú žiadosť o platbu do mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu, ktorú predkladá certifikačnému orgánu najneskôr nasledujúci pracovný deň po jej zostavení. Certifikačný orgán následne postupuje podľa bodov B.15 až B.17. V prípade neschválenia žiadosti o platbu, vracia predmetnú žiadosť o platbu v stanovenej lehote 3 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu v ITMS riadiacemu orgánu, ktorý postupuje podľa bodu 13b);
c)	žiadosti o platbu (zúčtovanie predfinancovania) vrátenej z certifikačného orgánu v zmysle bodu A.17 a A.18 za účelom odstránenia identifikovaných nedostatkov: 
i.	v prípade, ak sa dôvody vrátenia žiadosti o platbu z certifikačného orgánu týkajú úrovne platobnej jednotky, platobná jednotka odstráni zistené nedostatky na svojej úrovni a najneskôr nasledujúci pracovný deň, resp. podľa postupov a termínov stanovených certifikačným orgánom, zahrnie predmetnú žiadosť o platbu do mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu, ktorú predkladá certifikačnému orgánu najneskôr nasledujúci pracovný deň po jej zostavení. Certifikačný orgán následne postupuje podľa bodov B.15 až B.17;
ii.	v prípade, ak sa dôvody vrátenia žiadosti o platbu z certifikačného orgánu týkajú úrovne riadiaceho orgánu, platobná jednotka najneskôr nasledujúci pracovný deň po prijatí žiadosti o platbu z certifikačného orgánu vracia predmetnú žiadosť o platbu riadiacemu orgánu, ktorý postupuje podľa bodu 13b);
d)	žiadosti o platbu (zúčtovanie predfinancovania) (v rámci ktorej boli výdavky schválené certifikačným orgánom v plnej výške) vrátenej z certifikačného orgánu v zmysle bodu A.18 za účelom zaradenia do mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu po prijatí informácie o záveroch certifikačného overovania platobná jednotka zahrnie predmetnú žiadosť o platbu najneskôr nasledujúci pracovný deň, resp. podľa postupov a termínov stanovených certifikačným orgánom do mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu, ktorú predkladá certifikačnému orgánu najneskôr nasledujúci pracovný deň po jej zostavení. Certifikačný orgán následne postupuje podľa bodov B.15 až B.17.
A.	Postup overenia súhrnnej žiadosti o platbu certifikačným orgánom:
A.15.V prípade predloženej súhrnnej žiadosti o platbu certifikačný orgán vykoná overenie na svojej úrovni, ktoré zahrňuje administratívne overenie, prípadne certifikačné overovanie. Taktiež overuje súhrnnú žiadosť o platbu z hľadiska neprekročenia / dodržania celkovej alokácie podľa prioritných osí na základe čiastkového výkazu výdavkov predloženého platobnou jednotkou. V prípade potreby si od riadiaceho orgánu alebo platobnej jednotky vyžiadava ďalšie informácie nevyhnutné pre posúdenie predloženej súhrnnej žiadosti o platbu.
A.16.Ak certifikačný orgán na svojej úrovni vykoná overenie žiadosti o platbu zaradenej do súhrnnej žiadosti o platbu a toto overenie žiadosti o platbu:
a)	je ukončené v lehote na overenie súhrnnej žiadosti o platbu, postupuje certifikačný orgán ďalej podľa bodu A.17,
b)	nie je ukončené v lehote na overenie súhrnnej žiadosti o platbu, postupuje certifikačný orgán ďalej podľa bodu A.18.
A.17.Certifikačný orgán do 10 pracovných dní od prijatia súhrnnej žiadosti o platbu súhrnnú žiadosť o platbu schváli v plnej výške, schváli v zníženej výške o sumu žiadosti o platbu, v ktorej boli v rámci overovania certifikačným orgánom zistené nedostatky, schváli v zníženej výške o sumu žiadosti o platbu, ktorá je predmetom overovania, schvaľovanie pozastaví alebo neschváli. Žiadosť o platbu, v rámci ktorej boli zistené nedostatky, ktoré majú vplyv na výšku a / alebo oprávnenosť výdavkov certifikačný orgán vráti platobnej jednotke, ktorá následne postupuje podľa bodu 14c) a súhrnnú žiadosť o platbu certifikačný orgán schvaľuje v zníženej výške. 
A.18.Certifikačný orgán do 15 pracovných dní od prijatia súhrnnej žiadosti o platbu ukončí overovanie žiadosti o platbu zo súhrnnej žiadosti o platbu, ktorá bola schválená v zníženej výške v zmysle bodu A.17 (súhrnná žiadosť o platbu schválená v zníženej výške o sumu žiadosti o platbu, ktorá je predmetom overovania) a informuje platobnú jednotku o záveroch certifikačného overovania, v nadväznosti na ktoré platobná jednotka postupuje v zmysle bodu 14c) alebo 14d).
A.19.Certifikačný orgán v deň schválenia súhrnnej žiadosti o platbu a po jej spracovaní v ITMS informuje platobnú jednotku a v závislosti od zostatku na mimorozpočtovom účte prevádza prostriedky EÚ na príslušný príjmový účet platobnej jednotky.
B.	Postup overenia mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu certifikačným orgánom:
B.15.V prípade predloženej mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu certifikačný orgán vykoná overenie na svojej úrovni, ktoré zahrňuje len administratívne overenie. Taktiež overuje mimoriadnu súhrnnú žiadosť o platbu z hľadiska neprekročenia / dodržania celkovej alokácie podľa prioritných osí na základe čiastkového výkazu výdavkov predloženého platobnou jednotkou.
B.16.Certifikačný orgán mimoriadnu súhrnnú žiadosť o platbu schváli alebo neschváli do 7 pracovných dní od prijatia mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu.
B.17.Certifikačný orgán v deň schválenia mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu a po jej spracovaní v ITMS informuje platobnú jednotku a v závislosti od zostatku na mimorozpočtovom účte prevádza prostriedky EÚ na príslušný príjmový účet platobnej jednotky.
15.	Každé nasledujúce predfinancovanie sa poskytuje a zúčtováva obdobným spôsobom v zmysle bodov 1 až 14, A.15 až A.19, resp. B.15 až B17. Predfinancovanie sa poskytuje až do momentu dosiahnutia maximálne 95 % nenávratného finančného príspevku na projekt s výnimkou prípadov, keď bola ich suma znížená riadiacim orgánom.
Etapa refundácie:
16.	Po vyčerpaní maximálne 95 % nenávratného finančného príspevku je prijímateľ povinný zostávajúcich minimálne 5 % z nenávratného finančného príspevku, aj za podiel prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie, uhradiť najskôr z vlastných zdrojov. Až po uskutočnení tejto úhrady a ukončení realizácie aktivít projektu je prijímateľ oprávnený požiadať o platbu zostatku zo zdrojov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie.
17.	Prijímateľ predkladá žiadosť o platbu (s príznakom záverečná) riadiacemu orgánu elektronicky prostredníctvom ITMS a najneskôr do 31. decembra 2015 aj písomne. Prijímateľ predkladá spolu so žiadosťou o platbu aj účtovné doklady1 (preukazujúce úhradu výdavku deklarovaného v žiadosti o platbu) a relevantnú podpornú dokumentáciu, ktorej minimálny rozsah stanovuje Systém riadenia európskych štrukturálnych a investičných fondov na programové obdobie 2014 – 2020 a riadiaci orgán. 
18.	Riadiaci orgán vo vzťahu k žiadosti o platbu (s príznakom záverečná) postupuje obdobne ako v časti 6.5 v bode 4 až 8. 
19.	Platobná jednotka vo vzťahu k žiadosti o platbu (s príznakom záverečná) postupuje obdobne ako v časti 6.5 v bode 9.
20.	Certifikačný orgán postupuje obdobne ako v bode A.15 až A.19, resp. B.15 až B.17.
21.	Platobná jednotka je oprávnená ihneď, najneskôr do 3 pracovných dní po prijatí informácie o schválení súhrnnej žiadosti o platbu / mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu certifikačným orgánom, zadať platobné príkazy na úhradu zostatku prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie prijímateľovi.
Poskytnutie predfinancovania si nevyžaduje súhlas certifikačného orgánu. Certifikačný orgán prevádza prostriedky EÚ platobnej jednotke na základe skutočne čerpaných (zúčtovaných) prostriedkov z každého predfinancovania prijímateľom, zaradených platobnou jednotkou do súhrnnej žiadosti o platbu a schválených certifikačným orgánom.
Riadiaci orgán najneskôr do 31. decembra 2015 uchováva originál žiadosti o platbu, originál návrhu správy z kontroly (ak je relevantné), originál správy z kontroly, výpisy z účtov, jeden rovnopis účtovných dokladov alebo kópie18 účtovných dokladov označené podpisom štatutárneho orgánu prijímateľa a jeden rovnopis podpornej dokumentácie k žiadosti o platbu alebo kópie18 podpornej dokumentácie označené podpisom štatutárneho orgánu prijímateľa.
Platobná jednotka uchováva originál súhrnnej žiadosti o platbu / mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu a formuláre žiadosti o platbu, resp. príslušnú časť formulárov žiadosti o platbu.
6.2	Systém predfinancovania pre prijímateľov – štátne rozpočtové organizácie
Pri projektoch financovaných z Európskeho sociálneho fondu, Európskeho fondu regionálneho rozvoja, Európskeho námorného a rybárskeho fondu a Kohézneho fondu sa vyplácanie prijímateľa – štátne rozpočtové organizácie môže realizovať systémom predfinancovania, systémom zálohovej platby (časť 6.4) a systémom refundácie (časť 6.5) v súlade s určením riadiaceho orgánu v spolupráci s prijímateľom, pričom podmienky kombinovania uvedených systémov sú stanovené v zmluve o poskytnutí nenávratného finančného príspevku. Kombinovanie systému predfinancovania so systémom zálohovej platby je možné iba za podmienky, že sú jasne identifikované výdavky určené pre jednotlivé systémy financovania, bez rizika vzájomného prelínania, t. j. výdavok, ktorý je deklarovaný v rámci systému predfinancovania nie je možné aplikovať v rámci zúčtovania zálohovej platby / refundácie a naopak. 
Riadiaci orgán v spolupráci s prijímateľom v zmluve o poskytnutí nenávratného finančného príspevku zabezpečí identifikáciu jednotlivých typov výdavkov (rozpočtových položiek projektu) tak, že bude jednoznačne určené, ktoré konkrétne výdavky (napr. investičné) pôjdu výlučne systémom predfinancovania, a ktoré (napr. personálne) systémom zálohovej platby, resp. ktoré systémom refundácie.
Jednotlivé žiadosti o platbu môže prijímateľ predkladať len na jeden z uvedených systémov, tzn. že výdavky realizované z poskytnutého predfinancovania nemôže prijímateľ kombinovať s výdavkami uplatňovanými systémom refundácie, príp. systémom zálohovej platby v rámci jednej žiadosti o platbu. V takom prípade prijímateľ predkladá samostatne žiadosť o platbu (zúčtovanie predfinancovania), samostatne žiadosť o platbu (priebežná platba) a samostatne žiadosť o platbu (zúčtovanie zálohovej platby). V prípade zmeny právnej formy prijímateľa na typ, ktorý v zmysle časti 4.5.4 nie je oprávnený ďalej využívať systém predfinancovania, prijímateľovi nie sú poskytované žiadne platby až do zúčtovania poskytnutých predfinancovaní.
Predfinancovanie je prijímateľovi poskytované pomerne za prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie na základe ním predložených nezaplatených účtovných dokladov.
Riadiaci orgán prispôsobí po súčinnosti s platobnou jednotkou a prijímateľom lehoty predkladacieho a schvaľovacieho procesu v rámci systému predfinancovania tak, aby bola dodržaná maximálna možná lehota na splnenie peňažného záväzku dlžníka (t. j. uhradenie faktúry), vyplývajúca zo zákona č. 513/1991 Zb. Obchodný zákonník v znení neskorších predpisov.
Riadiaci orgán je zároveň oprávnený prijať prísnejšie postupy, ako sú stanovené v Systéme finančného riadenia štrukturálnych fondov a Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu na programové obdobie 2014 – 2020. 
V prípade, ak sa riadiaci orgán v súčinnosti s platobnou jednotkou rozhodne pre skrátenie lehôt schvaľovacieho procesu, ktoré by mali dopad na podmienky definované v zmluve o poskytnutí nenávratného finančného príspevku, na úpravu zmluvných podmienok vzťahujúcich sa k skráteniu týchto lehôt, nie je potrebný súhlas certifikačného orgánu.
Dôvody predĺženia schvaľovacieho procesu žiadosti o platbu uvedie riadiaci orgán v správe z kontroly žiadosti o platbu.
Pri využití systému predfinancovania sa vyplácanie prijímateľa – štátnej rozpočtovej organizácie uskutočňuje v dvoch etapách – etape poskytnutia predfinancovania a etape zúčtovania poskytnutého predfinancovania.
Etapa poskytnutia predfinancovania:
1.	Prijímateľ predkladá riadiacemu orgánu žiadosť o platbu (poskytnutie predfinancovania) elektronicky prostredníctvom ITMS a najneskôr do 31. decembra 2015 aj písomne. V rámci formulára žiadosti o platbu prijímateľ uvedie nárokované finančné prostriedky projektu podľa skupiny výdavkov v zmysle zmluvy o poskytnutí nenávratného finančného príspevku. Žiadosť o platbu predkladá prijímateľ v lehote splatnosti záväzku17 dodávateľovi / zhotoviteľovi. 
2.	Prijímateľ spolu so žiadosťou o platbu predkladá účtovné doklady1 (minimálne jeden rovnopis faktúry, prípadne rovnopis dokladu rovnocennej dôkaznej hodnoty) prijaté od dodávateľa / zhotoviteľa a relevantnú podpornú dokumentáciu, ktorej minimálny rozsah stanovuje Systém riadenia európskych štrukturálnych a investičných fondov na programové obdobie 2014 – 2020. Ďalší rovnopis účtovného dokladu si ponecháva prijímateľ. 
V prípade, ak súčasťou nárokovaných finančných prostriedkov prijímateľa sú aj hotovostné úhrady, zahrnie prijímateľ tieto výdavky do žiadosti o platbu a spolu so žiadosťou o platbu predloží aj rovnopisy, resp. kópie18 príslušných účtovných dokladov označené podpisom štatutárneho orgánu prijímateľa, ktoré potvrdzujú hotovostnú úhradu (napr. pokladničný blok).
3.	Riadiaci orgán vykonáva kontrolu žiadosti o platbu podľa čl. 125 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov a na základe podmienok a postupu výkonu kontroly projektu definovaných v Systéme riadenia európskych štrukturálnych a investičných fondov na programové obdobie 2014 – 2020. 
V prípade zistenia nedostatkov riadiaci orgán vyzve19 prijímateľa, aby v stanovenej lehote doplnil / zmenil žiadosť o platbu. Lehota na výkon kontroly žiadosti o platbu môže byť riadiacim orgánom pozastavená20. 
4.	Riadiaci orgán počas výkonu kontroly žiadosti o platbu vykonáva v prípade potreby aj samostatnú kontrolu vyčlenenej časti nárokovaných finančných prostriedkov z predloženej žiadosti o platbu. Samostatná kontrola vyčlenenej časti nárokovaných finančných prostriedkov z predloženej žiadosti o platbu sa nevykonáva v prípade žiadosti o platbu vrátenej z platobnej jednotky v zmysle bodu 14a) a 14b). Riadiaci orgán môže počas výkonu samostatnej kontroly vyčlenenej časti nárokovaných finančných prostriedkov vyčleniť z už vyčlenenej časti nárokovaných finančných prostriedkov ďalšiu časť nárokovaných finančných prostriedkov na samostatnú kontrolu. Podrobnosti výkonu samostatnej kontroly vyčlenenej časti nárokovaných finančných prostriedkov z predloženej žiadosti o platbu stanovuje Systém riadenia európskych štrukturálnych a investičných fondov na programové obdobie 2014 – 2020.
5.	Po vykonaní kontroly žiadosti o platbu riadiaci orgán žiadosť o platbu schváli (schváli nárokované finančné prostriedky prijímateľa v plnej výške), žiadosť o platbu schváli v zníženej sume (schváli nárokované finančné prostriedky vo výške zníženej o sumu neoprávnených nárokovaných finančných prostriedkov), žiadosť o platbu schváli v zníženej sume (schváli nárokované finančné prostriedky bez nárokovaných finančných prostriedkov, ktoré sú predmetom samostatnej kontroly, resp. schváli nárokované finančné prostriedky, ktoré sú predmetom samostatnej kontroly v zmysle postupu podľa bodu 6b), alebo žiadosť o platbu zamietne bezodkladne21, najneskôr však v lehote 25 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od prijímateľa riadiacim orgánom. 
Ukončením výkonu kontroly nárokovaných finančných prostriedkov z predloženej žiadosti o platbu (okrem prípadu podľa bodu 6a) sa ku kódu žiadosti o platbu (v rámci časti žiadosti o platbu vypĺňanej riadiacim orgánom) automaticky priraďuje dodatočný číselný identifikátor. V prípade schválenia nárokovaných finančných prostriedkov vo vyššie uvedených prípadoch, v stanovenej lehote 25 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od platobnej jednotky v ITMS, riadiaci orgán predkladá platobnej jednotke len príslušnú časť formulára žiadosti o platbu, v rámci ktorej je kód žiadosti o platbu rozšírený o príslušný číselný identifikátor.
6.	V prípade výkonu samostatnej kontroly riadiaci orgán schváli nárokované finančné prostriedky, ktoré boli predmetom samostatnej kontroly v plnej výške, schváli nárokované finančné prostriedky, ktoré boli predmetom samostatnej kontroly vo výške zníženej o sumu neoprávnených nárokovaných finančných prostriedkov, schváli nárokované finančné prostriedky, ktoré boli predmetom samostatnej kontroly vo výške zníženej o sumu nárokovaných finančných prostriedkov, ktoré sú predmetom ďalšej samostatnej kontroly, schvaľovanie pozastaví20 alebo zamietne bezodkladne21, najneskôr však v lehote 25 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od prijímateľa riadiacim orgánom, pričom v prípade, ak samostatná kontrola vyčlenenej časti nárokovaných finančných prostriedkov: 
a)	je ukončená pred alebo súčasne s ukončením kontroly nárokovaných finančných prostriedkov, ktoré neboli vyčlenené na samostatnú kontrolu, riadiaci orgán nárokované finančné prostriedky, ktoré neboli vyčlenené na samostatnú kontrolu a nárokované finančné prostriedky, ktoré boli vyčlenené na samostatnú kontrolu schváli v plnej výške, prípadne schváli v zníženej výške v lehote stanovenej na výkon kontroly (25 pracovných dní). V tomto prípade riadiaci orgán predkladá platobnej jednotke len príslušnú časť formulára žiadosti o platbu, v ktorom identifikuje všetky oprávnené nárokované finančné prostriedky. Ku kódu žiadosti o platbu (v rámci časti žiadosti o platbu vypĺňanej riadiacim orgánom) je v tomto prípade automaticky priraďovaný len jeden číselný identifikátor;
b)	je ukončená po ukončení kontroly nárokovaných finančných prostriedkov, ktoré neboli vyčlenené na samostatnú kontrolu, riadiaci orgán, v lehote stanovenej na výkon kontroly (25 pracovných dní), predkladá platobnej jednotke príslušnú časť formulára žiadosti o platbu, v ktorom identifikuje oprávnené nárokované finančné prostriedky, ktoré boli vyčlenené na samostatnú kontrolu.
V každom z uvedených prípadov predkladá riadiaci orgán platobnej jednotke príslušnú časť formulára žiadosti o platbu, v ktorej sa uvádza výška schválených nárokovaných finančných prostriedkov na preplatenie platobnou jednotkou.
7.	Platobná jednotka vykoná kontrolu žiadosti o platbu (poskytnutie predfinancovania) v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov do 5 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu v ITMS. Platobná jednotka overí súlad sumy nárokovaných finančných prostriedkov so schváleným rozpočtom platobnej jednotky. Následne v stanovenej lehote schváli alebo neschváli žiadosť o platbu. V prípade jej schválenia platobná jednotka najneskôr do 3 pracovných dní od schválenia žiadosti o platbu zabezpečí žiadosť o prevod prostriedkov rozpočtovým opatrením prostredníctvom úpravy limitov výdavkov pomerne za zdroje EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie: viazaním výdavkov v rozpočte platobnej jednotky a navýšením limitov výdavkov prijímateľa. V prípade neschválenia žiadosti o platbu, vracia predmetnú žiadosť o platbu riadiacemu orgánu v stanovenej lehote 5 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu v ITMS.
8.	V prípade vrátenia žiadosti o platbu z platobnej jednotky v zmysle bodu 7 riadiaci orgán vykoná kontrolu žiadosti o platbu podľa čl. 125 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov a na základe podmienok a postupov pre výkon kontroly žiadosti o platbu definovaných v Systéme riadenia európskych štrukturálnych a investičných fondov na programové obdobie 2014 – 2020. 
Riadiaci orgán počas výkonu kontroly žiadosti o platbu môže schvaľovanie žiadosti o platbu pozastaviť20.
Po vykonaní kontroly žiadosti o platbu riadiaci orgán žiadosť o platbu schváli (schváli nárokované finančné prostriedky v plnej výške), žiadosť o platbu schváli v zníženej sume (schváli nárokované finančné prostriedky vo výške zníženej o sumu neoprávnených výdavkov), alebo žiadosť o platbu zamietne bezodkladne21, najneskôr však v lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od platobnej jednotky v ITMS. Po schválení žiadosti o platbu vo vyššie uvedených prípadoch, v stanovenej lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu v ITMS, riadiaci orgán predloží príslušnú časť formulára žiadosti o platbu platobnej jednotke, ktorá postupuje podľa bodu 7.
9.	Prijímateľ je následne povinný bezodkladne21 previesť prostriedky EÚ, štátneho rozpočtu na spolufinancovanie a vlastných zdrojov dodávateľovi / zhotoviteľovi na úhradu nezaplatených účtovných dokladov. Úrok z omeškania platby voči dodávateľovi / zhotoviteľovi znáša samotný prijímateľ.
Etapa zúčtovania poskytnutého predfinancovania:
10.	Po poskytnutí predfinancovania je prijímateľ povinný celú výšku poskytnutého predfinancovania zúčtovať22 najneskôr do 10 pracovných dní odo dňa pripísania týchto prostriedkov na jeho účet. Ku každej schválenej žiadosti o platbu (poskytnutie predfinancovania) prijímateľ predkladá riadiacemu orgánu samostatnú žiadosť o platbu (zúčtovanie predfinancovania).
Prijímateľ v rámci zúčtovania predfinancovania predkladá spolu so žiadosťou o platbu výpis z bankového účtu1 (originál alebo kópiu18 označenú podpisom štatutárneho orgánu prijímateľa) potvrdzujúci príjem prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie, ako aj doklady preukazujúce skutočnú úhradu výdavkov deklarovaných v žiadosti o platbu (výpis z bankového účtu1, resp. prehlásenie banky o úhrade výdavkov originál alebo kópiu18 označenú podpisom štatutárneho orgánu prijímateľa). 
Prijímateľ v rámci zúčtovania predfinancovania uvedie v žiadosti o platbu aj výdavky viažuce sa na hotovostné úhrady uvedené v bode 2, ktoré boli zahrnuté v žiadosti o platbu (poskytnutie predfinancovania), pričom prijímateľ nie je povinný opätovne predkladať tie isté overené kópie príslušných účtovných dokladov potvrdzujúce hotovostnú úhradu. 
Nezúčtovaný rozdiel predfinancovania je prijímateľ povinný na základe vzájomnej komunikácie s riadiacim orgánom vrátiť platobnej jednotke bezodkladne21, najneskôr do 5 pracovných dní od ukončenia lehoty na zúčtovanie22. Prijímateľ predloží riadiacemu orgánu oznámenie o vysporiadaní finančných vzťahov v zmysle časti 4.5.9. 
11.	Riadiaci orgán vo vzťahu k žiadosti o platbu (zúčtovanie predfinancovania) postupuje podobne ako v bode 3 a 5, pričom skontroluje žiadosť o platbu a výpis z bankového účtu1.
12.	Po vykonaní kontroly žiadosti o platbu riadiaci orgán žiadosť o platbu schváli (schváli deklarované výdavky prijímateľa v plnej výške), žiadosť o platbu schváli v zníženej sume (schváli deklarované výdavky vo výške zníženej o sumu neoprávnených výdavkov), alebo žiadosť o platbu zamietne bezodkladne21, najneskôr však v lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od prijímateľa riadiacim orgánom a po schválení žiadosti o platbu vo vyššie uvedených prípadoch, v stanovenej lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od prijímateľa riadiacim orgánom, riadiaci orgán predloží príslušnú časť formulára žiadosti o platbu platobnej jednotke, ktorá postupuje v zmysle bodu 14a). 
13.	Riadiaci orgán v prípade vrátenia žiadosti o platbu z platobnej jednotky v zmysle:
a)	bodu 14a) vykoná kontrolu žiadosti o platbu podľa čl. 125 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov a na základe podmienok a postupov pre výkon kontroly žiadosti o platbu definovaných v Systéme riadenia európskych štrukturálnych a investičných fondov na programové obdobie 2014 – 2020. 
Riadiaci orgán počas výkonu kontroly žiadosti o platbu môže schvaľovanie žiadosti o platbu pozastaviť20. 
Po vykonaní kontroly žiadosti o platbu riadiaci orgán žiadosť o platbu schváli (schváli deklarované výdavky v plnej výške), žiadosť o platbu schváli v zníženej sume (schváli deklarované výdavky vo výške zníženej o sumu neoprávnených výdavkov), alebo žiadosť o platbu zamietne bezodkladne21, najneskôr však v lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od platobnej jednotky v ITMS a po schválení žiadosti o platbu vo vyššie uvedených prípadoch, v stanovenej lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od platobnej jednotky v ITMS, riadiaci orgán predloží príslušnú časť formulára žiadosti o platbu platobnej jednotke, ktorá postupuje v zmysle bodu 14a).
b)	bodu 14 b) a 14c) ii v prípade zistených nedostatkov, ktoré majú vplyv na výšku a / alebo oprávnenosť výdavkov vykoná kontrolu žiadosti o platbu podľa čl. 125 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov a na základe podmienok a postupov pre výkon kontroly žiadosti o platbu definovaných v Systéme riadenia európskych štrukturálnych a investičných fondov na programové obdobie 2014 – 2020. V rámci nedostatkov bez vplyvu na výšku a / alebo oprávnenosť výdavkov sa uplatňuje bod 30 časti 3.2.
Riadiaci orgán počas výkonu kontroly žiadosti o platbu môže schvaľovanie žiadosti o platbu pozastaviť20. 
Po vykonaní kontroly žiadosti o platbu riadiaci orgán žiadosť o platbu schváli (schváli deklarované výdavky v plnej výške), žiadosť o platbu schváli v zníženej sume (schváli deklarované výdavky vo výške zníženej o sumu neoprávnených výdavkov), alebo žiadosť o platbu zamietne bezodkladne21, najneskôr však v lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od platobnej jednotky v ITMS a po schválení žiadosti o platbu vo vyššie uvedených prípadoch, v stanovenej lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od platobnej jednotky v ITMS, riadiaci orgán predloží príslušnú časť formulára žiadosti o platbu platobnej jednotke, ktorá postupuje v zmysle bodu 14b).
14.	Platobná jednotka zostavuje súhrnnú žiadosť o platbu / mimoriadnu súhrnnú žiadosť o platbu zo žiadostí o platbu, pričom pri:
a)	žiadosti o platbu (zúčtovanie predfinancovania) predloženej riadiacim orgánom v zmysle bodu 12 a 13a) vykoná kontrolu žiadosti o platbu v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov do 5 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu v ITMS. Platobná jednotka overí súlad deklarovanej sumy so schváleným rozpočtom platobnej jednotky. Následne v stanovenej lehote schváli alebo neschváli žiadosť o platbu. V prípade jej schválenia platobná jednotka zahrnie sumu do nasledovnej súhrnnej žiadosti o platbu a v intervale dvakrát do mesiaca podľa stanovených termínov predkladá spolu s čiastkovým výkazom výdavkov certifikačnému orgánu prostredníctvom ITMS. V prípade neschválenia žiadosti o platbu, vracia predmetnú žiadosť o platbu v stanovenej lehote 5 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od platobnej jednotky v ITMS riadiacemu orgánu, ktorý postupuje podľa bodu 13a);
b)	žiadosti o platbu (zúčtovanie predfinancovania) predloženej riadiacim orgánom v zmysle bodu 13b) vykoná kontrolu žiadosti o platbu v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov do 3 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu v ITMS a v tejto lehote žiadosť o platbu schváli alebo neschváli. Po schválení žiadosti o platbu platobná jednotka najneskôr nasledujúci pracovný deň, resp. podľa postupov a termínov stanovených certifikačným orgánom, zahrnie predmetnú žiadosť o platbu do mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu, ktorú predkladá certifikačnému orgánu najneskôr nasledujúci pracovný deň po jej zostavení. Certifikačný orgán následne postupuje podľa bodov B.15 až B.17. V prípade neschválenia žiadosti o platbu, vracia predmetnú žiadosť o platbu v stanovenej lehote 3 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu v ITMS riadiacemu orgánu, ktorý postupuje podľa bodu 13b);
c)	žiadosti o platbu (zúčtovanie predfinancovania) vrátenej z certifikačného orgánu v zmysle bodu A.17 a A.18 za účelom odstránenia identifikovaných nedostatkov: 
i.	v prípade, ak sa dôvody vrátenia žiadosti o platbu z certifikačného orgánu týkajú úrovne platobnej jednotky, platobná jednotka odstráni zistené nedostatky na svojej úrovni a najneskôr nasledujúci pracovný deň, resp. podľa postupov a termínov stanovených certifikačným orgánom, zahrnie predmetnú žiadosť o platbu do mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu, ktorú predkladá certifikačnému orgánu najneskôr nasledujúci pracovný deň po jej zostavení. Certifikačný orgán následne postupuje podľa bodov B.15 až B.17;
ii.	v prípade, ak sa dôvody vrátenia žiadosti o platbu z certifikačného orgánu týkajú úrovne riadiaceho orgánu, platobná jednotka najneskôr nasledujúci pracovný deň po prijatí žiadosti o platbu z certifikačného orgánu vracia predmetnú žiadosť o platbu riadiacemu orgánu, ktorý postupuje podľa bodu 13b);
d)	žiadosti o platbu (zúčtovanie predfinancovania) (v rámci ktorej boli výdavky schválené certifikačným orgánom v plnej výške) vrátenej z certifikačného orgánu v zmysle bodu A.18 za účelom zaradenia do mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu po prijatí informácie o záveroch certifikačného overovania platobná jednotka zahrnie predmetnú žiadosť o platbu najneskôr nasledujúci pracovný deň, resp. podľa postupov a termínov stanovených certifikačným orgánom do mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu, ktorú predkladá certifikačnému orgánu najneskôr nasledujúci pracovný deň po jej zostavení. Certifikačný orgán následne postupuje podľa bodov B.15 až B.17.
A.	Postup overenia súhrnnej žiadosti o platbu certifikačným orgánom:
A.15.V prípade predloženej súhrnnej žiadosti o platbu certifikačný orgán vykoná overenie na svojej úrovni, ktoré zahrňuje administratívne overenie, prípadne certifikačné overovanie. Taktiež overuje súhrnnú žiadosť o platbu z hľadiska neprekročenia / dodržania celkovej alokácie podľa prioritných osí na základe čiastkového výkazu výdavkov predloženého platobnou jednotkou. V prípade potreby si od riadiaceho orgánu alebo platobnej jednotky vyžiadava ďalšie informácie nevyhnutné pre posúdenie predloženej súhrnnej žiadosti o platbu.
A.16.Ak certifikačný orgán na svojej úrovni vykoná overenie žiadosti o platbu zaradenej do súhrnnej žiadosti o platbu a overenie žiadosti o platbu:
a)	je ukončené v lehote na overenie súhrnnej žiadosti o platbu, postupuje certifikačný orgán ďalej podľa bodu A.17,
b)	nie je ukončené v lehote na overenie súhrnnej žiadosti o platbu, postupuje certifikačný orgán ďalej podľa bodu A.18.
A.17.Certifikačný orgán do 10 pracovných dní od prijatia súhrnnej žiadosti o platbu súhrnnú žiadosť o platbu schváli v plnej výške, schváli v zníženej výške o sumu žiadosti o platbu, v ktorej boli v rámci overovania certifikačným orgánom zistené nedostatky, schváli v zníženej výške o sumu žiadosti o platbu, ktorá je predmetom overovania, schvaľovanie pozastaví23 alebo neschváli. Žiadosť o platbu, v rámci ktorej boli zistené nedostatky, ktoré majú vplyv na výšku a / alebo oprávnenosť výdavkov certifikačný orgán vráti platobnej jednotke, ktorá následne postupuje podľa bodu 14c) a súhrnnú žiadosť o platbu certifikačný orgán schvaľuje v zníženej výške. 
A.18.Certifikačný orgán do 15 pracovných dní od prijatia súhrnnej žiadosti o platbu ukončí overovanie žiadosti o platbu zo súhrnnej žiadosti o platbu, ktorá bola schválená v zníženej výške v zmysle bodu A.17 (súhrnná žiadosť o platbu schválená v zníženej výške o sumu žiadosti o platbu, ktorá je predmetom overovania) a informuje platobnú jednotku o záveroch certifikačného overovania, v nadväznosti na ktoré platobná jednotka postupuje v zmysle bodu 14c) alebo 14d).
A.19.Certifikačný orgán v deň schválenia súhrnnej žiadosti o platbu a po jej spracovaní v ITMS informuje platobnú jednotku a v závislosti od zostatku na mimorozpočtovom účte prevádza prostriedky EÚ na príslušný príjmový účet platobnej jednotky.
B.	Postup overenia mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu certifikačným orgánom:
B.15.V prípade predloženej mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu certifikačný orgán vykoná overenie na svojej úrovni, ktoré zahrňuje len administratívne overenie. Taktiež overuje mimoriadnu súhrnnú žiadosť o platbu z hľadiska neprekročenia / dodržania celkovej alokácie podľa prioritných osí na základe čiastkového výkazu výdavkov predloženého platobnou jednotkou.
B.16.Certifikačný orgán mimoriadnu súhrnnú žiadosť o platbu schváli alebo neschváli do 7 pracovných dní od prijatia mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu.
B.17.Certifikačný orgán v deň schválenia mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu a po jej spracovaní v ITMS informuje platobnú jednotku a v závislosti od zostatku na mimorozpočtovom účte prevádza prostriedky EÚ na príslušný príjmový účet platobnej jednotky.
Každé nasledujúce predfinancovanie sa poskytuje a zúčtováva obdobným spôsobom v zmysle bodov 1 až 14, A.15 až A.19, resp. B.15 až B.17. 
Pre prijímateľa – štátna rozpočtová organizácia pri realizovaní systému predfinancovania platí, že každá žiadosť o predfinancovanie sa realizuje obdobným spôsobom v zmysle bodov 1. až 2. Systém predfinancovania sa týmto spôsobom realizuje až do dosiahnutia 100 % aktuálnej výšky oprávnených výdavkov projektu. Posledná žiadosť o platbu (zúčtovanie predfinancovania) plní funkciu záverečnej žiadosti o platbu (s príznakom záverečná). 
Presun prostriedkov prijímateľom – štátnym rozpočtovým organizáciám sa realizuje prostredníctvom platobnej jednotky, ktorá zabezpečí žiadosť prevod prostriedkov rozpočtovým opatrením prostredníctvom úpravy limitov výdavkov rozpočtu prijímateľa rozpočtovým opatrením na základe žiadosti o platbu (poskytnutie predfinancovania). 
Poskytnutie predfinancovania si nevyžaduje súhlas certifikačného orgánu. Certifikačný orgán prevádza prostriedky EÚ platobnej jednotke na základe skutočne čerpaných (zúčtovaných) prostriedkov z každého predfinancovania prijímateľom, zaradených platobnou jednotkou do súhrnnej žiadosti o platbu a schválených certifikačným orgánom.
Riadiaci orgán najneskôr do 31. decembra 2015 uchováva originál žiadosti o platbu, originál návrhu správy z kontroly (ak je relevantné), originál správy z kontroly, výpisy z účtov, jeden rovnopis účtovných dokladov alebo kópie18 účtovných dokladov označené podpisom štatutárneho orgánu prijímateľa a jeden rovnopis podpornej dokumentácie k žiadosti o platbu alebo kópie18 podpornej dokumentácie označené podpisom štatutárneho orgánu prijímateľa.
Platobná jednotka uchováva originál súhrnnej žiadosti o platbu / mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu a formuláre žiadosti o platbu, resp. príslušnú časť formulárov žiadosti o platbu.
6.3	Systém zálohových platieb
Pri projektoch financovaných z Európskeho sociálneho fondu okrem štátnej rozpočtovej organizácie, ktorá postupuje v zmysle časti 6.4, sa vyplácanie prijímateľa môže realizovať systémom zálohových platieb alebo systémom refundácie (časť 6.5) v súlade s určením riadiaceho orgánu v spolupráci s prijímateľom.
Prijímateľ môže kombinovať uvedené systémy v závislosti od určenia riadiaceho orgánu stanoveného v zmluve o poskytnutí nenávratného finančného príspevku. 
Riadiaci orgán môže stanoviť prísnejšie pravidlá pre poskytnutie zálohovej platby a zúčtovanie zálohovej platby ako tie, ktoré sú definované v Systéme finančného riadenia štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu na programové obdobie 2014 – 2020.
Riadiaci orgán posúdi opodstatnenosť a reálnosť požiadavky prijímateľa na poskytnutie zálohovej platby.
Jednotlivé žiadosti o platbu môže prijímateľ predkladať len na jeden z uvedených systémov, tzn. že výdavky realizované z poskytnutých zálohových platieb nemôže prijímateľ kombinovať spolu s výdavkami uplatňovanými systémom refundácie v jednej žiadosti o platbu. V takom prípade prijímateľ predkladá samostatne žiadosť o platbu (zúčtovanie zálohovej platby) a samostatne žiadosť o platbu (priebežná platba). V prípade zmeny právnej formy prijímateľa na typ, ktorý v zmysle časti 4.5.4 nie je oprávnený ďalej využívať systém zálohových platieb, prijímateľovi nie sú poskytované žiadne platby až do zúčtovania poskytnutých zálohových platieb.
Zálohové platby sú prijímateľovi poskytované maximálne do výšky 40 % z relevantnej časti rozpočtu projektu zodpovedajúcim 12 mesiacom realizácie aktivít projektu na základe postupov riadiaceho orgánu zapracovaných v relevantných dokumentoch (manuál procedúr a iné). V prípade kombinácie systému refundácie a systému zálohových platieb sa výška prvej zálohovej platby vypočíta na rovnakom základe, ako by sa vypočítala zálohová platba pri začatí realizácie projektu, t. j. maximálne do výšky 40 % z relevantnej časti rozpočtu projektu zodpovedajúcim 12 mesiacom realizácie aktivít projektu. Zálohové platby sú prijímateľovi poskytované pomerne za zdroje EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie po nadobudnutí účinnosti zmluvy o poskytnutí nenávratného finančného príspevku a začatí realizácie projektu, resp. na základe zúčtovania poskytnutej zálohovej platby.
Pri využití systému zálohových platieb sa vyplácanie prijímateľa uskutočňuje v troch etapách – etape poskytnutia zálohovej platby, etape zúčtovania poskytnutej zálohovej platby a etape refundácie.
Etapa poskytnutia zálohovej platby:
1.	Prijímateľ po začatí realizácie projektu predkladá žiadosť o platbu (poskytnutie zálohovej platby) riadiacemu orgánu v zmysle podmienok zmluvy o poskytnutí nenávratného finančného príspevku, a to maximálne do výšky 40 % z relevantnej časti rozpočtu projektu zodpovedajúcim 12 mesiacom realizácie aktivít projektu z prostriedkov zodpovedajúcich podielu EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie. 
Výška maximálnej zálohovej platby sa vypočíta nasledovne:
•	v prípade, ak plánovaná dĺžka realizácie projektu nepresahuje 12 mesiacov, výška zálohovej platby predstavuje maximálne 40 % oprávnených výdavkov rozpočtu projektu zodpovedajúcich podielu EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie;
•	v prípade, ak plánovaná dĺžka realizácie projektu presahuje 12 mesiacov, výška zálohovej platby sa vypočíta podľa nasledovného vzorca:
maximálna výška poskytnutej zálohovej platby	=	0,4	x	celková suma nenávratného finančného príspevku	x	12	
				celkový počet mesiacov realizácie			
2.	Prijímateľ predkladá žiadosť o platbu (poskytnutie zálohovej platby) riadiacemu orgánu elektronicky prostredníctvom ITMS a najneskôr do 31. decembra 2015 aj písomne.
3.	Riadiaci orgán vykonáva kontrolu žiadosti o platbu podľa čl. 125 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov a na základe podmienok a postupu výkonu kontroly projektu definovaných v Systéme riadenia európskych štrukturálnych a investičných fondov na programové obdobie 2014 – 2020. 
V prípade zistenia nedostatkov riadiaci orgán vyzve19 prijímateľa, aby v stanovenej lehote doplnil / zmenil žiadosť o platbu. Lehota na výkon kontroly žiadosti o platbu môže byť riadiacim orgánom pozastavená20. 
4.	Po vykonaní kontroly žiadosti o platbu riadiaci orgán žiadosť o platbu schváli v plnej výške, žiadosť o platbu schváli v zníženej sume, schvaľovanie žiadosti o platbu pozastaví20 alebo zamietne bezodkladne21, najneskôr však v lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od prijímateľa riadiacim orgánom a po schválení žiadosti o platbu vo vyššie uvedených prípadoch, v stanovenej lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od prijímateľa riadiacim orgánom, riadiaci orgán predloží príslušnú časť formulára žiadosti o platbu platobnej jednotke.
5.	Platobná jednotka po schválení žiadosti o platbu riadiacim orgánom vykoná kontrolu žiadosti o platbu (poskytnutie zálohovej platby) v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov do 5 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu v ITMS. Platobná jednotka overí súlad sumy nárokovaných finančných prostriedkov so schváleným rozpočtom platobnej jednotky. Následne platobná jednotka v stanovenej lehote žiadosť o platbu schváli alebo neschváli. V prípade jej schválenia platobná jednotka najneskôr do 3 pracovných dní od schválenia žiadosti o platbu zadá platobné príkazy na úhradu prijímateľovi z rozpočtovaných výdavkov (z výdavkového účtu) pomerne za zdroje EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie. V prípade neschválenia žiadosti o platbu, vracia predmetnú žiadosť o platbu riadiacemu orgánu v stanovenej lehote 5 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu v ITMS.
6.	V prípade vrátenia žiadosti o platbu z platobnej jednotky v zmysle bodu 5 riadiaci orgán vykoná kontrolu žiadosti o platbu podľa čl. 125 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov a na základe podmienok a postupov pre výkon kontroly žiadosti o platbu definovaných v Systéme riadenia európskych štrukturálnych a investičných fondov na programové obdobie 2014 – 2020. 
Riadiaci orgán počas výkonu kontroly žiadosti o platbu môže schvaľovanie žiadosti o platbu pozastaviť20.
Po vykonaní kontroly žiadosti o platbu riadiaci orgán žiadosť o platbu schváli (schváli nárokované finančné prostriedky v plnej výške), žiadosť o platbu schváli v zníženej sume (schváli nárokované finančné prostriedky vo výške zníženej o sumu neoprávnených výdavkov), alebo žiadosť o platbu zamietne bezodkladne21, najneskôr však v lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od platobnej jednotky v ITMS. Po schválení žiadosti o platbu vo vyššie uvedených prípadoch, v stanovenej lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od platobnej jednotky v ITMS, riadiaci orgán predloží príslušnú časť formulára žiadosti o platbu platobnej jednotke, ktorá postupuje podľa bodu 5.
Etapa zúčtovania poskytnutej zálohovej platby:
7.	Prijímateľ je povinný poskytnutú zálohovú platbu priebežne zúčtovávať, pričom najneskôr do 9 mesiacov odo dňa pripísania finančných prostriedkov na účte prijímateľa je povinný zúčtovať 100 % z poskytnutej zálohovej platby (sumy každej poskytnutej zálohovej platby). V prípade nedodržania tejto podmienky je prijímateľ povinný bezodkladne, najneskôr do 5 pracovných dní od ukončenia uvedeného obdobia 9 mesiacov, vrátiť platobnej jednotke sumu nezúčtovaného rozdielu. Žiadosť o platbu (zúčtovanie zálohovej platby) je potrebné priraďovať k najstaršej poskytnutej nezúčtovanej zálohovej platbe.
Prijímateľ v rámci zúčtovania zálohovej platby predkladá žiadosť o platbu (zúčtovanie zálohovej platby) riadiacemu orgánu elektronicky prostredníctvom ITMS a najneskôr do 31. decembra 2015 aj písomne. Prijímateľ predkladá spolu so žiadosťou o platbu (zúčtovanie zálohovej platby) aj účtovné doklady1 (preukazujúce úhradu výdavku deklarovaného v žiadosti o platbu) a relevantnú podpornú dokumentáciu, ktorej minimálny rozsah stanovuje Systém riadenia európskych štrukturálnych a investičných fondov na programové obdobie 2014 – 2020 a riadiaci orgán.
8.	Riadiaci orgán vo vzťahu k žiadosti o platbu (zúčtovanie zálohovej platby) postupuje obdobne ako v bode 3.
9.	Riadiaci orgán počas výkonu kontroly žiadosti o platbu vykonáva v prípade potreby aj samostatnú kontrolu vyčlenenej časti deklarovaných výdavkov z predloženej žiadosti o platbu. Samostatná kontrola vyčlenenej časti deklarovaných finančných prostriedkov z predloženej žiadosti o platbu sa nevykonáva v prípade žiadosti o platbu vrátenej z platobnej jednotky v zmysle bodu 13a) a 13b). Riadiaci orgán môže počas výkonu samostatnej kontroly vyčlenenej časti deklarovaných výdavkov vyčleniť z už vyčlenenej časti deklarovaných výdavkov ďalšiu časť deklarovaných výdavkov na samostatnú kontrolu. Podrobnosti výkonu samostatnej kontroly vyčlenenej časti deklarovaných výdavkov z predloženej žiadosti o platbu stanovuje Systém riadenia európskych štrukturálnych a investičných fondov na programové obdobie 2014 – 2020. 
10.	Po vykonaní kontroly žiadosti o platbu riadiaci orgán žiadosť o platbu schváli (schváli deklarované výdavky v plnej výške), žiadosť o platbu schváli v zníženej sume (schváli deklarované výdavky vo výške zníženej o sumu neoprávnených výdavkov), žiadosť o platbu schváli v zníženej sume (schváli deklarované výdavky bez deklarovaných výdavkov, ktoré sú predmetom samostatnej kontroly, resp. schváli deklarované výdavky, ktoré sú predmetom samostatnej kontroly v zmysle postupu podľa bodu 11b), alebo žiadosť o platbu zamietne bezodkladne21, najneskôr však v lehote 25 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od prijímateľa riadiacim orgánom. 
Ukončením výkonu kontroly deklarovaných výdavkov z predloženej žiadosti o platbu (okrem prípadu podľa bodu 11a) sa ku kódu žiadosti o platbu (v rámci časti žiadosti o platbu vypĺňanej riadiacim orgánom) automaticky priraďuje dodatočný číselný identifikátor. V prípade schválenia deklarovaných výdavkov vo vyššie uvedených prípadoch, v stanovenej lehote 25 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od platobnej jednotky v ITMS, riadiaci orgán predkladá platobnej jednotke len príslušnú časť formulára žiadosti o platbu, v rámci ktorej je kód žiadosti o platbu rozšírený o príslušný číselný identifikátor.
11.	V prípade výkonu samostatnej kontroly riadiaci orgán schváli deklarované výdavky, ktoré boli predmetom samostatnej kontroly v plnej výške, schváli deklarované výdavky, ktoré boli predmetom samostatnej kontroly vo výške zníženej o sumu neoprávnených výdavkov, schváli deklarované výdavky, ktoré boli predmetom samostatnej kontroly vo výške zníženej o sumu deklarovaných výdavkov, ktoré sú predmetom ďalšej samostatnej kontroly, schvaľovanie pozastaví20 alebo zamietne bezodkladne21, najneskôr však v lehote 25 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od prijímateľa riadiacim orgánom, pričom v prípade, ak samostatná kontrola vyčlenenej časti deklarovaných výdavkov:
a)	je ukončená pred alebo súčasne s ukončením kontroly deklarovaných výdavkov, ktoré neboli vyčlenené na samostatnú kontrolu, riadiaci orgán deklarované výdavky, ktoré neboli vyčlenené na samostatnú kontrolu a deklarované výdavky, ktoré boli vyčlenené na samostatnú kontrolu schváli v plnej výške, prípadne schváli v zníženej výške v lehote stanovenej na výkon kontroly (25 pracovných dní). V tomto prípade riadiaci orgán predkladá platobnej jednotke len príslušnú časť formulára žiadosti o platbu, v ktorom identifikuje všetky oprávnené deklarované výdavky. Ku kódu žiadosti o platbu (v rámci časti žiadosti o platbu vypĺňanej riadiacim orgánom) je v tomto prípade automaticky priraďovaný len jeden číselný identifikátor;
b)	je ukončená po ukončení kontroly deklarovaných výdavkov, ktoré neboli vyčlenené na samostatnú kontrolu, riadiaci orgán, v lehote stanovenej na výkon kontroly (25 pracovných dní), predkladá platobnej jednotke príslušnú časť formulára žiadosti o platbu, v ktorom identifikuje oprávnené deklarované výdavky, ktoré boli vyčlenené na samostatnú kontrolu;
V každom z uvedených prípadov predkladá riadiaci orgán platobnej jednotke príslušnú časť formulára žiadosti o platbu, v ktorej sa uvádza výška schválených výdavkov na preplatenie platobnou jednotkou.
12.	Riadiaci orgán v prípade vrátenia žiadosti o platbu z platobnej jednotky v zmysle:
a)	bodu 13a) vykoná kontrolu žiadosti o platbu podľa čl. 125 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov a na základe podmienok a postupov pre výkon kontroly žiadosti o platbu definovaných v Systéme riadenia európskych štrukturálnych a investičných fondov na programové obdobie 2014 – 2020. 
Riadiaci orgán počas výkonu kontroly žiadosti o platbu môže schvaľovanie žiadosti o platbu pozastaviť20. 
Po vykonaní kontroly žiadosti o platbu riadiaci orgán žiadosť o platbu schváli (schváli deklarované výdavky v plnej výške), žiadosť o platbu schváli v zníženej sume (schváli deklarované výdavky vo výške zníženej o sumu neoprávnených výdavkov), alebo žiadosť o platbu zamietne bezodkladne21, najneskôr však v lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od platobnej jednotky v ITMS a po schválení žiadosti o platbu vo vyššie uvedených prípadoch, v stanovenej lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od platobnej jednotky v ITMS, riadiaci orgán predloží príslušnú časť formulára žiadosti o platbu platobnej jednotke, ktorá postupuje v zmysle bodu 13a). 
b)	bodu 13b) a 13c) ii riadiaci orgán v prípade zistených nedostatkov, ktoré majú vplyv na výšku a / alebo oprávnenosť výdavkov vykoná kontrolu žiadosti o platbu podľa čl. 125 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov a na základe podmienok a postupov pre výkon kontroly žiadosti o platbu definovaných v Systéme riadenia európskych štrukturálnych a investičných fondov na programové obdobie 2014 – 2020. V rámci ostatných nedostatkov bez vplyvu na výšku a / alebo oprávnenosť výdavkov sa uplatňuje bod 30 časti 3.2.
Riadiaci orgán počas výkonu kontroly žiadosti o platbu môže schvaľovanie žiadosti o platbu pozastaviť20. 
Po vykonaní kontroly žiadosti o platbu riadiaci orgán žiadosť o platbu schváli (schváli deklarované výdavky v plnej výške), žiadosť o platbu schváli v zníženej sume (schváli deklarované výdavky vo výške zníženej o sumu neoprávnených výdavkov), alebo žiadosť o platbu zamietne bezodkladne21, najneskôr však v lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od platobnej jednotky v ITMS a po schválení žiadosti o platbu vo vyššie uvedených prípadoch, v stanovenej lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od platobnej jednotky v ITMS, riadiaci orgán predloží príslušnú časť formulára žiadosti o platbu platobnej jednotke, ktorá postupuje v zmysle bodu 13b).
13.	Platobná jednotka zostavuje súhrnnú žiadosť o platbu / mimoriadnu súhrnnú žiadosť o platbu zostavenú zo žiadostí o platbu, pričom pri:
a)	žiadosti o platbu (zúčtovanie zálohovej platby) predloženej riadiacim orgánom v zmysle bodu 10 a 12a) vykoná kontrolu žiadosti o platbu v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov do 5 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu v ITMS. Platobná jednotka overí súlad deklarovanej sumy so schváleným rozpočtom platobnej jednotky. Následne v stanovenej lehote schváli alebo neschváli žiadosť o platbu. V prípade jej schválenia platobná jednotka zahrnie sumu do nasledovnej súhrnnej žiadosti o platbu a v intervale dvakrát do mesiaca podľa stanovených termínov predkladá spolu s čiastkovým výkazom výdavkov certifikačnému orgánu prostredníctvom ITMS. V prípade neschválenia žiadosti o platbu, vracia predmetnú žiadosť o platbu v stanovenej lehote 5 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu v ITMS riadiacemu orgánu, ktorý postupuje podľa bodu 12a);
b)	žiadosti o platbu (zúčtovanie zálohovej platby) predloženej riadiacim orgánom v zmysle bodu 12b) kontrolu žiadosti o platbu v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov do 3 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu v ITMS a v tejto lehote žiadosť o platbu schváli alebo neschváli. Po schválení žiadosti o platbu platobná jednotka najneskôr nasledujúci pracovný deň, resp. podľa postupov a termínov stanovených certifikačným orgánom, zahrnie predmetnú žiadosť o platbu do mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu, ktorú predkladá certifikačnému orgánu najneskôr nasledujúci pracovný deň po jej zostavení. Certifikačný orgán následne postupuje podľa bodov B.14 až B.16. V prípade neschválenia žiadosti o platbu, vracia predmetnú žiadosť o platbu v stanovenej lehote 3 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu v ITMS riadiacemu orgánu, ktorý postupuje podľa bodu 12b);
c)	žiadosti o platbu (zúčtovanie zálohovej platby) vrátenej z certifikačného orgánu v zmysle bodu A.16 a A.17 za účelom odstránenia identifikovaných nedostatkov:
i.	v prípade, ak sa dôvody vrátenia žiadosti o platbu z certifikačného orgánu týkajú úrovne platobnej jednotky, platobná jednotka odstráni zistené nedostatky na svojej úrovni a najneskôr nasledujúci pracovný deň, resp. podľa postupov a termínov stanovených certifikačným orgánom, zahrnie predmetnú žiadosť o platbu do mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu, ktorú predkladá certifikačnému orgánu najneskôr nasledujúci pracovný deň po jej zostavení. Certifikačný orgán následne postupuje podľa bodov B.14 až B.16,
ii.	v prípade, ak sa dôvody vrátenia žiadosti o platbu z certifikačného orgánu týkajú úrovne riadiaceho orgánu, platobná jednotka najneskôr nasledujúci pracovný deň po prijatí žiadosti o platbu z certifikačného orgánu vracia predmetnú žiadosť o platbu riadiacemu orgánu, ktorý postupuje podľa bodu 12b);
d)	žiadosti o platbu (zúčtovanie zálohovej platby) (v rámci ktorej boli výdavky schválené certifikačným orgánom v plnej výške) vrátenej z certifikačného orgánu v zmysle bodu A.17 za účelom zaradenia do mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu, po prijatí informácie o záveroch certifikačného overovania platobná jednotka zahrnie predmetnú žiadosť o platbu najneskôr nasledujúci pracovný deň, resp. podľa postupov a termínov stanovených certifikačným orgánom do mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu, ktorú predkladá certifikačnému orgánu najneskôr nasledujúci pracovný deň po jej zostavení. Certifikačný orgán následne postupuje podľa bodov B14 až B.16.
A.	Postup overenia súhrnnej žiadosti o platbu certifikačným orgánom:
A.14.V prípade predloženej súhrnnej žiadosti o platbu certifikačný orgán vykoná overenie na svojej úrovni, ktoré zahrňuje administratívne overenie, prípadne certifikačné overovanie. Taktiež overuje súhrnnú žiadosť o platbu z hľadiska neprekročenia / dodržania celkovej alokácie podľa prioritných osí na základe čiastkového výkazu výdavkov predloženého platobnou jednotkou. V prípade potreby si od riadiaceho orgánu alebo platobnej jednotky vyžiadava ďalšie informácie nevyhnutné pre posúdenie predloženej súhrnnej žiadosti o platbu.
A.15.Ak certifikačný orgán na svojej úrovni vykoná overenie žiadosti o platbu zaradenej do súhrnnej žiadosti o platbu a toto overenie žiadosti o platbu:
a)	je ukončené v lehote na overenie súhrnnej žiadosti o platbu, postupuje certifikačný orgán ďalej podľa bodu A.16,
b)	nie je ukončené v lehote na overenie súhrnnej žiadosti o platbu, postupuje certifikačný orgán ďalej podľa bodu A.17.
A.16.Certifikačný orgán do 10 pracovných dní od prijatia súhrnnej žiadosti o platbu súhrnnú žiadosť o platbu schváli v plnej výške, schváli v zníženej výške o sumu žiadosti o platbu, v ktorej boli v rámci overovania certifikačným orgánom zistené nedostatky, schváli v zníženej výške o sumu žiadosti o platbu, ktorá je predmetom overovania, schvaľovanie pozastaví23 alebo neschváli. Žiadosť o platbu, v rámci ktorej boli zistené nedostatky, ktoré majú vplyv na výšku a / alebo oprávnenosť výdavkov certifikačný orgán vráti platobnej jednotke, ktorá následne postupuje podľa bodu 13c) a súhrnnú žiadosť o platbu certifikačný orgán schvaľuje v zníženej výške.
A.17.Certifikačný orgán do 15 pracovných dní od prijatia súhrnnej žiadosti o platbu ukončí overovanie žiadosti o platbu zo súhrnnej žiadosti o platbu, ktorá bola schválená v zníženej výške v zmysle bodu A.16. (súhrnná žiadosť o platbu schválená v zníženej výške o sumu žiadosti o platbu, ktorá je predmetom overovania) a informuje platobnú jednotku o záveroch certifikačného overovania, v nadväznosti na ktoré platobná jednotka postupuje v zmysle bodu 13c) alebo 13d).
A.18.Certifikačný orgán v deň schválenia súhrnnej žiadosti o platbu a po jej spracovaní v ITMS informuje platobnú jednotku a v závislosti od zostatku na mimorozpočtovom účte prevádza prostriedky EÚ na príslušný príjmový účet platobnej jednotky.
B.	Postup overenia mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu certifikačným orgánom:
B.14.V prípade predloženej mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu certifikačný orgán vykoná overenie na svojej úrovni, ktoré zahrňuje len administratívne overenie. Taktiež overuje mimoriadnu súhrnnú žiadosť o platbu z hľadiska neprekročenia / dodržania celkovej alokácie podľa prioritných osí na základe čiastkového výkazu výdavkov predloženého platobnou jednotkou.
B.15.Certifikačný orgán mimoriadnu súhrnnú žiadosť o platbu schváli alebo neschváli do 7 pracovných dní od prijatia mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu.
B.16.Certifikačný orgán v deň schválenia mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu a po jej spracovaní v ITMS informuje platobnú jednotku a v závislosti od zostatku na mimorozpočtovom účte prevádza prostriedky EÚ na príslušný príjmový účet platobnej jednotky.
14.	Prijímateľ je oprávnený požiadať o ďalšiu zálohovú platbu najskôr súčasne s podaním žiadosti o platbu (zúčtovanie zálohovej platby). Riadiaci orgán prostredníctvom platobnej jednotky zabezpečí úhradu finančných prostriedkov na základe žiadosti o platbu (poskytnutie zálohovej platby) až po schválení predloženej žiadosti o platbu (zúčtovanie zálohovej platby) certifikačným orgánom v rámci súhrnnej žiadosti o platbu. Riadiaci orgán v úzkej spolupráci s platobnou jednotkou zodpovedá za stanovenie postupu, ktorý má zabrániť neoprávnenému vyplateniu zálohovej platby prijímateľovi. V tomto prípade riadiaci orgán pozastaví schvaľovanie žiadosti o platbu (poskytnutie zálohovej platby) až do času schválenia žiadosti o platbu (zúčtovanie zálohovej platby) certifikačným orgánom v súhrnnej žiadosti o platbu. Uvedené sa nevzťahuje na prípady definované v bode 15.
15.	V prípade, ak predchádzajúca zálohová platba nebola poskytnutá v maximálnej možnej výške, prijímateľ môže požiadať o ďalšiu zálohovú platbu vo výške súčtu certifikačným orgánom schválených finančných prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie a sumy rovnajúcej sa rozdielu maximálnej výšky zálohovej platby a predchádzajúcej poskytnutej zálohovej platby. Súčet týchto prostriedkov, a teda výška poskytnutej zálohovej platby, je maximálne 40 % relevantnej časti rozpočtu projektu zodpovedajúcim 12 mesiacom realizácie aktivít projektu.
16.	Každá nasledovná zálohová platba sa poskytuje a zúčtováva obdobným spôsobom v zmysle bodov 2. – 15. Zálohové platby sa týmto spôsobom poskytujú až do momentu dosiahnutia maximálne 95 % nenávratného finančného príspevku na projekt s výnimkou prípadov, keď bola suma znížená riadiacim orgánom. Nezúčtovaný rozdiel zálohovej platby je prijímateľ povinný vrátiť platobnej jednotke na základe vzájomnej komunikácie s riadiacim orgánom. Prijímateľ predloží riadiacemu orgánu oznámenie o vysporiadaní finančných vzťahov a poslednú žiadosť o platbu (s príznakom záverečná) – zúčtovanie zálohovej platby, ktorá plní funkciu záverečnej žiadosti o platbu.
Etapa refundácie:
17.	Po vyčerpaní maximálne 95 % nenávratného finančného príspevku je prijímateľ povinný zostávajúcich minimálne 5 % z nenávratného finančného príspevku, aj za podiel prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie, uhradiť najskôr z vlastných zdrojov. Až po uskutočnení tejto úhrady a ukončení realizácie aktivít projektu je prijímateľ oprávnený požiadať o žiadosť o platbu (s príznakom záverečná) zostatku zo zdrojov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie.
18.	Prijímateľ predkladá žiadosť o platbu (s príznakom záverečná) riadiacemu orgánu elektronicky prostredníctvom ITMS a najneskôr do 31. decembra 2015 aj písomne. Prijímateľ predkladá spolu so žiadosťou o platbu aj účtovné doklady1 (preukazujúce úhradu výdavku deklarovaného v žiadosti o platbu) a relevantnú podpornú dokumentáciu, ktorej minimálny rozsah stanovuje Systém riadenia európskych štrukturálnych a investičných fondov na programové obdobie 2014 – 2020 a riadiaci orgán.
19.	Riadiaci orgán vo vzťahu k žiadosti o platbu (s príznakom záverečná) postupuje obdobne ako v časti 6.5 v bodoch 4 až 8.
20.	Platobná jednotka vo vzťahu k žiadosti o platbu (s príznakom záverečná) postupuje obdobne ako v časti 6.5 v bode 9. 
21.	Certifikačný orgán postupuje obdobne ako v bode A.14 až A.18, resp. B.14 až B.16.
22.	Platobná jednotka je oprávnená ihneď, najneskôr do 3 pracovných dní po prijatí informácie o schválení súhrnnej žiadosti o platbu / mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu certifikačným orgánom, zadať platobné príkazy na prevod zostatku prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie prijímateľovi.
Zálohovú platbu možno zúčtovať predložením viacerých žiadostí o platbu (zúčtovanie zálohovej platby). Prijímateľ môže disponovať finančnými prostriedkami EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie v maximálnej výške 40 % z relevantnej časti rozpočtu. 
Povinnosti pre zúčtovanie 100 % z poskytnutej zálohovej platby sa vzťahujú osobitne na každú poskytnutú zálohovú platbu. V danom prípade priraďovanie zúčtovaní zálohových platieb (žiadosť o platbu – zúčtovanie zálohovej platby) k poskytnutej zálohovej platbe je potrebné sledovať v časovej súslednosti. Zúčtovanie zálohovej platby je potrebné v časovom slede priraďovať k poskytnutým zálohovým platbám od najstaršieho dátumu poskytnutia. 
Prijímateľ je povinný poskytnutú zálohovú platbu priebežne zúčtovávať, pričom povinnosť pre zúčtovanie výšky 100 % z poskytnutej zálohovej platby (t. j. sumy každej poskytnutej zálohovej platby) do 9 mesiacov odo dňa pripísania finančných prostriedkov na účte prijímateľa sa vzťahuje osobitne na každú poskytnutú zálohovú platbu.
V prípade nedodržania tejto podmienky je prijímateľ povinný bezodkladne, najneskôr do 5 pracovných dní od ukončenia uvedeného obdobia 9 mesiacov, vrátiť platobnej jednotke sumu nezúčtovaného rozdielu.
Riadiaci orgán sleduje napĺňanie percentuálneho stavu zúčtovávania poskytnutých zálohových platieb v rámci projektu prijímateľa. Riadiaci orgán aktívne s prijímateľom komunikuje a zároveň ho s cieľom maximalizovania návratnosti finančných prostriedkov poskytnutých systémom zálohových platieb a minimalizovania rizika nezúčtovávania poskytnutej zálohovej platby ako i znižovania nenávratného finančného príspevku prijímateľa v primeranom predstihu (aj s využitím funkcionalít ITMS) upozorňuje na hraničné termíny pre splnenie povinností stanovených v Systéme finančného riadenia štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu na programové obdobie 2014 – 2020.
Riadiaci orgán je povinný sledovať a evidovať poskytovanie a zúčtovávanie zálohových platieb v rámci projektu prijímateľa (dodržiavanie povinnosti prijímateľa týkajúce sa zúčtovania26 poskytnutej zálohovej platby) v samostatnom prehľade, pričom rozsah štruktúry sledovania poskytovania a zúčtovávania zálohových platieb je v jeho kompetencii.
Sledovanie dodržiavania povinnosti prijímateľa týkajúcej sa zúčtovania 100 % z poskytnutej zálohovej platby najneskôr do 9 mesiacov odo dňa pripísania finančných prostriedkov na účte prijímateľa v rámci projektu zabezpečuje riadiaci orgán v samostatnej štruktúre aj s využitím funkcionalít ITMS.
Prijímateľ dodržiava povinnosti stanovené pre poskytnutie a zúčtovanie zálohovej platby, cielene napĺňa a sleduje percentuálny stav zúčtovávania poskytnutých zálohových platieb v rámci projektu a aktívne komunikuje s riadiacim orgánom. Zároveň s cieľom minimalizovania rizika nezúčtovávania zálohovej platby ako i znižovania nenávratného finančného príspevku dodržiava hraničné termíny pre splnenie povinností stanovených v Systéme finančného riadenia štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu na programové obdobie 2014 – 2020.
Riadiaci orgán priebežne aktualizuje a ukladá prehľady plnenia povinnosti zúčtovať 100 % najneskôr do 9 mesiacov odo dňa pripísania finančných prostriedkov na účte prijímateľa v štruktúre stanovenej riadiacim orgánom, ako elektronickú prílohu do ITMS (v časti prílohy) v rámci každej predloženej žiadosti o platbu.
1.	V prípade, ak prijímateľ najneskôr do skončenia lehoty na zúčtovanie26 poskytnutej zálohovej platby zistí, že vzhľadom na rôzne opodstatnené okolnosti (napr. priebeh verejného obstarávania), nedodrží podmienky stanovené na zúčtovanie26 poskytnutej zálohovej platby, bezodkladne o uvedenej skutočnosti ako i dôvodoch nedodržania stanovených podmienok informuje riadiaci orgán. Zároveň najneskôr do 5 pracovných dní od ukončenia lehoty na zúčtovanie26 poskytnutej zálohovej platby vráti sumu nezúčtovaného rozdielu platobnej jednotke.
1.1.	V prípade, ak prijímateľ informuje riadiaci orgán a vráti sumu nezúčtovaného rozdielu platobnej jednotke vo vyššie uvedenej lehote (5 pracovných dní od ukončenia lehoty na zúčtovanie26 poskytnutej zálohovej platby), prijímateľovi sa neznižuje nenávratný finančný príspevok. Uvedené sa vzťahuje aj na prípad, ak prijímateľ neinformuje riadiaci orgán, ale vráti sumu nezúčtovaného rozdielu platobnej jednotke v uvedenej lehote.
1.2.	V prípade, ak prijímateľ nevráti sumu nezúčtovaného rozdielu platobnej jednotke do 5 pracovných dní od ukončenia lehoty na zúčtovanie26 poskytnutej zálohovej platby, o sumu nezúčtovaného rozdielu sa prijímateľovi znižuje nenávratný finančný príspevok. V tomto prípade riadiaci orgán bezodkladne o tejto skutočnosti (t. j. prijímateľ nedodržal stanovenú povinnosť a nevrátil sumu nezúčtovaného rozdielu platobnej jednotke) prijímateľa upozorní. Zároveň najneskôr nasledujúci pracovný deň od zistenia mu riadiaci orgán zašle žiadosť o vrátenie finančných prostriedkov a postupuje v zmysle časti 4.5.9. 
2.	V prípade, ak prijímateľ najneskôr do skončenia lehoty na zúčtovanie26 poskytnutej zálohovej platby predložil žiadosť o platbu (zúčtovanie zálohovej platby), avšak riadiaci orgán identifikuje neoprávnené výdavky v predloženej žiadosti o platbu (zúčtovanie zálohovej platby) až po stanovenej lehote na zúčtovanie26 poskytnutej zálohovej platby, a teda reálne nedochádza k zúčtovaniu 100 % z poskytnutej zálohovej platby do stanovenej lehoty na zúčtovanie26 poskytnutej zálohovej platby a ani k vráteniu sumy nezúčtovaného rozdielu (vo výške sumy identifikovaných neoprávnených výdavkov) platobnej jednotke, riadiaci orgán prijímateľa upozorní, aby finančné prostriedky vrátil a zašle prijímateľovi žiadosť o vrátenie finančných prostriedkov (postup v zmysle časti 4.5.9). 
2.1.	V prípade, ak prijímateľ vráti sumu nezúčtovaného rozdielu (vo výške sumy identifikovaných neoprávnených výdavkov) platobnej jednotke v určenej lehote (postup v zmysle časti 4.5.9), o sumu nezúčtovaného rozdielu sa prijímateľovi neznižuje nenávratný finančný príspevok. 
2.2.	V prípade, ak prijímateľ nevráti sumu nezúčtovaného rozdielu platobnej jednotke v určenej lehote (postup v zmysle časti 4.5.9), je riadiaci orgán z objektívnych dôvodov oprávnený rozhodnúť, že o sumu nezúčtovaného rozdielu (vo výške sumy identifikovaných neoprávnených výdavkov) sa prijímateľovi znižuje nenávratný finančný príspevok.
3.	V prípade, ak si prijímateľ splnil povinnosť zúčtovať poskytnutú zálohovú platbu, ale počas kontroly žiadosti o platbu (zúčtovanie zálohovej platby) riadiaci orgán identifikuje neoprávnené výdavky, a teda reálne nedochádza k zúčtovaniu26 poskytnutej zálohovej platby, riadiaci orgán vyčísli sumu identifikovaných neoprávnených výdavkov a upozorní na túto skutočnosť prijímateľa. 
Prijímateľ je povinný sumu identifikovaných neoprávnených výdavkov zúčtovať26 predložením novej žiadosti o platbu (zúčtovanie zálohovej platby) s výdavkami minimálne vo výške sumy identifikovaných neoprávnených výdavkov, pri zachovaní povinnosti zúčtovania výšky 100 % z poskytnutej zálohovej platby v lehote najneskôr do ukončenia stanoveného obdobia 9 mesiacov. 
Prijímateľ môže postupovať aj v zmysle bodu 1.1, t. j. informuje riadiaci orgán o nedodržaní zúčtovania zálohovej platby (t. j. nepredložení zúčtovania vo výške sumy identifikovaných neoprávnených výdavkov) a najneskôr do 5 pracovných dní od ukončenia lehoty na zúčtovanie26 poskytnutej zálohovej platby vráti sumu nezúčtovaného rozdielu (vo výške sumy identifikovaných neoprávnených výdavkov) platobnej jednotke. V tomto prípade sa prijímateľovi neznižuje nenávratný finančný príspevok.
V prípade, ak prijímateľ najneskôr do skončenia lehoty na zúčtovanie26 poskytnutej zálohovej platby (9 mesiacov) predložil žiadosť o platbu (zúčtovanie zálohovej platby) s výdavkami minimálne vo výške sumy identifikovaných neoprávnených výdavkov, avšak riadiaci orgán opäť identifikoval neoprávnené výdavky v predloženej žiadosti o platbu (zúčtovanie zálohovej platby) až po stanovenej lehote 9 mesiacov, a teda reálne nedochádza k zúčtovaniu 100 % z poskytnutej zálohovej platby do stanovenej lehoty 9 mesiacov a ani k vráteniu sumy nezúčtovaného rozdielu (vo výške sumy identifikovaných neoprávnených výdavkov) platobnej jednotke, riadiaci orgán prijímateľa upozorní, aby finančné prostriedky vrátil a zašle prijímateľovi žiadosť o vrátenie finančných prostriedkov (postup v zmysle časti 4.5.9). 
3.1.	V prípade, ak prijímateľ vráti sumu nezúčtovaného rozdielu (vo výške sumy identifikovaných neoprávnených výdavkov) platobnej jednotke v určenej lehote (postup v zmysle časti 4.5.9), o sumu nezúčtovaného rozdielu sa prijímateľovi neznižuje nenávratný finančný príspevok. 
3.2.	V prípade, ak prijímateľ nevráti sumu nezúčtovaného rozdielu platobnej jednotke v určenej lehote (postup v zmysle časti 4.5.9), je riadiaci orgán oprávnený rozhodnúť, že o sumu nezúčtovaného rozdielu (vo výške sumy identifikovaných neoprávnených výdavkov) sa prijímateľovi znižuje nenávratný finančný príspevok.
Riadiaci orgán v zmysle zmluvných podmienok v spolupráci s prijímateľom prijme potrebné opatrenia pre zabezpečenie návratnosti poskytnutých finančných prostriedkov štátneho rozpočtu prostredníctvom zálohovej platby.
Ak dôjde k nedodržaniu podmienok stanovených pre zúčtovanie poskytnutej zálohovej platby, resp. pre vrátenie sumy nezúčtovaného rozdielu poskytnutej zálohovej platby, výnimky zo Systéme finančného riadenia štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu na programové obdobie 2014 – 2020 nebudú poskytované.
Poskytnutie zálohovej platby si nevyžaduje súhlas certifikačného orgánu. Certifikačný orgán prevádza prostriedky EÚ platobnej jednotke na základe skutočne čerpaných (zúčtovaných) prostriedkov zo zálohových platieb prijímateľom, zaradených platobnou jednotkou do súhrnnej žiadosti o platbu a schválených certifikačným orgánom.
Platobná jednotka poskytuje zálohové platby prijímateľom na transferovej podpoložke ekonomickej klasifikácie, na ktorej sa zálohová platba prijímateľom aj zúčtuje.
Riadiaci orgán najneskôr do 31. decembra 2015 uchováva originál žiadosti o platbu, originál návrhu správy z kontroly (ak je relevantné), originál správy z kontroly, výpisy z účtov, jeden rovnopis účtovných dokladov alebo kópie18 účtovných dokladov označené podpisom štatutárneho orgánu prijímateľa a jeden rovnopis podpornej dokumentácie k žiadosti o platbu alebo kópie18 podpornej dokumentácie označené podpisom štatutárneho orgánu prijímateľa. 
Platobná jednotka uchováva originál súhrnnej žiadosti o platbu / mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu a formuláre žiadosti o platbu, resp. príslušnú časť formulárov žiadosti o platbu.
6.4	Systém zálohových platieb pre prijímateľov – štátne rozpočtové organizácie
Pri projektoch financovaných z Európskeho sociálneho fondu, Európskeho fondu regionálneho rozvoja, Európskeho námorného a rybárskeho fondu a Kohézneho fondu sa vyplácanie prijímateľa – štátne rozpočtové organizácie môže realizovať systémom predfinancovania (6.2), systémom zálohových platieb alebo systémom refundácie (časť 6.5) v súlade s určením riadiaceho orgánu v spolupráci s prijímateľom, pričom podmienky kombinovania uvedených systémov sú stanovené v zmluve o poskytnutí nenávratného finančného príspevku. 
Kombinovanie systému zálohovej platby so systémom predfinancovania je možné iba za podmienky, že sú jasne identifikované typy výdavkov určené pre jednotlivé systémy financovania, bez rizika vzájomného prelínania, t. j. výdavok, ktorý je deklarovaný v rámci systému predfinancovania nie je možné aplikovať v rámci systému zúčtovania zálohovej platby / systému refundácie a naopak. 
Riadiaci orgán v spolupráci s prijímateľom v zmluve o poskytnutí nenávratného finančného príspevku zabezpečí identifikáciu jednotlivých typov výdavkov (rozpočtových položiek projektu) tak, že bude jednoznačne určené, ktoré konkrétne výdavky (napr. personálne) budú financované výlučne systémom zálohovej platby, a ktoré (napr. investičné) systémom predfinancovania, resp. ktoré systémom refundácie.
Riadiaci orgán môže stanoviť prísnejšie pravidlá pre poskytnutie zálohovej platby a zúčtovanie zálohovej platby ako tie, ktoré sú definované v Systéme finančného riadenia štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu na programové obdobie 2014 – 202025.
Riadiaci orgán posúdi opodstatnenosť a reálnosť požiadavky prijímateľa na poskytnutie zálohovej platby.
Jednotlivé žiadosti o platbu môže prijímateľ predkladať len na jeden z uvedených systémov, tzn. že výdavky realizované z poskytnutých zálohových platieb nemôže prijímateľ kombinovať spolu s výdavkami uplatňovanými systémom refundácie, resp. s výdavkami uplatňovanými systémom predfinancovania v rámci jednej žiadosti o platbu. V takom prípade prijímateľ predkladá samostatne žiadosť o platbu (zúčtovanie zálohovej platby), samostatne žiadosť o platbu (priebežná platba), a samostatne žiadosť o platbu (zúčtovanie predfinancovania). V prípade zmeny právnej formy prijímateľa na typ, ktorý v zmysle časti 4.5.4 nie je oprávnený ďalej využívať systém zálohových platieb, prijímateľovi nie sú poskytované žiadne platby až do zúčtovania poskytnutých zálohových platieb. 
Prijímateľ realizujúci národný projekt môže tieto prostriedky poskytovať konečným užívateľom na základe zmluvy v súlade s § 20, ods. 2 zákona č. 523/2004 Z. z. o rozpočtových pravidlách verejnej správy.
Zálohové platby sú prijímateľovi poskytované maximálne do výšky 40 % relevantnej časti rozpočtu projektu zodpovedajúcim 12 mesiacom realizácie aktivít projektu na základe postupov riadiaceho orgánu zapracovaných v relevantných dokumentoch (manuál procedúr a iné). V prípade kombinácie systému refundácie a systému zálohových platieb sa výška prvej zálohovej platby vypočíta na rovnakom základe, ako by sa vypočítala zálohová platba pri začatí realizácie projektu, t. j. do výšky maximálne 40 % z relevantnej časti rozpočtu projektu zodpovedajúcim 12 mesiacom realizácie aktivít projektu 
V prípade kombinácie systému predfinancovania, systému refundácie a systému zálohových platieb sa výška zálohovej platby vypočíta z celkovej sumy (súčtu súm) identifikovaných typov oprávnených výdavkov (rozpočtových položiek projektu jednoznačne určených na financovanie výlučne systémom zálohovej platby) v relevantnom roku realizácie projektu do výšky maximálne 40 % z relevantnej časti rozpočtu projektu (v danom prípade sa pri výpočte zálohovej platby za relevantnú časť rozpočtu projektu považuje celková suma identifikovaných oprávnených výdavkov jednoznačne určených na financovanie výlučne systémom zálohovej platby, zohľadňujúc aktuálny stav už vyčerpaných finančných prostriedkov na predmetných položkách projektu). Tzn. že v prípade, ak už došlo k čerpaniu finančných prostriedkov z celkovej sumy (súčtu súm) identifikovaných typov oprávnených výdavkov (rozpočtových položiek projektu, ktoré boli určené na financovanie výlučne systémom zálohovej platby), výška zálohovej platby sa vypočíta zo sumy nevyčerpaných finančných prostriedkov. 
Zálohové platby sú prijímateľovi poskytované pomerne za zdroje EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie po nadobudnutí účinnosti zmluvy o poskytnutí nenávratného finančného príspevku a začatí realizácie projektu, resp. na základe zúčtovania poskytnutej zálohovej platby až do momentu dosiahnutia maximálne 100 % celkových oprávnených výdavkov na projekt s výnimkou prípadov, keď bola suma znížená riadiacim orgánom. 
Pri využití systému zálohových platieb sa vyplácanie prijímateľa – štátne rozpočtové organizácie uskutočňuje v dvoch etapách – etape poskytnutia zálohovej platby a etape zúčtovania poskytnutej zálohovej platby. 
Etapa poskytnutia zálohovej platby:
1.	Prijímateľ po začatí realizácie projektu predkladá žiadosť o platbu (poskytnutie zálohovej platby) riadiacemu orgánu v zmysle podmienok zmluvy o poskytnutí nenávratného finančného príspevku, a to maximálne do výšky 40 % z relevantnej časti rozpočtu projektu zodpovedajúcim 12 mesiacom realizácie aktivít projektu z prostriedkov zodpovedajúcich podielu EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie. 
1.1.	Kombinácia systému zálohových platieb a systému refundácie
V prípade kombinácie systému zálohových platieb a systému refundácie sa výška maximálnej zálohovej platby vypočíta nasledovne:
•	v prípade, ak plánovaná dĺžka realizácie projektu nepresahuje 12 mesiacov, výška zálohovej platby predstavuje maximálne 40 % oprávnených výdavkov rozpočtu projektu zodpovedajúcich podielu EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie;
•	v prípade, ak plánovaná dĺžka realizácie projektu presahuje 12 mesiacov, výška zálohovej platby sa vypočíta podľa nasledovného vzorca:
maximálna výška poskytnutej zálohovej platby	=	0,4	x	celková suma nenávratného finančného príspevku	x	12	
				celkový počet mesiacov realizácie			
1.2.	Kombinácia systému zálohových platieb, systému refundácie a systému predfinancovania
V prípade kombinácie systému zálohových platieb, systému refundácie a systému predfinancovania sa výška maximálnej zálohovej platby vypočíta nasledovne:
-	z celkovej sumy (súčtu súm) identifikovaných typov oprávnených výdavkov (rozpočtových položiek projektu jednoznačne určených na financovanie výlučne systémom zálohovej platby) v relevantnom roku realizácie projektu do výšky maximálne 40 % z relevantnej časti rozpočtu projektu (v danom prípade sa pri výpočte zálohovej platby za relevantnú časť rozpočtu projektu považuje suma identifikovaných oprávnených výdavkov jednoznačne určených na financovanie výlučne systémom zálohovej platby, zohľadňujúc aktuálny stav už vyčerpaných finančných prostriedkov na predmetných položkách projektu) vo výške prostriedkov zodpovedajúcich podielu prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie.
maximálna výška poskytnutej zálohovej platby	=	0,4	x	celková suma identifikovaných typov oprávnených výdavkov (rozpočtových položiek projektu, ktoré sú jednoznačne určené na financovanie výlučne systémom zálohovej platby, zohľadňujúc aktuálny stav už vyčerpaných finančných prostriedkov na predmetných položkách projektu) v relevantnom roku realizácie projektu
(vo výške prostriedkov zodpovedajúcich podielu prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie)	
2.	Prijímateľ predkladá žiadosť o platbu (poskytnutie zálohovej platby) riadiacemu orgánu elektronicky prostredníctvom ITMS a najneskôr do 31. decembra 2015 aj písomne.
3.	Riadiaci orgán vykonáva kontrolu žiadosti o platbu podľa čl. 125 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov a na základe podmienok a postupu výkonu kontroly projektu definovaných v Systéme riadenia európskych štrukturálnych a investičných fondov na programové obdobie 2014 – 2020. 
V prípade zistenia nedostatkov riadiaci orgán vyzve19 prijímateľa, aby v stanovenej lehote doplnil / zmenil žiadosť o platbu. Lehota na výkon kontroly žiadosti o platbu môže byť riadiacim orgánom pozastavená20. 
4.	Po vykonaní kontroly žiadosti o platbu riadiaci orgán žiadosť o platbu schváli v plnej výške, žiadosť o platbu schváli v zníženej sume, schvaľovanie žiadosti o platbu pozastaví20 alebo zamietne bezodkladne21, najneskôr však v lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od prijímateľa riadiacim orgánom a po schválení žiadosti o platbu vo vyššie uvedených prípadoch, v stanovenej lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od prijímateľa riadiacim orgánom, riadiaci orgán predloží formulár tejto žiadosti o platbu platobnej jednotke.
5.	Platobná jednotka po schválení žiadosti o platbu riadiacim orgánom vykoná kontrolu v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov do 5 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu v ITMS. Platobná jednotka rovnako overí súlad sumy nárokovaných finančných prostriedkov so schváleným rozpočtom platobnej jednotky. Následne platobná jednotka v stanovenej lehote žiadosť o platbu schváli alebo neschváli. V prípade jej schválenia platobná jednotka najneskôr do 3 pracovných dní od schválenia žiadosti o platbu zabezpečí žiadosť o prevod prostriedkov rozpočtovým opatrením prostredníctvom úpravy limitov výdavkov pomerne za zdroje EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie: viazaním výdavkov v rozpočte platobnej jednotky a navýšením limitov výdavkov prijímateľa. V prípade neschválenia žiadosti o platbu, vracia predmetnú žiadosť o platbu riadiacemu orgánu v stanovenej lehote 5 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu v ITMS.
6.	V prípade vrátenia žiadosti o platbu z platobnej jednotky v zmysle bodu 5 riadiaci orgán vykoná kontrolu žiadosti o platbu podľa čl. 125 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov a na základe podmienok a postupov pre výkon kontroly žiadosti o platbu definovaných v Systéme riadenia európskych štrukturálnych a investičných fondov na programové obdobie 2014 – 2020. 
Riadiaci orgán počas výkonu kontroly žiadosti o platbu môže schvaľovanie žiadosti o platbu pozastaviť20.
Po vykonaní kontroly žiadosti o platbu riadiaci orgán žiadosť o platbu schváli (schváli nárokované finančné prostriedky v plnej výške), žiadosť o platbu schváli v zníženej sume (schváli nárokované finančné prostriedky vo výške zníženej o sumu neoprávnených výdavkov), alebo žiadosť o platbu zamietne bezodkladne21, najneskôr však v lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od platobnej jednotky v ITMS a po schválení žiadosti o platbu vo vyššie uvedených prípadoch, v stanovenej lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od platobnej jednotky v ITMS, riadiaci orgán predloží formulár tejto žiadosti o platbu platobnej jednotke, ktorá postupuje podľa bodu 5;
Etapa zúčtovania poskytnutej zálohovej platby:
7.	Prijímateľ je povinný poskytnutú zálohovú platbu priebežne zúčtovávať26, pričom najneskôr do 9 mesiacov odo dňa aktivácie rozpočtového opatrenia je povinný zúčtovať 100 % z poskytnutej zálohovej platby (sumy každej poskytnutej zálohovej platby). V prípade nedodržania tejto podmienky je prijímateľ povinný bezodkladne, najneskôr do 5 pracovných dní od ukončenia uvedeného obdobia 9 mesiacov, vrátiť platobnej jednotke sumu nezúčtovaného rozdielu. Žiadosť o platbu (zúčtovanie zálohovej platby) je potrebné priraďovať k najstaršej poskytnutej nezúčtovanej zálohovej platbe.
Prijímateľ v rámci zúčtovania zálohovej platby predkladá žiadosť o platbu (zúčtovanie zálohovej platby) riadiacemu orgánu elektronicky prostredníctvom ITMS a najneskôr do 31. decembra 2015 aj písomne. Prijímateľ predkladá spolu so žiadosťou o platbu (zúčtovanie zálohovej platby) aj účtovné doklady1 (preukazujúce úhradu výdavku deklarovaného v žiadosti o platbu) a relevantnú podpornú dokumentáciu, ktorej minimálny rozsah stanovuje Systém riadenia európskych štrukturálnych a investičných fondov na programové obdobie 2014 – 2020 a riadiaci orgán.
8.	Riadiaci orgán vo vzťahu k žiadosti o platbu (zúčtovanie zálohovej platby) postupuje obdobne ako v bode 3.
9.	Riadiaci orgán počas výkonu kontroly žiadosti o platbu vykonáva v prípade potreby aj samostatnú kontrolu vyčlenenej časti deklarovaných výdavkov z predloženej žiadosti o platbu. Samostatná kontrola vyčlenenej časti deklarovaných finančných prostriedkov z predloženej žiadosti o platbu sa nevykonáva v prípade žiadosti o platbu vrátenej z platobnej jednotky v zmysle bodu 13a) a 13b). Riadiaci orgán môže počas výkonu samostatnej kontroly vyčlenenej časti deklarovaných výdavkov vyčleniť z už vyčlenenej časti deklarovaných výdavkov ďalšiu časť deklarovaných výdavkov na samostatnú kontrolu. Podrobnosti výkonu samostatnej kontroly vyčlenenej časti deklarovaných výdavkov z predloženej žiadosti o platbu stanovuje Systém riadenia európskych štrukturálnych a investičných fondov na programové obdobie 2014 – 2020. 
10.	Po vykonaní kontroly žiadosti o platbu riadiaci orgán žiadosť o platbu schváli (schváli deklarované výdavky v plnej výške), žiadosť o platbu schváli v zníženej sume (schváli deklarované výdavky vo výške zníženej o sumu neoprávnených výdavkov), žiadosť o platbu schváli v zníženej sume (schváli deklarované výdavky bez deklarovaných výdavkov, ktoré sú predmetom samostatnej kontroly, resp. schváli deklarované výdavky, ktoré sú predmetom samostatnej kontroly v zmysle postupu podľa bodu 11b), alebo žiadosť o platbu zamietne bezodkladne21, najneskôr však v lehote 25 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od prijímateľa riadiacim orgánom.
Ukončením výkonu kontroly deklarovaných výdavkov z predloženej žiadosti o platbu (okrem prípadu podľa bodu 11a) sa ku kódu žiadosti o platbu (v rámci časti vypĺňanej riadiacim orgánom) automaticky priraďuje dodatočný číselný identifikátor. V prípade schválenia deklarovaných výdavkov vo vyššie uvedených prípadoch, v stanovenej lehote 25 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od platobnej jednotky v ITMS, riadiaci orgán predkladá platobnej jednotke len príslušnú časť formulára žiadosti o platbu, v rámci ktorej je kód žiadosti o platbu rozšírený o príslušný číselný identifikátor. 
11.	V prípade výkonu samostatnej kontroly riadiaci orgán schváli deklarované výdavky, ktoré boli predmetom samostatnej kontroly v plnej výške, schváli deklarované výdavky, ktoré boli predmetom samostatnej kontroly vo výške zníženej o sumu neoprávnených výdavkov, schváli deklarované výdavky, ktoré boli predmetom samostatnej kontroly vo výške zníženej o sumu deklarovaných výdavkov, ktoré sú predmetom ďalšej samostatnej kontroly, schvaľovanie pozastaví20 alebo zamietne bezodkladne21, najneskôr však v lehote 25 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od prijímateľa riadiacim orgánom, pričom v prípade, ak samostatná kontrola vyčlenenej časti deklarovaných výdavkov:
a)	je ukončená pred alebo súčasne s ukončením kontroly deklarovaných výdavkov, ktoré neboli vyčlenené na samostatnú kontrolu, riadiaci orgán deklarované výdavky, ktoré neboli vyčlenené na samostatnú kontrolu a deklarované výdavky, ktoré boli vyčlenené na samostatnú kontrolu schváli v plnej výške, prípadne schváli v zníženej výške v lehote stanovenej na výkon kontroly (25 pracovných dní). V tomto prípade riadiaci orgán predkladá platobnej jednotke len príslušnú časť formulára žiadosti o platbu, v ktorom identifikuje všetky oprávnené deklarované výdavky. Ku kódu žiadosti o platbu (v rámci časti žiadosti o platbu vypĺňanej riadiacim orgánom) je v tomto prípade automaticky priraďovaný len jeden číselný identifikátor;
b)	je ukončená po ukončení kontroly deklarovaných výdavkov, ktoré neboli vyčlenené na samostatnú kontrolu, riadiaci orgán, v lehote stanovenej na výkon kontroly (25 pracovných dní), predkladá platobnej jednotke príslušnú časť formulára žiadosti o platbu, v ktorom identifikuje oprávnené deklarované výdavky, ktoré boli vyčlenené na samostatnú kontrolu;
V každom z uvedených prípadov predkladá riadiaci orgán platobnej jednotke príslušnú časť formulára žiadosti o platbu, v ktorej sa uvádza výška schválených výdavkov na preplatenie platobnou jednotkou.
12.	Riadiaci orgán v prípade vrátenia žiadosti o platbu z platobnej jednotky v zmysle.
a)	bodu 13a) vykoná kontrolu žiadosti o platbu podľa čl. 125 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov a na základe podmienok a postupov pre výkon kontroly žiadosti o platbu definovaných v Systéme riadenia európskych štrukturálnych a investičných fondov na programové obdobie 2014 – 2020. 
Riadiaci orgán počas výkonu kontroly žiadosti o platbu môže schvaľovanie žiadosti o platbu pozastaviť20. 
Po vykonaní kontroly žiadosti o platbu riadiaci orgán žiadosť o platbu schváli (schváli deklarované výdavky v plnej výške), žiadosť o platbu schváli v zníženej sume (schváli deklarované výdavky vo výške zníženej o sumu neoprávnených výdavkov), alebo žiadosť o platbu zamietne bezodkladne21, najneskôr však v lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od platobnej jednotky v ITMS a po schválení žiadosti o platbu vo vyššie uvedených prípadoch, v stanovenej lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od platobnej jednotky v ITMS, riadiaci orgán predloží formulár tejto žiadosti o platbu platobnej jednotke, ktorá postupuje v zmysle bodu 13a).
b)	bodu 13b) a 13c) ii v prípade zistených nedostatkov, ktoré majú vplyv na výšku a / alebo oprávnenosť výdavkov vykoná kontrolu žiadosti o platbu podľa čl. 125 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov a na základe podmienok a postupov pre výkon kontroly žiadosti o platbu definovaných v Systéme riadenia európskych štrukturálnych a investičných fondov na programové obdobie 2014 – 2020. V rámci nedostatkov bez vplyvu na výšku a / alebo oprávnenosť výdavkov sa uplatňuje bod 30 časti 3.2.
Riadiaci orgán počas výkonu kontroly žiadosti o platbu môže schvaľovanie žiadosti o platbu pozastaviť20. 
Po vykonaní kontroly žiadosti o platbu riadiaci orgán žiadosť o platbu schváli (schváli deklarované výdavky v plnej výške), žiadosť o platbu schváli v zníženej sume (schváli deklarované výdavky vo výške zníženej o sumu neoprávnených výdavkov), alebo žiadosť o platbu zamietne bezodkladne21, najneskôr však v lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od platobnej jednotky v ITMS a po schválení žiadosti o platbu vo vyššie uvedených prípadoch, v stanovenej lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od platobnej jednotky v ITMS, riadiaci orgán predloží formulár tejto žiadosti o platbu platobnej jednotke, ktorá postupuje v zmysle bodu 13b).
13.	Platobná jednotka zostavuje súhrnnú žiadosť o platbu / mimoriadnu súhrnnú žiadosť o platbu zostavenú zo žiadostí o platbu pričom pri:
a)	žiadosti o platbu (zúčtovanie zálohovej platby) predloženej riadiacim orgánom v zmysle bodu 10 a 12a) vykoná kontrolu žiadosti o platbu v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov do 5 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu v ITMS. Platobná jednotka overí súlad deklarovanej sumy so schváleným rozpočtom platobnej jednotky. Následne v stanovenej lehote schváli alebo neschváli žiadosť o platbu. V prípade jej schválenia platobná jednotka zahrnie sumu do nasledovnej súhrnnej žiadosti o platbu a v intervale dvakrát do mesiaca podľa stanovených termínov predkladá spolu s čiastkovým výkazom výdavkov certifikačnému orgánu prostredníctvom ITMS. V prípade neschválenia žiadosti o platbu, vracia predmetnú žiadosť o platbu v stanovenej lehote 5 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu v ITMS riadiacemu orgánu, ktorý postupuje podľa bodu 12a);
b)	žiadosti o platbu (zúčtovanie zálohovej platby) predloženej riadiacim orgánom v zmysle bodu 12b) kontrolu žiadosti o platbu v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov do 3 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu v ITMS a v tejto lehote žiadosť o platbu schváli alebo neschváli. Po schválení žiadosti o platbu platobná jednotka najneskôr nasledujúci pracovný deň, resp. podľa postupov a termínov stanovených certifikačným orgánom, zahrnie predmetnú žiadosť o platbu do mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu, ktorú predkladá certifikačnému orgánu najneskôr nasledujúci pracovný deň po jej zostavení. Certifikačný orgán následne postupuje podľa bodov B.14 až B.16. V prípade neschválenia žiadosti o platbu, vracia predmetnú žiadosť o platbu v stanovenej lehote 3 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu v ITMS riadiacemu orgánu, ktorý postupuje podľa bodu 12b);
c)	žiadosti o platbu (zúčtovanie zálohovej platby) vrátenej z certifikačného orgánu v zmysle bodu A.16 a A.17 za účelom odstránenia identifikovaných nedostatkov:
i.	v prípade, ak sa dôvody vrátenia žiadosti o platbu z certifikačného orgánu týkajú úrovne platobnej jednotky, platobná jednotka odstráni zistené nedostatky na svojej úrovni a najneskôr nasledujúci pracovný deň, resp. podľa postupov a termínov stanovených certifikačným orgánom, zahrnie predmetnú žiadosť o platbu do mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu, ktorú predkladá certifikačnému orgánu najneskôr nasledujúci pracovný deň po jej zostavení. Certifikačný orgán následne postupuje podľa bodov B.14 až B.16;
ii.	v prípade, ak sa dôvody vrátenia žiadosti o platbu z certifikačného orgánu týkajú úrovne riadiaceho orgánu, platobná jednotka najneskôr nasledujúci pracovný deň po prijatí žiadosti o platbu z certifikačného orgánu vracia predmetnú žiadosť o platbu riadiacemu orgánu, ktorý postupuje podľa bodu 12b);
d)	žiadosti o platbu (zúčtovanie zálohovej platby) (v rámci ktorej boli výdavky schválené certifikačným orgánom v plnej výške) vrátenej z certifikačného orgánu v zmysle bodu A.17 za účelom zaradenia do mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu, po prijatí informácie o záveroch certifikačného overovania platobná jednotka zahrnie predmetnú žiadosť o platbu najneskôr nasledujúci pracovný deň, resp. podľa postupov a termínov stanovených certifikačným orgánom do mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu, ktorú predkladá certifikačnému orgánu najneskôr nasledujúci pracovný deň po jej zostavení. Certifikačný orgán následne postupuje podľa bodov B.14 až B.16.
A.	Postup overenia súhrnnej žiadosti o platbu certifikačným orgánom:
A.14.V prípade predloženej súhrnnej žiadosti o platbu certifikačný orgán vykoná overenie na svojej úrovni, ktoré zahrňuje administratívne overenie, prípadne certifikačné overovanie. Taktiež overuje súhrnnú žiadosť o platbu z hľadiska neprekročenia / dodržania celkovej alokácie podľa prioritných osí na základe čiastkového výkazu výdavkov predloženého platobnou jednotkou. V prípade potreby si od riadiaceho orgánu alebo platobnej jednotky vyžiadava ďalšie informácie nevyhnutné pre posúdenie predloženej súhrnnej žiadosti o platbu.
A.15.Ak certifikačný orgán na svojej úrovni vykoná overenie žiadosti o platbu zaradenej do súhrnnej žiadosti o platbu a toto overenie žiadosti o platbu:
a)	je ukončené v lehote na overenie súhrnnej žiadosti o platbu, postupuje certifikačný orgán ďalej podľa bodu A.16,
b)	nie je ukončené v lehote na overenie súhrnnej žiadosti o platbu, postupuje certifikačný orgán ďalej podľa bodu A.17.
A.16.Certifikačný orgán do 10 pracovných dní od prijatia súhrnnej žiadosti o platbu súhrnnú žiadosť o platbu schváli v plnej výške, schváli v zníženej výške o sumu žiadosti o platbu, v ktorej boli v rámci overovania certifikačným orgánom zistené nedostatky, schváli v zníženej výške o sumu žiadosti o platbu, ktorá je predmetom overovania, schvaľovanie pozastaví23 alebo neschváli. Žiadosť o platbu, v rámci ktorej boli zistené nedostatky, ktoré majú vplyv na výšku a / alebo oprávnenosť výdavkov certifikačný orgán vráti platobnej jednotke, ktorá následne postupuje podľa bodu 13c) a súhrnnú žiadosť o platbu certifikačný orgán schvaľuje v zníženej výške.
A.17.Certifikačný orgán do 15 pracovných dní od prijatia súhrnnej žiadosti o platbu ukončí overovanie žiadosti o platbu zo súhrnnej žiadosti o platbu, ktorá bola schválená v zníženej výške v zmysle bodu A.16 (súhrnná žiadosť o platbu schválená v zníženej výške o sumu žiadosti o platbu, ktorá je predmetom overovania) a informuje platobnú jednotku o záveroch certifikačného overovania, v nadväznosti na ktoré platobná jednotka postupuje v zmysle bodu 13c) alebo 13d).
A.18.Certifikačný orgán v deň schválenia súhrnnej žiadosti o platbu a po jej spracovaní v ITMS informuje platobnú jednotku a v závislosti od zostatku na mimorozpočtovom účte prevádza prostriedky EÚ na príslušný príjmový účet platobnej jednotky.
B.	Postup overenia mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu certifikačným orgánom:
B.14.V prípade predloženej mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu certifikačný orgán vykoná overenie na svojej úrovni, ktoré zahrňuje len administratívne overenie. Taktiež overuje mimoriadnu súhrnnú žiadosť o platbu z hľadiska neprekročenia / dodržania celkovej alokácie podľa prioritných osí na základe čiastkového výkazu výdavkov predloženého platobnou jednotkou.
B.15.Certifikačný orgán mimoriadnu súhrnnú žiadosť o platbu schváli alebo neschváli do 7 pracovných dní od prijatia mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu.
B.16.Certifikačný orgán v deň schválenia mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu a po jej spracovaní v ITMS informuje platobnú jednotku a v závislosti od zostatku na mimorozpočtovom účte prevádza prostriedky EÚ na príslušný príjmový účet platobnej jednotky.
14.	Prijímateľ je oprávnený požiadať o ďalšiu zálohovú platbu najskôr súčasne s podaním žiadosti o platbu (zúčtovanie zálohovej platby). Riadiaci orgán prostredníctvom platobnej jednotky zabezpečí úhradu finančných prostriedkov na základe žiadosti o platbu (poskytnutie zálohovej platby) až po schválení predloženej žiadosti o platbu (zúčtovanie zálohovej platby) certifikačným orgánom v rámci súhrnnej žiadosti o platbu. Riadiaci orgán v úzkej spolupráci s platobnou jednotkou zodpovedá za stanovenie postupu, ktorý má zabrániť neoprávnenému vyplateniu zálohovej platby prijímateľovi. V tomto prípade riadiaci orgán pozastaví schvaľovanie žiadosti o platbu (poskytnutie zálohovej platby) až do času schválenia žiadosti o platbu (zúčtovanie zálohovej platby) certifikačným orgánom v súhrnnej žiadosti o platbu. Uvedené sa nevzťahuje na prípady definované v bode 15.
15.	V prípade, ak predchádzajúca zálohová platba nebola poskytnutá v maximálnej možnej výške, prijímateľ môže požiadať o ďalšiu zálohovú platbu vo výške súčtu certifikačným orgánom schválených prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie a sumy rovnajúcej sa rozdielu maximálnej výšky zálohovej platby a predchádzajúcej poskytnutej zálohovej platby. Súčet týchto prostriedkov, a teda výška poskytnutej zálohovej platby je maximálne 40 % relevantnej časti rozpočtu projektu zodpovedajúcim 12 mesiacom realizácie aktivít projektu.
16.	Každá nasledovná zálohová platba sa poskytuje a zúčtováva obdobným spôsobom v zmysle bodov 2 – 15. Zálohové platby sa týmto spôsobom poskytujú až do momentu dosiahnutia maximálne 100 % celkových oprávnených výdavkov na projekt s výnimkou prípadov, keď bola suma znížená riadiacim orgánom. Nezúčtovaný rozdiel zálohovej platby je prijímateľ povinný vrátiť platobnej jednotke na základe vzájomnej komunikácie s riadiacim orgánom. Prijímateľ predloží riadiacemu orgánu oznámenie o vysporiadaní finančných vzťahov a poslednú žiadosť o platbu (s príznakom záverečná) – zúčtovanie zálohovej platby, ktorá plní funkciu záverečnej žiadosti o platbu.
Na konci rozpočtového roka môže riadiaci orgán po dohode s prijímateľom rozhodnúť o poskytnutí nižšej zálohovej platby, a to len do výšky potrebnej na realizáciu projektových aktivít do konca príslušného roka. V nasledujúcom rozpočtovom roku môže riadiaci orgán poskytnúť ďalšiu zálohovú platbu bez povinnosti schválenia akejkoľvek časti predchádzajúcej zálohovej platby certifikačným orgánom, ale maximálne do výšky 40 % z relevantnej časti rozpočtu projektu zodpovedajúcim 12 mesiacom realizácie aktivít projektu.
Zálohovú platbu možno zúčtovať predložením viacerých žiadostí o platbu (zúčtovanie zálohovej platby). Prijímateľ môže disponovať finančnými prostriedkami EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie v maximálnej výške 40 % z relevantnej časti rozpočtu.
Povinnosti pre zúčtovanie 100 % z poskytnutej zálohovej platby sa vzťahujú osobitne na každú poskytnutú zálohovú platbu. V danom prípade priraďovanie zúčtovaní zálohových platieb (žiadosť o platbu – zúčtovanie zálohovej platby) k poskytnutej zálohovej platbe je potrebné sledovať v časovej súslednosti. Zúčtovanie zálohovej platby je potrebné v časovom slede priraďovať k poskytnutým zálohovým platbám od najstaršieho dátumu poskytnutia.
Prijímateľ je povinný poskytnutú zálohovú platbu priebežne zúčtovávať, pričom povinnosť pre zúčtovanie výšky 100 % z poskytnutej zálohovej platby do 9 mesiacov odo dňa aktivácie rozpočtového opatrenia sa vzťahuje osobitne na každú poskytnutú zálohovú platbu.
V prípade nedodržania tejto podmienky je prijímateľ povinný bezodkladne21, najneskôr do 5 pracovných dní od ukončenia uvedeného obdobia 9 mesiacov, vrátiť platobnej jednotke sumu nezúčtovaného rozdielu. 
Riadiaci orgán sleduje napĺňanie percentuálneho stavu zúčtovávania poskytnutých zálohových platieb v rámci projektu prijímateľa. Riadiaci orgán aktívne s prijímateľom komunikuje a zároveň ho s cieľom maximalizovania návratnosti finančných prostriedkov poskytnutých systémom zálohových platieb a minimalizovania rizika nezúčtovávania poskytnutej zálohovej platby ako i znižovania nenávratného finančného príspevku prijímateľa v primeranom predstihu (aj s využitím funkcionalít ITMS) upozorňuje na hraničné termíny pre splnenie povinností stanovených v Systéme finančného riadenia štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu na programové obdobie 2014 – 2020.
Riadiaci orgán je povinný sledovať a evidovať poskytovanie a zúčtovávanie zálohových platieb v rámci projektu prijímateľa (dodržiavanie povinnosti prijímateľa týkajúce sa zúčtovania26 poskytnutej zálohovej platby) v samostatnom prehľade, pričom rozsah štruktúry sledovania poskytovania a zúčtovávania zálohových platieb je v jeho kompetencii.
Sledovanie dodržiavania povinnosti prijímateľa týkajúcej sa zúčtovania 100 % z poskytnutej zálohovej platby najneskôr do 9 mesiacov odo dňa aktivácie rozpočtového opatrenia v rámci projektu zabezpečuje riadiaci orgán v samostatnej štruktúre aj s využitím funkcionalít ITMS.
Prijímateľ dodržiava povinnosti stanovené pre poskytnutie a zúčtovanie zálohovej platby, cielene napĺňa a sleduje percentuálny stav zúčtovávania poskytnutých zálohových platieb v rámci projektu a aktívne komunikuje s riadiacim orgánom. Zároveň s cieľom minimalizovania rizika nezúčtovávania zálohovej platby ako i znižovania nenávratného finančného príspevku dodržiava hraničné termíny pre splnenie povinností stanovených v Systéme finančného riadenia štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu na programové obdobie 2014 – 2020.
Riadiaci orgán priebežne aktualizuje a ukladá prehľady plnenia povinnosti zúčtovať 100 % najneskôr do 9 mesiacov odo dňa aktivácie rozpočtového opatrenia v štruktúre stanovenej riadiacim orgánom, ako elektronickú prílohu do ITMS (v časti prílohy) v rámci každej predloženej žiadosti o platbu.
1.	V prípade, ak prijímateľ najneskôr do skončenia lehoty na zúčtovanie26 poskytnutej zálohovej platby zistí, že vzhľadom na rôzne opodstatnené okolnosti (napr. priebeh verejného obstarávania), nedodrží podmienky stanovené na zúčtovanie26 poskytnutej zálohovej platby, bezodkladne21 o uvedenej skutočnosti ako i dôvodoch nedodržania stanovených podmienok informuje riadiaci orgán. Zároveň najneskôr do 5 pracovných dní od ukončenia lehoty na zúčtovanie26 poskytnutej zálohovej platby vráti sumu nezúčtovaného rozdielu platobnej jednotke.
1.1	V prípade, ak prijímateľ informuje riadiaci orgán a vráti sumu nezúčtovaného rozdielu platobnej jednotke vo vyššie uvedenej lehote (5 pracovných dní od ukončenia lehoty na zúčtovanie26 poskytnutej zálohovej platby), prijímateľovi sa neznižuje nenávratný finančný príspevok. Uvedené sa vzťahuje aj na prípad, ak prijímateľ neinformuje riadiaci orgán, ale vráti sumu nezúčtovaného rozdielu platobnej jednotke v uvedenej lehote.
1.2	V prípade, ak prijímateľ nevráti sumu nezúčtovaného rozdielu platobnej jednotke do 5 pracovných dní od ukončenia lehoty na zúčtovanie26 poskytnutej zálohovej platby, o sumu nezúčtovaného rozdielu sa prijímateľovi znižuje nenávratný finančný príspevok. V tomto prípade riadiaci orgán bezodkladne21 o tejto skutočnosti (t. j. prijímateľ nedodržal stanovenú povinnosť a nevrátil sumu nezúčtovaného rozdielu platobnej jednotke) prijímateľa upozorní. Zároveň najneskôr nasledujúci pracovný deň od zistenia mu riadiaci orgán zašle žiadosť o vrátenie finančných prostriedkov a postupuje v zmysle časti 4.5.9. 
2.	V prípade, ak prijímateľ najneskôr do skončenia lehoty na zúčtovanie26 poskytnutej zálohovej platby predložil žiadosť o platbu (zúčtovanie zálohovej platby), avšak riadiaci orgán identifikuje neoprávnené výdavky v predloženej žiadosti o platbu (zúčtovanie zálohovej platby) až po stanovenej lehote na zúčtovanie26 poskytnutej zálohovej platby, a teda reálne nedochádza k zúčtovaniu 100 % z poskytnutej zálohovej platby do stanovenej lehoty na zúčtovanie26 poskytnutej zálohovej platby a ani k vráteniu sumy nezúčtovaného rozdielu (vo výške sumy identifikovaných neoprávnených výdavkov) platobnej jednotke, riadiaci orgán prijímateľa upozorní, aby finančné prostriedky vrátil a zašle prijímateľovi žiadosť o vrátenie finančných prostriedkov (postup v zmysle časti 4.5.9). 2.1	
2.1	V prípade, ak prijímateľ vráti sumu nezúčtovaného rozdielu (vo výške sumy identifikovaných neoprávnených výdavkov) platobnej jednotke v určenej lehote (postup v zmysle časti 4.5.9), o sumu nezúčtovaného rozdielu sa prijímateľovi neznižuje nenávratný finančný príspevok. 
2.2	V prípade, ak prijímateľ nevráti sumu nezúčtovaného rozdielu platobnej jednotke v určenej lehote (postup v zmysle časti 4.5.9), je riadiaci orgán z objektívnych dôvodov oprávnený rozhodnúť, že o sumu nezúčtovaného rozdielu (vo výške sumy identifikovaných neoprávnených výdavkov) sa prijímateľovi znižuje nenávratný finančný príspevok.
3.	V prípade, ak si prijímateľ splnil povinnosť zúčtovať poskytnutú zálohovú platbu, ale počas kontroly žiadosti o platbu (zúčtovanie zálohovej platby) riadiaci orgán identifikuje neoprávnené výdavky, a teda reálne nedochádza k zúčtovaniu26 poskytnutej zálohovej platby, riadiaci orgán vyčísli sumu identifikovaných neoprávnených výdavkov a upozorní na túto skutočnosť prijímateľa. 
Prijímateľ je povinný sumu identifikovaných neoprávnených výdavkov zúčtovať26 predložením novej žiadosti o platbu (zúčtovanie zálohovej platby) s výdavkami minimálne vo výške sumy identifikovaných neoprávnených výdavkov, pri zachovaní povinnosti zúčtovania výšky 100 % z poskytnutej zálohovej platby v lehote najneskôr do ukončenia stanoveného obdobia 9 mesiacov. 
Prijímateľ môže postupovať aj v zmysle bodu 1.1, t. j. informuje riadiaci orgán o nedodržaní zúčtovania zálohovej platby (t. j. nepredložení zúčtovania vo výške sumy identifikovaných neoprávnených výdavkov) a najneskôr do 5 pracovných dní od ukončenia lehoty na zúčtovanie26 poskytnutej zálohovej platby vráti sumu nezúčtovaného rozdielu (vo výške sumy identifikovaných neoprávnených výdavkov) platobnej jednotke. V tomto prípade sa prijímateľovi neznižuje nenávratný finančný príspevok.
V prípade, ak prijímateľ najneskôr do skončenia lehoty na zúčtovanie26 poskytnutej zálohovej platby (9 mesiacov) predložil žiadosť o platbu (zúčtovanie zálohovej platby) s výdavkami minimálne vo výške sumy identifikovaných neoprávnených výdavkov, avšak riadiaci orgán opäť identifikoval neoprávnené výdavky v predloženej žiadosti o platbu (zúčtovanie zálohovej platby) až po stanovenej lehote 9 mesiacov, a teda reálne nedochádza k zúčtovaniu 100 % z poskytnutej zálohovej platby do stanovenej lehoty 9 mesiacov a ani k vráteniu sumy nezúčtovaného rozdielu (vo výške sumy identifikovaných neoprávnených výdavkov) platobnej jednotke, riadiaci orgán prijímateľa upozorní, aby finančné prostriedky vrátil a zašle prijímateľovi žiadosť o vrátenie finančných prostriedkov (postup v zmysle časti 4.5.9). 
3.1	V prípade, ak prijímateľ vráti sumu nezúčtovaného rozdielu (vo výške sumy identifikovaných neoprávnených výdavkov) platobnej jednotke v určenej lehote (postup v zmysle časti 4.5.9), o sumu nezúčtovaného rozdielu sa prijímateľovi neznižuje nenávratný finančný príspevok. 
3.2	V prípade, ak prijímateľ nevráti sumu nezúčtovaného rozdielu platobnej jednotke v určenej lehote (postup v zmysle časti 4.5.9), je riadiaci orgán oprávnený rozhodnúť, že o sumu nezúčtovaného rozdielu (vo výške sumy identifikovaných neoprávnených výdavkov) sa prijímateľovi znižuje nenávratný finančný príspevok.
Riadiaci orgán v zmysle zmluvných podmienok v spolupráci s prijímateľom prijme potrebné opatrenia pre zabezpečenie návratnosti poskytnutých finančných prostriedkov štátneho rozpočtu prostredníctvom zálohovej platby.
Ak dôjde k nedodržaniu podmienok stanovených pre zúčtovanie poskytnutej zálohovej platby, resp. pre vrátenie sumy nezúčtovaného rozdielu poskytnutej zálohovej platby, výnimky zo Systému finančného riadenia štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu na programové obdobie 2014 – 2020 nebudú poskytované.
Poskytnutie zálohovej platby si nevyžaduje súhlas certifikačného orgánu. Certifikačný orgán prevádza prostriedky EÚ platobnej jednotke na základe skutočne čerpaných (zúčtovaných) prostriedkov zo zálohových platieb prijímateľom, zaradených platobnou jednotkou do súhrnnej žiadosti o platbu a schválených certifikačným orgánom.
Presun prostriedkov prijímateľom sa realizuje prostredníctvom platobnej jednotky, ktorá zabezpečí žiadosť o úpravu limitov výdavkov rozpočtu prijímateľa rozpočtovým opatrením na základe žiadosti o platbu (zálohovú platbu). 
Po schválení žiadosti o platbu (zúčtovanie zálohovej platby) platobná jednotka prostredníctvom ISUF upraví evidenciu k poskytnutej zálohovej platbe alebo jej časti v súlade s podpoložkami rozpočtovej klasifikácie uvedenými v žiadosti o platbu (zúčtovanie zálohovej platby), ktoré zodpovedajú reálnemu čerpaniu zálohovej platby alebo jej časti. 
Riadiaci orgán najneskôr do 31. decembra 2015 uchováva originál žiadosti o platbu, originál návrhu správy z kontroly (ak je relevantné), originál správy z kontroly, výpisy z účtov, jeden rovnopis účtovných dokladov alebo kópie18 účtovných dokladov označené podpisom štatutárneho orgánu prijímateľa a jeden rovnopis podpornej dokumentácie k žiadosti o platbu alebo kópie18 podpornej dokumentácie označené podpisom štatutárneho orgánu prijímateľa. 
Platobná jednotka uchováva originál súhrnnej žiadosti o platbu / mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu a formuláre žiadosti o platbu, resp. príslušnú časť formulárov žiadosti o platbu.
6.5	Systém refundácie
Pri systéme refundácie sa finančné prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie preplácajú v pomere stanovenom na projekt na základe skutočne vynaložených výdavkov prijímateľom, tzn. že prijímateľ je povinný realizovať výdavky najskôr z vlastných zdrojov a tie mu budú pri jednotlivých platbách refundované v pomernej výške. Každá platba prijímateľovi z prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie je realizovaná len do výšky súčtu pomeru prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie schváleného na projekt.
Pri predkladaní žiadosti o platbu postupuje prijímateľ rovnako pri všetkých programoch.
1.	Prijímateľ uhradí výdavky z vlastných zdrojov.
2.	Prijímateľ predkladá žiadosť o platbu (priebežná platba) riadiacemu orgánu elektronicky prostredníctvom ITMS a najneskôr do 31. decembra 2015 aj písomne. 
3.	Prijímateľ spolu s formulárom žiadosti o platbu predkladá aj účtovné doklady1 (preukazujúce úhradu výdavku deklarovaného v žiadosti o platbu) a relevantnú podpornú dokumentáciu, ktorej minimálny rozsah stanovuje Systém riadenia európskych štrukturálnych a investičných fondov na programové obdobie 2014 – 2020 a riadiaci orgán. 
4.	Riadiaci orgán vykonáva kontrolu žiadosti o platbu podľa čl. 125 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov a na základe podmienok a postupov pre výkon kontroly žiadosti o platbu definovaných v Systéme riadenia európskych štrukturálnych a investičných fondov na programové obdobie 2014 – 2020. 
V prípade zistenia nedostatkov riadiaci orgán vyzve19 prijímateľa, aby v stanovenej lehote doplnil / zmenil žiadosť o platbu. Lehota na výkon kontroly žiadosti o platbu môže byť riadiacim orgánom pozastavená20.
5.	Riadiaci orgán počas výkonu kontroly žiadosti o platbu vykonáva v prípade potreby aj samostatnú kontrolu vyčlenenej časti deklarovaných výdavkov z predloženej žiadosti o platbu. Samostatná kontrola vyčlenenej časti deklarovaných výdavkov z predloženej žiadosti o platbu sa nevykonáva v prípade žiadosti o platbu vrátenej z platobnej jednotky v zmysle bodu 9a) a 9b). Riadiaci orgán môže počas výkonu samostatnej kontroly vyčlenenej časti deklarovaných výdavkoch vyčleniť z už vyčlenenej časti deklarovaných výdavkov ďalšiu časť deklarovaných výdavkov na samostatnú kontrolu. Podrobnosti výkonu samostatnej kontroly vyčlenenej časti deklarovaných výdavkov z predloženej žiadosti o platbu stanovuje Systém riadenia európskych štrukturálnych a investičných fondov na programové obdobie 2014 – 2020. 
6.	Po vykonaní kontroly žiadosti o platbu riadiaci orgán žiadosť o platbu schváli (schváli deklarované výdavky v plnej výške), žiadosť o platbu schváli v zníženej sume (schváli deklarované výdavky vo výške zníženej o sumu neoprávnených výdavkov), žiadosť o platbu schváli v zníženej sume (schváli deklarované výdavky bez deklarovaných výdavkov, ktoré sú predmetom samostatnej kontroly, resp. schváli deklarované výdavky, ktoré sú predmetom samostatnej kontroly v zmysle postupu podľa bodu 7b), alebo žiadosť o platbu zamietne bezodkladne21, najneskôr však v lehote 25 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od prijímateľa riadiacim orgánom. 
Ukončením výkonu kontroly deklarovaných výdavkov z predloženej žiadosti o platbu (okrem prípadu podľa bodu 7a) sa ku kódu žiadosti o platbu (v rámci časti vypĺňanej riadiacim orgánom) automaticky priraďuje dodatočný číselný identifikátor. V prípade schválenia deklarovaných výdavkov vo vyššie uvedených prípadoch, v stanovenej lehote 25 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od platobnej jednotky v ITMS, riadiaci orgán predkladá platobnej jednotke len príslušnú časť formulára žiadosti o platbu, v rámci ktorej je kód žiadosti o platbu rozšírený o príslušný číselný identifikátor. 
7.	V prípade výkonu samostatnej kontroly vyčlenenej časti deklarovaných výdavkov riadiaci orgán schváli deklarované výdavky, ktoré boli predmetom samostatnej kontroly v plnej výške, schváli deklarované výdavky, ktoré boli predmetom samostatnej kontroly vo výške zníženej o sumu neoprávnených výdavkov, schváli deklarované výdavky, ktoré boli predmetom samostatnej kontroly vo výške zníženej o sumu deklarovaných výdavkov, ktoré sú predmetom ďalšej samostatnej kontroly, schvaľovanie pozastaví20 alebo zamietne bezodkladne21, najneskôr však v lehote 25 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od prijímateľa riadiacim orgánom, pričom v prípade, ak samostatná kontrola vyčlenenej časti deklarovaných výdavkov:
a)	je ukončená pred alebo súčasne s ukončením kontroly deklarovaných výdavkov, ktoré neboli vyčlenené na samostatnú kontrolu, riadiaci orgán deklarované výdavky, ktoré neboli vyčlenené na samostatnú kontrolu a deklarované výdavky, ktoré boli vyčlenené na samostatnú kontrolu schváli v plnej výške, prípadne schváli v zníženej výške v lehote stanovenej na výkon kontroly (25 pracovných dní). V tomto prípade riadiaci orgán predkladá platobnej jednotke len príslušnú časť formulára žiadosti o platbu, v ktorom identifikuje všetky oprávnené deklarované výdavky. Ku kódu žiadosti o platbu (v rámci žiadosti o platbu vypĺňanej riadiacim orgánom) je v tomto prípade automaticky priraďovaný len jeden číselný identifikátor.
b)	je ukončená po ukončení kontroly deklarovaných výdavkov, ktoré neboli vyčlenené na samostatnú kontrolu, riadiaci orgán, v lehote stanovenej na výkon kontroly (25 pracovných dní), predkladá platobnej jednotke príslušnú časť formulára žiadosti o platbu, v ktorom identifikuje oprávnené deklarované výdavky, ktoré boli vyčlenené na samostatnú kontrolu;
V každom z uvedených prípadov predkladá riadiaci orgán platobnej jednotke príslušnú časť formulára žiadosti o platbu, v ktorej sa uvádza výška schválených výdavkov na preplatenie platobnou jednotkou. 
8.	Riadiaci orgán v prípade vrátenia žiadosti o platbu z platobnej jednotky v zmysle:
a)	bodu 9a) vykoná kontrolu žiadosti o platbu podľa čl. 125 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov a na základe podmienok a postupov pre výkon kontroly žiadosti o platbu definovaných v Systéme riadenia európskych štrukturálnych a investičných fondov na programové obdobie 2014 – 2020. 
Riadiaci orgán počas výkonu kontroly žiadosti o platbu môže schvaľovanie žiadosti o platbu pozastaviť20. 
Po vykonaní kontroly žiadosti o platbu riadiaci orgán žiadosť o platbu schváli (schváli deklarované výdavky v plnej výške), žiadosť o platbu schváli v zníženej sume (schváli deklarované výdavky vo výške zníženej o sumu neoprávnených výdavkov), alebo žiadosť o platbu zamietne bezodkladne21, najneskôr však v lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od platobnej jednotky v ITMS a po schválení žiadosti o platbu vo vyššie uvedených prípadoch, v stanovenej lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od platobnej jednotky v ITMS, riadiaci orgán predloží príslušnú časť formulára žiadosti o platbu platobnej jednotke, ktorá postupuje v zmysle bodu 9a).
b)	bodu 9b) a 9c) ii v prípade zistených nedostatkov, ktoré majú vplyv na výšku a / alebo oprávnenosť výdavkov vykoná kontrolu žiadosti o platbu podľa čl. 125 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov a na základe podmienok a postupov pre výkon kontroly žiadosti o platbu definovaných v Systéme riadenia európskych štrukturálnych a investičných fondov na programové obdobie 2014 – 2020. V rámci nedostatkov bez vplyvu na výšku a / alebo oprávnenosť výdavkov sa uplatňuje bod 30 časti 3.2. 
Riadiaci orgán počas výkonu kontroly žiadosti o platbu môže schvaľovanie žiadosti o platbu pozastaviť20. 
Po vykonaní kontroly žiadosti o platbu riadiaci orgán žiadosť o platbu schváli (schváli deklarované výdavky v plnej výške), žiadosť o platbu schváli v zníženej sume (schváli deklarované výdavky vo výške zníženej o sumu neoprávnených výdavkov), alebo žiadosť o platbu zamietne bezodkladne21, najneskôr však v lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od platobnej jednotky v ITMS a po schválení žiadosti o platbu vo vyššie uvedených prípadoch, v stanovenej lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od platobnej jednotky v ITMS, riadiaci orgán predloží príslušnú časť formulára žiadosti o platbu platobnej jednotke, ktorá postupuje v zmysle bodu 9b).
9.	Platobná jednotka zostavuje súhrnnú žiadosť o platbu / mimoriadnu súhrnnú žiadosť o platbu zostavenú zo žiadostí o platbu, pričom pri:
a)	žiadosti o platbu (priebežná platba) predloženej riadiacim orgánom v zmysle bodu 6 a 8a) vykoná kontrolu žiadosti o platbu v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov do 5 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu v ITMS. Platobná jednotka rovnako overí súlad deklarovanej sumy so schváleným rozpočtom platobnej jednotky. Následne v stanovenej lehote schváli alebo neschváli žiadosť o platbu. V prípade jej schválenia platobná jednotka zahrnie sumu do nasledovnej súhrnnej žiadosti o platbu a v intervale dvakrát do mesiaca podľa stanovených termínov predkladá spolu s čiastkovým výkazom výdavkov certifikačnému orgánu prostredníctvom ITMS. V prípade neschválenia žiadosti o platbu, vracia predmetnú žiadosť o platbu v stanovenej lehote 5 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu v ITMS riadiacemu orgánu, ktorý postupuje podľa bodu 8a);
b)	žiadosti o platbu (priebežná platba) predloženej riadiacim orgánom v zmysle bodu 8b) vykoná kontrolu žiadosti o platbu v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov do 3 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu v ITMS a v tejto lehote žiadosť o platbu schváli alebo neschváli. Po schválení žiadosti o platbu platobná jednotka najneskôr nasledujúci pracovný deň, resp. podľa postupov a termínov stanovených certifikačným orgánom, zahrnie predmetnú žiadosť o platbu do mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu, ktorú predkladá certifikačnému orgánu nasledujúci pracovný deň po jej zostavení. Certifikačný orgán následne postupuje podľa bodov B.10 až B.12. V prípade neschválenia žiadosti o platbu, vracia predmetnú žiadosť o platbu v stanovenej lehote 3 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu v ITMS riadiacemu orgánu, ktorý postupuje podľa bodu 8b);
c)	žiadosti o platbu (priebežná platba) vrátenej z certifikačného orgánu v zmysle bodu A.12 a A.13 za účelom odstránenia identifikovaných nedostatkov:
i.	v prípade, ak sa dôvody vrátenia žiadosti o platbu z certifikačného orgánu týkajú úrovne platobnej jednotky, platobná jednotka odstráni zistené nedostatky na svojej úrovni a najneskôr nasledujúci pracovný deň, resp. podľa postupov a termínov stanovených certifikačným orgánom, zahrnie predmetnú žiadosť o platbu do mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu, ktorú predkladá certifikačnému orgánu najneskôr nasledujúci pracovný deň po jej zostavení. Certifikačný orgán následne postupuje podľa bodov B.10 až B.12,
ii.	v prípade, ak sa dôvody vrátenia žiadosti o platbu z certifikačného orgánu týkajú úrovne riadiaceho orgánu, platobná jednotka najneskôr nasledujúci pracovný deň po prijatí žiadosti o platbu z certifikačného orgánu vracia predmetnú žiadosť o platbu riadiacemu orgánu, ktorý postupuje podľa bodu 8b);
d)	žiadosti o platbu (priebežná platba) (v rámci ktorej boli výdavky schválené certifikačným orgánom v plnej výške) vrátenej z certifikačného orgánu v zmysle bodu A.13 za účelom zaradenia do mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu po prijatí informácie o záveroch certifikačného overovania platobná jednotka zahrnie predmetnú žiadosť o platbu najneskôr nasledujúci pracovný deň, resp. podľa postupov a termínov stanovených certifikačným orgánom do mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu, ktorú predkladá certifikačnému orgánu najneskôr nasledujúci pracovný deň po jej zostavení. Certifikačný orgán následne postupuje podľa bodov B.10 až B.12.
A.	Postup overenia súhrnnej žiadosti o platbu certifikačným orgánom:
A.10.V prípade predloženej súhrnnej žiadosti o platbu certifikačný orgán vykoná overenie na svojej úrovni, ktoré zahrňuje administratívne overenie, prípadne certifikačné overovanie. Taktiež overuje súhrnnú žiadosť o platbu z hľadiska neprekročenia / dodržania celkovej alokácie podľa prioritných osí na základe čiastkového výkazu výdavkov predloženého platobnou jednotkou. V prípade potreby si od riadiaceho orgánu alebo platobnej jednotky vyžiadava ďalšie informácie nevyhnutné pre posúdenie predloženej súhrnnej žiadosti o platbu.
A.11.Ak certifikačný orgán na svojej úrovni vykoná overenie žiadosti o platbu zaradenej do súhrnnej žiadosti o platbu a toto overenie žiadosti o platbu:
a)	je ukončené v lehote na overenie súhrnnej žiadosti o platbu, postupuje certifikačný orgán ďalej podľa bodu A.12,
b)	nie je ukončené v lehote na overenie súhrnnej žiadosti o platbu, postupuje certifikačný orgán ďalej podľa bodu A.13.
A.12.Certifikačný orgán do 10 pracovných dní od prijatia súhrnnej žiadosti o platbu certifikačný orgánom súhrnnú žiadosť o platbu schváli v plnej výške, schváli v zníženej výške o sumu žiadosti o platbu, v ktorej boli v rámci overovania certifikačným orgánom zistené nedostatky, schváli v zníženej výške o sumu žiadosti o platbu, ktorá je predmetom overovania, schvaľovanie pozastaví23 alebo neschváli . Žiadosť o platbu, v rámci ktorej boli zistené nedostatky, ktoré majú vplyv na výšku a / alebo oprávnenosť výdavkov certifikačný orgán vráti platobnej jednotke, ktorá následne postupuje podľa bodu 9c) a súhrnnú žiadosť o platbu certifikačný orgán schvaľuje v zníženej výške. 
A.13.Certifikačný orgán do 15 pracovných dní od prijatia súhrnnej žiadosti o platbu ukončí overovanie žiadosti o platbu zo súhrnnej žiadosti o platbu, ktorá bola schválená v zníženej výške v zmysle bodu A.12 (súhrnná žiadosť o platbu schválená v zníženej výške o sumu žiadosti o platbu, ktorá je predmetom overovania) a informuje platobnú jednotku o záveroch certifikačného overovania, v nadväznosti na ktoré platobná jednotka postupuje v zmysle bodu 9c) alebo 9d).
A.14.Certifikačný orgán v deň schválenia súhrnnej žiadosti o platbu a po jej spracovaní v ITMS informuje platobnú jednotku a v závislosti od zostatku na mimorozpočtovom účte prevádza prostriedky EÚ na príslušný príjmový účet platobnej jednotky.
A.15.Platobná jednotka je oprávnená ihneď, najneskôr však do 3 pracovných dní po prijatí informácie o schválení súhrnnej žiadosti o platbu certifikačným orgánom, zadať platobné príkazy na prevod prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie prijímateľovi.
B.	Postup overenia mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu certifikačným orgánom:
B.10.V prípade predloženej mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu certifikačný orgán vykoná overenie na svojej úrovni, ktoré zahrňuje len administratívne overenie. Taktiež overuje mimoriadnu súhrnnú žiadosť o platbu z hľadiska neprekročenia / dodržania celkovej alokácie podľa prioritných osí na základe čiastkového výkazu výdavkov predloženého platobnou jednotkou.
B.11.Certifikačný orgán mimoriadnu súhrnnú žiadosť o platbu schváli alebo neschváli do 7 pracovných dní od prijatia mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu.
B.12.Certifikačný orgán v deň schválenia mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu a po jej spracovaní v ITMS informuje platobnú jednotku a v závislosti od zostatku na mimorozpočtovom účte prevádza prostriedky EÚ na príslušný príjmový účet platobnej jednotky.
B.13.Platobná jednotka je oprávnená ihneď, najneskôr však do 3 pracovných dní po prijatí informácie o schválení mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu certifikačným orgánom, zadať platobné príkazy na prevod prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie prijímateľovi.
Riadiaci orgán najneskôr do 31. decembra 2015 uchováva originál žiadosti o platbu, originál návrhu správy z kontroly (ak je relevantné), originál správy z kontroly, výpisy z účtov, jeden rovnopis účtovných dokladov alebo kópie18 účtovných dokladov označené podpisom štatutárneho orgánu prijímateľa a jeden rovnopis podpornej dokumentácie k žiadosti o platbu alebo kópie18 podpornej dokumentácie označené podpisom štatutárneho orgánu prijímateľa. 
Platobná jednotka uchováva originál súhrnnej žiadosti o platbu / mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu a formuláre žiadosti o platbu, resp. príslušnú časť formulárov žiadosti o platbu.
6.6	Systém refundácie Programov Interreg V-A SK – CZ, Interreg V-A SK – AT a Interreg V-A SK – HU
Pre projekty projektových partnerstiev v rámci programov cieľa Európska územná spolupráca platia špecifiká stanovené nariadením Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1299/2013. 
Prostriedky EÚ (Európskeho fondu regionálneho rozvoja) platobná jednotka poskytuje hlavným prijímateľom zo Slovenskej republiky / Českej republiky / Rakúskej spolkovej republiky / Maďarska v pomere stanovenom na projekt na základe skutočne vynaložených výdavkov partnerstva. Jednotliví partneri sú povinní realizovať výdavky najskôr z vlastných zdrojov, ktoré sú následne hlavnému prijímateľovi refundované v pomernej výške. 
Každá platba hlavnému prijímateľovi zo Slovenskej republiky / Českej republiky / Rakúskej spolkovej republiky / Maďarska z prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie / národných príspevkov na spolufinancovanie je následne realizovaná prostredníctvom platobnej jednotky / orgánu zabezpečujúceho úhradu národného príspevku na spolufinancovanie v Českej republike / Rakúskej spolkovej republike / Maďarsku len do výšky súčtu pomerov prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie / národných príspevkov na spolufinancovanie schváleného projektu.
Pre prijímateľov (hlavných prijímateľov) v rámci Programu Interreg V-A SK – CZ, Programu Interreg V-A SK – AT a Programu Interreg V-A SK – HU, pri ktorom vystupuje Slovenská republika ako riadiaci orgán aj certifikačný orgán, platia nasledovné zásady:
-	projekty alebo operácie v rámci programu zahrňujú prijímateľov (partnerov) z oboch štátov, s výnimkou projektov technickej pomoci a v prípade, ak je prijímateľom európske zoskupenie územnej spolupráce, 
-	jeden z prijímateľov projektu je určený za hlavného prijímateľa, ktorý takto v mene celého projektového partnerstva vystupuje a nesie zodpovednosť za celú realizáciu projektu.
Zmluvy o poskytnutí nenávratného finančného príspevku s hlavnými prijímateľmi uzatvára riadiaci orgán. Každá zmluva o poskytnutí nenávratného finančného príspevku obsahuje rozpočet projektu v EUR vrátane rozpočtov jednotlivých partnerov.
Pri predkladaní žiadosti o platbu (priebežná platba) postupuje hlavný prijímateľ / partner zo Slovenskej republiky / Českej republiky / Rakúskej spolkovej republiky / Maďarska nasledovne:
1.	Hlavný prijímateľ / partner zo Slovenskej republiky / Českej republiky / Rakúskej spolkovej republiky / Maďarska uhradí záväzky dodávateľovi / zhotoviteľovi z vlastných zdrojov.
2.	Hlavný prijímateľ / partner zo Slovenskej republiky / Českej republiky / Rakúskej spolkovej republiky / Maďarska elektronicky predkladá riadiacemu orgánu / zodpovednému subjektu určenému na národnej úrovni zoznam deklarovaných výdavkov v intervaloch stanovených riadiacim orgánom a za podmienok splnenia minimálnej výšky oprávnených výdavkov stanovenej riadiacim orgánom / zodpovedným subjektom určeným na národnej úrovni. 
3.	Hlavný prijímateľ / partner zo Slovenskej republiky / Českej republiky / Rakúskej spolkovej republiky / Maďarska elektronicky predkladá spolu so zoznamom deklarovaných výdavkov aj účtovné doklady1 (preukazujúce úhradu výdavkov) a relevantnú podpornú dokumentáciu, ktorej minimálny rozsah stanovuje Systém riadenia európskych štrukturálnych a investičných fondov na programové obdobie 2014 – 2020, resp. relevantnú podpornú dokumentáciu v súlade s usmernením riadiaceho orgánu / zodpovedného subjektu určeného na národnej úrovni.
4.	Riadiaci orgán / zodpovedný subjekt určený na národnej úrovni vykonáva kontrolu zoznamu deklarovaných výdavkov podľa čl. 23 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1299/2013 a v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov (ustanovenia zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov sa nevzťahujú na zodpovedný subjekt určený na národnej úrovni v Českej republike / Rakúskej spolkovej republike / Maďarsku) a na základe podmienok a postupov pre výkon kontroly zoznamu deklarovaných výdavkov definovaných Systémom riadenia európskych štrukturálnych a investičných fondov na programové obdobie 2014 – 2020, resp. v súlade s usmernením riadiaceho orgánu / zodpovedného subjektu určeného na národnej úrovni. 
V prípade zistenia nedostatkov v zozname deklarovaných výdavkov riadiaci orgán / zodpovedný subjekt na národnej úrovni vyzve hlavného prijímateľa / partnera, aby v stanovenej lehote odstránil nedostatky. Lehota na výkon kontroly zoznamu deklarovaných výdavkov môže byť riadiacim orgánom / zodpovedným subjektom určeným na národnej úrovni pozastavená. 
5.	Po vykonaní kontroly riadiaci orgán / zodpovedný subjekt určený na národnej úrovni výdavky deklarované hlavným prijímateľom / partnerom schváli (schváli deklarované výdavky v plnej výške), schváli v zníženej sume (schváli deklarované výdavky vo výške zníženej o sumu neoprávnených výdavkov), alebo zamietne bezodkladne21, najneskôr však v lehote do 90 kalendárnych dní od prijatia zoznamu deklarovaných výdavkov. Po schválení zoznamu deklarovaných výdavkov vo vyššie uvedených prípadoch v stanovenej lehote 90 kalendárnych dní od prijatia zoznamu deklarovaných výdavkov riadiaci orgán / zodpovedný subjekt určený na národnej úrovni zašle hlavnému prijímateľovi / partnerovi schválený zoznam deklarovaných výdavkov. Partner dva rovnopisy zoznamu deklarovaných výdavkov bezodkladne21 zašle hlavnému prijímateľovi.
6.	Hlavný prijímateľ na základe schválených zoznamov deklarovaných výdavkov od partnera zostaví žiadosť o platbu a zostavenú žiadosť o platbu spolu so schválenými zoznamami deklarovaných výdavkov predkladá riadiacemu orgánu elektronicky prostredníctvom ITMS a najneskôr do 31. decembra 2015 aj písomne za dodržania podmienok uvedených v bode 2.
7.	Riadiaci orgán vykoná kontrolu žiadosti o platbu podľa čl. 125 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov a na základe podmienok a postupu výkonu kontroly projektu definovaných v Systéme riadenia európskych štrukturálnych a investičných fondov na programové obdobie 2014 – 2020, resp. v súlade s ustanoveniami riadiaceho orgánu (skontroluje, či výdavky projektu boli uplatnené v súlade so zmluvou o poskytnutí nenávratného finančného príspevku). 
V prípade zistenia nedostatkov riadiaci orgán vyzve19 hlavného prijímateľa, aby v stanovenej lehote doplnil / zmenil žiadosť o platbu. Lehota na výkon kontroly žiadosti o platbu môže byť riadiacim orgánom pozastavená20.
Po vykonaní kontroly žiadosti o platbu riadiaci orgán žiadosť o platbu schváli (schváli deklarované výdavky v plnej výške), žiadosť o platbu schváli v zníženej sume (schváli deklarované výdavky vo výške zníženej o sumu neoprávnených výdavkov), alebo žiadosť o platbu zamietne bezodkladne21, najneskôr však v lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od hlavného prijímateľa riadiacim orgánom. Po schválení žiadosti o platbu vo vyššie uvedených prípadoch, v stanovenej lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od hlavného prijímateľa riadiacim orgánom, riadiaci orgán predloží príslušnú časť formulára žiadosti o platbu platobnej jednotke, ktorá postupuje v zmysle bodu 9a) 
8.	Riadiaci orgán v prípade vrátenia žiadosti o platbu z platobnej jednotky v zmysle:
a)	bodu 9a) vykoná kontrolu žiadosti o platbu podľa čl. 125 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov a na základe podmienok a postupov pre výkon kontroly žiadosti o platbu definovaných v Systéme riadenia európskych štrukturálnych a investičných fondov na programové obdobie 2014 – 2020, resp. v súlade s usmernením riadiaceho orgánu. 
Riadiaci orgán počas výkonu kontroly žiadosti o platbu môže schvaľovanie žiadosti o platbu pozastaviť20. 
Po vykonaní kontroly žiadosti o platbu riadiaci orgán žiadosť o platbu schváli (schváli deklarované výdavky v plnej výške), žiadosť o platbu schváli v zníženej sume (schváli deklarované výdavky vo výške zníženej o sumu neoprávnených výdavkov), alebo žiadosť o platbu zamietne bezodkladne21, najneskôr však v lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od platobnej jednotky v ITMS a po schválení žiadosti o platbu vo vyššie uvedených prípadoch, v stanovenej lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od platobnej jednotky v ITMS, riadiaci orgán predloží príslušnú časť formulára žiadosti o platbu platobnej jednotke, ktorá postupuje v zmysle bodu 9a).
b)	bodu 9b) a 9c) ii v prípade zistených nedostatkov, ktoré majú vplyv na výšku a / alebo oprávnenosť výdavkov vykoná kontrolu žiadosti o platbu podľa čl. 125 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov a na základe podmienok a postupov pre výkon kontroly žiadosti o platbu definovaných v Systéme riadenia európskych štrukturálnych a investičných fondov na programové obdobie 2014 – 2020, resp. v súlade s usmernením riadiaceho orgánu. V rámci nedostatkov bez vplyvu na výšku a / alebo oprávnenosť výdavkov sa uplatňuje bod 30 časti 3.2 Systému finančného riadenia štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu na programové obdobie 2014 – 2020.
Riadiaci orgán počas výkonu kontroly žiadosti o platbu môže schvaľovanie žiadosti o platbu pozastaviť20. 
Po vykonaní kontroly žiadosti o platbu riadiaci orgán žiadosť o platbu schváli (schváli deklarované výdavky v plnej výške), žiadosť o platbu schváli v zníženej sume (schváli deklarované výdavky vo výške zníženej o sumu neoprávnených výdavkov), alebo žiadosť o platbu zamietne bezodkladne21, najneskôr však v lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od platobnej jednotky v ITMS a po schválení žiadosti o platbu vo vyššie uvedených prípadoch, v stanovenej lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od platobnej jednotky v ITMS, riadiaci orgán predloží príslušnú časť formulára žiadosti o platbu platobnej jednotke, ktorá postupuje v zmysle bodu 9b).
9.	Platobná jednotka zostavuje súhrnnú žiadosť o platbu / mimoriadnu súhrnnú žiadosť o platbu zo žiadostí o platbu, pričom pri:
a)	žiadosti o platbu (priebežná platba) predloženej riadiacim orgánom v zmysle bodu 7 a 8a) vykoná kontrolu žiadosti o platbu v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov do 5 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu v ITMS. Platobná jednotka overí súlad deklarovanej sumy so schváleným rozpočtom platobnej jednotky. Následne v stanovenej lehote schváli alebo neschváli žiadosť o platbu. V prípade jej schválenia platobná jednotka zahrnie sumu do nasledovnej súhrnnej žiadosti o platbu a v intervale dvakrát do mesiaca podľa stanovených termínov certifikačným orgánom predkladá súhrnnú žiadosť o platbu spolu s čiastkovým výkazom výdavkov certifikačnému orgánu prostredníctvom ITMS. V prípade neschválenia žiadosti o platbu, vracia predmetnú žiadosť o platbu v stanovenej lehote 5 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu v ITMS riadiacemu orgánu, ktorý postupuje podľa bodu 8a);
b)	žiadosti o platbu (priebežná platba) predloženej riadiacim orgánom v zmysle bodu 8b) vykoná kontrolu žiadosti o platbu v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov do 3 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu v ITMS a v tejto lehote žiadosť o platbu schváli alebo neschváli. Po schválení žiadosti o platbu platobná jednotka najneskôr nasledujúci pracovný deň, resp. podľa postupov a termínov stanovených certifikačným orgánom, zahrnie predmetnú žiadosť o platbu do mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu, ktorú predkladá certifikačnému orgánu najneskôr nasledujúci pracovný deň po jej zostavení. Certifikačný orgán následne postupuje podľa bodov B.10 až B.12. V prípade neschválenia žiadosti o platbu, vracia predmetnú žiadosť o platbu v stanovenej lehote 3 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu v ITMS riadiacemu orgánu, ktorý postupuje podľa bodu 8b);
c)	žiadosti o platbu (priebežná platba) vrátenej z certifikačného orgánu v zmysle bodu A.12 a A.13 za účelom odstránenia identifikovaných nedostatkov: 
i.	v prípade, ak sa dôvody vrátenia žiadosti o platbu z certifikačného orgánu týkajú úrovne platobnej jednotky, platobná jednotka odstráni zistené nedostatky na svojej úrovni a najneskôr nasledujúci pracovný deň, resp. podľa postupov a termínov stanovených certifikačným orgánom, zahrnie predmetnú žiadosť o platbu do mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu, ktorú predkladá certifikačnému orgánu najneskôr nasledujúci pracovný deň po jej zostavení. Certifikačný orgán následne postupuje podľa bodov B.10 až B.12;
ii.	v prípade, ak sa dôvody vrátenia žiadosti o platbu z certifikačného orgánu týkajú úrovne riadiaceho orgánu, platobná jednotka najneskôr nasledujúci pracovný deň po prijatí žiadosti o platbu z certifikačného orgánu vracia predmetnú žiadosť o platbu riadiacemu orgánu, ktorý postupuje podľa bodu 8b);
d)	žiadosti o platbu (priebežná platba) (v rámci ktorej boli výdavky schválené certifikačným orgánom v plnej výške) vrátenej z certifikačného orgánu v zmysle bodu A.13 za účelom zaradenia do mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu po prijatí informácie o záveroch certifikačného overovania platobná jednotka zahrnie predmetnú žiadosť o platbu najneskôr nasledujúci pracovný deň, resp. podľa postupov a termínov stanovených certifikačným orgánom do mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu, ktorú predkladá certifikačnému orgánu najneskôr nasledujúci pracovný deň po jej zostavení. Certifikačný orgán následne postupuje podľa bodov B.10 až B.12.
A. Postup overenia súhrnnej žiadosti o platbu certifikačným orgánom:
A.10.V prípade predloženej súhrnnej žiadosti o platbu certifikačný orgán vykoná overenie na svojej úrovni, ktoré zahrňuje administratívne overenie, prípadne certifikačné overovanie. Taktiež overuje súhrnnú žiadosť o platbu z hľadiska neprekročenia / dodržania celkovej alokácie podľa prioritných osí na základe čiastkového výkazu výdavkov predloženého platobnou jednotkou. 
A.11.Ak certifikačný orgán na svojej úrovni vykoná overenie žiadosti o platbu zaradenej do súhrnnej žiadosti o platbu a toto overenie žiadosti o platbu:
a)	je ukončené v lehote na overenie súhrnnej žiadosti o platbu, postupuje certifikačný orgán ďalej podľa bodu A.12,
b)	nie je ukončené v lehote na overenie súhrnnej žiadosti o platbu, postupuje certifikačný orgán ďalej podľa bodu A.13.
A.12.Certifikačný orgán do 10 pracovných dní od prijatia súhrnnej žiadosti o platbu súhrnnú žiadosť o platbu schváli v plnej výške, schváli v zníženej výške o sumu žiadosti o platbu, v ktorej boli v rámci overovania certifikačným orgánom zistené nedostatky, schváli v zníženej výške o sumu žiadosti o platbu, ktorá je predmetom overovania, schvaľovanie pozastaví23 alebo neschváli. Žiadosť o platbu, v rámci ktorej boli zistené nedostatky, ktoré majú vplyv na výšku a / alebo oprávnenosť výdavkov certifikačný orgán vráti platobnej jednotke, ktorá postupuje podľa bodu 9c) a súhrnnú žiadosť o platbu certifikačný orgán schvaľuje v zníženej výške. 
A.13.Certifikačný orgán do 15 pracovných dní od prijatia súhrnnej žiadosti o platbu ukončí overovanie žiadosti o platbu zo súhrnnej žiadosti o platbu, ktorá bola schválená v zníženej výške v zmysle bodu A.12 (súhrnná žiadosť o platbu schválená v zníženej výške o sumu žiadosti o platbu, ktorá je predmetom overovania) a informuje platobnú jednotku o záveroch certifikačného overovania, v nadväznosti na ktoré platobná jednotka postupuje v zmysle bodu 9c) alebo 9d).
A.14.Certifikačný orgán v deň schválenia súhrnnej žiadosti o platbu a po jej spracovaní v ITMS informuje o schválení súhrnnej žiadosti o platbu platobnú jednotku v Slovenskej republike. 
A.15Platobná jednotka v Slovenskej republike je oprávnená ihneď, najneskôr do 3 pracovných dní po prijatí informácie o schválení súhrnnej žiadosti o platbu, zadať platobné príkazy na úhradu prostriedkov EÚ z rozpočtových výdavkov (z výdavkového účtu) priamo na účet hlavného prijímateľa zo Slovenskej republiky / Českej republiky / Rakúskej spolkovej republiky / Maďarska. V prípade hlavného prijímateľa zo Slovenskej republiky (štátna rozpočtová organizácia) platobná jednotka zabezpečí žiadosť o prevod prostriedkov EÚ rozpočtovým opatrením, prostredníctvom úpravy limitov výdavkov. Hlavný prijímateľ zo Slovenskej republiky / Českej republiky / Rakúskej spolkovej republiky / Maďarska je na základe písomnej zmluvy s projektovým partnerom zodpovedný za ďalší prevod prostriedkov EÚ svojim projektovým partnerom (v prípade ich existencie). 
	Zároveň, v prípade hlavného prijímateľa zo Slovenskej republiky platobná jednotka zadá platobné príkazy na úhradu prostriedkov štátneho rozpočtu z rozpočtových výdavkov (výdavkového účtu) na spolufinancovanie priamo na účet hlavného prijímateľa zo Slovenskej republiky. V prípade hlavného prijímateľa zo Slovenskej republiky (štátna rozpočtová organizácia) platobná jednotka zabezpečí žiadosť o prevod prostriedkov rozpočtovým opatrením, prostredníctvom úpravy limitov výdavkov za prostriedky štátneho rozpočtu na spolufinancovanie. Hlavný prijímateľ zo Slovenskej republiky je na základe písomnej zmluvy s projektovým partnerom zodpovedný za ďalší prevod prostriedkov štátneho rozpočtu na spolufinancovanie svojim projektovým partnerom zo Slovenskej republiky (v prípade ich existencie).
	V prípade, ak je viac projektových partnerov zo Slovenskej republiky a títo majú hlavného prijímateľa z Českej republiky / Rakúskej spolkovej republiky / Maďarska dochádza k prevodu prostriedkov v zmysle zmluvy o spolufinancovaní. Platobná jednotka zabezpečuje prevod prostriedkov štátneho rozpočtu na spolufinancovanie hlavnému cezhraničnému partnerovi a ten ich následne na základe písomných zmlúv s projektovými partnermi prevedie ostatným partnerom zo Slovenskej republiky. O prevode finančných prostriedkov hlavnému cezhraničnému partnerovi zo Slovenskej republiky platobná jednotka do 3 pracovných dní informuje hlavného prijímateľa Českej republiky / Rakúskej spolkovej republiky / Maďarska a orgán zabezpečujúci úhradu národného príspevku na spolufinancovanie v Českej republike / Rakúskej spolkovej republike / Maďarsku.
	Prevod národných príspevkov na spolufinancovanie hlavnému prijímateľovi z Českej republike / Rakúskej spolkovej republike / Maďarska zabezpečuje orgán zabezpečujúci úhradu národného spolufinancovania v Českej republike / Rakúskej spolkovej republike / Maďarsku.
A.16.Certifikačný orgán spravidla v lehote 10 pracovných dní od schválenia súhrnnej žiadosti o platbu, resp. v závislosti od zostatku na mimorozpočtovom účte prevádza prostriedky EÚ na príslušný príjmový účet platobnej jednotky v Slovenskej republike.
A.17.Hlavný prijímateľ a hlavný cezhraničný partner sú povinní pri každej nasledujúcej žiadosti o platbu, resp. najneskôr pri žiadosti o platbu (s príznakom záverečná) predložiť výpisy z účtu preukazujúce prevod prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie jednotlivým partnerom projektu.
B. Postup overenia mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu certifikačným orgánom:
B.10.V prípade predloženej mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu certifikačný orgán vykoná overenie na svojej úrovni, ktoré zahrňuje len administratívne overenie. Taktiež overuje mimoriadnu súhrnnú žiadosť o platbu z hľadiska neprekročenia / dodržania celkovej alokácie podľa prioritných osí na základe čiastkového výkazu výdavkov predloženého platobnou jednotkou.
B.11.Certifikačný orgán mimoriadnu súhrnnú žiadosť o platbu schváli alebo neschváli do 7 pracovných dní od prijatia mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu.
B.12.Certifikačný orgán v deň schválenia mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu a po jej spracovaní v ITMS informuje o schválení mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu platobnú jednotku.
B.13.Platobná jednotka v Slovenskej republike je oprávnená ihneď, najneskôr do 3 pracovných dní po prijatí informácie o schválení mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu, zadať platobné príkazy na úhradu prostriedkov EÚ z rozpočtových výdavkov (z výdavkového účtu) priamo na účet hlavného prijímateľa zo Slovenskej republiky / Českej republiky / Rakúskej spolkovej republiky / Maďarska. V prípade hlavného prijímateľa zo Slovenskej republiky (štátna rozpočtová organizácia) platobná jednotka zabezpečí žiadosť o prevod prostriedkov EÚ rozpočtovým opatrením, prostredníctvom úpravy limitov výdavkov. Hlavný prijímateľ zo Slovenskej republiky / Českej republiky / Rakúskej spolkovej republiky / Maďarska je na základe písomnej zmluvy s projektovým partnerom zodpovedný za ďalší prevod prostriedkov EÚ svojim projektovým partnerom (v prípade ich existencie).
	Zároveň, v prípade hlavného prijímateľa zo Slovenskej republiky platobná jednotka zadá platobné príkazy na úhradu prostriedkov štátneho rozpočtu z rozpočtových výdavkov (výdavkového účtu) na spolufinancovanie priamo na účet hlavného prijímateľa zo Slovenskej republiky. V prípade hlavného prijímateľa zo Slovenskej republiky (štátna rozpočtová organizácia) platobná jednotka zabezpečí žiadosť o prevod prostriedkov rozpočtovým opatrením, prostredníctvom úpravy limitov výdavkov za prostriedky štátneho rozpočtu na spolufinancovanie. Hlavný prijímateľ zo Slovenskej republiky je na základe písomnej zmluvy s projektovým partnerom zodpovedný za ďalší prevod prostriedkov štátneho rozpočtu na spolufinancovanie svojim projektovým partnerom zo Slovenskej republiky (v prípade ich existencie).
	V prípade, ak je viac projektových partnerov zo Slovenskej republiky a títo majú hlavného prijímateľa z Českej republiky / Rakúskej spolkovej republiky / Maďarska dochádza k prevodu prostriedkov v zmysle zmluvy o spolufinancovaní. Platobná jednotka zabezpečuje prevod prostriedkov štátneho rozpočtu na spolufinancovanie hlavnému cezhraničnému partnerovi a ten ich následne na základe písomných zmlúv s projektovými partnermi prevedie ostatným partnerom zo Slovenskej republiky. O prevode finančných prostriedkov hlavnému cezhraničnému partnerovi zo Slovenskej republiky platobná jednotka 3 pracovných dní informuje hlavného prijímateľa Českej republiky / Rakúskej spolkovej republiky / Maďarska a orgán zabezpečujúci úhradu národného príspevku na spolufinancovanie v Českej republike / Rakúskej spolkovej republike / Maďarsku.
	Prevod národných príspevkov na spolufinancovanie hlavnému prijímateľovi z Českej republike / Rakúskej spolkovej republike / Maďarska zabezpečuje orgán zabezpečujúci úhradu národného spolufinancovania v Českej republike / Rakúskej spolkovej republike / Maďarsku.
B.14.Certifikačný orgán spravidla v lehote 10 pracovných dní od schválenia mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu, resp. v závislosti od zostatku na mimorozpočtovom účte prevádza prostriedky EÚ na príslušný príjmový účet platobnej jednotky v Slovenskej republike.
B.15.Hlavný prijímateľ a hlavný cezhraničný partner sú povinní pri každej nasledujúcej žiadosti o platbu, resp. najneskôr pri žiadosti o platbu (s príznakom záverečná) predložiť výpisy z účtu preukazujúce prevod prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie jednotlivým partnerom projektu.
V prípade, ak hlavný prijímateľ, resp. partneri uhrádzajú svoje výdavky spojené s projektom v inej mene ako EUR, príslušné účtovné doklady vystavené dodávateľom / zhotoviteľom v tejto mene sú platobnou jednotkou preplácané v EUR. Do žiadosti o platbu zahrnie hlavný prijímateľ oprávnené výdavky prepočítané na menu EUR mesačným kurzom Európskej komisie platným v tom mesiaci, v ktorom partner zostaví zoznam deklarovaných výdavkov. Tento kurz Európska komisia zverejňuje každý mesiac na webovom sídle www.ec.europa.eu/budget a zároveň je zverejňovaný aj na webovom sídle príslušného programu. 
Riadiaci orgán najneskôr do 31. decembra 2015 uchováva originál žiadosti o platbu, originál návrhu správy z kontroly (ak je relevantné), originál správy z kontroly, výpisy z účtov, jeden rovnopis účtovných dokladov alebo kópie18 účtovných dokladov označené podpisom štatutárneho orgánu hlavného prijímateľa / partnera a jeden rovnopis podpornej dokumentácie k žiadosti o platbu alebo kópie18 podpornej dokumentácie označené podpisom štatutárneho orgánu hlavného prijímateľa / partnera.
Platobná jednotka uchováva originál súhrnnej žiadosti o platbu / mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu a formuláre žiadosti o platbu, resp. príslušnú časť formulárov žiadosti o platbu.
6.7	Systém finančných tokov pri implementácii finančných nástrojov 
Systém prevodu tranže sa využíva v prípade poskytovania finančných prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie prijímateľovi v rámci implementácie finančných nástrojov na základe podpísania zmluvy o financovaní medzi riadiacim orgánom, prijímateľom a správcom prijímateľa.
Prvá žiadosť o platbu (finančné nástroje) a každá nasledujúca nesmie prekročiť 25 % z celkovej sumy programového príspevku (za zdroj EÚ) a 25 % národného spolufinancovania (zdroj štátneho rozpočtu na spolufinancovanie a súkromné zdroje) viazaných na finančný nástroj, ktorý by sa mal vyplatiť počas obdobia oprávnenosti konečnému prijímateľovi. 
Druhá žiadosť o platbu (finančné nástroje) je prijímateľom predložená najskôr, ak minimálne 60 % z deklarovaných výdavkov prvej žiadosti o platbu je oprávnených a zároveň bola táto suma vyplatená konečnému prijímateľovi. 
Tretia žiadosť o platbu (finančné nástroje) a každá nasledujúca je prijímateľom predložená najskôr, ak minimálne 85 % z deklarovaných výdavkov v predchádzajúcich žiadostiach o platbu je oprávnených a zároveň bola táto suma vyplatená konečnému prijímateľovi.
Etapa poskytnutia prvej žiadosti o platbu (finančné nástroje):
1.	Prijímateľ predkladá prvú žiadosť o platbu (finančné nástroje) riadiacemu orgánu v zmysle podmienok zmluvy o financovaní, a to maximálne do výšky 25 % z celkovej sumy programového príspevku na finančný nástroj elektronicky prostredníctvom ITMS a najneskôr do 31. decembra 2015 aj písomne. 
2.	Riadiaci orgán vykoná kontrolu žiadosti o platbu (finančné nástroje) na základe podmienok a postupov pre výkon kontroly žiadosti o platbu (finančné nástroje) definovaných v zákone č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov a v Systéme riadenia finančných nástrojov financovaných z Kohézneho fondu, Európskeho fondu regionálneho rozvoja a Európskeho sociálneho fondu na programové obdobie 2014 – 2020 a v právnych predpisoch Európskej únie.
3.	Po vykonaní kontroly žiadosti o platbu (finančné nástroje) riadiaci orgán žiadosť o platbu (finančné nástroje) schváli, schvaľovanie žiadosti o platbu (finančné nástroje) pozastaví20 alebo žiadosť o platbu (finančné nástroje) zamietne bezodkladne21 najneskôr však v lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu (finančné nástroje) od prijímateľa riadiacim orgánom a po schválení žiadosti o platbu (finančné nástroje) v stanovenej lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu (finančné nástroje) od prijímateľa riadiacim orgánom predkladá príslušnú časť formulára žiadosti o platbu (finančné nástroje) platobnej jednotke.
4.	Platobná jednotka vykoná kontrolu žiadosti o platbu (finančné nástroje) v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov a na základe podmienok a postupov definovaných v Systéme riadenia finančných nástrojov financovaných z Kohézneho fondu, Európskeho fondu regionálneho rozvoja a Európskeho sociálneho fondu na programové obdobie 2014 – 2020 do 5 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu (finančné nástroje) v ITMS. Platobná jednotka rovnako overí súlad deklarovanej sumy so schváleným rozpočtom platobnej jednotky. Následne v stanovenej lehote 5 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu (finančné nástroje) v ITMS žiadosť o platbu (finančné nástroje) schváli alebo neschváli. 
5.	Platobná jednotka najneskôr do 3 pracovných dní od schválenia žiadosti o platbu (finančné nástroje) zadá platobné príkazy na úhradu prijímateľovi z rozpočtovaných výdavkov (z výdavkového účtu) pomerne za zdroje EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie.
Etapa poskytnutia druhej, tretej a každej nasledujúcej žiadosti o platbu (finančné nástroje):
Pri predkladaní druhej, tretej a každej nasledujúcej žiadosti o platbu (finančné nástroje) prijímateľ deklaruje efektívne využitie 60%, resp. 85 % výdavkov zo súm poskytnutých v predchádzajúcej / predchádzajúcich žiadostiach o platbu (finančné nástroje) konečnými prijímateľmi. 
Prijímateľovi bude vyplatená nasledujúca žiadosť o platbu (finančné nástroje) najskôr až po potvrdení oprávnenosti efektívneho využitia 60 %, resp. 85 % výdavkov zo súm poskytnutých v predchádzajúcej / predchádzajúcich žiadostiach o platbu (finančné nástroje) konečnými prijímateľmi certifikačným orgánom. Prijímateľ ukladá ako prílohu žiadosti o platbu (finančné nástroje) v ITMS prehľad napĺňania percentuálneho stavu oprávnenosti výdavkov.
Riadiaci orgán prostredníctvom platobnej jednotky zabezpečí úhradu finančných prostriedkov prijímateľovi na základe žiadosti o platbu (finančné nástroje) (druhá, tretia a každá nasledujúca) až po potvrdení oprávnenosti efektívneho využitia 60 %, resp. 85 % výdavkov zo súm poskytnutých v predchádzajúcej / predchádzajúcich žiadostiach o platbu (finančné nástroje) konečnými prijímateľmi a schválení predloženej žiadosti o platbu (finančné nástroje) certifikačným orgánom v rámci súhrnnej žiadosti o platbu (finančné nástroje). 
Ak je prijímateľovi vyplatených 100 % z celkovej sumy programového príspevku na základe predložených a schválených žiadostí o platbu (finančné nástroje), predkladá prijímateľ následne žiadosť o platbu (finančné nástroje) (žiadosti o platbu), v ktorej na základe schválených výkazov deklarovaných výdavkov len deklaruje efektívne využitie výdavkov zo súm poskytnutých v predchádzajúcich žiadostiach o platbu (finančné nástroje) vrátane vzniknutých nákladov na riadenie alebo platby poplatkov za riadenie finančného nástroja. Žiadosť o platbu (finančné nástroje), v ktorej na základe schválených výkazov deklarovaných výdavkov deklaruje 100 % efektívne využitie výdavkov zo súm poskytnutých v predchádzajúcich žiadostiach o platbu (finančné nástroje) vrátane vzniknutých nákladov na riadenie alebo platby poplatkov za riadenie finančného nástroja, označí príznakom záverečná. V prípade, ak prijímateľ nie je schopný deklarovať 100 % efektívne využitie výdavkov, označí za žiadosť o platbu (finančné nástroje) s príznakom záverečná tú žiadosť o platbu (finančné nástroje), v ktorej deklaruje konečnú sumu efektívneho využitia výdavkov vrátane vzniknutých nákladov na riadenie alebo platby poplatkov za riadenie finančného nástroja. Nezúčtovaný rozdiel (rozdiel medzi sumou vyplateného programového príspevku a konečnou sumou efektívneho využitia výdavkov konečnými prijímateľmi vrátane vzniknutých nákladov na riadenie alebo platby poplatkov za riadenie finančného nástroja) je prijímateľ povinný na základe vzájomnej komunikácie s riadiacim orgánom vrátiť platobnej jednotke bezodkladne21. Prijímateľ predloží riadiacemu orgánu oznámenie o vysporiadaní finančných vzťahov v zmysle časti 4.5.9. 
Riadiaci orgán v úzkej spolupráci s platobnou jednotkou zodpovedá za stanovenie postupu, ktorý zabráni neoprávnenému vyplateniu platby prijímateľovi (druhá, tretia a každá nasledujúca). V tomto prípade riadiaci orgán pozastaví vyplatenie platby prijímateľovi (druhá, tretia a každá nasledujúca) až do času schválenia žiadosti o platbu (finančné nástroje) certifikačným orgánom v súhrnnej žiadosti o platbu / mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu.
6.	Prijímateľ predkladá riadiacemu orgánu na prvostupňovú kontrolu výkaz deklarovaných výdavkov, ktorým deklaruje efektívne využitie výdavkov zo súm poskytnutých v predchádzajúcej / predchádzajúcich žiadostiach o platbu (finančné nástroje) konečnými prijímateľmi v intervaloch a za podmienok stanovených riadiacim orgánom.
7.	Prijímateľ predkladá spolu s výkazom deklarovaných výdavkov aj doklady preukazujúce splnenie podmienok oprávnenosti výdavkov a relevantnú podpornú dokumentáciu, ktorej minimálny rozsah stanovuje Systém riadenia finančných nástrojov financovaných z Kohézneho fondu, Európskeho fondu regionálneho rozvoja a Európskeho sociálneho fondu, usmernenia riadiaceho orgánu a legislatíva EÚ. 
8.	Riadiaci orgán vykonáva kontrolu výkazu deklarovaných výdavkov podľa čl. 125 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013, a v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov a na základe podmienok a postupov pre výkon kontroly výkazu deklarovaných výdavkov definovaných v Systéme riadenia finančných nástrojov financovaných z Kohézneho fondu, Európskeho fondu regionálneho rozvoja a Európskeho sociálneho fondu, postupoch riadiaceho orgánu a legislatíve EÚ. 
V prípade zistenia nedostatkov vyzve prijímateľa, aby v stanovenej lehote doplnil výkaz deklarovaných výdavkov. Lehota na výkon kontroly výkazu deklarovaných výdavkov môže byť riadiacim orgánom pozastavená20. V prípade zistenia vážnych nedostatkov (klasifikovaných riadiacim orgánom) alebo nedoplnenia požadovaných údajov v stanovenej lehote, riadiaci orgán výkaz deklarovaných výdavkov zamietne.
Riadiaci orgán overuje splnenie podmienky použitia 60 %, resp. 85 % výdavkov zo súm poskytnutých v predchádzajúcej / predchádzajúcich žiadostiach o platbu prijímateľa v súlade s čl. 41 ods. 1 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013.
9.	Po vykonaní kontroly riadiaci orgán výkaz deklarovaných výdavkov schváli, neschváli alebo zníži o relevantnú časť a v lehote do 25 pracovných dní od prijatia výkazu deklarovaných výdavkov zašle prijímateľovi schválený výkaz deklarovaných výdavkov. 
10.	Následne na základe schválených výkazov deklarovaných výdavkov, ktoré preukazujú splnenie podmienok na poskytnutie druhej, tretej a každej nasledujúcej žiadosti o platbu (finančné nástroje), zostaví prijímateľ žiadosť o platbu (finančné nástroje). Zostavenú žiadosť o platbu (finančné nástroje) spolu so schválenými výkazmi deklarovaných výdavkov predkladá riadiacemu orgánu elektronicky prostredníctvom ITMS a najneskôr do 31. decembra 2015 aj písomne.
11.	Riadiaci orgán vykoná kontrolu žiadosti o platbu (finančné nástroje) na základe podmienok a postupov pre výkon kontroly žiadosti o platbu (finančné nástroje) definovaných v zákone č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov a v Systéme riadenia finančných nástrojov financovaných z Kohézneho fondu, Európskeho fondu regionálneho rozvoja a Európskeho sociálneho fondu.
Riadiaci orgán počas výkonu kontroly žiadosti o platbu (finančné nástroje) môže schvaľovanie žiadosti o platbu (finančné nástroje) pozastaviť20. 
Po vykonaní kontroly žiadosti o platbu (finančné nástroje) riadiaci orgán žiadosť o platbu (finančné nástroje) schváli, alebo žiadosť o platbu (finančné nástroje) zamietne bezodkladne21 najneskôr však v lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu (finančné nástroje) od prijímateľa riadiacim orgánom. Po schválení žiadosti o platbu (finančné nástroje), v stanovenej lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu (finančné nástroje) od prijímateľa riadiacim orgánom, riadiaci orgán predloží príslušnú časť formulára žiadosti o platbu (finančné nástroje) platobnej jednotke, ktorá postupuje v zmysle bodu 13a).
12.	Riadiaci orgán v prípade vrátenia žiadosti o platbu (finančné nástroje) z platobnej jednotky v zmysle:
a)	bodu 13a) vykoná kontrolu žiadosti o platbu podľa čl. 125 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013, a v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov a na základe podmienok a postupov pre výkon kontroly žiadosti o platbu (finančné nástroje) definovaných v Systéme riadenia finančných nástrojov financovaných z Kohézneho fondu, Európskeho fondu regionálneho rozvoja a Európskeho sociálneho fondu. 
Riadiaci orgán počas výkonu kontroly žiadosti o platbu (finančné nástroje) môže schvaľovanie žiadosti o platbu (finančné nástroje) pozastaviť20. 
Po vykonaní kontroly žiadosti o platbu (finančné nástroje) riadiaci orgán žiadosť o platbu (finančné nástroje) schváli (schváli deklarované výdavky v plnej výške), žiadosť o platbu (finančné nástroje) schváli v zníženej sume (schváli deklarované výdavky vo výške zníženej o sumu neoprávnených výdavkov), alebo žiadosť o platbu (finančné nástroje) zamietne bezodkladne21, najneskôr však v lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu (finančné nástroje) od platobnej jednotky v ITMS. Po schválení žiadosti o platbu (finančné nástroje) vo vyššie uvedených prípadoch, v stanovenej lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu (finančné nástroje) od platobnej jednotky v ITMS, riadiaci orgán predloží príslušnú časť formulára žiadosti o platbu (finančné nástroje) platobnej jednotke, ktorá postupuje v zmysle bodu 13a).
b)	bodu 13b) a 13c) ii v prípade zistených nedostatkov, ktoré majú vplyv na výšku a / alebo oprávnenosť výdavkov vykoná kontrolu žiadosti o platbu (finančné nástroje) podľa čl. 125 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013, a v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov a na základe podmienok a postupov pre výkon kontroly žiadosti o platbu (finančné nástroje) definovaných v Systéme riadenia finančných nástrojov financovaných z Kohézneho fondu, Európskeho fondu regionálneho rozvoja a Európskeho sociálneho fondu. V rámci nedostatkov bez vplyvu na výšku a / alebo oprávnenosť výdavkov sa uplatňuje bod 30 časti 3.2.
Riadiaci orgán počas výkonu kontroly žiadosti o platbu (finančné nástroje) môže schvaľovanie žiadosti o platbu (finančné nástroje) pozastaviť20. 
Po vykonaní kontroly žiadosti o platbu (finančné nástroje) riadiaci orgán žiadosť o platbu (finančné nástroje) schváli (schváli deklarované výdavky v plnej výške), žiadosť o platbu (finančné nástroje) schváli v zníženej sume (schváli deklarované výdavky vo výške zníženej o sumu neoprávnených výdavkov), alebo žiadosť o platbu (finančné nástroje) zamietne bezodkladne21, najneskôr však v lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu (finančné nástroje)od platobnej jednotky v ITMS a po schválení žiadosti o platbu (finančné nástroje) vo vyššie uvedených prípadoch, v stanovenej lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu (finančné nástroje) od platobnej jednotky v ITMS, riadiaci orgán predloží príslušnú časť formulára žiadosti o platbu (finančné nástroje) platobnej jednotke, ktorá postupuje v zmysle bodu 13b).
13.	Platobná jednotka zostavuje súhrnnú žiadosť o platbu / mimoriadnu súhrnnú žiadosť o platbu zostavenú zo žiadostí o platbu (finančné nástroje), pričom pri:
a)	žiadosti o platbu (finančné nástroje) predloženej riadiacim orgánom v zmysle bodu 11 a 12a) vykoná kontrolu žiadosti o platbu (finančné nástroje) v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov a na základe podmienok a postupov definovaných v Systéme riadenia finančných nástrojov financovaných z Kohézneho fondu, Európskeho fondu regionálneho rozvoja a Európskeho sociálneho fondu na programové obdobie 2014 – 2020 do 5 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu (finančné nástroje) v ITMS. Platobná jednotka overí súlad nárokovanej sumy so schváleným rozpočtom platobnej jednotky. Následne v stanovenej lehote schváli alebo neschváli žiadosť o platbu (finančné nástroje). V prípade jej schválenia platobná jednotka zahrnie sumu do nasledovnej súhrnnej žiadosti o platbu a v intervale dvakrát do mesiaca podľa stanovených termínov predkladá spolu s čiastkovým výkazom výdavkov certifikačnému orgánu prostredníctvom ITMS. V prípade neschválenia žiadosti o platbu (finančné nástroje), vracia predmetnú žiadosť o platbu (finančné nástroje) v stanovenej lehote 5 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu v ITMS riadiacemu orgánu, ktorý postupuje podľa bodu 12a);
b)	žiadosti o platbu (finančné nástroje) predloženej riadiacim orgánom v zmysle bodu 12b) vykoná kontrolu žiadosti o platbu (finančné nástroje) v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov a na základe podmienok a postupov definovaných v Systéme riadenia finančných nástrojov financovaných z Kohézneho fondu, Európskeho fondu regionálneho rozvoja a Európskeho sociálneho fondu na programové obdobie 2014 – 2020 do 3 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu (finančné nástroje) v ITMS a v tejto lehote žiadosť o platbu (finančné nástroje) schváli alebo neschváli. Po schválení žiadosti o platbu (finančné nástroje) platobná jednotka najneskôr nasledujúci pracovný deň, resp. podľa postupov a termínov stanovených certifikačným orgánom, zahrnie predmetnú žiadosť o platbu (finančné nástroje) do mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu, ktorú predkladá certifikačnému orgánu najneskôr nasledujúci pracovný deň po jej zostavení. Certifikačný orgán následne postupuje podľa bodov B.14 až B.16. V prípade neschválenia žiadosti o platbu (finančné nástroje), vracia predmetnú žiadosť o platbu (finančné nástroje) v stanovenej lehote 3 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu (finančné nástroje) v ITMS riadiacemu orgánu, ktorý postupuje podľa bodu 12b);
c)	žiadosti o platbu (finančné nástroje) vrátenej z certifikačného orgánu v zmysle bodu A.16 a A.17 za účelom odstránenia identifikovaných nedostatkov:
i.	v prípade, ak sa dôvody vrátenia žiadosti o platbu (finančné nástroje) z certifikačného orgánu týkajú úrovne platobnej jednotky, platobná jednotka odstráni zistené nedostatky na svojej úrovni a najneskôr nasledujúci pracovný deň, resp. podľa postupov a termínov stanovených certifikačným orgánom, zahrnie predmetnú žiadosť o platbu (finančné nástroje) do mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu, ktorú predkladá certifikačnému orgánu najneskôr nasledujúci pracovný deň po jej zostavení. Certifikačný orgán následne postupuje podľa bodov B.14 až B.16;
ii.	v prípade, ak sa dôvody vrátenia žiadosti o platbu (finančné nástroje) z certifikačného orgánu týkajú úrovne riadiaceho orgánu, platobná jednotka najneskôr nasledujúci pracovný deň po prijatí žiadosti o platbu (finančné nástroje) z certifikačného orgánu vracia predmetnú žiadosť o platbu (finančné nástroje) riadiacemu orgánu, ktorý postupuje podľa bodu 12b);
d)	žiadosti o platbu (finančné nástroje) (v rámci ktorej boli výdavky schválené certifikačným orgánom v plnej výške) vrátenej z certifikačného orgánu v zmysle bodu A.17 za účelom zaradenia do mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu po prijatí informácie o záveroch certifikačného overovania platobná jednotka zahrnie predmetnú žiadosť o platbu (finančné nástroje) najneskôr nasledujúci pracovný deň, resp. podľa postupov a termínov stanovených certifikačným orgánom do mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu, ktorú predkladá certifikačnému orgánu najneskôr nasledujúci pracovný deň po jej zostavení. Certifikačný orgán následne postupuje podľa bodov B.14 až B.16;
A.	Postup overenia súhrnnej žiadosti o platbu certifikačným orgánom:
A.14.V prípade predloženej súhrnnej žiadosti o platbu certifikačný orgán vykoná overenie na svojej úrovni, ktoré zahrňuje administratívne overenie, prípadne certifikačné overovanie. Taktiež overuje súhrnnú žiadosť o platbu z hľadiska neprekročenia / dodržania celkovej alokácie podľa prioritných osí na základe čiastkového výkazu výdavkov predloženého platobnou jednotkou. V prípade potreby si od riadiaceho orgánu alebo platobnej jednotky vyžiadava ďalšie informácie nevyhnutné pre posúdenie predloženej súhrnnej žiadosti o platbu. 
A.15.Ak certifikačný orgán na svojej úrovni vykoná overenie žiadosti o platbu (finančné nástroje) zaradenej do súhrnnej žiadosti o platbu a toto overenie žiadosti o platbu (finančné nástroje):
a)	je ukončené v lehote na overenie súhrnnej žiadosti o platbu, postupuje certifikačný orgán ďalej podľa bodu A.16,
b)	nie je ukončené v lehote na overenie súhrnnej žiadosti o platbu, postupuje certifikačný orgán ďalej podľa bodu A.17.
A.16.Certifikačný orgán do 10 pracovných dní od prijatia súhrnnej žiadosti o platbu súhrnnú žiadosť o platbu schváli v plnej výške, schváli v zníženej výške o sumu žiadosti o platbu (finančné nástroje), v ktorej boli v rámci overovania certifikačným orgánom zistené nedostatky, schváli v zníženej výške o sumu žiadosti o platbu (finančné nástroje), ktorá je predmetom overovania, schvaľovanie pozastaví23 alebo neschváli. Žiadosť o platbu (finančné nástroje), v rámci ktorej boli zistené nedostatky, ktoré majú vplyv na výšku a / alebo oprávnenosť výdavkov certifikačný orgán vráti platobnej jednotke, ktorá následne postupuje podľa bodu 13c) a súhrnnú žiadosť o platbu certifikačný orgán schvaľuje v zníženej výške.
A.17.Certifikačný orgán do 15 pracovných dní od prijatia súhrnnej žiadosti o platbu ukončí overovanie žiadosti o platbu (finančné nástroje) zo súhrnnej žiadosti o platbu, ktorá bola schválená v zníženej výške v zmysle bodu A.16 (súhrnná žiadosť o platbu schválená v zníženej výške o sumu žiadosti o platbu (finančné nástroje), ktorá je predmetom overovania) a informuje platobnú jednotku o záveroch certifikačného overovania, v nadväznosti na ktoré platobná jednotka postupuje v zmysle bodu 13c) alebo 13d).
A.18.Certifikačný orgán v deň schválenia súhrnnej žiadosti o platbu a po jej spracovaní v ITMS informuje platobnú jednotku a v závislosti od zostatku na mimorozpočtovom účte prevádza prostriedky EÚ na príslušný príjmový účet platobnej jednotky.
A.20.Platobná jednotka je oprávnená ihneď, najneskôr však do 3 pracovných dní po prijatí informácie o schválení súhrnnej žiadosti o platbu certifikačným orgánom, zadať platobné príkazy na prevod prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie prijímateľovi.
B.	Postup overenia mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu certifikačným orgánom:
B.14.V prípade predloženej mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu certifikačný orgán vykoná overenie na svojej úrovni, ktoré zahrňuje len administratívne overenie. Taktiež overuje mimoriadnu súhrnnú žiadosť o platbu z hľadiska neprekročenia / dodržania celkovej alokácie podľa prioritných osí na základe čiastkového výkazu výdavkov predloženého platobnou jednotkou.
B.15.Certifikačný orgán mimoriadnu súhrnnú žiadosť o platbu schváli alebo neschváli do 7 pracovných dní od prijatia mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu.
B.16.Certifikačný orgán v deň schválenia mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu a po jej spracovaní v ITMS informuje platobnú jednotku a v závislosti od zostatku na mimorozpočtovom účte prevádza prostriedky EÚ na príslušný príjmový účet platobnej jednotky.
B.17.Platobná jednotka je oprávnená ihneď, najneskôr však do 3 pracovných dní po prijatí informácie o schválení mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu certifikačným orgánom, zadať platobné príkazy na prevod prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie prijímateľovi.
Konečný prijímateľ, ktorý získava pomoc z finančného nástroja a zároveň získava pomoc aj z iného zdroja, je povinný viesť samostatné záznamy o každom zdroji pomoci. 
Riadiaci orgán najneskôr do 31. decembra 2015 uchováva originál žiadosti o platbu (finančné nástroje), originál návrhu správy z kontroly (ak je relevantné), originál správy z kontroly, originál výkazu deklarovaných výdavkov a ďalšie doklady preukazujúce splnenie podmienok oprávnenosti výdavkov. 
Platobná jednotka uchováva originál súhrnnej žiadosti o platbu / mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu, formuláre žiadosti o platbu (finančné nástroje), resp. príslušnú časť formulárov žiadosti o platbu (finančné nástroje).
6.8	Systém finančných tokov pri implementácii globálnych grantov
Implementácia globálnych grantov sa v zmysle čl. 123, ods. 7 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 realizuje poverením riadiaceho orgánu sprostredkovateľskému orgánu pre globálny grant na základe písomnej zmluvy, v zmysle ktorej sú sprostredkovateľskému orgánu globálneho grantu poskytované prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie za účelom implementácie časti programu, a to systémom zálohových platieb.
Sprostredkovateľský orgán pre globálny grant za účelom implementácie časti programu formou globálneho grantu predkladá riadiacemu orgánu žiadosť o platbu (poskytnutie zálohovej platby, zúčtovanie zálohovej platby). Zálohové platby sa sprostredkovateľskému orgánu pre globálny grant poskytujú do úrovne 100 % alokácie globálneho grantu.
Sprostredkovateľský orgán pre globálny grant plní aj platobnú funkciu, t. j. zodpovedá za prevod finančných prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie prijímateľovi na základe jeho žiadosti o platbu, ktorú predkladá sprostredkovateľskému orgánu pre globálny grant. 
Prijímateľovi sú finančné prostriedky poskytované pomerne za zdroje EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie systémom refundácie.
6.8.1	Poskytnutie platby riadiacim orgánom sprostredkovateľskému orgánu pre globálny grant
Zálohové platby sú sprostredkovateľskému orgánu pre globálny grant poskytované pomerne za prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie po nadobudnutí účinnosti zmluvy uzatvorenej medzi riadiacim orgánom a sprostredkovateľským orgánom pre globálny grant a začatí realizácie projektu, resp. na základe zúčtovania poskytnutej zálohovej platby. 
Sprostredkovateľskému orgánu pre globálny grant sú poskytované finančné prostriedky na základe žiadosti o platbu (poskytnutie zálohovej platby), a to maximálne do výšky 40 % z programového príspevku (vyčlenená časť operačného programu pre implementáciu globálneho grantu) zodpovedajúceho 12 mesiacom realizácie globálneho grantu.
V prípade, ak zálohová platba nebola poskytnutá v maximálnej možnej výške, sprostredkovateľský orgán pre globálny grant môže požiadať o ďalšiu zálohovú platbu (poskytnutie zálohovej platby) vo výške súčtu certifikačným orgánom schválených prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie a sumy rovnajúcej sa rozdielu maximálnej výšky zálohovej platby a predchádzajúcej poskytnutej zálohovej platby. Súčet týchto prostriedkov, a teda výška poskytnutej zálohovej platby je maximálne 40 % z programového príspevku.
Sprostredkovateľský orgán pre globálny grant je povinný poskytnutú zálohovú platbu priebežne zúčtovávať, pričom zúčtovať 100 % z poskytnutej zálohovej platby (sumy každej poskytnutej zálohovej platby) je povinný najneskôr do 12 mesiacov odo dňa pripísania finančných prostriedkov na účte sprostredkovateľského orgánu pre globálny grant. Riadiaci orgán je povinný sledovať a evidovať poskytovanie a zúčtovávanie zálohových platieb poskytnutých sprostredkovateľskému orgánu pre globálny grant (dodržiavanie povinnosti sprostredkovateľského orgánu pre globálny grant týkajúcej sa zúčtovania poskytnutej zálohovej platby) v samostatnom prehľade, pričom rozsah štruktúry sledovania poskytovania a zúčtovávania zálohových platieb je v kompetencii riadiaceho orgánu. Žiadosť o platbu (zúčtovanie zálohovej platby) je potrebné priraďovať k najstaršej poskytnutej zálohovej platbe. Riadiaci orgán je oprávnený pozastaviť financovanie sprostredkovateľského orgánu pre globálny grant systémom zálohových platieb v prípade, ak sprostredkovateľský orgán pre globálny grant po poskytnutí finančných prostriedkov systémom zálohovej platby nedodržiava podmienky zúčtovania zálohovej platby, resp. neplní podmienky zmluvy uzatvorenej medzi riadiacim orgánom a sprostredkovateľským orgánom pre globálny grant.
Etapa poskytnutia zálohovej platby sprostredkovateľskému orgánu pre globálny grant:
1.	Sprostredkovateľský orgán pre globálny grant po začatí realizácie globálneho grantu predkladá žiadosť o platbu (globálny grant) (poskytnutie zálohovej platby) riadiacemu orgánu elektronicky prostredníctvom ITMS a najneskôr do 31. decembra 2015 aj písomne v zmysle podmienok zmluvy uzatvorenej medzi riadiacim orgánom a sprostredkovateľským orgánom pre globálny grant.
2.	Riadiaci orgán vykoná kontrolu žiadosti o platbu (globálny grant) podľa čl. 125 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013, v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov a na základe podmienok a postupu výkonu kontroly definovaných v Systéme riadenia európskych štrukturálnych a investičných fondov na programové obdobie 2014 – 2020. 
V prípade zistenia nedostatkov riadiaci orgán vyzve19 sprostredkovateľský orgán pre globálny grant, aby v stanovenej lehote doplnil / zmenil žiadosť o platbu (globálny grant). Lehota na výkon kontroly žiadosti o platbu (globálny grant) môže byť riadiacim orgánom pozastavená20. 
3.	Po vykonaní kontroly žiadosti o platbu (globálny grant), riadiaci orgán žiadosť o platbu (globálny grant) schváli v plnej výške, žiadosť o platbu (globálny grant) schváli v zníženej sume, alebo zamietne bezodkladne21, najneskôr však v lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu (globálny grant) od sprostredkovateľského orgánu pre globálny grant a po schválení žiadosti o platbu (globálny grant) vo vyššie uvedených prípadoch, v stanovenej lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu (globálny grant) od sprostredkovateľského orgánu pre globálny grant, riadiaci orgán predloží formulár tejto žiadosti o platbu (globálny grant) platobnej jednotke.
4.	Platobná jednotka vykoná kontrolu žiadosti o platbu (globálny grant) v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov do 5 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu (globálny grant) v ITMS. Platobná jednotka overí súlad deklarovanej sumy so schváleným rozpočtom platobnej jednotky. Následne v stanovenej lehote schváli alebo neschváli žiadosť o platbu (globálny grant). 
5.	V prípade jej schválenia platobná jednotka najneskôr do 3 pracovných dní od schválenia žiadosti o platbu (globálny grant) zadá platobné príkazy na úhradu z rozpočtovaných výdavkov (z výdavkového účtu) pomerne za zdroje EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie sprostredkovateľskému orgánu pre globálny grant. V prípade neschválenia žiadosti o platbu (globálny grant), vracia predmetnú žiadosť o platbu (globálny grant) riadiacemu orgánu v stanovenej lehote 5 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu (globálny grant) v ITMS.
Etapa zúčtovania zálohovej platby sprostredkovateľským orgánom pre globálny grant:
6.	Sprostredkovateľský orgán pre globálny grant sumarizuje relevantnú dokumentáciu predloženú prijímateľom, na základe ktorej po vykonaní kontroly na svojej úrovni zostaví žiadosť o platbu (globálny grant) (zúčtovanie zálohovej platby). Následne túto žiadosť o platbu (globálny grant) (zúčtovanie zálohovej platby) predkladá riadiacemu orgánu elektronicky prostredníctvom ITMS a najneskôr do 31. decembra 2015 aj písomne. 
7.	Sprostredkovateľský orgán pre globálny grant v rámci formulára žiadosti o platbu (globálny grant) uvedie oprávnenú sumu použitú na implementáciu globálneho grantu v súlade so zmluvou uzatvorenou medzi riadiacim orgánom a sprostredkovateľským orgánom pre globálny grant. Spolu s formulárom žiadosti o platbu (globálny grant) predkladá riadiacemu orgánu aj doklady preukazujúce úhradu sumy použitej na implementáciu globálneho grantu, resp. relevantnú podpornú dokumentáciu, ktorej minimálny rozsah stanovuje Systém riadenia finančných nástrojov financovaných z Kohézneho fondu, Európskeho fondu regionálneho rozvoja a Európskeho sociálneho fondu a riadiaci orgán. 
8.	Riadiaci orgán vykonáva kontrolu žiadosti o platbu (globálny grant) podľa čl. 125 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013, v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov a na základe podmienok a postupov pre výkon kontroly žiadosti o platbu (globálny grant) definovaných v Systéme riadenia európskych štrukturálnych a investičných fondov na programové obdobie 2014 – 2020. 
V prípade zistenia nedostatkov vyzve19 sprostredkovateľský orgán pre globálny grant, aby v stanovenej lehote doplnil / zmenil žiadosť o platbu (globálny grant). Lehota na výkon kontroly žiadosti o platbu (globálny grant) môže byť riadiacim orgánom pozastavená20.
9.	Riadiaci orgán počas výkonu kontroly žiadosti o platbu (globálny grant) vykonáva v prípade potreby aj samostatnú kontrolu vyčlenenej časti deklarovaných výdavkov z predloženej žiadosti o platbu (globálny grant). Samostatná kontrola vyčlenenej časti deklarovaných výdavkov z predloženej žiadosti o platbu (globálny grant) sa nevykonáva v prípade žiadosti o platbu (globálny grant) vrátenej z platobnej jednotky v zmysle bodu 13a) a 13b). Riadiaci orgán môže počas výkonu samostatnej kontroly vyčlenenej časti deklarovaných výdavkov vyčleniť z už vyčlenenej časti deklarovaných výdavkov ďalšiu časť deklarovaných výdavkov na samostatnú kontrolu. Podrobnosti výkonu samostatnej kontroly vyčlenenej časti deklarovaných výdavkov z predloženej žiadosti o platbu (globálny grant) stanovuje Systém riadenia európskych štrukturálnych a investičných fondov na programové obdobie 2014 – 2020. 
10.	Po vykonaní kontroly žiadosti o platbu (globálny grant), riadiaci orgán žiadosť o platbu (globálny grant) schváli (schváli deklarované výdavky v plnej výške), žiadosť o platbu (globálny grant) schváli v zníženej sume (schváli deklarované výdavky vo výške zníženej o sumu neoprávnených výdavkov), žiadosť o platbu (globálny grant) schváli v zníženej sume (schváli deklarované výdavky bez deklarovaných výdavkov, ktoré sú predmetom samostatnej kontroly, resp. schváli deklarované výdavky, ktoré sú predmetom samostatnej kontroly v zmysle postupu podľa bodu 11b) alebo žiadosť o platbu (globálny grant) zamietne bezodkladne21, najneskôr však v lehote 25 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu (globálny grant) od sprostredkovateľského orgánu pre globálny grant riadiacim orgánom. 
Ukončením výkonu kontroly deklarovaných výdavkov z predloženej žiadosti o platbu (globálny grant) (okrem prípadu podľa bodu 11a) sa ku kódu žiadosti o platbu (globálny grant) (v rámci časti žiadosti o platbu (globálny grant) vypĺňanej riadiacim orgánom) automaticky priraďuje dodatočný číselný identifikátor. V prípade schválenia deklarovaných výdavkov vo vyššie uvedených prípadoch, v stanovenej lehote 25 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu od platobnej jednotky v ITMS, riadiaci orgán predkladá platobnej jednotke len príslušnú časť formulára žiadosti o platbu (globálny grant), v rámci ktorej je kód žiadosti o platbu (globálny grant) rozšírený o príslušný číselný identifikátor. 
11.	V prípade výkonu samostatnej kontroly vyčlenenej časti deklarovaných výdavkov riadiaci orgán schváli deklarované výdavky, ktoré boli predmetom samostatnej kontroly v plnej výške, schváli deklarované výdavky, ktoré boli predmetom samostatnej kontroly vo výške zníženej o sumu neoprávnených výdavkov, schváli deklarované výdavky, ktoré boli predmetom samostatnej kontroly vo výške zníženej o sumu deklarovaných výdavkov, ktoré sú predmetom ďalšej samostatnej kontroly, schvaľovanie pozastaví20 alebo zamietne bezodkladne21, najneskôr však v lehote 25 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu (globálny grant) od sprostredkovateľského orgánu pre globálny grant riadiacim orgánom, pričom v prípade, ak samostatná kontrola vyčlenenej časti deklarovaných výdavkov:
a)	je ukončená pred alebo súčasne s ukončením kontroly deklarovaných výdavkov, ktoré neboli vyčlenené na samostatnú kontrolu, riadiaci orgán deklarované výdavky, ktoré neboli vyčlenené na samostatnú kontrolu a deklarované výdavky, ktoré boli vyčlenené na samostatnú kontrolu schváli v plnej výške, prípadne schváli v zníženej výške v lehote stanovenej na výkon kontroly (25 pracovných dní). V tomto prípade riadiaci orgán predkladá platobnej jednotke len príslušnú časť formulára žiadosti o platbu (globálny grant), v ktorom identifikuje všetky oprávnené deklarované výdavky. Ku kódu žiadosti o platbu (globálny grant) (v rámci časti žiadosti o platbu (globálny grant) vypĺňanej riadiacim orgánom) je v tomto prípade automaticky priraďovaný len jeden číselný identifikátor;
b)	je ukončená po ukončení kontroly deklarovaných výdavkov, ktoré neboli vyčlenené na samostatnú kontrolu, riadiaci orgán, v lehote stanovenej na výkon kontroly (25 pracovných dní), predkladá platobnej jednotke príslušnú časť formulára žiadosti o platbu (globálny grant), v ktorom identifikuje oprávnené deklarované výdavky, ktoré boli vyčlenené na samostatnú kontrolu.
V každom z uvedených prípadov predkladá riadiaci orgán platobnej jednotke príslušnú časť formulára žiadosti o platbu (globálny grant), v ktorej sa uvádza výška schválených výdavkov na preplatenie platobnou jednotkou.
12.	Riadiaci orgán v prípade vrátenia žiadosti o platbu (globálny grant) z platobnej jednotky v zmysle:
a)	Bodu 13a) vykoná kontrolu žiadosti o platbu (globálny grant) podľa čl. 125 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013, v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov a na základe podmienok a postupov pre výkon kontroly žiadosti o platbu (globálny grant) definovaných v Systéme riadenia európskych štrukturálnych a investičných fondov na programové obdobie 2014 – 2020. 
Riadiaci orgán počas výkonu kontroly žiadosti o platbu (globálny grant) môže schvaľovanie žiadosti o platbu pozastaviť20. 
Po vykonaní kontroly žiadosti o platbu (globálny grant) riadiaci orgán žiadosť o platbu schváli (schváli deklarované výdavky v plnej výške), žiadosť o platbu (globálny grant) schváli v zníženej sume (schváli deklarované výdavky vo výške zníženej o sumu neoprávnených výdavkov), alebo žiadosť o platbu (globálny grant) zamietne bezodkladne21, najneskôr však v lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu (globálny grant) od platobnej jednotky v ITMS a po schválení žiadosti o platbu (globálny grant) vo vyššie uvedených prípadoch, v stanovenej lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu (globálny grant) od platobnej jednotky v ITMS, riadiaci orgán predloží formulár tejto žiadosti o platbu (globálny grant) platobnej jednotke, ktorá postupuje v zmysle bodu 13a).
b)	bodu 13b) a 13c) ii v prípade zistených nedostatkov, ktoré majú vplyv na výšku a / alebo oprávnenosť výdavkov vykoná kontrolu žiadosti o platbu (globálny grant) podľa čl. 125 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013, v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov a na základe podmienok a postupov pre výkon kontroly žiadosti o platbu (globálny grant) definovaných v Systéme riadenia európskych štrukturálnych a investičných fondov na programové obdobie 2014 – 2020. V rámci nedostatkov bez vplyvu na výšku a / alebo oprávnenosť výdavkov sa uplatňuje bod 30 časť 3.2.
Riadiaci orgán počas výkonu kontroly žiadosti o platbu (globálny grant) môže schvaľovanie žiadosti o platbu (globálny grant) pozastaviť20. 
Po vykonaní kontroly žiadosti o platbu (globálny grant) riadiaci orgán žiadosť o platbu (globálny grant) schváli (schváli deklarované výdavky v plnej výške), žiadosť o platbu (globálny grant) schváli v zníženej sume (schváli deklarované výdavky vo výške zníženej o sumu neoprávnených výdavkov), alebo žiadosť o platbu (globálny grant) zamietne bezodkladne21, najneskôr však v lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu (globálny grant) od platobnej jednotky v ITMS a po schválení žiadosti o platbu (globálny grant) vo vyššie uvedených prípadoch, v stanovenej lehote 10 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu (globálny grant) od platobnej jednotky v ITMS, riadiaci orgán predloží formulár tejto žiadosti o platbu (globálny grant) platobnej jednotke, ktorá postupuje v zmysle bodu 13b).
13.	Platobná jednotka zostavuje súhrnnú žiadosť o platbu / mimoriadnu súhrnnú žiadosť o platbu zostavenú zo žiadostí o platbu (globálny grant), pričom pri:
a)	žiadosti o platbu (globálny grant) (zúčtovanie zálohovej platby) predloženej riadiacim orgánom v zmysle bodu 10 a 12a) vykoná kontrolu žiadosti o platbu (globálny grant) v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov do 5 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu (globálny grant) v ITMS. Platobná jednotka overí súlad deklarovanej sumy so schváleným rozpočtom platobnej jednotky. Následne v stanovenej lehote schváli alebo neschváli žiadosť o platbu (globálny grant). V prípade jej schválenia platobná jednotka zahrnie sumu do nasledovnej súhrnnej žiadosti o platbu a v intervale dvakrát do mesiaca podľa stanovených termínov predkladá spolu s čiastkovým výkazom výdavkov certifikačnému orgánu prostredníctvom ITMS. V prípade neschválenia žiadosti o platbu (globálny grant), vracia predmetnú žiadosť o platbu (globálny grant) v stanovenej lehote 5 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu (globálny grant) v ITMS riadiacemu orgánu, ktorý postupuje podľa bodu 12a);
b)	žiadosti o platbu (globálny grant) (zúčtovanie zálohovej platby) predloženej riadiacim orgánom v zmysle bodu 12b) vykoná kontrolu žiadosti o platbu (globálny grant) v zmysle zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov do 3 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu (globálny grant) v ITMS a v tejto lehote žiadosť o platbu (globálny grant) schváli alebo neschváli. Po schválení žiadosti o platbu (globálny grant) platobná jednotka najneskôr nasledujúci pracovný deň, resp. podľa postupov a termínov stanovených certifikačným orgánom, zahrnie predmetnú žiadosť o platbu (globálny grant) do mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu, ktorú predkladá certifikačnému orgánu najneskôr nasledujúci pracovný deň po jej zostavení. Certifikačný orgán následne postupuje podľa bodov B.14 až B.16. V prípade neschválenia žiadosti o platbu (globálny grant), vracia predmetnú žiadosť o platbu (globálny grant) v stanovenej lehote 3 pracovných dní od prijatia žiadosti o platbu (globálny grant) v ITMS riadiacemu orgánu, ktorý postupuje podľa bodu 12b);
c)	žiadosti o platbu (globálny grant) (zúčtovanie zálohovej platby) vrátenej z certifikačného orgánu v zmysle bodu A.16 a A.17 za účelom odstránenia identifikovaných nedostatkov:
i.	v prípade, ak sa dôvody vrátenia žiadosti o platbu (globálny grant) z certifikačného orgánu týkajú úrovne platobnej jednotky, platobná jednotka odstráni zistené nedostatky na svojej úrovni a najneskôr nasledujúci pracovný deň, resp. podľa postupov a termínov stanovených certifikačným orgánom, zahrnie predmetnú žiadosť o platbu (globálny grant) do mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu, ktorú predkladá certifikačnému orgánu najneskôr nasledujúci pracovný deň po jej zostavení. Certifikačný orgán následne postupuje podľa bodov B.14 až B.16;
ii.	v prípade, ak sa dôvody vrátenia žiadosti o platbu (globálny grant) z certifikačného orgánu týkajú úrovne riadiaceho orgánu, platobná jednotka najneskôr nasledujúci pracovný deň po prijatí žiadosti o platbu (globálny grant) z certifikačného orgánu vracia predmetnú žiadosť o platbu (globálny grant) riadiacemu orgánu, ktorý postupuje podľa bodu 12b);
d)	žiadosti o platbu (globálny grant) (zúčtovanie zálohovej platby) (v rámci ktorej boli výdavky schválené certifikačným orgánom v plnej výške) vrátenej z certifikačného orgánu v zmysle bodu A.17 za účelom zaradenia do mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu po prijatí informácie o záveroch z certifikačného overovania platobná jednotka zahrnie predmetnú žiadosť o platbu (globálny grant) najneskôr nasledujúci pracovný deň, resp. podľa postupov a termínov stanovených certifikačným orgánom do mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu, ktorú predkladá certifikačnému orgánu najneskôr nasledujúci pracovný deň po jej zostavení. Certifikačný orgán následne postupuje podľa bodov B.14 až B.16.
A.	Postup overenia súhrnnej žiadosti o platbu certifikačným orgánom:
A.14.V prípade predloženej súhrnnej žiadosti o platbu certifikačný orgán vykoná overenie na svojej úrovni, ktoré zahrňuje administratívne overenie, prípadne certifikačné overovanie. Taktiež overuje súhrnnú žiadosť o platbu z hľadiska neprekročenia / dodržania celkovej alokácie podľa prioritných osí na základe čiastkového výkazu výdavkov predloženého platobnou jednotkou. V prípade potreby si od riadiaceho orgánu alebo platobnej jednotky vyžiadava ďalšie informácie nevyhnutné pre posúdenie predloženej súhrnnej žiadosti o platbu.
A.15.Ak certifikačný orgán na svojej úrovni vykoná overenie žiadosti o platbu (globálny grant) zaradenej do súhrnnej žiadosti o platbu a toto overenie žiadosti o platbu (globálny grant):
a)	je ukončené v lehote na overenie súhrnnej žiadosti o platbu, postupuje certifikačný orgán ďalej podľa bodu A.16;
b)	nie je ukončené v lehote na overenie súhrnnej žiadosti o platbu, postupuje certifikačný orgán ďalej podľa bodu A.17.
A.16.Certifikačný orgán do 10 pracovných dní od prijatia súhrnnej žiadosti o platbu súhrnnú žiadosť o platbu schváli v plnej výške, schváli v zníženej výške o sumu žiadosti o platbu (globálny grant), v ktorej boli v rámci overovania certifikačným orgánom zistené nedostatky, schváli v zníženej výške o sumu žiadosti o platbu (globálny grant), ktorá je predmetom overovania, schvaľovanie pozastaví23 alebo neschváli. Žiadosť o platbu (globálny grant), v rámci ktorej boli zistené nedostatky, ktoré majú vplyv na výšku a / alebo oprávnenosť výdavkov certifikačný orgán vráti platobnej jednotke, ktorá následne postupuje podľa bodu 13c) a súhrnnú žiadosť o platbu certifikačný orgán schvaľuje v zníženej výške. 
A.17.Certifikačný orgán do 15 pracovných dní od prijatia súhrnnej žiadosti o platbu ukončí overovanie žiadosti o platbu (globálny grant) zo súhrnnej žiadosti o platbu, ktorá bola schválená v zníženej výške v zmysle bodu A.16 (súhrnná žiadosť o platbu schválená v zníženej výške o sumu žiadosti o platbu (globálny grant), ktorá je predmetom overovania) a informuje platobnú jednotku o záveroch certifikačného overovania, v nadväznosti na ktoré platobná jednotka postupuje v zmysle bodu 13c) alebo 13d).
A.18.Certifikačný orgán v deň schválenia súhrnnej žiadosti o platbu a po jej spracovaní v ITMS informuje platobnú jednotku a v závislosti od zostatku na mimorozpočtovom účte prevádza prostriedky EÚ na príslušný príjmový účet platobnej jednotky.
B.	Postup overenia mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu certifikačným orgánom:
B.14.V prípade predloženej mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu certifikačný orgán vykoná overenie na svojej úrovni, ktoré zahrňuje len administratívne overenie. Taktiež overuje mimoriadnu súhrnnú žiadosť o platbu z hľadiska neprekročenia / dodržania celkovej alokácie podľa prioritných osí na základe čiastkového výkazu výdavkov predloženého platobnou jednotkou.
B.15.Certifikačný orgán mimoriadnu súhrnnú žiadosť o platbu schváli alebo neschváli do 7 pracovných dní od prijatia mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu.
B.16.Certifikačný orgán v deň schválenia mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu a po jej spracovaní v ITMS informuje platobnú jednotku a v závislosti od zostatku na mimorozpočtovom účte prevádza prostriedky EÚ na príslušný príjmový účet platobnej jednotky.
Riadiaci orgán najneskôr do 31. decembra 2015 uchováva originál žiadosti o platbu (globálny grant), originál návrhu správy z kontroly (ak je relevantné), originál správy z kontroly, výpisy z účtov, jeden rovnopis účtovných dokladov alebo kópie18 účtovných dokladov označené podpisom štatutárneho orgánu sprostredkovateľského orgánu pre globálny grant.
Sprostredkovateľský orgán pre globálny grant, ktorý získava pomoc aj z iného zdroja, je povinný viesť samostatné záznamy o každom zdroji pomoci. 
Platobná jednotka uchováva originál súhrnnej žiadosti o platbu / mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu, originál príslušnej časti formulára žiadosti o platbu (globálny grant).
6.8.2	Poskytnutie platby sprostredkovateľským orgánom pre globálny grant prijímateľovi
6.8.2.1	Systém refundácie pri implementácii globálnych grantov
Pri systéme refundácie sa prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie preplácajú v pomere stanovenom v zmluve o poskytnutí nenávratného finančného príspevku na základe skutočne vynaložených výdavkov prijímateľom, tzn. že prijímateľ realizuje výdavky najskôr z vlastných zdrojov a tie mu budú pri jednotlivých platbách refundované (preplatené) v pomernej výške. Každá platba prijímateľovi z prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie je realizovaná len do výšky súčtu pomeru prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie schváleného v zmluve o poskytnutí nenávratného finančného príspevku. 
Postup a rozsah predkladania dokumentácie od prijímateľa preukazujúcej oprávnenosť výdavkov určuje sprostredkovateľský orgán pre globálny grant v zmluve o poskytnutí nenávratného finančného príspevku.
1.	Prijímateľ uhradí výdavky z vlastných zdrojov.
2.	Prijímateľ žiada sprostredkovateľský orgán pre globálny grant o ich preplatenie v zmysle zmluvy o poskytnutí nenávratného finančného príspevku.
3.	Sprostredkovateľský orgán pre globálny grant vykoná kontrolu dokumentácie predloženej prijímateľom na základe podmienok a postupov pre výkon kontroly definovaných v Systéme riadenia európskych štrukturálnych a investičných fondov na programové obdobie 2014 – 2020 a v súlade so zmluvou uzatvorenou medzi riadiacim orgánom a sprostredkovateľským orgánom pre globálny grant.
4.	Po vykonaní kontroly dokumentácie predloženej prijímateľom sprostredkovateľský orgán pre globálny grant deklarované výdavky prijímateľa schváli (schváli deklarované výdavky prijímateľa v plnej výške), deklarované výdavky schváli v zníženej sume (schváli deklarované výdavky vo výške zníženej o sumu neoprávnených výdavkov), schvaľovanie predložených výdavkov pozastaví20 alebo ich zamietne. 
5.	Sprostredkovateľský orgán pre globálny grant bezodkladne21 po schválení dokumentácie predloženej prijímateľom, prevádza prijímateľovi finančné prostriedky pomerne za zdroj EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie v zmysle zmluvy o poskytnutí nenávratného finančného príspevku.
6.	Sprostredkovateľský orgán pre globálny grant sumarizuje relevantnú dokumentáciu predloženú prijímateľom, ktorá slúži ako podklad pre zúčtovanie zálohovej platby sprostredkovateľským orgánom pre globálny grant. Následne sprostredkovateľský orgán pre globálny grant postupuje v zmysle časti 6.8.1, časť "Etapa zúčtovania zálohovej platby sprostredkovateľským orgánom pre globálny grant".
6.9	Prechod a prevod práv a povinností prijímateľa na iný subjekt
V prípade prechodu alebo prevodu práv a povinností prijímateľa na iný subjekt je prijímateľ povinný s dostatočným časovým predstihom informovať riadiaci orgán o pripravovanom prechode alebo prevode práv a povinností na iný subjekt. Následne je riadiaci orgán povinný zabezpečiť vysporiadanie platieb a vrátení súvisiacich s prechodom alebo prevodom práv a povinností prijímateľa na iný subjekt. 
Prijímateľ a riadiaci orgán v závislosti od systémov financovania postupujú nasledovne:
a)	systém predfinancovania: 
•	prijímateľ vystaví žiadosť o platbu (poskytnutie predfinancovania) pre všetky záväzky, ktoré vyplývajú z implementácie projektu (záväzky voči dodávateľom / zhotoviteľom, a pod.), a ktoré vzniknú pred prechodom a prevodom práv a povinností na iný subjekt, a to v zmysle bodov 1 a 2 časti 6.1 (resp. v prípade štátnych rozpočtových organizácií v zmysle bodov 1 a 2 časti 6.2);
•	riadiaci orgán postupuje pri poskytnutí predfinancovania v zmysle bodov 3 až 6 časti 6.1 (resp. v prípade štátnych rozpočtových organizácií v zmysle bodov 3 a 6 časti 6.2);
•	po poskytnutí predfinancovania prijímateľ uhradí všetky záväzky, ktoré vyplývajú z implementácie projektu (záväzky voči dodávateľom / zhotoviteľom, a pod.), a ktoré vznikli pred prechodom práv a povinností na iný subjekt v zmysle bodov 9 a 10 časti 6.1 (resp. v prípade štátnych rozpočtových organizácií v zmysle bodov 9 a 10 časti 6.2);
•	riadiaci orgán postupuje pri zúčtovaní poskytnutého predfinancovania v zmysle bodov 11 až 13 časti 6.1 (resp. v prípade štátnych rozpočtových organizácií v zmysle bodov 11 až 13 časti 6.2);
•	v prípade, ak prijímateľ nezúčtuje celú výšku poskytnutého predfinancovania, prevedie zostatok nezúčtovanej časti predfinancovania na účet platobnej jednotky v súlade s časťou 4.5.9;
b)	systém zálohových platieb:
•	prijímateľ z poskytnutej zálohovej platby uhradí všetky záväzky, ktoré vyplývajú z implementácie projektu (záväzky voči dodávateľom / zhotoviteľom, a pod.), a ktoré vznikli pred prechodom práv a povinností na iný subjekt. Tieto výdavky zahrnie do žiadosti o platbu (zúčtovanie zálohovej platby), ktorú predloží riadiacemu orgánu podľa bodu 7 časti 6.3 (resp. v prípade štátnych rozpočtových organizácií v zmysle bodu 7 časti 6.4);
•	prijímateľ prevedie zostatok zálohovej platby, resp. nezúčtovaný rozdiel zálohovej platby na účet platobnej jednotky v súlade s časťou 4.5.9;
c)	systém refundácie:
•	prijímateľ vykoná úhradu všetkých svojich záväzkov, ktoré vyplývajú z implementácie projektu (záväzky voči dodávateľom / zhotoviteľom, a pod.), a ktoré vznikli pred prechodom alebo prevodom práv a povinností na iný subjekt. Následne predloží zrealizované výdavky (systémom refundácie) podľa bodu 2 časti 6.5.
K prevodu práv a povinností prijímateľa na iný subjekt môže dôjsť až po zúčtovaní zrealizovaných výdavkov, t. j. po predložení žiadosti o platbu (zúčtovanie predfinancovania, zúčtovanie zálohovej platby, priebežná platba) riadiacemu orgánu a ich následnom schválení certifikačným orgánom v súhrnnej žiadosti o platbu / mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu, resp. o vrátení nezúčtovanej časti poskytnutého predfinancovania (v prípade systému predfinancovania) a / alebo vrátení nezúčtovanej časti zálohovej platby (v prípade systému zálohových platieb). 
V súvislosti s prechodom práv a povinností prijímateľa na iný subjekt je potrebné zabezpečiť zúčtovanie zrealizovaných výdavkov, t. j. predloženie žiadosti o platbu (zúčtovanie predfinancovania, zúčtovanie poskytnutej zálohovej platby, priebežná platba) riadiacemu orgánu a ich následné schválenie certifikačným orgánom v súhrnnej žiadosti o platbu / mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu, resp. zabezpečiť vrátenie nezúčtovanej časti poskytnutého predfinancovania (v prípade systému predfinancovania) a / alebo zabezpečiť vrátenie nezúčtovanej časti zálohovej platby (v prípade systému zálohových platieb). 
Postup pre evidenciu prechodu a prevodu práv a povinností na iný subjekt v ITMS upravuje samostatný postup, ktorý je uverejnený v ITMS.

7	Systém certifikácie
Certifikáciu vykonáva certifikačný orgán v dvoch etapách:
1.	pri príprave žiadosti o platbu Európskej komisii,
2.	pri príprave účtov.
Základom pre uskutočnenie certifikácie podľa bodu 1 je žiadosť o platbu a výkaz výdavkov, ktorý certifikačný orgán vypracuje na základe schválených súhrnných žiadostí o platbu / mimoriadnych súhrnných žiadostí o platbu. 
Certifikačný orgán sa pred certifikáciou žiadosti o platbu Európskej komisii musí ubezpečiť, že: 
a)	výdavky deklarované v žiadosti o platbu vychádzajú zo spoľahlivých účtovných systémov a sú založené na overiteľnej podpornej dokumentácii a boli predmetom overenia riadiacim orgánom (v zmysle čl. 126 písm. a) nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a vykonávacieho nariadenia Komisie (EÚ) č. 1011/2014);
b)	je zabezpečený systém na zaznamenávanie a uchovávanie účtovných záznamov o každej operácii v elektronickej podobe, ktorý potvrdzuje všetky údaje potrebné na vypracovanie žiadostí o platbu a účtov vrátane záznamov vymáhateľných súm, vrátených súm a súm vybraných po zrušení celého príspevku na projekt alebo program alebo časti tohto príspevku. Pri zabezpečení uvedenej podmienky certifikačný orgán vychádza z ISUF, ITMS a SFC (v zmysle čl. 126 písm. d) nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a vykonávacieho nariadenia Komisie (EÚ) č. 1011/2014);
c)	dostal od riadiaceho orgánu primerané informácie o postupoch a overeniach vykonaných v súvislosti s výdavkami. Pre tento účel riadiaci orgán predkladá informáciu o kontrolách vykonaných v zmysle čl. 125 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 v rozsahu a forme stanovenej certifikačným orgánom (v zmysle čl. 126 písm. e) nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a vykonávacieho nariadenia Komisie (EÚ) č. 1011/2014). Zohľadňujúc skutočnosť, že na národnej úrovni sú zavedené aj iné kontrolné mechanizmy, predkladá riadiaci orgán a platobná jednotka certifikačnému orgánu v zmysle § 35 ods. 3 zákona č. 292/2014 Z. z. o príspevku poskytovanom z európskych štrukturálnych a investičných fondov a o zmene a doplnení niektorých zákonov správy o výsledkoch kontrol podľa osobitného predpisu, auditu podľa osobitného predpisu a opatrenia prijaté na odstránenie nedostatkov zistených touto kontrolou a auditom, pokiaľ sa týkajú implementácie príslušného programu. Jedným z dôležitých podkladov slúžiacich k získaniu uistenia o správnosti postupov riadiaceho orgánu a platobnej jednotky sú aj manuály procedúr, ktoré zasiela riadiaci orgán a platobná jednotka certifikačnému orgánu v zmysle časti 3.2. V zmysle časti 3.2 riadiaci orgán zároveň poskytuje certifikačnému orgánu aj záverečné správy z výberu žiadostí o poskytnutie nenávratného finančného príspevku;
d)	boli zohľadnené výsledky všetkých vládnych auditov vykonaných orgánom auditu a spolupracujúcimi orgánmi. O správach z vládnych auditov je certifikačný orgán informovaný prostredníctvom CEDIS. Na základe správ z vládnych auditov a informácie od orgánu auditu certifikačný orgán vykoná prípadnú úpravu žiadosti o platbu (v zmysle čl. 126 písm. f) nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a vykonávacieho nariadenia Komisie (EÚ) č. 1011/2014);
e)	sú vedené účtovné záznamy v elektronickej podobe o výdavkoch vykázaných Európskej komisii a príslušných verejných príspevkoch vyplatených prijímateľom. Pri zabezpečení uvedenej podmienky certifikačný orgán vychádza zo systémov ISUF, ITMS a SFC (vyplýva z čl. 126 písm. g) nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a vykonávacieho nariadenia Komisie (EÚ) č. 1011/2014);
f)	sú vedené záznamy o vymáhateľných sumách a sumách vybraných po zrušení celého príspevku na projekt alebo jeho časti. Vrátené sumy sa vyplatia naspäť do rozpočtu EÚ pred ukončením programu tak, že sa odpočítajú z nasledujúceho výkazu výdavkov (vyplýva z čl. 126 písm. h) nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a vykonávacieho nariadenia Komisie (EÚ) č. 1011/2014).
Základom pre uskutočnenie certifikácie podľa bodu 2 sú účty vypracované v zmysle čl.137 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a časti 4.5.8. Certifikačný orgán sa pred certifikáciou účtov Európskej komisii musí ubezpečiť, že: 
a)	zahrnuté výdavky týkajúce sa účtovného roka boli skutočne realizované v rámci obdobia oprávnenosti stanoveného v zmysle čl. 65 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013;
b)	účty sú úplné, presné a pravdivé a že zaúčtované výdavky sú v súlade s uplatniteľným právom (vyplýva z čl. 126 písm. c) nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a vykonávacieho nariadenia Komisie č. 1011/2014). O uvedenom sa certifikačný orgán uistí na základe podkladov poskytnutých riadiacim orgánom, orgánom auditu, ako aj na základe vlastných overovaní (vyplýva z § 35 ods. 2 zákona č. 292/2014 Z. z. o príspevku poskytovanom z európskych štrukturálnych a investičných fondov a o zmene a doplnení niektorých zákonov);
c)	všetky výdavky zahrnuté v priložených výkazoch týkajúcich sa účtovného roka sú v súlade s kritériami oprávnenosti stanovenými v čl. 65 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a boli vyplatené pri realizácii operácií vybraných v rámci programu v súlade s podmienkami pre poskytovanie verejných príspevkov podľa platných predpisov EÚ. Na tento účel riadiaci orgán po skončení účtovného roka dokončí všetky potrebné overenia výdavkov príslušného účtovného roku pripraví a predloží certifikačnému orgánu podľa čl. 125 ods. 4 písm. e) nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 do 30. septembra po skončení účtovného roku návrh Ročného súhrnu konečných audítorských správ a výsledkov uskutočnených kontrol (vyplýva z čl. 126 písm. c) nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a vykonávacieho nariadenia Komisie č. 1011/2014) a v prípade potreby aj ďalšie informácie v rozsahu a forme stanovenej certifikačným orgánom. Do 15. decembra po skončení účtovného roku predloží riadiaci orgán certifikačnému orgánu Vyhlásenie riadiaceho orgánu o vierohodnosti a Ročný súhrn konečných audítorských správ a výsledkov uskutočnených kontrol vrátane analýzy o povahe a rozsahu chýb a slabých stránkach nájdených v systémoch riadenia a kontroly a o akýchkoľvek prijatých opravných opatreniach SR. Tieto dokumenty certifikačný orgán zohľadní na prípadnú úpravu účtov. Zohľadňujúc skutočnosť, že na národnej úrovni sú zavedené aj iné kontrolné mechanizmy, predkladá riadiaci orgán a platobná jednotka certifikačnému orgánu v zmysle § 35 ods. 3 písm. c) zákona č. 292/2014 Z. z. o príspevku poskytovanom z európskych štrukturálnych a investičných fondov a o zmene a doplnení niektorých zákonov správy o výsledkoch kontrol podľa osobitného predpisu30, auditu podľa osobitného predpisu31 a opatrenia prijaté na odstránenie nedostatkov zistených touto kontrolou a auditom, pokiaľ sa týkajú implementácie príslušného programu;
d)	je zabezpečený systém na zaznamenávanie a uchovávanie účtovných záznamov o každej operácii v elektronickej podobe, ktorý potvrdzuje všetky údaje potrebné na vypracovanie žiadostí o platbu a účtov vrátane záznamov vymáhateľných súm, vrátených súm a súm vybraných po zrušení celého príspevku na operáciu alebo program alebo časti tohto príspevku (vyplýva z čl. 126 písm. d) nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a vykonávacieho nariadenia Komisie (EÚ) č. 1011/2014). Pri zabezpečení uvedenej podmienky certifikačný orgán vychádza z ISUF, ITMS a SFC;
e)	boli zohľadnené výsledky všetkých vládnych auditov vykonaných orgánom auditu a spolupracujúcim orgánmi (vyplýva z čl. 126 písm. f) nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a vykonávacieho nariadenia Komisie (EÚ) č. 1011/2014). O správach z vládnych auditov je certifikačný orgán informovaný prostredníctvom CEDIS. Správy z vládnych auditov sú zosumarizované v kontrolnej správe a zohľadnené v stanovisku podľa čl. 127 ods. 5 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013. Na základe kontrolnej správy a stanoviska podľa čl. 127 ods. 5 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 certifikačný orgán vykoná prípadné úpravy účtov;
f)	boli dodržané ustanovenia čl.140 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 týkajúcich sa dostupnosti dokumentov. O uvedenom sa certifikačný orgán uistí na základe podkladov poskytnutých riadiacim orgánom, orgánom auditu, ako aj na základe vlastných overovaní príspevku (vyplýva vykonávacieho nariadenia Komisie (EÚ) č. 1011/2014).
S cieľom presvedčiť sa o správnosti, zákonnosti, oprávnenosti a overiteľnosti výdavkov, ako aj správnosti a zákonnosti postupu riadiaceho orgánu a platobnej jednotky pri realizácii príspevku je certifikačný orgán v rámci svojich kompetencií v ktorejkoľvek etape, najneskôr však pred predložením účtov Európskej komisii, oprávnený uskutočniť certifikačné overovanie. Certifikačné overovanie môže byť vykonané na súhrnnej žiadosti o platbu v ktoromkoľvek momente pred zaslaním účtov Európskej komisii, do ktorých bude predmetná súhrnná žiadosť o platbu zaradená, t. j. pred schválením súhrnnej žiadosti o platbu certifikačným orgánom alebo po jej schválení certifikačným orgánom. Z hľadiska rozsahu môže byť certifikačné overovanie vykonané aj so zameraním na tematické okruhy problémov, napr. výber žiadosti o nenávratný finančný príspevok, verejné obstarávanie, štátnu pomoc, oprávnenosť, publicitu, dodržiavanie postupov stanovených v manuáli procedúr a podobne. Výstupom certifikačného overovania sú zistenia a odporúčania z certifikačného overovania, ktoré certifikačný orgán predkladá na riadiaci orgán a platobnú jednotku.
Ak sú pri výkone certifikačného overovania identifikované závažné nedostatky, ktoré môžu mať priamy dopad na vznik nezrovnalosti alebo na vznik podozrenia z nezrovnalosti, certifikačný orgán môže požiadať riadiaci orgán o opätovné vykonanie administratívnej kontroly a vypracovanie správy o zistenej nezrovnalosti v zmysle usmernenia k nezrovnalostiam a finančným opravám. V prípade zistenia alebo podozrenia vzniku nezrovnalosti s finančným dopadom, môže byť súhrnná žiadosť o platbu / mimoriadna súhrnná žiadosť o platbu schválená v zníženej sume (o sumu zodpovedajúcej problematickej žiadosti o platbu, ktorej certifikačné overovanie má za následok zníženie súhrnnej žiadosti o platbu / mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu), alebo môže byť pozastavené financovanie projektu až do odstránenia zistených nedostatkov. Certifikačný orgán pri schvaľovaní súhrnnej žiadosti o platbu / mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu postupuje ďalej podľa časti 6.
V prípade, ak neboli splnené podmienky na certifikáciu žiadosti o platbu na Európsku komisiu alebo účtov, certifikačný orgán informuje riadiaci orgán a platobnú jednotku o zistených nedostatkoch. Pokiaľ riadiaci orgán alebo platobná jednotka poskytne certifikačnému orgánu prijateľné vysvetlenie pre vzniknuté nedostatky, alebo navrhne vhodné nápravné opatrenia na odstránenie nedostatkov a certifikačný orgán získa potrebné uistenie o ich uskutočnení, certifikuje žiadosť o platbu na Európsku komisiu, resp. certifikuje účty.

8	Nezrovnalosti a finančné opravy
V súlade s nariadením Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 s delegovaným nariadením Komisie (EÚ) č. 2015/1970 sa pod pojmom:
•	"nezrovnalosť" rozumie akékoľvek porušenie práva Únie alebo vnútroštátneho práva týkajúceho sa jeho uplatňovania, vyplývajúce z konania alebo opomenutia hospodárskeho subjektu, ktorý sa zúčastňuje na vykonávaní európskych štrukturálnych a investičných fondov, dôsledkom čoho je alebo by bol negatívny dopad na rozpočet Únie zaťažením všeobecného rozpočtu neoprávneným výdavkom;
•	"systémová nezrovnalosť" rozumie každá nezrovnalosť, ktorá sa môže vyskytnúť opakovane, s vysokou pravdepodobnosťou výskytu pri podobnom type operácií a ktorá je dôsledkom závažného nedostatku účinného fungovania systémov riadenia a kontroly, a to vrátane nestanovenia vhodných postupov. V prípade zistenia systémovej nezrovnalosti členský štát je povinný rozšíriť svoje vyšetrovanie na všetky operácie, ktoré by mohli byť negatívne ovplyvnené systémovou nezrovnalosťou;
•	"podozrenie z podvodu" rozumie nezrovnalosť, ktorá vyvolá začatie správneho alebo súdneho konania na vnútroštátnej úrovni s cieľom zistiť existenciu úmyselného správania, najmä podvodu podľa čl. 1 ods. 1 písm. a) Dohovoru vypracovaného na základe článku K.3 Zmluvy o Európskej únii o ochrane finančných záujmov Európskych spoločenstiev;
•	"prvý správny alebo súdny nález" rozumie prvý písomný posudok príslušného orgánu (správneho alebo súdneho) so závermi na základe určitých skutočností o tom, že k nezrovnalosti došlo, bez toho, aby bola dotknutá možnosť, že tento záver sa možno bude musieť následne prehodnotiť alebo zrušiť v dôsledku vývoja v priebehu správneho alebo súdneho postupu
•	"závažný nedostatok v účinnom fungovaní systému riadenia a kontroly" rozumie nedostatok, ktorý vyžaduje podstatné zlepšenie systému, ktorý vystavuje európsky štrukturálny a investičný fond závažnému riziku nezrovnalostí a ktorého existencia nie je zlučiteľná s audítorským stanoviskom bez výhrad k fungovaniu systému riadenia a kontroly;
•	"finančná oprava" sa rozumie úprava výdavkov následkom porušenia uplatniteľného práva Únie alebo vnútroštátneho práva, ktoré boli vykázané Európskej komisii alebo sú predmetom schvaľovania na národnej úrovni. Finančnú opravu je možné vykonať režimom ex ante, t. j. vo fáze pred schválením a úhradou deklarovaných výdavkov alebo režimom ex post, t. j. vo fáze po schválení a realizovanej úhrade deklarovaných výdavkov. Európska komisia pri rozhodovaní o finančnej oprave dodržiava zásadu proporcionality tým, že zohľadní povahu a závažnosť porušenia uplatniteľného práva Únie alebo vnútroštátneho práva a jeho finančné dôsledky pre rozpočet EÚ. Členské štáty vykonávajú požadované finančné opravy v súvislosti s individuálnymi alebo systémovými nezrovnalosťami zistenými v jednotlivých fázach implementácie a financovania operácií a programov.
Nezrovnalosť vznikne v dôsledku porušenia právnych predpisov EÚ alebo Slovenskej republiky, prípadne porušením zmluvných dokumentov, ktoré upravujú pravidlá a podmienky pre poskytnutie alebo použitie finančných prostriedkov EÚ a finančných prostriedkov štátneho rozpočtu na spolufinancovanie, úmyselného alebo spôsobeného z nedbanlivosti, pričom toto porušenie vyplýva z konania alebo opomenutia konania subjektu (riadiaceho orgánu alebo prijímateľa / partnera) a jeho dôsledkom je alebo by mohlo byť poškodenie rozpočtu EÚ alebo rozpočtu verejnej správy. Pre vznik nezrovnalosti forma zavinenia nie je rozhodujúca, nezrovnalosti, ktoré majú charakter trestných činov (napr. poškodzovania finančných záujmov ES, podvodov, korupcie, prijímania úplatku, podplácania atď.) sú nezrovnalosti spôsobené úmyselným konaním alebo z nedbanlivosti. Za nezrovnalosť sa považuje aj porušenie právnych prepisov EÚ alebo Slovenskej republiky, ktoré vo svojich ustanoveniach chránia finančné záujmy EÚ. Nezrovnalosti sa môžu vyskytovať na všetkých úrovniach v procese implementácie a finančného riadenia štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu, tzn. vrátane úrovne konania, resp. opomenutia konania prijímateľa alebo partnera, pokiaľ neboli dodržané podmienky poskytnutia alebo použitia finančných prostriedkov EÚ.
Z pohľadu legislatívy Slovenskej republiky má na vznik nezrovnalosti priamy dopad najmä: 
•	porušenie finančnej disciplíny podľa § 31 ods. 1 zákona č. 523/2004 Z. z. o rozpočtových pravidlách verejnej správy, pričom § 31 zákona č. 523/2004 Z. z. o rozpočtových pravidlách verejnej správy definuje jednotlivé skutkové podstaty porušenia finančnej disciplíny. Nezrovnalosť nemusí vždy predstavovať porušenie finančnej disciplíny a naopak porušenie finančnej disciplíny nemusí vždy zodpovedať nezrovnalosti;
•	porušenie pravidiel a postupov verejného obstarávania podľa rozhodnutia Komisie č. C(2013) 9527 o stanovení a schválení usmernení o určení finančných opráv v platnom znení, ktoré má Komisia uplatňovať na výdavky financované Úniou v rámci zdieľaného hospodárenia pri nedodržaní pravidiel verejného obstarávania a podľa zákona č. 25/2006 Z. z. o verejnom obstarávaní; 
•	porušenie ochrany hospodárskej súťaže podľa zákona č. 136/2001 Z. z. o ochrane hospodárskej súťaže a o zmene a doplnení niektorých zákonov v znení neskorších predpisov najmä pre prípady kartelov, zneužívania dominantného postavenia, vertikálnych dohôd, koncentrácie alebo obmedzenia hospodárskej súťaže; 
•	protiprávne konanie ako trestný čin podľa zákona č. 300/2005 Z. z. trestný zákon v znení neskorších predpisov najmä pre trestné činy poškodzovania finančných záujmov ES, subvenčný podvod alebo machinácie pri verejnom obstarávaní a verejnej dražbe. 
V prípade podozrenia alebo zistenia závažného nedostatku alebo systémovej nezrovnalosti môže certifikačný orgán v odôvodnených prípadoch, pozastaviť platby pre príslušný program, resp. relevantnú časť programu alebo znížiť výšku deklarovaných výdavkov v rámci výkazu výdavkov, pričom následne informuje orgán auditu, riadiaci orgán a platobnú jednotku pre príslušný program.
Podrobné postupy pre fázy vývoja nezrovnalostí, riešenie nezrovnalostí a súvisiace úlohy a zodpovednosti zapojených subjektov do procesu finančného riadenia štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu sú upravené v metodickom usmernení Ministerstva financií SR č. 2/2015 – U k nezrovnalostiam a finančným opravám v rámci finančného riadenia štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu na programové obdobie 2014 – 2020.
8.1	Nezrovnalosti
V rámci systému ochrany finančných záujmov legislatíva EÚ určuje povinnosti členským štátom pre oznamovanie a administráciu nezrovnalostí, individuálnych alebo systémových nezrovnalostí a podozrenia z podvodu. Na účely ďalšieho využitia informácií oznamovaných Európskemu úradu pre boj proti podvodom, legislatíva EÚ určuje rozsah informácií a údajov, ktoré sú poskytované v štruktúre podľa dokumentu správa o zistenej nezrovnalosti.
Slovenská republika je povinná v súlade s čl. 122 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 predchádzať, zisťovať a opravovať nezrovnalosti a vymáhať neoprávnene vyplatené sumy spolu s úrokmi z omeškania. O nezrovnalostiach, ktoré presahujú 10 000 EUR za prostriedky EÚ a o nezrovnalostiach, ktoré boli predmetom prvého správneho alebo súdneho nálezu, ako aj o významnom pokroku v rámci správnych konaní / súdnych konaní členský štát je povinný informovať Európsku komisiu. V rámci oznamovacej povinnosti členského štátu sú podľa čl. 122 ods. 2 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 stanovené výnimky z oznamovacej povinnosti pre tieto prípady zistených nezrovnalostí: 
•	prípady, keď realizácia operácie zlyhala úplne alebo čiastočne v dôsledku konkurzu prijímateľa alebo partnera; 
•	prípady, na ktoré prijímateľ alebo partner upozornil riadiaci orgán alebo certifikačný orgán dobrovoľne a skôr, ako niektorý z týchto orgánov danú nezrovnalosť zistil, či už pred alebo po vyplatení verejného príspevku; 
•	prípady, ktoré zistil a opravil riadiaci orgán alebo certifikačný orgán pred zahrnutím príslušných výdavkov do výkazu výdavkov, ktorý sa predkladá Európskej komisii.
Vo všetkých ostatných prípadoch, najmä v prípadoch predchádzajúcich konkurzu alebo v prípadoch podozrenia z podvodu sa zistené nezrovnalosti a súvisiace preventívne a nápravné opatrenia oznamujú Európskej komisii podľa podmienok stanovených v delegovaných nariadeniach Komisie (EÚ) č. 2015/1970 a č.2015/1974. Vo vzťahu k nezrovnalostiam bez finančného dopadu je Slovenská republika povinná oznamovať iba prípady nezrovnalostí zistených vo fáze pred výkonom platby prijímateľovi alebo partnerovi, ak ide súčasne o prípady podozrenia z podvodu alebo prípady, ktoré predchádzajú konkurzu prijímateľa alebo partnera.
Vo vzťahu k nezrovnalostiam bez finančného dopadu a zároveň prípadom podozrenia z podvodu, v nadväznosti na platnú právnu úpravu štátne orgány, vyššie územné celky, obce a iné povinné osoby sú povinné bez meškania oznamovať orgánom činným v trestnom konaní skutočnosti nasvedčujúce tomu, že bol spáchaný trestný čin.
Štruktúra kódov Európskeho úradu pre boj proti podvodom (OLAF EK) pre kvalifikáciu nezrovnalosti je uvedená v prílohe 4.
Z hľadiska určenia zásad systému riadenia a kontroly a zodpovedností národných orgánov priamo zapojených do procesu implementácie, nezrovnalosť môže zistiť riadiaci orgán, platobná jednotka, certifikačný orgán, orgán auditu alebo spolupracujúci orgán.
V rámci národných kontrolných alebo správnych orgánov môže nezrovnalosť zistiť aj Najvyšší kontrolný úrad SR, Úrad vládneho auditu, Úrad pre verejné obstarávanie, Protimonopolný úrad, Národná kriminálna agentúra Prezídia Policajného zboru alebo Úrad vlády SR v rámci výkonu svojich kompetencií. Nezrovnalosť môžu zistiť aj orgány Európskej komisie, Európsky dvor audítorov alebo Európsky úrad pre boj proti podvodom v rámci výkonu auditov a vyšetrovaní.
Nezrovnalosť môže zistiť samotný prijímateľ, partner, užívateľ alebo tretí subjekt, ktorý bezodkladne oznámi zistenú nezrovnalosť a predloží dokumenty preukazujúce zistenú nezrovnalosť riadiacemu orgánu. Následne je riadiaci orgán povinný zdokumentovať podozrenie z nezrovnalosti alebo zistenú nezrovnalosť v ITMS.
V rámci implementácie finančných nástrojov môže nezrovnalosť identifikovať samotný prijímateľ, ktorý identifikovanú nezrovnalosť bezodkladne oznámi zmluvnej strane podľa štruktúry uvedenej v prílohe 10 tohto materiálu riadiacemu orgánu a certifikačnému orgánu. Ak finančný sprostredkovateľ alebo konečný prijímateľ zistí nezrovnalosť, je povinný to bezodkladne oznámiť poskytovateľovi a prijímateľovi. 
Subjekty zapojené do systému riadenia a kontroly na národnej úrovni sú povinné všetky podozrenia z nezrovnalostí alebo zistené nezrovnalosti bezodkladne oznámiť riadiacemu orgánu. V súlade so všeobecnými zásadami systému riadenia a kontroly podľa čl. 72 písm. h) nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 je Slovenská republika povinná zabezpečiť najmä prevenciu, zisťovanie a opravu nezrovnalostí vrátane podvodu a vymáhania neoprávnene vyplatených súm vrátane všetkých úrokov z omeškania. Za riešenie nezrovnalostí v rámci programu je v podmienkach Slovenskej republiky zodpovedný riadiaci orgán. V prípade, ak riadiaci orgán poverí sprostredkovateľský orgán zodpovednosťou za riešenie nezrovnalostí, konečná zodpovednosť riadiaceho orgánu za riešenie nezrovnalostí v rámci programu tým nie je dotknutá.
Nezrovnalosť sa na národnej úrovni formálne zdokumentuje schválením správy o zistenej nezrovnalosti, a to v nadväznosti na schválenie / prerokovanie / zaslanie / oboznámenie / doručenie oficiálneho dokumentu podľa typu vykonanej kontroly / auditu / overovania, resp. nadobudnutie právoplatnosti rozhodnutia vydaného v správnom / súdnom konaní.
Podrobnosti pre zdokumentovanie nezrovnalosti a kvalifikáciu nezrovnalosti v jednotlivých prípadoch sú upravené v metodickom usmernení Ministerstva financií SR č. 2/2015-U k nezrovnalostiam a finančným opravám v rámci finančného riadenia štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu na programové obdobie 2014 – 2020 v platnom znení.
Ak riadiaci orgán, certifikačný orgán, orgán auditu alebo príslušný orgán, ktorý vydáva rozhodnutie v správnom konaní získa nové alebo dodatočné informácie podľa čl. 122 ods. 2 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 alebo čl. 4 delegovaného nariadenia Komisie (EÚ) č. 2015/1970, najmä o významnom pokroku a výsledku v rámci správnych konaní a súdnych konaní, uložených správnych alebo trestných sankcií alebo potrebe opravy už oznámených údajov aktualizuje správu o zistenej nezrovnalosti.
Riadiaci orgán, certifikačný orgán, orgán auditu alebo príslušný orgán, ktorý vydáva rozhodnutie v správnom konaní je povinný aktualizovať údaje o nezrovnalosti v ITMS a zabezpečiť oznamovaciu povinnosť voči certifikačnému orgánu a riadiacemu orgánu.
V súlade s čl. 2 delegovaného nariadenia Komisie (EÚ) č. 2015/1974 certifikačný orgán na základe zhromaždených údajov o oznámených nezrovnalostiach vypracuje súhrnný prehľad počiatočných správ o zistenej nezrovnalosti štvrťročne (k 15. máju, k 15. augustu, k 15. novembru a k 15. februáru), v ktorom uvedie nezrovnalosti podľa podmienok čl. 122 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a čl. 3 delegovaného nariadenia Komisie (EÚ) č. 2015/1970. O zistených počiatočných nezrovnalostiach informuje orgán zabezpečujúci ochranu finančných záujmov v nasledujúcej štvrťročnej správe o nezrovnalostiach Európsky úrad pre boj proti podvodom. Informácie o nezrovnalostiach nepresahujúcich čiastku 10 000 EUR predkladá orgán zabezpečujúci ochranu finančných záujmov Európskej komisii výlučne na jej žiadosť. Následné správy o zistených nezrovnalostiach podľa čl. 2 ods. 2 delegovaného nariadenia Komisie (EÚ) č. 2015/1974 orgán zabezpečujúci ochranu finančných záujmov je povinný oznámiť Európskemu úradu pre boj proti podvodom na základe dostupných aktualizácií v ITMS.
Orgán zabezpečujúci ochranu finančných záujmov je povinný okamžite oznámiť Európskej komisii a v prípade potreby ostatným dotknutým členským štátom nezrovnalosti, ktoré môžu mať následky mimo územia SR. Ide najmä o prípady nezrovnalostí spojených s nadnárodnými spoločnosťami, ktoré prostredníctvom svojich dcérskych organizácií pôsobia na území viacerých členských štátov EÚ alebo prípady nezrovnalostí zistených v rámci programov Európskej územnej spolupráce v rámci projektov realizovaných na princípe partnerstva. 
Podrobnosti pre zdokumentovanie nezrovnalosti, kvalifikáciu nezrovnalosti a ich oznamovanie sú upravené v metodickom usmernení Ministerstva financií SR č. 2/2015-U k nezrovnalostiam a finančným opravám v rámci finančného riadenia štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu na programové obdobie 2014 – 2020 v platnom znení.
8.2	Finančné opravy
Finančné opravy v súlade s čl. 143 až 147 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 vykonáva Slovenská republika alebo Európska komisia. Finančné opravy v súvislosti s individuálnymi alebo systémovými nezrovnalosťami zistenými v projektoch alebo programoch pozostávajú zo zrušenia celého príspevku na program alebo jeho časti.
Ak Európska komisia navrhne finančnú opravu, členský štát má príležitosť preukázať na základe preskúmania dotknutej dokumentácie, že rozsah nezrovnalosti je menší ako je vyhodnotenie Európskej komisie. Po dohode s Európskou komisiou môže riadiaci orgán proporčne obmedziť rozsah preskúmania dotknutej dokumentácie a s výnimkou odôvodnených prípadov môže byť lehota preskúmania predĺžená o najviac dva mesiace podľa čl. 145 ods. 2 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013. 
V súlade s čl. 145 ods. 4 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 pokiaľ riadiaci orgán (členský štát) neakceptuje predbežné závery k zisteniam Európskej komisie, v záujme potvrdenia, že Európska komisia disponuje všetkými relevantnými a dostupnými informáciami pre prijatie rozhodnutia o uplatnení finančnej opravy, bude členský štát pozvaný na vypočutie Európskou komisiou. V prípade, že členský štát a Európska komisia dospeje v rámci vypočutia k vzájomnej dohode, finančné prostriedky uvoľnené z uplatnenej finančnej opravy (nezrovnalosti s finančným dopadom na rozpočet EÚ) môžu byť opätovne použité do 31. decembra 2023 na príslušný program v súlade s podmienkami čl. 143 ods. 3 a 4 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013. 
Európska komisia príjme rozhodnutie k finančnej oprave v lehote do 6 mesiacov, ktorá začne plynúť 
•	odo dňa uskutočneného vypočutia členského štátu alebo
•	dva mesiace od dátumu písomného pozvania členského štátu na vypočutie v prípade, ak sa vypočutie neuskutoční. 
Podrobnosti pre určovanie a uplatňovanie finančných opráv sú upravené v metodickom usmernení Ministerstva financií SR č. 2/2015-U k nezrovnalostiam a finančným opravám v rámci finančného riadenia štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu na programové obdobie 2014 – 2020 v platnom znení.
8.2.1	Finančné opravy vykonané Slovenskou republikou
V súlade s postupom podľa čl. 143 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 finančné opravy z individuálnych alebo systémových nezrovnalostí zistených Slovenskou republikou v projektoch alebo programoch pozostávajú zo zrušenia celého príspevku na program alebo jeho časti. Členský štát vezme do úvahy povahu a závažnosť zistených nezrovnalostí a finančnú stratu spôsobenú fondom EÚ a uplatní primeranú finančnú opravu. Zdroje z fondov EÚ uvoľnené na základe uplatnenia finančnej opravy Slovenskou republikou je možné opätovne použiť v rámci príslušného programu do 31. decembra 2023 v súlade s čl. 143 ods. 3 a 4 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013. V prípade zistenia systémovej nezrovnalosti je členský štát v súlade s čl. 143 ods. 1 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 povinný rozšíriť svoje preskúmanie aj na výdavky / projekty dotknuté systémovou nezrovnalosťou. Finančná oprava je prostredníctvom nezrovnalosti zaznamenaná v ITMS a ISUF, resp. v účtovníctve certifikačného orgánu v účtovnom roku, v ktorom sa o zrušení celého príspevku na program alebo jeho časti rozhodlo. 
Finančné opravy v súvislosti s individuálnymi alebo systémovými nezrovnalosťami sa uplatnia v sume prostriedkov EÚ a pomerne všetkých ostatných zdrojov financovania zodpovedajúcich výške nezrovnalosti v rámci nasledovnej žiadosti o platbu na Európsku komisiu / účtov. Ak nie je možné odpočítanie prostriedkov zodpovedajúcich výške finančnej opravy od nasledovnej žiadosti o platbu na Európsku komisiu (napr. splatná suma prevyšuje výšku sumy uvedenej v nasledovnej žiadosti o platbu), vrátenie týchto finančných prostriedkov uskutoční certifikačný orgán spätným prevodom Európskej komisii.
V súlade s § 40 ods. 1 zákona č. 292/2014 Z. z. o príspevku poskytovanom z európskych štrukturálnych a investičných fondov a o zmene a doplnení niektorých zákonov / § 21 ods. 1 zákona č. 323/2015 Z. z. o finančných nástrojoch financovaných z európskych štrukturálnych a investičných fondov a o zmene a doplnení niektorých zákonov finančnú opravu môže vykonať riadiaci orgán, certifikačný orgán alebo orgán auditu pred ukončením programu.
Vykonanie finančných opráv v súvislosti s individuálnymi alebo systémovými nezrovnalosťami v rámci žiadosti o platbu na Európsku komisiu / účtov zabezpečuje certifikačný orgán dvoma spôsobmi:
•	stiahnutím príspevku alebo jeho časti z výkazu výdavkov v nasledujúcej žiadosti o platbu na Európsku komisiu / účtov okamžite, bez ohľadu nato, kedy je ukončený proces vysporiadania / vymáhania a kedy zodpovedajúce neoprávnené výdavky boli vysporiadané v prospech mimorozpočtového účtu certifikačného orgánu alebo
•	odpočítaním príspevku alebo jeho časti z výkazu výdavkov v nasledujúcej žiadosti o platbu na Európsku komisiu / účtov až po ukončení procesu vysporiadania / vymáhania, tzn. následným odpočítaním po ich pripísaní na príslušný mimorozpočtový účet certifikačného orgánu.
V prípade, ak výdavky projektu nemôžu byť certifikované ako oprávnené výdavky financované z rozpočtu EÚ na základe oznámenia o nezrovnalosti potom, ako boli dotknuté výdavky schválené v súhrnnej žiadosti o platbu / mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu a uhradené zdroje EÚ na príjmový účet platobnej jednotky / prijímateľa, v súlade s čl. 143 ods. 4 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 sa pristupuje k zníženiu nenávratného finančného príspevku, keďže príspevok zrušený v súvislosti s individuálnou nezrovnalosťou / systémovou nezrovnalosťou nemožno opätovne použiť na operáciu (projekt), ktorá bola predmetom opravy. 
Na účely správneho zaradenia finančných opráv do účtov podľa požiadaviek čl. 137 ods. 1 písm. b) nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a vykonávacieho nariadenia Komisie (EÚ) č. 1011/2014 stanovujúci vzor účtov, ak bola nezrovnalosť zistená na základe auditu Európskej komisie alebo vyšetrovania Európskeho úradu pre boj proti podvodom alebo Európskeho dvora audítorov, v správe o zistenej nezrovnalosti riadiaci orgán uvedie Európsku komisiu, Európsky úrad pre boj proti podvodom alebo Európsky dvor audítorov ako inštitúciu (alebo orgán), ktorá zistila nezrovnalosť.
V prípade zistenia nedostatku, resp. nezrovnalosti s následkom finančnej opravy orgánom auditu, ktorú má certifikačný orgán stiahnuť v účtoch, je schválená správa o zistenej nezrovnalosti predložená certifikačnému orgánu najneskôr v termíne do 30. novembra nasledujúceho po skončení účtovného roku.
Pri ukončení finančných nástrojov, ak prijímateľ nezabezpečil použitie prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie na účel pomoci definovaný v zmluve o financovaní do 31. decembra 2023, certifikačný orgán vykoná na základe dokumentov predložených riadiacim orgánom opravu výkazu výdavkov zodpovedajúcim spôsobom.
8.2.2	Finančné opravy vykonané Európskou komisiou
V súlade s postupmi podľa čl. 144 až 145 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 Európska komisia uskutočňuje finančné opravy v súvislosti s individuálnymi alebo systémovými nezrovnalosťami zrušením celého príspevku na program alebo jeho časti, keď po vykonaní potrebného preskúmania príde k záveru, že:
•	v účinnom fungovaní systému riadenia a kontroly programu existujú závažné nedostatky, ktoré ohrozili už vyplatený príspevok z rozpočtu EÚ na program;
•	členský štát si pred začatím opravného konania (vykonanie finančnej opravy Európskou komisiou) neplnil svoje povinnosti, t. j. členský štát neodhalil nezrovnalosti a neuskutočnil požadované finančné opravy a vymáhanie pohľadávok. V prípade systémovej nezrovnalosti členský štát nerozšíril svoje vyšetrovanie na všetky operácie, ktoré by mohli byť negatívne ovplyvnené systémovou nezrovnalosťou;
•	výdavky uvedené v žiadosti o platbu na Európsku komisiu sú neoprávnené a členský štát ich pred začatím opravného konania (vykonanie finančnej opravy Európskou komisiou) neopravil, t. j. členský štát neuskutočnil finančné opravy požadované Európskou komisiou. V prípade systémovej nezrovnalosti členský štát nerozšíril svoje vyšetrovanie na všetky operácie, ktoré by mohli byť negatívne ovplyvnené systémovou nezrovnalosťou.
V súlade s čl. 145 ods. 7 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013, ak Európska komisia alebo Európsky dvor audítorov zistí nezrovnalosť, ktorá poukazuje na závažný nedostatok v účinnom fungovaní systému riadenia a kontroly programu, uplatní finančnú opravu, ktorá predstavuje pre Slovenskú republiku definitívne zrušenie celého príspevku pre program alebo jeho časti, t. j. čistú stratu.
Európska komisia neuplatní definitívne zrušenie celého príspevku pre program alebo jeho časti iba v prípade, ak pred dátumom zistenia nezrovnalosti Európskou komisiou / Európskym dvorom audítorov bola dotknutá nezrovnalosť už predmetom zistenia aj členského štátu:
•	vo vyhlásení riadiaceho orgánu a ak sa prijmú príslušné nápravné opatrenia;
•	v kontrolnej správe orgánu auditu a ak sa prijmú príslušné nápravné opatrenia;
•	v audítorskom stanovisku orgánu auditu a ak sa prijmú príslušné nápravné opatrenia;
•	v účtoch a ak sa prijmú príslušné nápravné opatrenia;
•	v iných auditných správach orgánu auditu predkladaných Európskej komisii;
•	alebo bola súčasťou nápravných opatrení členského štátu. 
V tejto súvislosti certifikačný orgán neodpočíta predmetnú sumu finančnej opravy z nasledovnej žiadosti o platbu na Európsku komisiu, ale vrátenie tejto sumy príspevku z EÚ sa uskutoční spätným prevodom Európskej komisii v lehote splatnosti 2 mesiacov odo dňa vystavenia platobného príkazu Európskou komisiou. Každá vrátená suma sa prevádza Európskej komisii vrátane úrokov z omeškania. Úroková sadzba pre úrok z omeškania je stanovená úrokovou mierou Európskej centrálnej banky pre jej hlavné refinančné operácie určenou v prvý pracovný deň mesiaca, kedy sa mala dlžná suma vrátiť, vrátane 1,5 % penalizačnej sadzby.
Suma podliehajúca finančnej oprave sa vyčísli na základe jednotlivých prípadov v zodpovedajúcej sume podľa proporcionality. V prípadoch, keď nie je možné presne vyčísliť finančnú opravu, Európska komisia ju určí na základe extrapolácie alebo na základe paušálnej sadzby. Extrapolácia sa používa v rámci homogénnej skupiny projektov zdieľajúcich podobné charakteristiky ako výsledok dôkladného preskúmania reprezentatívnej náhodne vybranej vzorky projektov. Percentuálna paušálna sadzba sa používa, pokiaľ sa vyskytli systémové nezrovnalosti rôznej povahy / typu s rozptýleným účinkom, najmä závažné nedostatky v kľúčových alebo pomocných prvkoch systému riadenia a kontroly požadované ustanoveniami nariadení EÚ.
Ak na základe výslovnej požiadavky Európskej komisie rozhodne príslušný orgán Slovenskej republiky o začatí alebo pokračovaní súdneho / správneho konania vrátane exekučného konania s cieľom vymôcť neoprávnene vyplatenú sumu, Európska komisia môže Slovenskej republike nahradiť sčasti alebo v plnom rozsahu náklady na právne zastúpenie a náklady vynaložené v priamej súvislosti so súdnym / správnym konaním vrátane exekučného konania. Európska komisia tak urobí na základe doloženej dokumentácie aj v prípade, ak súdne / správne konanie vrátane exekučného konania bolo neúspešné.
8.3	Vysporiadanie finančných vzťahov na národnej úrovni
Vo všeobecnosti sa vysporiadanie nezrovnalostí vykonáva voči rozpočtu EÚ podľa podmienok stanovených legislatívou EÚ a vysporiadanie nezrovnalostí na národnej úrovni sa vykonáva v súlade s § 40 až 41 a 45 zákona č. 292/2014 Z. z. o príspevku poskytovanom z európskych štrukturálnych a investičných fondov a o zmene a doplnení niektorých zákonov. 
Vysporiadanie nezrovnalostí na národnej úrovni sa vykonáva:
a)	vzájomným započítaním pohľadávky z príspevku voči pohľadávke prijímateľa na poskytnutie príspevku alebo jeho časti;
b)	vzájomným započítaním pohľadávky z rozhodnutia voči pohľadávke prijímateľa na poskytnutie príspevku alebo jeho časti alebo
c)	vrátením príspevku alebo jeho časti, ak sa nevykoná vzájomné započítanie pohľadávok.
Riadiaci orgán môže uzavrieť s prijímateľom dohodu o splátkach a dohodu o odklade plnenia podľa postupov a za splnenia podmienok ustanovených v § 45 zákona č. 292/2014 Z. z. o príspevku poskytovanom z európskych štrukturálnych a investičných fondov a o zmene a doplnení niektorých zákonov. Osobitný režim vysporiadania finančných vzťahov je pre riadiaci orgán stanovený v § 41 zákona č. 292/2014 Z. z. o príspevku poskytovanom z európskych štrukturálnych a investičných fondov a o zmene a doplnení niektorých zákonov pri zistení porušenia pravidiel a postupov verejného obstarávania. 
Ak subjekt spôsobil nezrovnalosť, ktorá je zároveň porušením finančnej disciplíny, a to: 
•	poskytnutie alebo použitie verejných prostriedkov nad rámec oprávnenia, ktorým dôjde k vyššiemu čerpaniu verejných prostriedkov;
•	neodvedenie prostriedkov subjektu verejnej správy v ustanovenej alebo určenej lehote a rozsahu;
•	neodvedenie výnosu z verejných prostriedkov do rozpočtu subjektu verejnej správy podľa tohto alebo osobitného zákona
a zároveň sám zistí nezrovnalosť, ktorá je súčasne porušením finančnej disciplíny alebo sa nezrovnalosť, ktorá je zároveň porušením finančnej disciplíny zistí pri výkone následnej finančnej kontroly / vládneho auditu / inej kontroly a protiprávny stav je odstránený do dňa skončenia kontroly / vládneho auditu v súlade s § 31 ods. 4 zákona č. 523/2004 Z. z. o rozpočtových pravidlách verejnej správy osobitnými postupmi podľa poslednej vety § 42 ods. 7 zákona č. 292/2014 Z. z. o príspevku poskytovanom z európskych štrukturálnych a investičných fondov a o zmene a doplnení niektorých zákonov do dňa skončenia kontroly alebo vnútorného auditu, najneskôr do začatia vládneho auditu, správne konanie sa nezačne.
Ak ide o porušenie finančnej disciplíny, odvod, penále a pokutu za porušenie finančnej disciplíny pri nakladaní s finančnými prostriedkami štátneho rozpočtu a s finančnými prostriedkami EÚ ukladá a vymáha Úrad vládneho auditu, prípadne Ministerstvo financií SR v súlade s § 31 zákona č. 523/2004 Z. z. o rozpočtových pravidlách verejnej správy.
Subjekt, ktorý porušil finančnú disciplínu, je povinný vrátiť finančné prostriedky EÚ a finančné prostriedky štátneho rozpočtu na spolufinancovanie podľa § 42 ods. 8 a 9 zákona č. 292/2014 Z. z. o príspevku poskytovanom z európskych štrukturálnych a investičných fondov a o zmene a doplnení niektorých zákonov, ak ide odvod za porušenie finančnej disciplíny, pre ktorý rozhodnutie nadobudlo právoplatnosť od 1. januára 2015. 
Pre finančné prostriedky s označením kódu zdroja "pro-rata" sa uplatní postup pre vrátenie finančných prostriedkov štátneho rozpočtu na spolufinancovanie primerane.
Vysporiadanie finančných vzťahov po vykonaní finančnej opravy voči riadiacemu orgánu, sprostredkovateľskému orgánu, certifikačnému orgánu alebo orgánu auditu sa finančná oprava vykoná viazaním podľa § 18 zákona č. 523/2004 Z. z. o rozpočtových pravidlách verejnej správy.
V dôsledku finančnej opravy vykonanej Slovenskou republikou alebo Európskou komisiou Ministerstvo financií SR rozhodne o viazaní rozpočtových prostriedkov v rozpočte kapitoly, ktorú tvorí rozpočet ministerstva ako subjektu, ktorý nezrovnalosť spôsobil alebo ktorý pôvodne poskytol finančné prostriedky dlžníkovi v rámci implementácie programu. Viazanie rozpočtových prostriedkov vykoná Ministerstvo financií SR rozpočtovým opatrením v súlade s § 18 zákona č. 523/2004 Z. z. o rozpočtových pravidlách verejnej správy.
V rámci implementácie finančných nástrojov sú pravidlá vrátenia príspevku na finančný nástroj a vysporiadanie finančných vzťahov upravené v rámci ustanovení § 19 až 21 zákona č. 323/2015 Z. z. o finančných nástrojoch financovaných z európskych štrukturálnych a investičných fondov a o zmene a doplnení niektorých zákonov. Ak vznikne nezrovnalosť na úrovni finančného sprostredkovateľa alebo konečného prijímateľa, finančná oprava sa vykoná u prijímateľa. Prijímateľ následne vymáha tieto prostriedky od finančného sprostredkovateľa v súlade so zmluvou s finančným sprostredkovateľom podľa § 16 zákona č. 323/2015 Z. z. o finančných nástrojoch financovaných z európskych štrukturálnych a investičných fondov a o zmene a doplnení niektorých zákonov alebo od konečného prijímateľa v súlade so zmluvou uzatvorenou podľa § 17 zákona č. 323/2015 Z. z. o finančných nástrojoch financovaných z európskych štrukturálnych a investičných fondov a o zmene a doplnení niektorých zákonov. Výška finančnej opravy u prijímateľa sa určí primerane podľa § 20 ods. 3 a 4 zákona č. 323/2015 Z. z. o finančných nástrojoch financovaných z európskych štrukturálnych a investičných fondov a o zmene a doplnení niektorých zákonov. 
8.3.1	Uznanie neoprávnených výdavkov za opätovne oprávnené
V prípade, ak prijímateľ vysporiada nezrovnalosť alebo žiadosť o vrátenie finančných prostriedkov s vplyvom na rozpočet EÚ a následne je preukázané, že neoprávnené výdavky nezrovnalosti alebo ich časť je opätovne oprávnená, prijímateľ má nárok na vrátenie tejto sumy. V takomto prípade môžu byť tieto výdavky opätovne zaradené do nasledujúcej žiadosti o platbu, ktorú predloží prijímateľ. V prípade nesprávne vyčíslenej sumy na vymáhanie / vrátenie a ak k úhrade dlhu zo strany prijímateľa ešte nedošlo, suma na vymáhanie / vrátenie bude opravená v príslušnej nezrovnalosti a žiadosti o vrátenie finančných prostriedkov.
8.4	Vylúčenie projektu z financovania pomoci a podpory EÚ
V prípade, ak v rámci projektu financovaného z pomoci EÚ bola zistená nezrovnalosť a certifikačný orgán rozhodne, že výdavky daného projektu nemôžu byť certifikované ako oprávnené výdavky financované z rozpočtu EÚ podľa čl. 143 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 certifikačný orgán pozastaví realizáciu platieb a certifikáciu výdavkov pre daný projekt až do momentu vrátenia finančných prostriedkov prijímateľom. Certifikačný orgán v spolupráci s riadiacim orgánom rozhodne, že projekt bude vylúčený z financovania štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu a financovanie projektu môže byť ďalej zabezpečené z verejných zdrojov príslušnej kapitoly štátneho rozpočtu na základe dohody riadiaceho orgánu so správcom príslušnej kapitoly. V rámci procesu riadenia finančnej alokácie pre príslušný program riadiaci orgán musí v rámci ďalších postupov zohľadniť, že daný projekt nebude financovaný zo zdrojov EÚ napriek skutočnosti, že bola uzatvorená zmluva o poskytnutí nenávratného finančného príspevku s prijímateľom. 
V prípade, ak výdavky projektu nemôžu byť certifikované ako oprávnené výdavky financované z rozpočtu EÚ na základe oznámenia nezrovnalosti predtým, ako boli dotknuté výdavky schválené v súhrnnej žiadosti o platbu / mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu (napr. platobná jednotka uhradila dotknuté výdavky v rámci poskytnutej zálohovej platby alebo poskytnutého predfinancovania na účet prijímateľa), riadiaci orgán po posúdení vylúči projekt z financovania pomoci EÚ a po dohode so správcom kapitoly môže zabezpečiť financovanie projektu zo zdrojov príslušnej kapitoly štátneho rozpočtu. V tomto prípade dotknuté výdavky nie je možné zahrnúť do súhrnnej žiadosti o platbu / mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu a uhradiť zdroje EÚ na príjmový účet platobnej jednotky. Zároveň riadiaci orgán je prvotne zodpovedný podľa zmluvy o poskytnutí nenávratného finančného príspevku za zabezpečenie vrátenia neoprávnene vyplatených finančných prostriedkov od prijímateľa na príslušné účty platobnej jednotky.
V prípade, ak výdavky projektu nemôžu byť certifikované ako oprávnené výdavky financované z rozpočtu EÚ na základe oznámenia nezrovnalosti potom, ako boli dotknuté výdavky schválené v súhrnnej žiadosti o platbu / mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu a uhradené zdroje EÚ na príjmový účet platobnej jednotky, certifikačný orgán v spolupráci s riadiacim orgánom po spoločnom posúdení vylúčia projekt z financovania pomoci EÚ. V tomto prípade dotknuté výdavky nie je možné zahrnúť do žiadosti o platbu na Európsku komisiu a riadiaci orgán je prvotne zodpovedný podľa zmluvy o poskytnutí nenávratného finančného príspevku za zabezpečenie vrátenia neoprávnene vyplatených finančných prostriedkov od prijímateľa na príslušné účty certifikačného orgánu za zdroj EÚ a platobnej jednotky za zdroj štátneho rozpočtu. Financovanie projektu môže byť ďalej zabezpečené z verejných zdrojov príslušnej kapitoly štátneho rozpočtu na základe dohody riadiaceho orgánu so správcom príslušnej kapitoly.
V prípade, ak výdavky projektu nemôžu byť certifikované ako oprávnené výdavky financované z rozpočtu EÚ na základe oznámenia nezrovnalosti potom, ako boli dotknuté výdavky certifikované a zahrnuté do žiadosti o platbu na Európsku komisiu, certifikačný orgán v spolupráci s riadiacim orgánom po spoločnom posúdení vylúčia projekt z financovania pomoci EÚ. V tomto prípade dotknuté výdavky certifikačný orgán odpočíta od nasledujúcej žiadosti o platbu na Európsku komisiu a riadiaci orgán je prvotne zodpovedný podľa zmluvy o poskytnutí nenávratného finančného príspevku za zabezpečenie vrátenia neoprávnene vyplatených finančných prostriedkov od prijímateľa na príslušné účty certifikačného orgánu za zdroj EÚ a platobnej jednotky za zdroj štátneho rozpočtu. Financovanie projektu môže byť ďalej zabezpečené z verejných zdrojov príslušnej kapitoly štátneho rozpočtu na základe dohody riadiaceho orgánu so správcom príslušnej kapitoly.

9	Účtovníctvo
9.1	Účtovníctvo certifikačného orgánu a platobnej jednotky
Podľa čl. 125 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 je potrebné, aby subjekty zabezpečujúce riadenie a implementáciu projektov Európskeho fondu regionálneho rozvoja, Európskeho sociálneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu viedli samostatný účtovný systém alebo používali vhodné účtovné kódy pre všetky transakcie týkajúce sa projektov pri dodržaní požiadaviek legislatívy Slovenskej republiky pre vedenie účtovníctva. Je potrebné, aby právnické osoby (účtovné jednotky), ktorých súčasťou je certifikačný orgán alebo platobná jednotka, viedli účtovníctvo spôsobom, ktorý umožní zabezpečiť jednotný postup účtovania, poskytovania výstupov z účtovníctva a spracovania údajov v elektronickej podobe v súlade s požiadavkami čl. 72 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013.
Vzhľadom na to, že finančné toky prostriedkov EÚ sa realizujú prostredníctvom štátneho rozpočtu, subjektmi, ktoré účtujú o poskytovaní a použití finančných prostriedkov EÚ a finančných prostriedkov štátneho rozpočtu na spolufinancovanie sú certifikačný orgán a platobné jednotky.
Certifikačný orgán a platobné jednotky postupujú pri vedení účtovníctva v súlade s § 38 a § 44 ods. 3 zákona č. 292/2014 Z. z. o príspevku poskytovanom z európskych štrukturálnych a investičných fondov a o zmene a doplnení niektorých zákonov. Účtovanie pohľadávok podľa § 44 ods. 3 zákona č. 292/2014 Z. z. o príspevku poskytovanom z európskych štrukturálnych a investičných fondov a o zmene a doplnení niektorých zákonov sa vzťahuje na odvod za porušenie finančnej disciplíny, pre ktorý rozhodnutie nadobudlo právoplatnosť od 1. januára 2015.
Tieto subjekty zabezpečujú sledovanie transakcií súvisiacich s finančnými prostriedkami EÚ a finančnými prostriedkami štátneho rozpočtu na spolufinancovanie, za ktoré zodpovedajú, a to v rámci účtovníctva vnútorných organizačných jednotiek príslušného ministerstva alebo inej právnickej osoby, ktorej je platobná jednotka súčasťou.
Vedenie účtovníctva certifikačného orgánu a platobných jednotiek je zabezpečované prostredníctvom ISUF, ktorý je založený na spracovávaní procesov v prostredí SAP R/3 prostredníctvom jednotlivých modulov.
Spracovanie účtovných záznamov a výstupov podľa osobitných predpisov (najmä informácií z účtovníctva a údajov potrebných na účely hodnotenia plnenia rozpočtu verejnej správy podľa § 2b, ods. 2 zákona č. 291/2002 Z. z. o Štátnej pokladnici a o zmene a doplnení niektorých zákonov v znení neskorších predpisov) súvisiacich s poskytovaním prostriedkov EÚ a prostriedkov štátneho rozpočtu na spolufinancovanie zabezpečuje ISUF a je špecifikované v dokumentácii jeho používateľov.
Každá úroveň programovej štruktúry (program, prioritná os, projekt) je financovaná z rôznych zdrojov, t. j. prostriedkov EÚ, prostriedkov štátneho rozpočtu na spolufinancovanie a vlastných zdrojov prijímateľa. ISUF umožňuje v rámci integrovaného prepojenia informačných systémov väzby na Rozpočtový informačný systém, ITMS a Informačný systém Štátnej pokladnice.
Certifikačný orgán a platobné jednotky vedú účtovníctvo ako sústavu účtovných záznamov v súlade so zákonom č. 431/2002 Z. z. o účtovníctve v znení neskorších predpisov v rámci účtovníctva príslušnej vnútornej organizačnej jednotky – ministerstva alebo inej právnickej osoby, ktorej je platobná jednotka súčasťou, v ktorom osobitne zaznamenávajú a vykazujú všetky transakcie týkajúce sa finančných prostriedkov EÚ a finančných prostriedkov štátneho rozpočtu na spolufinancovanie, ktoré vznikli počas realizácie projektov.
Prostriedky EÚ sa zaznamenávajú v účtovníctve certifikačného orgánu v momente pripísania prostriedkov EÚ na mimorozpočtových účtoch pre príslušné programy certifikačného orgánu na základe zálohovej platby, priebežných platieb a záverečnej platby z Európskej komisie. Zaradenie do príjmov štátneho rozpočtu a realizácia výdavkov prostredníctvom štátneho rozpočtu je predmetom účtovníctva platobnej jednotky ako vnútornej organizačnej jednotky príslušného ministerstva alebo inej právnickej osoby, ktorej je platobná jednotka súčasťou, ktorá má v rozpočte rozpočtované adekvátne príjmy a výdavky.
V prípade globálnych grantov Ministerstvo financií SR v zmysle § 9 ods. 2 písm. d) a 38 ods. 1 návrhu zákona o príspevku poskytovanom z európskych štrukturálnych a investičných fondov a o zmene a doplnení niektorých zákonov zabezpečuje metodické riadenie a koordináciu postupov účtovania len platobných jednotiek a v rámci ISUF evidujú a aktualizujú údaje len certifikačný orgán a platobné jednotky. Rozhodnutím riadiaceho orgánu delegovať kompetencie na sprostredkovateľské orgány pre globálny grant, riadiaci orgán deleguje aj všetky podmienky plynúce z nariadení EÚ a legislatívy SR na sprostredkovateľské orgány pre globálny grant vrátane podmienok čl. 125 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013, tzn. aj koordinácie postupov účtovania pre účtovanie transakcií týkajúcich sa projektov prijímateľov podľa požiadaviek legislatívy EÚ a SR. 
9.2	Účtovníctvo prijímateľa a partnera
Prijímateľ a partner postupujú pri vedení účtovníctva v súlade s § 39 zákona č. 292/2014 Z. z. o príspevku poskytovanom z európskych štrukturálnych a investičných fondov a o zmene a doplnení niektorých zákonov. V rámci implementácie finančných nástrojov prijímateľ (s výnimkou prijímateľa so sídlom mimo územia Slovenskej republiky), finančný sprostredkovateľ a konečný prijímateľ postupujú pri vedení účtovníctva v súlade s ustanovením § 23 zákona č. 323/2015 Z. z. o finančných nástrojoch financovaných z európskych štrukturálnych a investičných fondov a o zmene a doplnení niektorých zákonov. Prijímateľ alebo partner so sídlom mimo územia Slovenskej republiky postupuje pri vedení účtovníctva podľa právneho poriadku štátu, na území ktorého má sídlo alebo miesto podnikania. 
V súvislosti s plnením povinností riadiaceho orgánu podľa čl. 72 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 riadiaci orgán zabezpečí v ustanoveniach zmluvy o poskytnutí nenávratného finančného príspevku spôsob monitorovania čistých príjmov z projektu podľa čl. 61 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 a vedenia záznamov u prijímateľa, a to na účely zdokladovania a preukázania skutočností týkajúcich sa čistého príjmu uvedených v následných monitorovacích správach.
10	Finančné výkazníctvo a archivácia
Na účely zostavovania finančných výkazov v súlade s legislatívou Slovenskej republiky (najmä zákon č. 523/2004 Z. z. o rozpočtových pravidlách verejnej správy) a nariadeniami EÚ sa uplatní členenie podľa rozpočtovej klasifikácie, členenie podľa programového rozpočtovania a členenie podľa kódov zdrojov v štátnom rozpočte pre prostriedky EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie.
Certifikačný orgán a platobné jednotky v rámci systému finančného výkazníctva zabezpečujú pravidelné a štandardizované výstupy pre každý projekt financovaný z prostriedkov EÚ a z prostriedkov štátneho rozpočtu na spolufinancovanie. Tento systém monitoruje dosiahnutý pokrok pri realizácii projektu, uľahčuje proces overovania a kontroly výdavkov z prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie a predstavuje súhrnné podklady pre vypracovanie žiadosti o platbu Európskej komisii.
Systém finančného výkazníctva riadiaceho orgánu, certifikačného orgánu a platobných jednotiek pokrýva všetky oprávnené výdavky na projekt v súlade so zmluvou o poskytnutí nenávratného finančného príspevku bez ohľadu na zdroj jeho financovania. Certifikačný orgán a platobné jednotky zabezpečia súlad údajov vo finančných výkazoch s údajmi v účtovných záznamoch a v účtovnej dokumentácii, ktoré vedú.
Podľa čl. 140 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 pre projekty financované zo štrukturálnych fondov a Kohézneho fondu s celkovými oprávnenými výdavkami menej ako 1 mil. EUR riadiaci orgán zabezpečí, aby všetky podporné dokumenty boli uchovávané pre potreby Európskej komisie a Európskeho dvora audítorov počas obdobia 3 rokov, ktoré začína plynúť 31. decembra následne po predložení účtov zahrnujúcich dotknuté výdavky projektu. 
V prípade projektov financovaných zo štrukturálnych fondov a Kohézneho fondu s celkovými oprávnenými výdavkami nad 1 mil. EUR riadiaci orgán zabezpečí, aby všetky podporné dokumenty boli uchovávané pre potreby Európskej komisie a Európskeho dvora audítorov počas obdobia 2 rokov, ktoré začína plynúť 31. decembra následne po predložení účtov zahrnujúcich záverečné výdavky projektu. 
Uvedená doba sa môže prerušiť z dôvodu správnych alebo súdnych konaní a na základe riadne odôvodnenej žiadosti Európskej komisie. Registrácia a uchovávanie dokumentov musí byť zabezpečené aj v súlade so zákonom č. 395/2002 Z. z. o archívoch a registratúrach a o doplnení niektorých zákonov v znení neskorších predpisov.
Certifikačný orgán a platobná jednotka uchováva účtovníctvo a účtovnú dokumentáciu v súlade s § 38 zákona č. 292/2014 Z. z. o príspevku poskytovanom z európskych štrukturálnych a investičných fondov a o zmene a doplnení niektorých zákonov.
V súlade s čl. 140 ods. 3 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 platí, že dokumenty musia byť uchovávané buď ako originály alebo na všeobecne akceptovateľných nosičoch údajov. Všeobecne akceptovateľné nosiče údajov predovšetkým zahŕňajú:
a)	fotokópie originálnych dokumentov;
b)	mikrofiše originálnych dokumentov;
c)	elektronické verzie originálnych dokumentov na optických nosičoch údajov (napr. CD-ROM, pevný disk alebo magnetický disk);
d)	dokumenty existujúce len v elektronickej podobe.
Postup overovania súladu dokumentov uchovávaných na všeobecne akceptovateľných nosičoch údajov s originálmi dokumentov musí byť v súlade s národnými predpismi a musí poskytovať dostatočnú záruku dôveryhodnosti pre účely auditu a kontroly. V prípade, ak existujú dokumenty len v elektronickej podobe, musia používané počítačové systémy spĺňať bezpečnostné štandardy, ktoré zabezpečia, že uchovávané dokumenty sú v súlade so záväznými právnymi predpismi Slovenskej republiky a sú dôveryhodné pre účely auditu a kontroly. Ak účtovná jednotka prenáša účtovný záznam mimo účtovnej jednotky prostredníctvom informačného systému, považuje sa účtovný záznam za preukázateľný, ak sa prenášal spôsobom podľa § 33 zákona č. 431/2002 Z. z. o účtovníctve v znení neskorších predpisov. Účtovný záznam určený na prenášanie musí byť zabezpečený podpisovým záznamom, ktorým môže byť účtovnými jednotkami vzájomne uznávaný obdobný preukázateľný účtovný záznam v technickej forme. Účtovný záznam musí byť zabezpečený najneskôr v okamihu jeho odovzdania na prenos.
Prijímateľ zabezpečí, aby dodávateľ / zhotoviteľ vyhotovoval účtovné doklady minimálne v dvoch rovnopisoch, pričom jeden uchováva prijímateľ a druhý riadiaci orgán. V prípade, ak má prijímateľ k dispozícii len jeden originál, tento originál účtovného dokladu uchováva prijímateľ a kópiu18 originálu účtovného dokladu označeného podpisom štatutárneho orgánu prijímateľa uchováva riadiaci orgán.

11	Používanie mien a kurzové rozdiely
V rámci finančného riadenia štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu podľa nastavenia finančných tokov na národnej úrovni môžu vznikať kurzové rozdiely iba na úrovni prijímateľa.
V prípade, ak prijímateľ uhrádza výdavky spojené s projektom v inej mene ako EUR, príslušné účtovné doklady vystavené dodávateľom / zhotoviteľom v cudzej mene sú platobnou jednotkou preplácané formou refundácie v EUR, resp. na ich úhradu môže použiť prostriedky poskytnuté zálohovou platbou, predfinancovaním. Prípadné rozdiely z dôvodu použitia rôznych mien znáša prijímateľ. Prijímateľ je povinný nezúčtovaný rozdiel poskytnutého predfinancovania vrátiť platobnej jednotke v súlade s časťou 4.5.9.
Pri použití výmenného kurzu pre potreby prepočtu sumy výdavkov uhrádzaných prijímateľom v cudzej mene je potrebné postupovať v súlade s § 24 zákona č. 431/2002 Z. z. o účtovníctve v znení neskorších predpisov.
V súlade s vyššie uvedeným prijímateľ:
a)	pri prevode peňažných prostriedkov v cudzej mene zo svojho účtu zriadeného v EUR na účet dodávateľa / zhotoviteľa zriadeného v cudzej mene použije kurz banky platný v deň odpísania prostriedkov z účtu prijímateľa, tzn. v deň uskutočnenia účtovného prípadu. Týmto kurzom prepočítaný výdavok na EUR, uhradený dodávateľovi / zhotoviteľovi, zahrnie do žiadosti o platbu (priebežná platba, zúčtovanie zálohovej platby, zúčtovanie predfinancovania);
b)	pri prevode peňažných prostriedkov v cudzej mene zo svojho účtu zriadeného v cudzej mene na účet dodávateľa / zhotoviteľa v rovnakej cudzej mene použije referenčný výmenný kurz určený a vyhlásený Európskou centrálnou bankou v deň predchádzajúci dňu uskutočnenia účtovného prípadu. Týmto kurzom prepočítaný výdavok na EUR, uhradený dodávateľovi / zhotoviteľovi, zahrnie do žiadosti o platbu (priebežná platba, zúčtovanie zálohovej platby, zúčtovanie predfinancovania).
Pre systém predfinancovania platí:
V prípade, ak prijímateľ v súvislosti s realizáciou projektu bude na úhradu výdavkov v inej mene ako EUR, využívať systém predfinancovania, tak v predloženej žiadosti o platbu (poskytnutie predfinancovania) pre nárokované finančné prostriedky použije kurz banky platný v deň zdaniteľného plnenia uvedený na účtovnom doklade. Následne prijímateľ uplatní pri žiadosti o platbu (zúčtovanie predfinancovania) postup v zmysle bodu a), resp. b) tejto časti. 
Prijímateľ je povinný v rámci systému predfinancovania priebežne sledovať a kumulatívne nasčítavať kladnú a zápornú hodnotu vzniknutých kurzových rozdielov. Záverečný kumulatívny prehľad vzniknutých kurzových rozdielov prijímateľ predkladá riadiacemu orgánu k žiadosti o platbu (s príznakom záverečná). 
V prípade, ak kumulatívna suma kurzových rozdielov predstavuje pre prijímateľa kurzovú stratu, prijímateľ požiada o jej preplatenie v rámci žiadosti o platbu (s príznakom záverečná).
V prípade, ak kumulatívna suma kurzových rozdielov predstavuje pre prijímateľa kurzový zisk, prijímateľ a riadiaci orgán postupuje v súlade s časťou 4.5.9 (vzájomné započítanie pohľadávok a záväzkov). 
Tento postup sa uplatní len v prípade, ak kumulatívna suma kurzových rozdielov presiahne 40,00 EUR, keďže v súlade s časťou 4.5.9 platí, že ak suma nenávratného finančného príspevku alebo jeho časti, ktorá sa má vrátiť, nepresiahne 40,00 EUR, tento nenávratný finančný príspevok alebo jeho časť riadiaci orgán nevymáha.

12	Monitorovanie a elektronická výmena informácií
V zmysle čl. 122 nariadenia Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) č. 1303/2013 bude v prípade financovania pomoci zo štrukturálnych fondov a Kohézneho fondu najneskôr od 31. decembra 2015 celá výmena dát, údajov a dokumentov medzi prijímateľom a riadiacim orgánom, certifikačným orgánom, platobnou jednotkou, orgánom auditu a sprostredkovateľským orgánom realizovaná elektronickou formou. Centrálnym systémom určeným pre komunikáciu s prijímateľom je monitorovací systém ITMS, ktorý zahŕňa procesy programového a projektového riadenia, obsahuje údaje, ktoré sú potrebné na transparentné a efektívne riadenie, finančné riadenie a kontrolu poskytovania príspevku. 
V procese informačných a finančných tokov, každý subjekt (riadiaci orgán, platobná jednotka, certifikačný orgán, orgán auditu) zúčastňujúci sa riadenia a implementácie štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu je povinný na svojej úrovni zabezpečiť v príslušných informačných systémoch evidenciu a spracovanie údajov súvisiacich s riadením pomoci EÚ, údajov týkajúcich sa poskytovania prostriedkov EÚ a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie prijímateľom a údajov týkajúcich sa vrátenia a spätného vymáhania finančných prostriedkov.
Na národnej úrovni sú tieto informačné systémy prevádzkované DataCentrom v spoločnej komunikačno-technologickej infraštruktúre a navzájom sú integračne prepojené. Do procesu finančného riadenia vstupujú nasledovné informačné systémy:
a)	ITMS zahŕňa štandardizované procesy programového a projektového riadenia, obsahuje údaje, ktoré sú potrebné na transparentné a efektívne riadenie, finančné riadenie a kontrolu poskytovania príspevku a na zabezpečenie informácií podľa osobitných predpisov;
b)	ISUF je jednotný účtovný systém určený pre certifikačný orgán a platobné jednotky na zabezpečenie jednotného postupu účtovania, poskytovania výstupov z účtovníctva a spracovania údajov vyhovujúcich požiadavkám Európskej komisie a požiadavkám legislatívy Slovenskej republiky pre vedenie účtovníctva;
c)	RIS je rozpočtový informačný systém;
d)	ManEx je modulom Informačného systému Štátnej pokladnice pre riadenie výdavkov, ktorý poskytuje používateľom služby elektronického bankovníctva.
Elektronická výmena údajov, správ a informácií s Európskou komisiou v oblastiach strategického plánovania, programovania, monitorovania, vykonávania pomoci, auditu, hodnotenia a uzatvárania pomoci prebieha prostredníctvom informačného systému SFC, ktorého vývoj a prevádzku zabezpečuje Európska komisia.
Na nahlasovanie podvodov a nezrovnalostí súvisiacich riadením fondov EÚ slúži informačný systém IMS, ktorý je v gestorstve Európskeho úradu pre boj proti podvodom.
Pre všetky ustanovenia, povinnosti a postupy stanovené v platnom znení Systému finančného riadenia štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu na programové obdobie 2014 – 2020, ktoré predpokladajú použitie ITMS po 31. decembri 2015, pričom príslušná funkcionalita ešte nie je v rámci ITMS v plnom rozsahu zabezpečená, platí, že aj po tomto termíne sa uplatňuje obdobný postup ako do 31. decembra 2015. Po spustení príslušných funkcionalít ITMS je zodpovedný subjekt povinný dodatočne zaevidovať príslušné dokumenty v jednotlivých moduloch ITMS.
Vzhľadom na skutočnosť, že úpravy ITMS sa pri aktualizácii metodických dokumentov uskutočňujú s určitým časovým oneskorením, môže dôjsť k obsahovým odlišnostiam medzi Systémom finančného riadenia štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu na programové obdobie 2014 – 2020 a ITMS (predovšetkým v prípade formulárov podľa príloh tohto materiálu). V takom prípade, do času zabezpečenia súladu ITMS s ostatnou platnou verziou Systému finančného riadenia štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu na programové obdobie 2014 – 2020, je relevantná ITMS verzia.

13	Zoznam príloh
Príloha 1a:	Žiadosť o platbu 	
Príloha 1b:	Pokyny k vyplneniu žiadosti o platbu	
Príloha 1c:	Žiadosť o platbu (finančné nástroje) – poskytnutie 1. tranže	
Príloha 1d:	Pokyny k vyplneniu žiadosti o platbu (finančné nástroje) – poskytnutie 1. tranže	
Príloha 1e:	Žiadosť o platbu (globálny grant)	
Príloha 1f:	Pokyny k vyplneniu žiadosti o platbu (globálny grant)	
Príloha 2a:	Súhrnná žiadosť o platbu / Mimoriadna súhrnná žiadosť o platbu	
Príloha 2b:	Čiastkový výkaz výdavkov k súhrnnej žiadosti o platbu platobnej jednotky / Čiastkový výkaz výdavkov k mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu platobnej jednotky / Čiastkový výkaz výdavkov k mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu riadiaceho orgánu v rámci Programu Interreg V-A SK – CZ, Programu Interreg V-A SK – AT a Programu Interreg V-A SK – HU	
Príloha 2c:	Pokyny k vyplneniu súhrnnej žiadosti o platbu / Pokyny k vyplneniu mimoriadnej súhrnnej žiadosti o platbu	
Príloha 3:	Identifikácia hlásenia / správy o zistenej nezrovnalosti	
Príloha 4:	Štruktúra kódov pre nezrovnalosti (kódovník Európskeho úradu pre boj proti podvodom)	
Príloha 5a:	Schéma finančných a informačných tokov pre systém predfinancovania	
Príloha 5b:	Schéma finančných a informačných tokov pre systém zálohovej platby	
Príloha 5c:	Schéma finančných a informačných tokov pre systém refundácie	
Príloha 6a:	Žiadosť o vrátenie finančných prostriedkov	
Príloha 6b:	Pokyny k vyplneniu žiadosti o vrátenie finančných prostriedkov	
Príloha 6c:	Žiadosť o vrátenie finančných prostriedkov pre programy Interreg V-A	
Príloha 6d:	Pokyny k vyplneniu žiadosti o vrátenie finančných prostriedkov pre programy Interreg V-A 	
Príloha 7:	Mandát na INKASO v SEPA	
Príloha 7a:	Vydaním Systému finančného riadenia štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu na programové obdobie 2014 – 2020, verzia 1.2 sa z dôvodu automatizácie procesu úhrady pohľadávky VYPÚŠŤA príloha „Oznámenie o vysporiadaní finančných vzťahov“.	
Príloha 7b:	Vydaním Systému finančného riadenia štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu na programové obdobie 2014 – 2020, verzia 1.2 sa z dôvodu automatizácie procesu úhrady pohľadávky VYPÚŠŤA príloha „Pokyny k vyplneniu oznámenia o vysporiadaní finančných vzťahov“	
Príloha 7c:	Vydaním Systému finančného riadenia štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu na programové obdobie 2014 – 2020, verzia 1.2 sa z dôvodu automatizácie procesu úhrady pohľadávky VYPÚŠŤA príloha „Oznámenie o vysporiadaní finančných vzťahov pre programy Interreg V-A“ 	
Príloha 7d:	Vydaním Systému finančného riadenia štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu na programové obdobie 2014 – 2020, verzia 1.2 sa z dôvodu automatizácie procesu úhrady pohľadávky VYPÚŠŤA príloha „Pokyny k vyplneniu oznámenia o vysporiadaní finančných vzťahov pre programy Interreg V-A“ 	
Príloha 8a:	Odhady očakávaných výdavkov	
Príloha 8b:	Pokyny k vyplneniu odhadu očakávaných výdavkov 	
Príloha 9:	Formulár pre zoznam nevymožiteľných súm	
Príloha 10:	Štruktúra väzieb v rámci implementácie finančných nástrojov prostredníctvom Slovenského investičného holdingu	
Príloha 11:	Vydaním Systému finančného riadenia štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu na programové obdobie 2014 – 2020, verzia 1.2 sa VYPÚŠŤA príloha „Schéma a popis schémy k vráteniu finančných prostriedkov v rámci finančného riadenia štrukturálnych fondov, Kohézneho fondu a Európskeho námorného a rybárskeho fondu“ 	

14	Zoznam odkazov